Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

Ku80 англ X ray repair cross complementing 5 білок який кодується геном XRCC5 розташованим у людей на короткому плечі 2

XRCC5

XRCC5

Ku80 (англ. X-ray repair cross complementing 5) – білок, який кодується геном XRCC5, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 732 амінокислот, а молекулярна маса — 82 705. Разом з Ku70 формують -гетеродимер

XRCC5
image
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи XRCC5, KARP-1, KARP1, KU80, KUB2, Ku86, NFIV, Ku80, X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5, X-ray repair cross complementing 5
Зовнішні ІД OMIM: 194364 MGI: 104517 HomoloGene: 40681 GeneCards: XRCC5
Шаблон експресії
image

image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7520
22596
Ensembl
ENSG00000079246
ENSMUSG00000026187
UniProt
P13010
P27641
RefSeq (мРНК)
NM_021141
NM_009533
NM_001357519
NM_001357520
RefSeq (білок)
NP_066964
NP_033559
NP_001344448
NP_001344449
Локус (UCSC) Хр. 2: 216.11 – 216.21 Mb Хр. 1: 72.35 – 72.43 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MVRSGNKAAVVLCMDVGFTMSNSIPGIESPFEQAKKVITMFVQRQVFAEN
KDEIALVLFGTDGTDNPLSGGDQYQNITVHRHLMLPDFDLLEDIESKIQP
GSQQADFLDALIVSMDVIQHETIGKKFEKRHIEIFTDLSSRFSKSQLDII
IHSLKKCDISLQFFLPFSLGKEDGSGDRGDGPFRLGGHGPSFPLKGITEQ
QKEGLEIVKMVMISLEGEDGLDEIYSFSESLRKLCVFKKIERHSIHWPCR
LTIGSNLSIRIAAYKSILQERVKKTWTVVDAKTLKKEDIQKETVYCLNDD
DETEVLKEDIIQGFRYGSDIVPFSKVDEEQMKYKSEGKCFSVLGFCKSSQ
VQRRFFMGNQVLKVFAARDDEAAAVALSSLIHALDDLDMVAIVRYAYDKR
ANPQVGVAFPHIKHNYECLVYVQLPFMEDLRQYMFSSLKNSKKYAPTEAQ
LNAVDALIDSMSLAKKDEKTDTLEDLFPTTKIPNPRFQRLFQCLLHRALH
PREPLPPIQQHIWNMLNPPAEVTTKSQIPLSKIKTLFPLIEAKKKDQVTA
QEIFQDNHEDGPTAKKLKTEQGGAHFSVSSLAEGSVTSVGSVNPAENFRV
LVKQKKASFEEASNQLINHIEQFLDTNETPYFMKSIDCIRAFREEAIKFS
EEQRFNNFLKALQEKVEIKQLNHFWEIVVQDGITLITKEEASGSSVTAEE
AKKFLAPKDKPSGDTAAVFEEGGDVDDLLDMI

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, активаторів, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Oderwald H., Hughes M.J., Jost J.-P. (1996). Non-histone protein 1 (NHP1) is a member of the Ku protein family which is upregulated in differentiating mouse myoblasts and human promyelocytes. FEBS Lett. 382: 313—318. PMID 8605992 DOI:10.1016/0014-5793(96)00189-5
  • Stuiver M.H., Coenjaerts F.E.J., van der Vlied P.C. (1990). The autoantigen Ku is indistinguishable from NF IV, a protein forming multimeric protein-DNA complexes. J. Exp. Med. 172: 1049—1054. PMID 2212941 DOI:10.1084/jem.172.4.1049
  • Cao Q.P., Pitt S., Leszyk J., Baril E.F. (1994). DNA-dependent ATPase from HeLa cells is related to human Ku autoantigen. Biochemistry. 33: 8548—8557. PMID 8031790 DOI:10.1021/bi00194a021
  • Chan D.W., Ye R., Veillette C.J., Lees-Miller S.P. (1999). DNA-dependent protein kinase phosphorylation sites in Ku 70/80 heterodimer. Biochemistry. 38: 1819—1828. PMID 10026262 DOI:10.1021/bi982584b
  • Wang H., Fang R., Cho J.-Y., Libermann T.A., Oettgen P. (2004). Positive and negative modulation of the transcriptional activity of the ETS factor ESE-1 through interaction with p300, CREB-binding protein, and Ku 70/86. J. Biol. Chem. 279: 25241—25250. PMID 15075319 DOI:10.1074/jbc.M401356200

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 11 травня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

Ku80 angl X ray repair cross complementing 5 bilok yakij koduyetsya genom XRCC5 roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 2 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 732 aminokislot a molekulyarna masa 82 705 Razom z Ku70 formuyut geterodimerXRCC5Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1JEQ 1JEY 1Q2Z 1RW2 3RZ9IdentifikatoriSimvoliXRCC5 KARP 1 KARP1 KU80 KUB2 Ku86 NFIV Ku80 X ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5 X ray repair cross complementing 5Zovnishni ID OMIM 194364 MGI 104517 HomoloGene 40681 GeneCards XRCC5Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding nucleotide binding double stranded telomeric DNA binding telomeric DNA binding GO 0008026 helicase activity 5 deoxyribose 5 phosphate lyase activity GO 0004003 DNA helicase activity hydrolase activity acting on acid anhydrides protein C terminus binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding hydrolase activity ATP binding ubiquitin protein ligase binding double stranded DNA binding damaged DNA binding RNA binding GO 0010577 enzyme activator activity GO 0032403 protein containing complex binding DNA end bindingKlitinna komponenta citoplazma gialoplazma nuclear telomere cap complex membrana klitinna membrana nukleoplazma hromosoma yaderce nonhomologous end joining complex klitinne yadro extracellular region secretory granule lumen protein DNA complex Ku70 Ku80 complex GO 0009327 protein containing complex site of DNA damage RibonukleoproteyiniBiologichnij proces DNA recombination GO 0009373 regulation of transcription DNA templated regulation of smooth muscle cell proliferation transcription DNA templated cellular response to DNA damage stimulus positive regulation of neurogenesis hematopoietic stem cell differentiation double strand break repair negative regulation of t circle formation establishment of integrated proviral latency proliferaciya GO 0045996 negative regulation of transcription DNA templated positive regulation of type I interferon production cellular hyperosmotic salinity response GO 0100026 Reparaciya DNK DNA duplex unwinding brain development cellular response to fatty acid double strand break repair via nonhomologous end joining neutrophil degranulation cellular response to gamma radiation cellular response to X ray telomere maintenance regulation of telomere maintenance positive regulation of telomere maintenance via telomerase GO 0048554 positive regulation of catalytic activity positive regulation of protein kinase activity positive regulation of telomerase activity protein localization to chromosome telomeric region cellular response to leukemia inhibitory factor activation of innate immune response proces imunnoyi sistemi vrodzhenij imunitetDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez7520 22596Ensembl ENSG00000079246 ENSMUSG00000026187UniProt P13010 P27641RefSeq mRNK NM 021141NM 009533 NM 001357519 NM 001357520RefSeq bilok NP 066964NP 033559 NP 001344448 NP 001344449Lokus UCSC Hr 2 216 11 216 21 MbHr 1 72 35 72 43 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MVRSGNKAAVVLCMDVGFTMSNSIPGIESPFEQAKKVITMFVQRQVFAEN KDEIALVLFGTDGTDNPLSGGDQYQNITVHRHLMLPDFDLLEDIESKIQP GSQQADFLDALIVSMDVIQHETIGKKFEKRHIEIFTDLSSRFSKSQLDII IHSLKKCDISLQFFLPFSLGKEDGSGDRGDGPFRLGGHGPSFPLKGITEQ QKEGLEIVKMVMISLEGEDGLDEIYSFSESLRKLCVFKKIERHSIHWPCR LTIGSNLSIRIAAYKSILQERVKKTWTVVDAKTLKKEDIQKETVYCLNDD DETEVLKEDIIQGFRYGSDIVPFSKVDEEQMKYKSEGKCFSVLGFCKSSQ VQRRFFMGNQVLKVFAARDDEAAAVALSSLIHALDDLDMVAIVRYAYDKR ANPQVGVAFPHIKHNYECLVYVQLPFMEDLRQYMFSSLKNSKKYAPTEAQ LNAVDALIDSMSLAKKDEKTDTLEDLFPTTKIPNPRFQRLFQCLLHRALH PREPLPPIQQHIWNMLNPPAEVTTKSQIPLSKIKTLFPLIEAKKKDQVTA QEIFQDNHEDGPTAKKLKTEQGGAHFSVSSLAEGSVTSVGSVNPAENFRV LVKQKKASFEEASNQLINHIEQFLDTNETPYFMKSIDCIRAFREEAIKFS EEQRFNNFLKALQEKVEIKQLNHFWEIVVQDGITLITKEEASGSSVTAEE AKKFLAPKDKPSGDTAAVFEEGGDVDDLLDMI A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do gidrolaz aktivatoriv gelikaz Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi poshkodzhennya DNK reparaciya DNK rekombinaciya DNK Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ATF nukleotidami DNK Lokalizovanij u yadri hromosomah LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Oderwald H Hughes M J Jost J P 1996 Non histone protein 1 NHP1 is a member of the Ku protein family which is upregulated in differentiating mouse myoblasts and human promyelocytes FEBS Lett 382 313 318 PMID 8605992 DOI 10 1016 0014 5793 96 00189 5 Stuiver M H Coenjaerts F E J van der Vlied P C 1990 The autoantigen Ku is indistinguishable from NF IV a protein forming multimeric protein DNA complexes J Exp Med 172 1049 1054 PMID 2212941 DOI 10 1084 jem 172 4 1049 Cao Q P Pitt S Leszyk J Baril E F 1994 DNA dependent ATPase from HeLa cells is related to human Ku autoantigen Biochemistry 33 8548 8557 PMID 8031790 DOI 10 1021 bi00194a021 Chan D W Ye R Veillette C J Lees Miller S P 1999 DNA dependent protein kinase phosphorylation sites in Ku 70 80 heterodimer Biochemistry 38 1819 1828 PMID 10026262 DOI 10 1021 bi982584b Wang H Fang R Cho J Y Libermann T A Oettgen P 2004 Positive and negative modulation of the transcriptional activity of the ETS factor ESE 1 through interaction with p300 CREB binding protein and Ku 70 86 J Biol Chem 279 25241 25250 PMID 15075319 DOI 10 1074 jbc M401356200PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 28 travnya 2017 Procitovano 6 lyutogo 2017 angl Arhiv originalu za 11 travnya 2017 Procitovano 6 lyutogo 2017 Div takozhHromosoma 2 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ