U2AF2 (англ. U2 small nuclear RNA auxiliary factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 475 амінокислот, а молекулярна маса — 53 501.
U2AF2 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | U2AF2, U2AF65, U2 small nuclear RNA auxiliary factor 2 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 191318 MGI: 98886 HomoloGene: 110853 GeneCards: U2AF2 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 19: 55.65 – 55.67 Mb | Хр. 7: 5.06 – 5.08 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSDFDEFERQ | LNENKQERDK | ENRHRKRSHS | RSRSRDRKRR | SRSRDRRNRD | ||||
QRSASRDRRR | RSKPLTRGAK | EEHGGLIRSP | RHEKKKKVRK | YWDVPPPGFE | ||||
HITPMQYKAM | QAAGQIPATA | LLPTMTPDGL | AVTPTPVPVV | GSQMTRQARR | ||||
LYVGNIPFGI | TEEAMMDFFN | AQMRLGGLTQ | APGNPVLAVQ | INQDKNFAFL | ||||
EFRSVDETTQ | AMAFDGIIFQ | GQSLKIRRPH | DYQPLPGMSE | NPSVYVPGVV | ||||
STVVPDSAHK | LFIGGLPNYL | NDDQVKELLT | SFGPLKAFNL | VKDSATGLSK | ||||
GYAFCEYVDI | NVTDQAIAGL | NGMQLGDKKL | LVQRASVGAK | NATLVSPPST | ||||
INQTPVTLQV | PGLMSSQVQM | GGHPTEVLCL | MNMVLPEELL | DDEEYEEIVE | ||||
DVRDECSKYG | LVKSIEIPRP | VDGVEVPGCG | KIFVEFTSVF | DCQKAMQGLT | ||||
GRKFANRVVV | TKYCDPDSYH | RRDFW |
Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Zamore P.D., Patton J.G., Green M.R. (1992). Cloning and domain structure of the mammalian splicing factor U2AF. Nature. 355: 609—614. PMID 1538748 DOI:10.1038/355609a0
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Rappsilber J., Ryder U., Lamond A.I., Mann M. (2002). Large-scale proteomic analysis of the human spliceosome. Genome Res. 12: 1231—1245. PMID 12176931 DOI:10.1101/gr.473902
- Tronchere H., Wang J., Fu X.D. (1997). A protein related to splicing factor U2AF35 that interacts with U2AF65 and SR proteins in splicing of pre-mRNA. Nature. 388: 397—400. PMID 9237760 DOI:10.1038/41137
- Zhang W.-J., Wu J.Y. (1998). Sip1, a novel RS domain-containing protein essential for pre-mRNA splicing. Mol. Cell. Biol. 18: 676—684. PMID 9447963 DOI:10.1128/MCB.18.2.676
- Warf M.B., Diegel J.V., von Hippel P.H., Berglund J.A. (2009). The protein factors MBNL1 and U2AF65 bind alternative RNA structures to regulate splicing. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106: 9203—9208. PMID 19470458 DOI:10.1073/pnas.0900342106
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23156 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 22 липня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до . |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
U2AF2 angl U2 small nuclear RNA auxiliary factor 2 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 19 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 475 aminokislot a molekulyarna masa 53 501 U2AF2Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSBSpisok kodiv PDB1JMT 1O0P 1OPI 1U2F 2G4B 2HZC 2M0G 2U2F 2YH0 2YH1 3VAF 3VAG 3VAH 3VAI 3VAJ 3VAK 3VAL 3VAM 4FXW 4TU7 4TU8 4TU9 5EV1 5EV3 5EV4 5EV2IdentifikatoriSimvoliU2AF2 U2AF65 U2 small nuclear RNA auxiliary factor 2Zovnishni ID OMIM 191318 MGI 98886 HomoloGene 110853 GeneCards U2AF2Ontologiya genaMolekulyarna funkciya pre mRNA 3 splice site binding poly pyrimidine tract binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding nucleic acid binding enzyme binding C2H2 zinc finger domain binding RNA bindingKlitinna komponenta nuclear speck U2AF complex Prp19 complex spliceosomal complex commitment complex U2 type prespliceosome klitinne yadro nukleoplazmaBiologichnij proces mRNA splicing via spliceosome termination of RNA polymerase II transcription positive regulation of protein targeting to mitochondrion mRNA processing mRNA export from nucleus negative regulation of mRNA splicing via spliceosome regulation of autophagy of mitochondrion positive regulation of RNA splicing mRNA 3 end processing Splajsing RNK RNA export from nucleus negative regulation of protein ubiquitinationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez11338 22185Ensembl ENSG00000063244 ENSMUSG00000030435UniProt P26368 P26369RefSeq mRNK NM 001012478 NM 007279NM 001205231 NM 133671RefSeq bilok NP 001012496 NP 009210NP 001192160 NP 598432 NP 001390074 NP 001390075 NP 001390076NP 001390077 NP 001390078 NP 001390079 NP 001390080 NP 001390083 NP 001390084 NP 001390085 NP 001390087 NP 001390088 NP 001390082Lokus UCSC Hr 19 55 65 55 67 MbHr 7 5 06 5 08 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishejPoslidovnist aminokislot1020304050MSDFDEFERQLNENKQERDKENRHRKRSHSRSRSRDRKRRSRSRDRRNRDQRSASRDRRRRSKPLTRGAKEEHGGLIRSPRHEKKKKVRKYWDVPPPGFEHITPMQYKAMQAAGQIPATALLPTMTPDGLAVTPTPVPVVGSQMTRQARRLYVGNIPFGITEEAMMDFFNAQMRLGGLTQAPGNPVLAVQINQDKNFAFLEFRSVDETTQAMAFDGIIFQGQSLKIRRPHDYQPLPGMSENPSVYVPGVVSTVVPDSAHKLFIGGLPNYLNDDQVKELLTSFGPLKAFNLVKDSATGLSKGYAFCEYVDINVTDQAIAGLNGMQLGDKKLLVQRASVGAKNATLVSPPSTINQTPVTLQVPGLMSSQVQMGGHPTEVLCLMNMVLPEELLDDEEYEEIVEDVRDECSKYGLVKSIEIPRPVDGVEVPGCGKIFVEFTSVFDCQKAMQGLTGRKFANRVVVTKYCDPDSYHRRDFWA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do represoriv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak procesing mRNK splajsing mRNK Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z RNK Lokalizovanij u yadri LiteraturaZamore P D Patton J G Green M R 1992 Cloning and domain structure of the mammalian splicing factor U2AF Nature 355 609 614 PMID 1538748 DOI 10 1038 355609a0 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Rappsilber J Ryder U Lamond A I Mann M 2002 Large scale proteomic analysis of the human spliceosome Genome Res 12 1231 1245 PMID 12176931 DOI 10 1101 gr 473902 Tronchere H Wang J Fu X D 1997 A protein related to splicing factor U2AF35 that interacts with U2AF65 and SR proteins in splicing of pre mRNA Nature 388 397 400 PMID 9237760 DOI 10 1038 41137 Zhang W J Wu J Y 1998 Sip1 a novel RS domain containing protein essential for pre mRNA splicing Mol Cell Biol 18 676 684 PMID 9447963 DOI 10 1128 MCB 18 2 676 Warf M B Diegel J V von Hippel P H Berglund J A 2009 The protein factors MBNL1 and U2AF65 bind alternative RNA structures to regulate splicing Proc Natl Acad Sci U S A 106 9203 9208 PMID 19470458 DOI 10 1073 pnas 0900342106PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 23156 angl Procitovano 22 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 22 lipnya 2017 Procitovano 22 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 19Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Na cyu stattyu ne posilayutsya inshi statti Vikipediyi Bud laska rozstavte posilannya vidpovidno do prijnyatih rekomendacij