Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

TOPORS англ TOP1 binding arginine serine rich protein білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на кор

TOPORS

TOPORS

TOPORS (англ. TOP1 binding arginine/serine rich protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 045 амінокислот, а молекулярна маса — 119 198.

TOPORS
Ідентифікатори
Символи TOPORS, LUN, P53BP3, RP31, TP53BPL, TOP1 binding arginine/serine rich protein, TOP1 binding arginine/serine rich protein, E3 ubiquitin ligase
Зовнішні ІД OMIM: 609507 MGI: 2146189 HomoloGene: 4237 GeneCards: TOPORS
Пов'язані генетичні захворювання
retinitis pigmentosa 31
Шаблон експресії
image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
10210
106021
Ensembl
н/д
ENSMUSG00000036822
UniProt
Q9NS56
Q80Z37
RefSeq (мРНК)
NM_005802
NM_001195622
NM_134097
RefSeq (білок)
NP_001182551
NP_005793
NP_598858
Локус (UCSC) н/д Хр. 4: 40.26 – 40.27 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MGSQPPLGSPLSREEGEAPPPAPASEGRRRSRRVRLRGSCRHRPSFLGCR
ELAASAPARPAPASSEIMASAAKEFKMDNFSPKAGTSKLQQTVPADASPD
SKCPICLDRFDNVSYLDRCLHKFCFRCVQEWSKNKAECPLCKQPFDSIFH
SVRAEDDFKEYVLRPSYNGSFVTPDRRFRYRTTLTRERNASVYSPSGPVN
RRTTTPPDSGVLFEGLGISTRPRDVEIPQFMRQIAVRRPTTADERSLRKI
QEQDIINFRRTLYRAGARVRNIEDGGRYRDISAEFFRRNPACLHRLVPWL
KRELTVLFGAHGSLVNIVQHIIMSNVTRYDLESQAFVSDLRPFLLNRTEH
FIHEFISFARSPFNMAAFDQHANYDCPAPSYEEGSHSDSSVITISPDEAE
TQELDINVATVSQAPWDDETPGPSYSSSEQVHVTMSSLLNTSDSSDEELV
TGGATSQIQGVQTNDDLNNDSDDSSDNCVIVGFVKPLAERTPELVELSSD
SEDLGSYEKMETVKTQEQEQSYSSGDSDVSRCSSPHSVLGKDEQINKGHC
DSSTRIKSKKEEKRSTSLSSPRNLNSSVRGDRVYSPYNHRHRKRGRSRSS
DSRSQSRSGHDQKNHRKHHGKKRMKSKRSRSRESSRPRGRRDKKRSRTRD
SSWSRRSQTLSLSSESTSRSRSRSSDHGKRRSRSRNRDRYYLRNNYGSRY
KWEYTYYSRNKDRDGYESSYRRRTLSRAHYSRQSSSPEFRVQSFSERTNA
RKKNNHSERKYYYYERHRSRSLSSNRSRTASTGTDRVRNEKPGGKRKYKT
RHLEGTNEVAQPSREFASKAKDSHYQKSSSKLDGNYKNESDTFSDSRSSD
RETKHKRRKRKTRSLSVEIVYEGKATDTTKHHKKKKKKHKKKHKKHHGDN
ASRSPVVITIDSDSDKDSEVKEDTECDNSGPQDPLQNEFLAPSLEPFETK
DVVTIEAEFGVLDKECDIATLSNNLNNANKTVDNIPPLAASVEQTLDVRE
ESTFVSDLENQPSNIVSLQTEPSRQLPSPRTSLMSVCLGRDCDMS

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Zhou R., Wen H., Ao S.-Z. (1999). Identification of a novel gene encoding a p53-associated protein. Gene. 235: 93—101. PMID 10415337 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00203-6
  • Rasheed Z.A., Saleem A., Ravee Y., Pandolfi P.P., Rubin E.H. (2002). The topoisomerase I-binding RING protein, topors, is associated with promyelocytic leukemia nuclear bodies. Exp. Cell Res. 277: 152—160. PMID 12083797 DOI:10.1006/excr.2002.5550
  • Weger S., Hammer E., Engstler M. (2003). The DNA topoisomerase I binding protein topors as a novel cellular target for SUMO-1 modification: characterization of domains necessary for subcellular localization and sumolation. Exp. Cell Res. 290: 13—27. PMID 14516784 DOI:10.1016/S0014-4827(03)00292-1
  • Weger S., Hammer E., Heilbronn R. (2005). Topors acts as a SUMO-1 E3 ligase for p53 in vitro and in vivo. FEBS Lett. 579: 5007—5012. PMID 16122737 DOI:10.1016/j.febslet.2005.07.088
  • Renner F., Moreno R., Schmitz M.L. (2010). SUMOylation-dependent localization of IKKepsilon in PML nuclear bodies is essential for protection against DNA-damage-triggered cell death. Mol. Cell. 37: 503—515. PMID 20188669 DOI:10.1016/j.molcel.2010.01.018

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з TOPORS переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21653 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
  5. (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

TOPORS angl TOP1 binding arginine serine rich protein bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 9 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 045 aminokislot a molekulyarna masa 119 198 TOPORSIdentifikatoriSimvoliTOPORS LUN P53BP3 RP31 TP53BPL TOP1 binding arginine serine rich protein TOP1 binding arginine serine rich protein E3 ubiquitin ligaseZovnishni ID OMIM 609507 MGI 2146189 HomoloGene 4237 GeneCards TOPORSPov yazani genetichni zahvoryuvannyaretinitis pigmentosa 31 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0003823 GO 0051635 antigen binding DNA binding SUMO transferase activity GO 1904264 GO 1904822 GO 0090622 GO 0090302 ubiquitin protein ligase activity zv yazuvannya z ionom metalu GO 0050372 ubiquitin protein transferase activity DNA topoisomerase binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding transferase activityKlitinna komponenta ciliary basal body PML body nuclear speck spindle pole ubiquitin ligase complex gamma tubulin complex photoreceptor connecting cilium midbody cytoplasmic dynein complex Centriol klitinne yadro nukleoplazmaBiologichnij proces intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator retina layer formation ubiquitin dependent protein catabolic process protein polyubiquitination negative regulation of apoptotic process retinal cone cell development protein monoubiquitination photoreceptor cell outer segment organization protein sumoylation transcription DNA templated cellular response to DNA damage stimulus GO 0060469 GO 0009371 positive regulation of transcription DNA templated protein K48 linked ubiquitination regulation of cell population proliferation positive regulation of ubiquitin protein transferase activity retinal rod cell development intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage protein localization to nucleus maintenance of protein location in nucleus proteasome mediated ubiquitin dependent protein catabolic processDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez10210 106021Ensembl n d ENSMUSG00000036822UniProt Q9NS56 Q80Z37RefSeq mRNK NM 005802 NM 001195622NM 134097RefSeq bilok NP 001182551 NP 005793NP 598858Lokus UCSC n dHr 4 40 26 40 27 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MGSQPPLGSPLSREEGEAPPPAPASEGRRRSRRVRLRGSCRHRPSFLGCR ELAASAPARPAPASSEIMASAAKEFKMDNFSPKAGTSKLQQTVPADASPD SKCPICLDRFDNVSYLDRCLHKFCFRCVQEWSKNKAECPLCKQPFDSIFH SVRAEDDFKEYVLRPSYNGSFVTPDRRFRYRTTLTRERNASVYSPSGPVN RRTTTPPDSGVLFEGLGISTRPRDVEIPQFMRQIAVRRPTTADERSLRKI QEQDIINFRRTLYRAGARVRNIEDGGRYRDISAEFFRRNPACLHRLVPWL KRELTVLFGAHGSLVNIVQHIIMSNVTRYDLESQAFVSDLRPFLLNRTEH FIHEFISFARSPFNMAAFDQHANYDCPAPSYEEGSHSDSSVITISPDEAE TQELDINVATVSQAPWDDETPGPSYSSSEQVHVTMSSLLNTSDSSDEELV TGGATSQIQGVQTNDDLNNDSDDSSDNCVIVGFVKPLAERTPELVELSSD SEDLGSYEKMETVKTQEQEQSYSSGDSDVSRCSSPHSVLGKDEQINKGHC DSSTRIKSKKEEKRSTSLSSPRNLNSSVRGDRVYSPYNHRHRKRGRSRSS DSRSQSRSGHDQKNHRKHHGKKRMKSKRSRSRESSRPRGRRDKKRSRTRD SSWSRRSQTLSLSSESTSRSRSRSSDHGKRRSRSRNRDRYYLRNNYGSRY KWEYTYYSRNKDRDGYESSYRRRTLSRAHYSRQSSSPEFRVQSFSERTNA RKKNNHSERKYYYYERHRSRSLSSNRSRTASTGTDRVRNEKPGGKRKYKT RHLEGTNEVAQPSREFASKAKDSHYQKSSSKLDGNYKNESDTFSDSRSSD RETKHKRRKRKTRSLSVEIVYEGKATDTTKHHKKKKKKHKKKHKKHHGDN ASRSPVVITIDSDSDKDSEVKEDTECDNSGPQDPLQNEFLAPSLEPFETK DVVTIEAEFGVLDKECDIATLSNNLNNANKTVDNIPPLAASVEQTLDVRE ESTFVSDLENQPSNIVSLQTEPSRQLPSPRTSLMSVCLGRDCDMS A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do transferaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak poshkodzhennya DNK ubikvitinuvannya bilkiv alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku Lokalizovanij u yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Zhou R Wen H Ao S Z 1999 Identification of a novel gene encoding a p53 associated protein Gene 235 93 101 PMID 10415337 DOI 10 1016 S0378 1119 99 00203 6 Rasheed Z A Saleem A Ravee Y Pandolfi P P Rubin E H 2002 The topoisomerase I binding RING protein topors is associated with promyelocytic leukemia nuclear bodies Exp Cell Res 277 152 160 PMID 12083797 DOI 10 1006 excr 2002 5550 Weger S Hammer E Engstler M 2003 The DNA topoisomerase I binding protein topors as a novel cellular target for SUMO 1 modification characterization of domains necessary for subcellular localization and sumolation Exp Cell Res 290 13 27 PMID 14516784 DOI 10 1016 S0014 4827 03 00292 1 Weger S Hammer E Heilbronn R 2005 Topors acts as a SUMO 1 E3 ligase for p53 in vitro and in vivo FEBS Lett 579 5007 5012 PMID 16122737 DOI 10 1016 j febslet 2005 07 088 Renner F Moreno R Schmitz M L 2010 SUMOylation dependent localization of IKKepsilon in PML nuclear bodies is essential for protection against DNA damage triggered cell death Mol Cell 37 503 515 PMID 20188669 DOI 10 1016 j molcel 2010 01 018PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z TOPORS pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 21653 angl Procitovano 8 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 8 serpnya 2017 Procitovano 8 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 9 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ