Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

ZEB1 англ Zinc finger E box binding homeobox 1 білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому

ZEB1

ZEB1

ZEB1 (англ. Zinc finger E-box binding homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 124 амінокислот, а молекулярна маса — 124 074.

ZEB1
image
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи ZEB1, zinc finger E-box binding homeobox 1, AREB6, BZP, DELTAEF1, FECD6, NIL2A, PPCD3, TCF8, ZFHEP, ZFHX1A
Зовнішні ІД OMIM: 189909 MGI: 1344313 HomoloGene: 31779 GeneCards: ZEB1
Пов'язані генетичні захворювання
Fuchs' endothelial dystrophy
Шаблон експресії
image

image

image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6935
21417
Ensembl
ENSG00000148516
ENSMUSG00000024238
UniProt
P37275
Q64318
RefSeq (мРНК)
NM_011546
NM_001360981
NM_001360982
RefSeq (білок)
NP_035676
NP_001347910
NP_001347911
Локус (UCSC) Хр. 10: 31.32 – 31.53 Mb Хр. 18: 5.59 – 5.78 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MADGPRCKRRKQANPRRNNVTNYNTVVETNSDSDDEDKLHIVEEESVTDA
ADCEGVPEDDLPTDQTVLPGRSSEREGNAKNCWEDDRKEGQEILGPEAQA
DEAGCTVKDDECESDAENEQNHDPNVEEFLQQQDTAVIFPEAPEEDQRQG
TPEASGHDENGTPDAFSQLLTCPYCDRGYKRFTSLKEHIKYRHEKNEDNF
SCSLCSYTFAYRTQLERHMTSHKSGRDQRHVTQSGCNRKFKCTECGKAFK
YKHHLKEHLRIHSGEKPYECPNCKKRFSHSGSYSSHISSKKCISLIPVNG
RPRTGLKTSQCSSPSLSASPGSPTRPQIRQKIENKPLQEQLSVNQIKTEP
VDYEFKPIVVASGINCSTPLQNGVFTGGGPLQATSSPQGMVQAVVLPTVG
LVSPISINLSDIQNVLKVAVDGNVIRQVLENNQANLASKEQETINASPIQ
QGGHSVISAISLPLVDQDGTTKIIINYSLEQPSQLQVVPQNLKKENPVAT
NSCKSEKLPEDLTVKSEKDKSFEGGVNDSTCLLCDDCPGDINALPELKHY
DLKQPTQPPPLPAAEAEKPESSVSSATGDGNLSPSQPPLKNLLSLLKAYY
ALNAQPSAEELSKIADSVNLPLDVVKKWFEKMQAGQISVQSSEPSSPEPG
KVNIPAKNNDQPQSANANEPQDSTVNLQSPLKMTNSPVLPVGSTTNGSRS
STPSPSPLNLSSSRNTQGYLYTAEGAQEEPQVEPLDLSLPKQQGELLERS
TITSVYQNSVYSVQEEPLNLSCAKKEPQKDSCVTDSEPVVNVIPPSANPI
NIAIPTVTAQLPTIVAIADQNSVPCLRALAANKQTILIPQVAYTYSTTVS
PAVQEPPLKVIQPNGNQDERQDTSSEGVSNVEDQNDSDSTPPKKKMRKTE
NGMYACDLCDKIFQKSSSLLRHKYEHTGKRPHECGICKKAFKHKHHLIEH
MRLHSGEKPYQCDKCGKRFSHSGSYSQHMNHRYSYCKREAEERDSTEQEE
AGPEILSNEHVGARASPSQGDSDERESLTREEDEDSEKEEEEEDKEMEEL
QEEKECEKPQGDEEEEEEEEEVEEEEVEEAENEGEEAKTEGLMKDDRAES
QASSLGQKVGESSEQVSEEKTNEA

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Long J., Zuo D., Park M. (2005). Pc2-mediated sumoylation of Smad-interacting protein 1 attenuates transcriptional repression of E-cadherin. J. Biol. Chem. 280: 35477—35489. PMID 16061479 DOI:10.1074/jbc.M504477200
  • Papadopoulou V., Postigo A., Sanchez-Tillo E., Porter A.C., Wagner S.D. (2010). ZEB1 and CtBP form a repressive complex at a distal promoter element of the BCL6 locus. Biochem. J. 427: 541—550. PMID 20175752 DOI:10.1042/BJ20091578
  • Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
  • Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
  • Chung D.W., Frausto R.F., Ann L.B., Jang M.S., Aldave A.J. (2014). Functional impact of ZEB1 mutations associated with posterior polymorphous and Fuchs' endothelial corneal dystrophies. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 55: 6159—6166. PMID 25190660 DOI:10.1167/iovs.14-15247

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з ZEB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11642 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
  5. (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

ZEB1 angl Zinc finger E box binding homeobox 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 10 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 124 aminokislot a molekulyarna masa 124 074 ZEB1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2E19IdentifikatoriSimvoliZEB1 zinc finger E box binding homeobox 1 AREB6 BZP DELTAEF1 FECD6 NIL2A PPCD3 TCF8 ZFHEP ZFHX1AZovnishni ID OMIM 189909 MGI 1344313 HomoloGene 31779 GeneCards ZEB1Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaFuchs endothelial dystrophy Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding GO 0001106 transcription corepressor activity GO 0001105 transcription coactivator activity zinc ion binding transcription factor binding chromatin binding zv yazuvannya z ionom metalu GO 0001948 GO 0016582 protein binding nucleic acid binding GO 0001078 GO 0001214 GO 0001206 DNA binding transcription repressor activity RNA polymerase II specific GO 0001131 GO 0001151 GO 0001130 GO 0001204 DNA binding transcription factor activity E box binding GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specificKlitinna komponenta transcription regulator complex klitinne yadro nukleoplazma gialoplazmaBiologichnij proces pattern specification process embryonic skeletal system morphogenesis regulation of smooth muscle cell differentiation animal organ development diferenciaciya klitin semicircular canal morphogenesis GO 0009373 regulation of transcription DNA templated GO 0044324 GO 0003256 GO 1901213 GO 0046019 GO 0046020 GO 1900094 GO 0061216 GO 0060994 GO 1902064 GO 0003258 GO 0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II transcription DNA templated nejrobiologiya rozvitku regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway regulation of T cell differentiation in thymus central nervous system development cartilage development regulation of mesenchymal cell proliferation embryonic camera type eye morphogenesis cochlea morphogenesis GO 0046730 GO 0046737 GO 0046738 GO 0046736 imunna vidpovid embryonic morphogenesis cellular response to amino acid stimulus proliferaciya negative regulation of epithelial cell differentiation GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II negative regulation of cell population proliferation GO 0045996 negative regulation of transcription DNA templated positive regulation of neuron differentiation GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II negative regulation of endothelial cell differentiation cytokine mediated signaling pathwayDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez6935 21417Ensembl ENSG00000148516 ENSMUSG00000024238UniProt P37275 Q64318RefSeq mRNK NM 001128128 NM 001174093 NM 001174094 NM 001174095 NM 001174096NM 030751 NM 001323638 NM 001323641 NM 001323642 NM 001323643 NM 001323644 NM 001323645 NM 001323646 NM 001323647 NM 001323648 NM 001323649 NM 001323650 NM 001323651 NM 001323652 NM 001323653 NM 001323654 NM 001323655 NM 001323656 NM 001323657 NM 001323658 NM 001323659 NM 001323660 NM 001323661 NM 001323662 NM 001323663 NM 001323664 NM 001323665 NM 001323666 NM 001323671 NM 001323672 NM 001323673 NM 001323674 NM 001323675 NM 001323676 NM 001323677 NM 001323678NM 011546 NM 001360981 NM 001360982RefSeq bilok NP 001121600 NP 001167564 NP 001167565 NP 001167566 NP 001167567NP 001310567 NP 001310570 NP 001310571 NP 001310572 NP 001310573 NP 001310574 NP 001310575 NP 001310576 NP 001310577 NP 001310578 NP 001310579 NP 001310580 NP 001310581 NP 001310582 NP 001310583 NP 001310584 NP 001310585 NP 001310586 NP 001310587 NP 001310588 NP 001310589 NP 001310590 NP 001310591 NP 001310592 NP 001310593 NP 001310594 NP 001310595 NP 001310600 NP 001310601 NP 001310602 NP 001310603 NP 001310604 NP 001310605 NP 001310606 NP 001310607 NP 110378NP 035676 NP 001347910 NP 001347911Lokus UCSC Hr 10 31 32 31 53 MbHr 18 5 59 5 78 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MADGPRCKRRKQANPRRNNVTNYNTVVETNSDSDDEDKLHIVEEESVTDA ADCEGVPEDDLPTDQTVLPGRSSEREGNAKNCWEDDRKEGQEILGPEAQA DEAGCTVKDDECESDAENEQNHDPNVEEFLQQQDTAVIFPEAPEEDQRQG TPEASGHDENGTPDAFSQLLTCPYCDRGYKRFTSLKEHIKYRHEKNEDNF SCSLCSYTFAYRTQLERHMTSHKSGRDQRHVTQSGCNRKFKCTECGKAFK YKHHLKEHLRIHSGEKPYECPNCKKRFSHSGSYSSHISSKKCISLIPVNG RPRTGLKTSQCSSPSLSASPGSPTRPQIRQKIENKPLQEQLSVNQIKTEP VDYEFKPIVVASGINCSTPLQNGVFTGGGPLQATSSPQGMVQAVVLPTVG LVSPISINLSDIQNVLKVAVDGNVIRQVLENNQANLASKEQETINASPIQ QGGHSVISAISLPLVDQDGTTKIIINYSLEQPSQLQVVPQNLKKENPVAT NSCKSEKLPEDLTVKSEKDKSFEGGVNDSTCLLCDDCPGDINALPELKHY DLKQPTQPPPLPAAEAEKPESSVSSATGDGNLSPSQPPLKNLLSLLKAYY ALNAQPSAEELSKIADSVNLPLDVVKKWFEKMQAGQISVQSSEPSSPEPG KVNIPAKNNDQPQSANANEPQDSTVNLQSPLKMTNSPVLPVGSTTNGSRS STPSPSPLNLSSSRNTQGYLYTAEGAQEEPQVEPLDLSLPKQQGELLERS TITSVYQNSVYSVQEEPLNLSCAKKEPQKDSCVTDSEPVVNVIPPSANPI NIAIPTVTAQLPTIVAIADQNSVPCLRALAANKQTILIPQVAYTYSTTVS PAVQEPPLKVIQPNGNQDERQDTSSEGVSNVEDQNDSDSTPPKKKMRKTE NGMYACDLCDKIFQKSSSLLRHKYEHTGKRPHECGICKKAFKHKHHLIEH MRLHSGEKPYQCDKCGKRFSHSGSYSQHMNHRYSYCKREAEERDSTEQEE AGPEILSNEHVGARASPSQGDSDERESLTREEDEDSEKEEEEEDKEMEEL QEEKECEKPQGDEEEEEEEEEVEEEEVEEAENEGEEAKTEGLMKDDRAES QASSLGQKVGESSEQVSEEKTNEA A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do represoriv aktivatoriv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi diferenciaciya klitin nejrogenez alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku DNK Lokalizovanij u yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Long J Zuo D Park M 2005 Pc2 mediated sumoylation of Smad interacting protein 1 attenuates transcriptional repression of E cadherin J Biol Chem 280 35477 35489 PMID 16061479 DOI 10 1074 jbc M504477200 Papadopoulou V Postigo A Sanchez Tillo E Porter A C Wagner S D 2010 ZEB1 and CtBP form a repressive complex at a distal promoter element of the BCL6 locus Biochem J 427 541 550 PMID 20175752 DOI 10 1042 BJ20091578 Impens F Radoshevich L Cossart P Ribet D 2014 Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli Proc Natl Acad Sci U S A 111 12432 12437 PMID 25114211 DOI 10 1073 pnas 1413825111 Hendriks I A Treffers L W Verlaan de Vries M Olsen J V Vertegaal A C 2015 SUMO 2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage Cell Rep 10 1778 1791 PMID 25772364 DOI 10 1016 j celrep 2015 02 033 Chung D W Frausto R F Ann L B Jang M S Aldave A J 2014 Functional impact of ZEB1 mutations associated with posterior polymorphous and Fuchs endothelial corneal dystrophies Invest Ophthalmol Vis Sci 55 6159 6166 PMID 25190660 DOI 10 1167 iovs 14 15247PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z ZEB1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 11642 angl Procitovano 8 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 17 veresnya 2017 Procitovano 8 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 10 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ