THAP1 (англ. THAP domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 213 амінокислот, а молекулярна маса — 24 944.
THAP1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | THAP1, DYT6, THAP domain containing, apoptosis associated protein 1, THAP domain containing 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 609520 MGI: 1921004 HomoloGene: 10005 GeneCards: THAP1 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
torsion dystonia 6 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 8: 42.84 – 42.84 Mb | Хр. 8: 26.65 – 26.65 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MVQSCSAYGC | KNRYDKDKPV | SFHKFPLTRP | SLCKEWEAAV | RRKNFKPTKY | ||||
SSICSEHFTP | DCFKRECNNK | LLKENAVPTI | FLCTEPHDKK | EDLLEPQEQL | ||||
PPPPLPPPVS | QVDAAIGLLM | PPLQTPVNLS | VFCDHNYTVE | DTMHQRKRIH | ||||
QLEQQVEKLR | KKLKTAQQRC | RRQERQLEKL | KEVVHFQKEK | DDVSERGYVI | ||||
LPNDYFEIVE | VPA |
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Roussigne M., Cayrol C., Clouaire T., Amalric F., Girard J.-P. (2003). THAP1 is a nuclear proapoptotic factor that links prostate-apoptosis-response-4 (Par-4) to PML nuclear bodies. Oncogene. 22: 2432—2442. PMID 12717420 DOI:10.1038/sj.onc.1206271
- Sabogal A., Lyubimov A.Y., Corn J.E., Berger J.M., Rio D.C. (2010). THAP proteins target specific DNA sites through bipartite recognition of adjacent major and minor grooves. Nat. Struct. Mol. Biol. 17: 117—123. PMID 20010837 DOI:10.1038/nsmb.1742
- Campagne S., Saurel O., Gervais V., Milon A. (2010). Structural determinants of specific DNA-recognition by the THAP zinc finger. Nucleic Acids Res. 38: 3466—3476. PMID 20144952 DOI:10.1093/nar/gkq053
- Van Gerpen J.A., Ledoux M.S., Wszolek Z.K. (2010). Adult-onset leg dystonia due to a missense mutation in THAP1. Mov. Disord. 25: 1306—1307. PMID 20629133 DOI:10.1002/mds.23086
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з THAP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20856 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
{{}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url () - UniProt, Q9NVV9 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до . |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
THAP1 angl THAP domain containing 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 8 yi hromosomi 4 Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 213 aminokislot a molekulyarna masa 24 944 5 THAP1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2JTG 2KO0 2L1GIdentifikatoriSimvoliTHAP1 DYT6 THAP domain containing apoptosis associated protein 1 THAP domain containing 1Zovnishni ID OMIM 609520 MGI 1921004 HomoloGene 10005 GeneCards THAP1Pov yazani genetichni zahvoryuvannyatorsion dystonia 6 1 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya zv yazuvannya z ionom metalu sequence specific DNA binding DNA binding zinc ion binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding identical protein binding nucleic acid binding GO 0000980 RNA polymerase II cis regulatory region sequence specific DNA binding GO 0001078 GO 0001214 GO 0001206 DNA binding transcription repressor activity RNA polymerase II specific protein homodimerization activity GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specificKlitinna komponenta PML body vnutrishnoklitinna membranna organela klitinne yadro nukleoplazma fibrillar centerBiologichnij proces klitinnij cikl endothelial cell proliferation regulation of mitotic cell cycle transcription DNA templated GO 0009373 regulation of transcription DNA templated GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase IIDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez55145 73754Ensembl ENSG00000131931 ENSMUSG00000037214UniProt Q9NVV9 Q8CHW1RefSeq mRNK NM 199003 NM 018105NM 199042RefSeq bilok NP 060575 NP 945354NP 950243Lokus UCSC Hr 8 42 84 42 84 MbHr 8 26 65 26 65 MbPubMed search 2 3 VikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MVQSCSAYGCKNRYDKDKPVSFHKFPLTRPSLCKEWEAAVRRKNFKPTKY SSICSEHFTPDCFKRECNNKLLKENAVPTIFLCTEPHDKKEDLLEPQEQL PPPPLPPPVSQVDAAIGLLMPPLQTPVNLSVFCDHNYTVEDTMHQRKRIH QLEQQVEKLRKKLKTAQQRCRRQERQLEKLKEVVHFQKEKDDVSERGYVI LPNDYFEIVEVPA A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi klitinnij cikl alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku DNK Lokalizovanij u yadri Literaturared The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Roussigne M Cayrol C Clouaire T Amalric F Girard J P 2003 THAP1 is a nuclear proapoptotic factor that links prostate apoptosis response 4 Par 4 to PML nuclear bodies Oncogene 22 2432 2442 PMID 12717420 DOI 10 1038 sj onc 1206271 Sabogal A Lyubimov A Y Corn J E Berger J M Rio D C 2010 THAP proteins target specific DNA sites through bipartite recognition of adjacent major and minor grooves Nat Struct Mol Biol 17 117 123 PMID 20010837 DOI 10 1038 nsmb 1742 Campagne S Saurel O Gervais V Milon A 2010 Structural determinants of specific DNA recognition by the THAP zinc finger Nucleic Acids Res 38 3466 3476 PMID 20144952 DOI 10 1093 nar gkq053 Van Gerpen J A Ledoux M S Wszolek Z K 2010 Adult onset leg dystonia due to a missense mutation in THAP1 Mov Disord 25 1306 1307 PMID 20629133 DOI 10 1002 mds 23086Primitkired Zahvoryuvannya genetichno pov yazani z THAP1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 20856 angl Procitovano 7 veresnya 2017 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite web title Shablon Cite web cite web a Obslugovuvannya CS1 Storinki z parametrom url status ale bez parametra archive url posilannya UniProt Q9NVV9 angl Arhiv originalu za 24 veresnya 2017 Procitovano 7 veresnya 2017 Div takozhred Hromosoma 8 nbsp Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Na cyu stattyu ne posilayutsya inshi statti Vikipediyi Bud laska rozstavte posilannya vidpovidno do prijnyatih rekomendacij Otrimano z https uk wikipedia org w index php title THAP1 amp oldid 43453830