TOP3A (англ. DNA topoisomerase III alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 001 амінокислот, а молекулярна маса — 112 372.
TOP3A | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | TOP3A, TOP3, ZGRF7, topoisomerase (DNA) III alpha, DNA topoisomerase III alpha, PEOB5, MGRISCE2 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 601243 MGI: 1197527 HomoloGene: 3394 GeneCards: TOP3A | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 17: 18.27 – 18.32 Mb | Хр. 11: 60.63 – 60.67 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MIFPVARYAL | RWLRRPEDRA | FSRAAMEMAL | RGVRKVLCVA | EKNDAAKGIA | ||||
DLLSNGRMRR | REGLSKFNKI | YEFDYHLYGQ | NVTMVMTSVS | GHLLAHDFQM | ||||
QFRKWQSCNP | LVLFEAEIEK | YCPENFVDIK | KTLERETRQC | QALVIWTDCD | ||||
REGENIGFEI | IHVCKAVKPN | LQVLRARFSE | ITPHAVRTAC | ENLTEPDQRV | ||||
SDAVDVRQEL | DLRIGAAFTR | FQTLRLQRIF | PEVLAEQLIS | YGSCQFPTLG | ||||
FVVERFKAIQ | AFVPEIFHRI | KVTHDHKDGI | VEFNWKRHRL | FNHTACLVLY | ||||
QLCVEDPMAT | VVEVRSKPKS | KWRPQALDTV | ELEKLASRKL | RINAKETMRI | ||||
AEKLYTQGYI | SYPRTETNIF | PRDLNLTVLV | EQQTPDPRWG | AFAQSILERG | ||||
GPTPRNGNKS | DQAHPPIHPT | KYTNNLQGDE | QRLYEFIVRH | FLACCSQDAQ | ||||
GQETTVEIDI | AQERFVAHGL | MILARNYLDV | YPYDHWSDKI | LPVYEQGSHF | ||||
QPSTVEMVDG | ETSPPKLLTE | ADLIALMEKH | GIGTDATHAE | HIETIKARMY | ||||
VGLTPDKRFL | PGHLGMGLVE | GYDSMGYEMS | KPDLRAELEA | DLKLICDGKK | ||||
DKFVVLRQQV | QKYKQVFIEA | VAKAKKLDEA | LAQYFGNGTE | LAQQEDIYPA | ||||
MPEPIRKCPQ | CNKDMVLKTK | KNGGFYLSCM | GFPECRSAVW | LPDSVLEASR | ||||
DSSVCPVCQP | HPVYRLKLKF | KRGSLPPTMP | LEFVCCIGGC | DDTLREILDL | ||||
RFSGGPPRAS | QPSGRLQANQ | SLNRMDNSQH | PQPADSRQTG | SSKALAQTLP | ||||
PPTAAGESNS | VTCNCGQEAV | LLTVRKEGPN | RGRQFFKCNG | GSCNFFLWAD | ||||
SPNPGAGGPP | ALAYRPLGAS | LGCPPGPGIH | LGGFGNPGDG | SGSGTSCLCS | ||||
QPSVTRTVQK | DGPNKGRQFH | TCAKPREQQC | GFFQWVDENT | APGTSGAPSW | ||||
TGDRGRTLES | EARSKRPRAS | SSDMGSTAKK | PRKCSLCHQP | GHTRPFCPQN | ||||
R |
Кодований геном білок за функціями належить до ізомераз, топоізомераз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, іоном магнію.
Література
- Hanai R., Caron P.R., Wang J.C. (1996). Human TOP3: a single-copy gene encoding DNA topoisomerase III. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 3653—3657. PMID 8622991 DOI:10.1073/pnas.93.8.3653
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Yang J., Bachrati C.Z., Ou J., Hickson I.D., Brown G.W. (2010). Human topoisomerase IIIalpha is a single-stranded DNA decatenase that is stimulated by BLM and RMI1. J. Biol. Chem. 285: 21426—21436. PMID 20445207 DOI:10.1074/jbc.M110.123216
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 6 квітня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
TOP3A angl DNA topoisomerase III alpha bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 17 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 001 aminokislot a molekulyarna masa 112 372 TOP3ANayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB4CGY 4CHTIdentifikatoriSimvoliTOP3A TOP3 ZGRF7 topoisomerase DNA III alpha DNA topoisomerase III alpha PEOB5 MGRISCE2Zovnishni ID OMIM 601243 MGI 1197527 HomoloGene 3394 GeneCards TOP3AOntologiya genaMolekulyarna funkciya DNA topoisomerase type I single strand cut ATP independent activity DNA binding zinc ion binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding isomerase activity zv yazuvannya z ionom metalu DNA topoisomerase activity single stranded DNA binding nucleic acid bindingKlitinna komponenta PML body nukleoplazma hromosoma klitinne yadro mitohondriya mitohondrialnij matriksBiologichnij proces replikaciya DNK DNA topological change GO 0007126 mejoz mitochondrial DNA metabolic process chromosome separation regulation of signal transduction by p53 class mediatorDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez7156 21975Ensembl ENSG00000284238 ENSG00000177302 ENSMUSG00000002814UniProt Q13472 O70157RefSeq mRNK NM 004618 NM 001320759NM 009410RefSeq bilok NP 001307688 NP 004609NP 033436Lokus UCSC Hr 17 18 27 18 32 MbHr 11 60 63 60 67 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MIFPVARYALRWLRRPEDRAFSRAAMEMALRGVRKVLCVAEKNDAAKGIA DLLSNGRMRRREGLSKFNKIYEFDYHLYGQNVTMVMTSVSGHLLAHDFQM QFRKWQSCNPLVLFEAEIEKYCPENFVDIKKTLERETRQCQALVIWTDCD REGENIGFEIIHVCKAVKPNLQVLRARFSEITPHAVRTACENLTEPDQRV SDAVDVRQELDLRIGAAFTRFQTLRLQRIFPEVLAEQLISYGSCQFPTLG FVVERFKAIQAFVPEIFHRIKVTHDHKDGIVEFNWKRHRLFNHTACLVLY QLCVEDPMATVVEVRSKPKSKWRPQALDTVELEKLASRKLRINAKETMRI AEKLYTQGYISYPRTETNIFPRDLNLTVLVEQQTPDPRWGAFAQSILERG GPTPRNGNKSDQAHPPIHPTKYTNNLQGDEQRLYEFIVRHFLACCSQDAQ GQETTVEIDIAQERFVAHGLMILARNYLDVYPYDHWSDKILPVYEQGSHF QPSTVEMVDGETSPPKLLTEADLIALMEKHGIGTDATHAEHIETIKARMY VGLTPDKRFLPGHLGMGLVEGYDSMGYEMSKPDLRAELEADLKLICDGKK DKFVVLRQQVQKYKQVFIEAVAKAKKLDEALAQYFGNGTELAQQEDIYPA MPEPIRKCPQCNKDMVLKTKKNGGFYLSCMGFPECRSAVWLPDSVLEASR DSSVCPVCQPHPVYRLKLKFKRGSLPPTMPLEFVCCIGGCDDTLREILDL RFSGGPPRASQPSGRLQANQSLNRMDNSQHPQPADSRQTGSSKALAQTLP PPTAAGESNSVTCNCGQEAVLLTVRKEGPNRGRQFFKCNGGSCNFFLWAD SPNPGAGGPPALAYRPLGASLGCPPGPGIHLGGFGNPGDGSGSGTSCLCS QPSVTRTVQKDGPNKGRQFHTCAKPREQQCGFFQWVDENTAPGTSGAPSW TGDRGRTLESEARSKRPRASSSDMGSTAKKPRKCSLCHQPGHTRPFCPQN R A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do izomeraz topoizomeraz Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku DNK ionom magniyu LiteraturaHanai R Caron P R Wang J C 1996 Human TOP3 a single copy gene encoding DNA topoisomerase III Proc Natl Acad Sci U S A 93 3653 3657 PMID 8622991 DOI 10 1073 pnas 93 8 3653 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Yang J Bachrati C Z Ou J Hickson I D Brown G W 2010 Human topoisomerase IIIalpha is a single stranded DNA decatenase that is stimulated by BLM and RMI1 J Biol Chem 285 21426 21436 PMID 20445207 DOI 10 1074 jbc M110 123216PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 6 kvitnya 2016 Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 26 veresnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 17 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi