TYMS (англ. Thymidylate synthetase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 313 амінокислот, а молекулярна маса — 35 716.
TYMS | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | TYMS, HST422, TMS, TS, thymidylate synthetase | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 188350 MGI: 98878 HomoloGene: 834 GeneCards: TYMS | ||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
Капецитабін, pemetrexed, raltitrexed | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 18: 0.66 – 0.67 Mb | Хр. 5: 30.26 – 30.28 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MPVAGSELPR | RPLPPAAQER | DAEPRPPHGE | LQYLGQIQHI | LRCGVRKDDR | ||||
TGTGTLSVFG | MQARYSLRDE | FPLLTTKRVF | WKGVLEELLW | FIKGSTNAKE | ||||
LSSKGVKIWD | ANGSRDFLDS | LGFSTREEGD | LGPVYGFQWR | HFGAEYRDME | ||||
SDYSGQGVDQ | LQRVIDTIKT | NPDDRRIIMC | AWNPRDLPLM | ALPPCHALCQ | ||||
FYVVNSELSC | QLYQRSGDMG | LGVPFNIASY | ALLTYMIAHI | TGLKPGDFIH | ||||
TLGDAHIYLN | HIEPLKIQLQ | REPRPFPKLR | ILRKVEKIDD | FKAEDFQIEG | ||||
YNPHPTIKME | MAV |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, мітохондрії, внутрішній мембрані мітохондрії.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Anderson D.D., Quintero C.M., Stover P.J. (2011). Identification of a de novo thymidylate biosynthesis pathway in mammalian mitochondria. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 15163—15168. PMID 21876188 DOI:10.1073/pnas.1103623108
- Schiffer C.A., Clifton I.J., Davisson V.J., Santi D.V., Stroud R.M. (1995). Crystal structure of human thymidylate synthase: a structural mechanism for guiding substrates into the active site. Biochemistry. 34: 16279—16287. PMID 8845352 DOI:10.1021/bi00050a007
- Shimizu K., Ayusawa D., Takeishi K., Seno T. (1985). Purification and NH2-terminal amino acid sequence of human thymidylate synthase in an overproducing transformant of mouse FM3A cells. J. Biochem. 97: 845—850. PMID 3839505
- Davisson V.J., Sirawaraporn W., Santi D.V. (1989). Expression of human thymidylate synthase in Escherichia coli. J. Biol. Chem. 264: 9145—9148. PMID 2656695
Примітки
- Сполуки, які фізично взаємодіють з TYMS переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12441 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
TYMS angl Thymidylate synthetase bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 18 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 313 aminokislot a molekulyarna masa 35 716 TYMSNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1YPV 1JU6 2RDA 3EF9 3ED7 1HW3 3EHI 3GH0 4JEF 4O1X 1HZW 3EAW 3OB7 3EBU 4KPW 3EGY 3EJL 3N5G 3N5E 1HVY 4GD7 4G2O 4H1I 2ONB 3H9K 4GYH 3HB8 1I00 3GG5 4FGT 2RD8 3EDW 4G6W 1HW4 3GH2 4E28 1JUJ 4O1U 4UP1 5HS3 s1HW3 1YPV 4GD7 2ONBIdentifikatoriSimvoliTYMS HST422 TMS TS thymidylate synthetaseZovnishni ID OMIM 188350 MGI 98878 HomoloGene 834 GeneCards TYMSReaguye na spolukuKapecitabin pemetrexed raltitrexed Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0102674 GO 0102675 methyltransferase activity transferase activity nucleotide binding protein homodimerization activity folic acid binding thymidylate synthase activity mRNA binding translation repressor activity mRNA regulatory element binding sequence specific mRNA bindingKlitinna komponenta citoplazma gialoplazma membrana mitohondrialnij matriks yaderce mitohondriya mitohondrialna vnutrishnya membrana klitinne yadroBiologichnij proces response to cytokine nucleotide biosynthetic process DNA biosynthetic process GO 1904578 response to organic cyclic compound response to progesterone tetrahydrofolate interconversion GO 0010260 starinnya lyudini response to glucocorticoid regulation of transcription involved in G1 S transition of mitotic cell cycle dTTP biosynthetic process tetrahydrofolate metabolic process response to vitamin A cartilage development Metilyuvannya developmental growth response to organophosphorus cirkadnij ritm uracil metabolic process dTMP biosynthetic process intestinal epithelial cell maturation dUMP metabolic process response to folic acid response to ethanol response to toxic substance pyrimidine nucleobase metabolic process regulation of translation liver regeneration nucleobase containing small molecule interconversion negative regulation of translationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez7298 22171Ensembl ENSG00000176890 ENSMUSG00000025747UniProt P04818 Q53Y97 P07607RefSeq mRNK NM 001071 NM 001354867 NM 001354868NM 021288RefSeq bilok NP 001062 NP 001341796 NP 001341797 NP 001062 1NP 067263Lokus UCSC Hr 18 0 66 0 67 MbHr 5 30 26 30 28 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MPVAGSELPRRPLPPAAQERDAEPRPPHGELQYLGQIQHILRCGVRKDDR TGTGTLSVFGMQARYSLRDEFPLLTTKRVFWKGVLEELLWFIKGSTNAKE LSSKGVKIWDANGSRDFLDSLGFSTREEGDLGPVYGFQWRHFGAEYRDME SDYSGQGVDQLQRVIDTIKTNPDDRRIIMCAWNPRDLPLMALPPCHALCQ FYVVNSELSCQLYQRSGDMGLGVPFNIASYALLTYMIAHITGLKPGDFIH TLGDAHIYLNHIEPLKIQLQREPRPFPKLRILRKVEKIDDFKAEDFQIEG YNPHPTIKMEMAV A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do transferaz metiltransferaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak alternativnij splajsing Lokalizovanij u citoplazmi yadri membrani mitohondriyi vnutrishnij membrani mitohondriyi LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Anderson D D Quintero C M Stover P J 2011 Identification of a de novo thymidylate biosynthesis pathway in mammalian mitochondria Proc Natl Acad Sci U S A 108 15163 15168 PMID 21876188 DOI 10 1073 pnas 1103623108 Schiffer C A Clifton I J Davisson V J Santi D V Stroud R M 1995 Crystal structure of human thymidylate synthase a structural mechanism for guiding substrates into the active site Biochemistry 34 16279 16287 PMID 8845352 DOI 10 1021 bi00050a007 Shimizu K Ayusawa D Takeishi K Seno T 1985 Purification and NH2 terminal amino acid sequence of human thymidylate synthase in an overproducing transformant of mouse FM3A cells J Biochem 97 845 850 PMID 3839505 Davisson V J Sirawaraporn W Santi D V 1989 Expression of human thymidylate synthase in Escherichia coli J Biol Chem 264 9145 9148 PMID 2656695PrimitkiSpoluki yaki fizichno vzayemodiyut z TYMS pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 12441 angl Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 25 veresnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 18 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi