Валозін-вмісний білок (англ. Valosin containing protein) — білок, який кодується геном VCP, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 806 амінокислот, а молекулярна маса — 89 322.
Валозін-вмісний білок | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | VCP, ALS14, HEL-220, HEL-S-70, IBMPFD, IBMPFD1, TERA, p97, Valosin-containing protein, CMT2Y, valosin containing protein, CDC48, FTDALS6 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 601023 MGI: 99919 HomoloGene: 5168 GeneCards: VCP | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
amyotrophic lateral sclerosis type 14, Charcot-Marie-Tooth disease type 2Y, inclusion body myopathy with Paget disease of bone and frontotemporal dementia, familial amyotrophic lateral sclerosis, бічний аміотрофічний склероз | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 9: 35.05 – 35.07 Mb | Хр. 4: 42.98 – 43 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MASGADSKGD | DLSTAILKQK | NRPNRLIVDE | AINEDNSVVS | LSQPKMDELQ | ||||
LFRGDTVLLK | GKKRREAVCI | VLSDDTCSDE | KIRMNRVVRN | NLRVRLGDVI | ||||
SIQPCPDVKY | GKRIHVLPID | DTVEGITGNL | FEVYLKPYFL | EAYRPIRKGD | ||||
IFLVRGGMRA | VEFKVVETDP | SPYCIVAPDT | VIHCEGEPIK | REDEEESLNE | ||||
VGYDDIGGCR | KQLAQIKEMV | ELPLRHPALF | KAIGVKPPRG | ILLYGPPGTG | ||||
KTLIARAVAN | ETGAFFFLIN | GPEIMSKLAG | ESESNLRKAF | EEAEKNAPAI | ||||
IFIDELDAIA | PKREKTHGEV | ERRIVSQLLT | LMDGLKQRAH | VIVMAATNRP | ||||
NSIDPALRRF | GRFDREVDIG | IPDATGRLEI | LQIHTKNMKL | ADDVDLEQVA | ||||
NETHGHVGAD | LAALCSEAAL | QAIRKKMDLI | DLEDETIDAE | VMNSLAVTMD | ||||
DFRWALSQSN | PSALRETVVE | VPQVTWEDIG | GLEDVKRELQ | ELVQYPVEHP | ||||
DKFLKFGMTP | SKGVLFYGPP | GCGKTLLAKA | IANECQANFI | SIKGPELLTM | ||||
WFGESEANVR | EIFDKARQAA | PCVLFFDELD | SIAKARGGNI | GDGGGAADRV | ||||
INQILTEMDG | MSTKKNVFII | GATNRPDIID | PAILRPGRLD | QLIYIPLPDE | ||||
KSRVAILKAN | LRKSPVAKDV | DLEFLAKMTN | GFSGADLTEI | CQRACKLAIR | ||||
ESIESEIRRE | RERQTNPSAM | EVEEDDPVPE | IRRDHFEEAM | RFARRSVSDN | ||||
DIRKYEMFAQ | TLQQSRGFGS | FRFPSGNQGG | AGPSQGSGGG | TGGSVYTEDN | ||||
DDDLYG |
Цей білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, автофагія. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендоплазматичному ретикулумі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Pleasure I.T., Black M.M., Keen J.H. (1993). Valosin-containing protein, VCP, is a ubiquitous clathrin-binding protein. Nature. 365: 459—462. PMID 8413590 DOI:10.1038/365459a0
- Cloutier P., Lavallee-Adam M., Faubert D., Blanchette M., Coulombe B. (2013). A newly uncovered group of distantly related lysine methyltransferases preferentially interact with molecular chaperones to regulate their activity. PLoS Genet. 9: E1003210—E1003210. PMID 23349634 DOI:10.1371/journal.pgen.1003210
- McNeill H., Knebel A., Arthur J.S., Cuenda A., Cohen P. (2004). A novel UBA and UBX domain protein that binds polyubiquitin and VCP and is a substrate for SAPKs. Biochem. J. 384: 391—400. PMID 15362974 DOI:10.1042/BJ20041498
- Ye Y., Shibata Y., Yun C., Ron D., Rapoport T.A. (2004). A membrane protein complex mediates retro-translocation from the ER lumen into the cytosol. Nature. 429: 841—847. PMID 15215856 DOI:10.1038/nature02656
- Song B.L., Sever N., DeBose-Boyd R.A. (2005). Gp78, a membrane-anchored ubiquitin ligase, associates with Insig-1 and couples sterol-regulated ubiquitination to degradation of HMG CoA reductase. Mol. Cell. 19: 829—840. PMID 16168377 DOI:10.1016/j.molcel.2005.08.009
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з Валозін-вмісний білок переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 10 жовтня 2017. Процитовано 30 січня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 31 грудня 2016. Процитовано 30 січня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Valozin vmisnij bilok angl Valosin containing protein bilok yakij koduyetsya genom VCP roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 9 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 806 aminokislot a molekulyarna masa 89 322 Valozin vmisnij bilokNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB3EBB 3HU1 3HU2 3HU3 3QC8 3QQ7 3QQ8 3QWZ 3TIW 4KDI 4KDL 4KLN 4KO8 4KOD 4P0A 5C19 3CF2 3CF1 5FTK 5C18 3CF3 5FTJ 5FTM 5FTL 5FTN 5C1B 5C1A 5DYI 5DYGIdentifikatoriSimvoliVCP ALS14 HEL 220 HEL S 70 IBMPFD IBMPFD1 TERA p97 Valosin containing protein CMT2Y valosin containing protein CDC48 FTDALS6Zovnishni ID OMIM 601023 MGI 99919 HomoloGene 5168 GeneCards VCPPov yazani genetichni zahvoryuvannyaamyotrophic lateral sclerosis type 14 Charcot Marie Tooth disease type 2Y inclusion body myopathy with Paget disease of bone and frontotemporal dementia familial amyotrophic lateral sclerosis bichnij amiotrofichnij skleroz Ontologiya genaMolekulyarna funkciya nucleotide binding protein domain specific binding GO 0032403 protein containing complex binding ADP binding K48 linked polyubiquitin modification dependent protein binding polyubiquitin modification dependent protein binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding ubiquitin like protein ligase binding ubiquitin specific protease binding MHC class I protein binding protein phosphatase binding deubiquitinase activator activity signaling receptor binding hydrolase activity ATP binding ubiquitin protein ligase binding lipid binding identical protein binding ATPase activity RNA binding BAT3 complex bindingKlitinna komponenta site of double strand break gialoplazma vnutrishnoklitinna membranna organela myelin sheath lipid droplet nukleoplazma VCP NSFL1C complex endoplazmatichnij retikulum Derlin 1 retrotranslocation complex VCP NPL4 UFD1 AAA ATPase complex perinuclear region of cytoplasm Proteasoma klitinne yadro ekzosoma extracellular region secretory granule lumen azurophil granule lumen ficolin 1 rich granule lumen ATPase complex endoplasmic reticulum membrane citoplazma cytoplasmic stress granule GO 0009327 protein containing complex sinaps glutamatergic synapseBiologichnij proces regulation of aerobic respiration regulation of apoptotic process GO 1903364 positive regulation of protein catabolic process positive regulation of protein containing complex assembly ubiquitin dependent protein catabolic process positive regulation of Lys63 specific deubiquitinase activity establishment of protein localization error free translesion synthesis viral genome replication positive regulation of oxidative phosphorylation ER associated misfolded protein catabolic process protein N linked glycosylation via asparagine cellular response to DNA damage stimulus positive regulation of ATP biosynthetic process endoplasmic reticulum to Golgi vesicle mediated transport ATP metabolic process retrograde protein transport ER to cytosol NADH metabolic process positive regulation of protein K63 linked deubiquitination double strand break repair ubiquitin dependent ERAD pathway positive regulation of mitochondrial membrane potential activation of cysteine type endopeptidase activity involved in apoptotic process protein homooligomerization positive regulation of proteasomal ubiquitin dependent protein catabolic process protein hexamerization aggresome assembly flavin adenine dinucleotide catabolic process proteasome mediated ubiquitin dependent protein catabolic process avtofagiya GO 0100026 Reparaciya DNK ERAD pathway positive regulation of ubiquitin specific protease activity GO 0000046 autophagosome maturation translesion synthesis zgortannya bilkiv Metilyuvannya bilkiv protein deubiquitination neutrophil degranulation transmembrannij transport proteasomal protein catabolic process Ubikvitin zalezhnij proteoliz Vidpovid na nezgornuti bilki endoplasmic reticulum stress induced pre emptive quality control macroautophagy endosome to lysosome transport via multivesicular body sorting pathway GO 0015915 transport cellular response to heat stress granule disassembly GO 1904739 regulation of synapse organization mitotic spindle disassembly positive regulation of canonical Wnt signaling pathway cellular response to arsenite ionDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez7415 269523Ensembl ENSG00000165280 ENSMUSG00000028452UniProt P55072 Q01853RefSeq mRNK NM 007126 NM 001354927 NM 001354928NM 009503RefSeq bilok NP 009057 NP 001341856 NP 001341857NP 033529Lokus UCSC Hr 9 35 05 35 07 MbHr 4 42 98 43 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQ LFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVI SIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGD IFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNE VGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTG KTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAI IFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRP NSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVA NETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMD DFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHP DKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTM WFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRV INQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDE KSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIR ESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDN DIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDN DDDLYG A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Cej bilok za funkciyeyu nalezhit do gidrolaz Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transport poshkodzhennya DNK reparaciya DNK ubikvitinuvannya bilkiv avtofagiya Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ATF nukleotidami lipidami Lokalizovanij u citoplazmi yadri endoplazmatichnomu retikulumi LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Pleasure I T Black M M Keen J H 1993 Valosin containing protein VCP is a ubiquitous clathrin binding protein Nature 365 459 462 PMID 8413590 DOI 10 1038 365459a0 Cloutier P Lavallee Adam M Faubert D Blanchette M Coulombe B 2013 A newly uncovered group of distantly related lysine methyltransferases preferentially interact with molecular chaperones to regulate their activity PLoS Genet 9 E1003210 E1003210 PMID 23349634 DOI 10 1371 journal pgen 1003210 McNeill H Knebel A Arthur J S Cuenda A Cohen P 2004 A novel UBA and UBX domain protein that binds polyubiquitin and VCP and is a substrate for SAPKs Biochem J 384 391 400 PMID 15362974 DOI 10 1042 BJ20041498 Ye Y Shibata Y Yun C Ron D Rapoport T A 2004 A membrane protein complex mediates retro translocation from the ER lumen into the cytosol Nature 429 841 847 PMID 15215856 DOI 10 1038 nature02656 Song B L Sever N DeBose Boyd R A 2005 Gp78 a membrane anchored ubiquitin ligase associates with Insig 1 and couples sterol regulated ubiquitination to degradation of HMG CoA reductase Mol Cell 19 829 840 PMID 16168377 DOI 10 1016 j molcel 2005 08 009PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z Valozin vmisnij bilok pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 10 zhovtnya 2017 Procitovano 30 sichnya 2017 angl Arhiv originalu za 31 grudnya 2016 Procitovano 30 sichnya 2017 Div takozhHromosoma 9 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi