VPS33B (англ. VPS33B, late endosome and lysosome associated) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 617 амінокислот, а молекулярна маса — 70 585.
VPS33B | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | VPS33B, late endosome and lysosome associated, VPS33B late endosome and lysosome associated | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 608552 MGI: 2446237 HomoloGene: 10261 GeneCards: VPS33B | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
arthrogryposis–renal dysfunction–cholestasis syndrome | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 15: 91 – 91.02 Mb | Хр. 7: 79.92 – 79.94 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAFPHRPDAP | ELPDFSMLKR | LARDQLIYLL | EQLPGKKDLF | IEADLMSPLD | ||||
RIANVSILKQ | HEVDKLYKVE | NKPALSSNEQ | LCFLVRPRIK | NMRYIASLVN | ||||
ADKLAGRTRK | YKVIFSPQKF | YACEMVLEEE | GIYGDVSCDE | WAFSLLPLDV | ||||
DLLSMELPEF | FRDYFLEGDQ | RWINTVAQAL | HLLSTLYGPF | PNCYGIGRCA | ||||
KMAYELWRNL | EEEEDGETKG | RRPEIGHIFL | LDRDVDFVTA | LCSQVVYEGL | ||||
VDDTFRIKCG | SVDFGPEVTS | SDKSLKVLLN | AEDKVFNEIR | NEHFSNVFGF | ||||
LSQKARNLQA | QYDRRRGMDI | KQMKNFVSQE | LKGLKQEHRL | LSLHIGACES | ||||
IMKKKTKQDF | QELIKTEHAL | LEGFNIREST | SYIEEHIDRQ | VSPIESLRLM | ||||
CLLSITENGL | IPKDYRSLKT | QYLQSYGPEH | LLTFSNLRRA | GLLTEQAPGD | ||||
TLTAVESKVS | KLVTDKAAGK | ITDAFSSLAK | RSNFRAISKK | LNLIPRVDGE | ||||
YDLKVPRDMA | YVFGGAYVPL | SCRIIEQVLE | RRSWQGLDEV | VRLLNCSDFA | ||||
FTDMTKEDKA | SSESLRLILV | VFLGGCTFSE | ISALRFLGRE | KGYRFIFLTT | ||||
AVTNSARLME | AMSEVKA |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, ендосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Bach H., Papavinasasundaram K.G., Wong D., Hmama Z., Av-Gay Y. (2008). Mycobacterium tuberculosis virulence is mediated by PtpA dephosphorylation of human vacuolar protein sorting 33B. Cell Host Microbe. 3: 316—322. PMID 18474358 DOI:10.1016/j.chom.2008.03.008
- Zlatic S.A., Tornieri K., L'Hernault S.W., Faundez V. (2011). Clathrin-dependent mechanisms modulate the subcellular distribution of class C Vps/HOPS tether subunits in polarized and nonpolarized cells. Mol. Biol. Cell. 22: 1699—1715. PMID 21411634 DOI:10.1091/mbc.E10-10-0799
- Carim-Todd L., Sumoy L., Andreu N., Estivill X., Escarceller M. (2000). Cloning, mapping and expression analysis of VPS33B, the human orthologue of rat Vps33b. Cytogenet. Cell Genet. 89: 92—95. PMID 10894945
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з VPS33B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
VPS33B angl VPS33B late endosome and lysosome associated bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 15 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 617 aminokislot a molekulyarna masa 70 585 VPS33BIdentifikatoriSimvoliVPS33B late endosome and lysosome associated VPS33B late endosome and lysosome associatedZovnishni ID OMIM 608552 MGI 2446237 HomoloGene 10261 GeneCards VPS33BPov yazani genetichni zahvoryuvannyaarthrogryposis renal dysfunction cholestasis syndrome Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0001948 GO 0016582 protein bindingKlitinna komponenta citoplazma HOPS complex platelet alpha granule recycling endosome AP 3 adaptor complex endosoma late endosome early endosome membrane membrana late endosome membrane Klatrin lysosomal membrane early endosome perinuclear region of cytoplasm lizosoma GO 0016023 cytoplasmic vesicle clathrin coated vesicleBiologichnij proces megakaryocyte development endosome to lysosome transport platelet alpha granule organization membrane fusion melanosome localization endosome organization vesicle docking involved in exocytosis GO 0000046 autophagosome maturation lysosome localization GO 0015915 transport protein transport vesicle mediated transport regulation of platelet aggregationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez26276 233405Ensembl ENSG00000184056 ENSMUSG00000030534UniProt Q9H267 P59016RefSeq mRNK NM 001289148 NM 001289149 NM 018668NM 178070RefSeq bilok NP 001276077 NP 001276078 NP 061138NP 835171Lokus UCSC Hr 15 91 91 02 MbHr 7 79 92 79 94 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MAFPHRPDAPELPDFSMLKRLARDQLIYLLEQLPGKKDLFIEADLMSPLD RIANVSILKQHEVDKLYKVENKPALSSNEQLCFLVRPRIKNMRYIASLVN ADKLAGRTRKYKVIFSPQKFYACEMVLEEEGIYGDVSCDEWAFSLLPLDV DLLSMELPEFFRDYFLEGDQRWINTVAQALHLLSTLYGPFPNCYGIGRCA KMAYELWRNLEEEEDGETKGRRPEIGHIFLLDRDVDFVTALCSQVVYEGL VDDTFRIKCGSVDFGPEVTSSDKSLKVLLNAEDKVFNEIRNEHFSNVFGF LSQKARNLQAQYDRRRGMDIKQMKNFVSQELKGLKQEHRLLSLHIGACES IMKKKTKQDFQELIKTEHALLEGFNIRESTSYIEEHIDRQVSPIESLRLM CLLSITENGLIPKDYRSLKTQYLQSYGPEHLLTFSNLRRAGLLTEQAPGD TLTAVESKVSKLVTDKAAGKITDAFSSLAKRSNFRAISKKLNLIPRVDGE YDLKVPRDMAYVFGGAYVPLSCRIIEQVLERRSWQGLDEVVRLLNCSDFA FTDMTKEDKASSESLRLILVVFLGGCTFSEISALRFLGREKGYRFIFLTT AVTNSARLMEAMSEVKA A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transport transport bilkiv acetilyuvannya alternativnij splajsing Lokalizovanij u membrani citoplazmatichnih vezikulah lizosomi endosomah LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Bach H Papavinasasundaram K G Wong D Hmama Z Av Gay Y 2008 Mycobacterium tuberculosis virulence is mediated by PtpA dephosphorylation of human vacuolar protein sorting 33B Cell Host Microbe 3 316 322 PMID 18474358 DOI 10 1016 j chom 2008 03 008 Zlatic S A Tornieri K L Hernault S W Faundez V 2011 Clathrin dependent mechanisms modulate the subcellular distribution of class C Vps HOPS tether subunits in polarized and nonpolarized cells Mol Biol Cell 22 1699 1715 PMID 21411634 DOI 10 1091 mbc E10 10 0799 Carim Todd L Sumoy L Andreu N Estivill X Escarceller M 2000 Cloning mapping and expression analysis of VPS33B the human orthologue of rat Vps33b Cytogenet Cell Genet 89 92 95 PMID 10894945PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z VPS33B pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 10 veresnya 2015 Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 14 lipnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 15 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi