Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

TARDBP англ TAR DNA binding protein білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі 1 ї х

TARDBP

TARDBP

TARDBP (англ. TAR DNA binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 414 амінокислот, а молекулярна маса — 44 740.

TARDBP
image
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи TARDBP, ALS10, TDP-43, TAR DNA binding protein
Зовнішні ІД OMIM: 605078 MGI: 2387629 HomoloGene: 7221 GeneCards: TARDBP
Пов'язані генетичні захворювання
amyotrophic lateral sclerosis type 10, familial amyotrophic lateral sclerosis, бічний аміотрофічний склероз, amyotrophic lateral sclerosis and frontotemporal dementia
Шаблон експресії
image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
23435
230908
Ensembl
ENSG00000120948
ENSMUSG00000041459
UniProt
Q13148
Q921F2
RefSeq (мРНК)
NM_007375
RefSeq (білок)
NP_031401
NP_031401.1
Локус (UCSC) Хр. 1: 11.01 – 11.03 Mb Хр. 4: 148.7 – 148.71 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MSEYIRVTEDENDEPIEIPSEDDGTVLLSTVTAQFPGACGLRYRNPVSQC
MRGVRLVEGILHAPDAGWGNLVYVVNYPKDNKRKMDETDASSAVKVKRAV
QKTSDLIVLGLPWKTTEQDLKEYFSTFGEVLMVQVKKDLKTGHSKGFGFV
RFTEYETQVKVMSQRHMIDGRWCDCKLPNSKQSQDEPLRSRKVFVGRCTE
DMTEDELREFFSQYGDVMDVFIPKPFRAFAFVTFADDQIAQSLCGEDLII
KGISVHISNAEPKHNSNRQLERSGRFGGNPGGFGNQGGFGNSRGGGAGLG
NNQGSNMGGGMNFGAFSINPAMMAAAQAALQSSWGMMGMLASQQNQSGPS
GNNQNQGNMQREPNQAFGSGNNSYSGSNSGAAIGWGSASNAGSGSGFNGG
FGSSMDSKSSGWGM

Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Buratti E., Baralle F.E. (2001). Characterization and functional implications of the RNA binding properties of nuclear factor TDP-43, a novel splicing regulator of CFTR exon 9. J. Biol. Chem. 276: 36337—36343. PMID 11470789 DOI:10.1074/jbc.M104236200
  • Cassel J.A., Reitz A.B. (2013). Ubiquilin-2 (UBQLN2) binds with high affinity to the C-terminal region of TDP-43 and modulates TDP-43 levels in H4 cells: characterization of inhibition by nucleic acids and 4-aminoquinolines. Biochim. Biophys. Acta. 1834: 964—971. PMID 23541532 DOI:10.1016/j.bbapap.2013.03.020
  • Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
  • Luquin N., Yu B., Saunderson R.B., Trent R.J., Pamphlett R. (2009). Genetic variants in the promoter of TARDBP in sporadic amyotrophic lateral sclerosis. Neuromuscul. Disord. 19: 696—700. PMID 19695877 DOI:10.1016/j.nmd.2009.07.005
  • Ou S.-H.I., Wu F., Harrich D., Garcia-Martinez L.F., Gaynor R.B. (1995). Cloning and characterization of a novel cellular protein, TDP-43, that binds to human immunodeficiency virus type 1 TAR DNA sequence motifs. J. Virol. 69: 3584—3596. PMID 7745706

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з TARDBP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2016. Процитовано 21 серпня 2017.
  5. (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також


image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

TARDBP angl TAR DNA binding protein bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 1 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 414 aminokislot a molekulyarna masa 44 740 TARDBPNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1WF0 2CQG 4BS2 4IUF 4Y0F 2N4P 2N2C 4Y00 2N4G 2N4H 2N3XIdentifikatoriSimvoliTARDBP ALS10 TDP 43 TAR DNA binding proteinZovnishni ID OMIM 605078 MGI 2387629 HomoloGene 7221 GeneCards TARDBPPov yazani genetichni zahvoryuvannyaamyotrophic lateral sclerosis type 10 familial amyotrophic lateral sclerosis bichnij amiotrofichnij skleroz amyotrophic lateral sclerosis and frontotemporal dementia Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding GO 0001131 GO 0001151 GO 0001130 GO 0001204 DNA binding transcription factor activity mRNA 3 UTR binding GO 0001077 GO 0001212 GO 0001213 GO 0001211 GO 0001205 DNA binding transcription activator activity RNA polymerase II specific GO 0001948 GO 0016582 protein binding identical protein binding RNA binding nucleic acid binding double stranded DNA binding single stranded RNA binding sequence specific double stranded DNA bindingKlitinna komponenta citoplazma nuclear speck nukleoplazma interchromatin granule perichromatin fibrils klitinne yadro Ribonukleoproteyini cytoplasmic stress granuleBiologichnij proces GO 0033128 negative regulation of protein phosphorylation GO 0009373 regulation of transcription DNA templated mRNA processing negative regulation of gene expression response to endoplasmic reticulum stress transcription DNA templated regulation of cell cycle negative regulation by host of viral transcription Splajsing RNK nuclear inner membrane organization 3 UTR mediated mRNA stabilization GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II positive regulation of insulin secretion transcription by RNA polymerase II regulation of apoptotic process positive regulation of protein import into nucleus regulation of protein stability regulation of circadian rhythm ritmichnij procesDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez23435 230908Ensembl ENSG00000120948 ENSMUSG00000041459UniProt Q13148 Q921F2RefSeq mRNK NM 007375NM 001003898 NM 001003899 NM 001008545 NM 001008546 NM 145556NM 001305425RefSeq bilok NP 031401 NP 031401 1NP 001003898 NP 001003899 NP 001008545 NP 001008546 NP 001292354NP 663531Lokus UCSC Hr 1 11 01 11 03 MbHr 4 148 7 148 71 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MSEYIRVTEDENDEPIEIPSEDDGTVLLSTVTAQFPGACGLRYRNPVSQC MRGVRLVEGILHAPDAGWGNLVYVVNYPKDNKRKMDETDASSAVKVKRAV QKTSDLIVLGLPWKTTEQDLKEYFSTFGEVLMVQVKKDLKTGHSKGFGFV RFTEYETQVKVMSQRHMIDGRWCDCKLPNSKQSQDEPLRSRKVFVGRCTE DMTEDELREFFSQYGDVMDVFIPKPFRAFAFVTFADDQIAQSLCGEDLII KGISVHISNAEPKHNSNRQLERSGRFGGNPGGFGNQGGFGNSRGGGAGLG NNQGSNMGGGMNFGAFSINPAMMAAAQAALQSSWGMMGMLASQQNQSGPS GNNQNQGNMQREPNQAFGSGNNSYSGSNSGAAIGWGSASNAGSGSGFNGG FGSSMDSKSSGWGM A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do represoriv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak procesing mRNK splajsing mRNK transkripciya regulyaciya transkripciyi Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z DNK RNK Lokalizovanij u yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Buratti E Baralle F E 2001 Characterization and functional implications of the RNA binding properties of nuclear factor TDP 43 a novel splicing regulator of CFTR exon 9 J Biol Chem 276 36337 36343 PMID 11470789 DOI 10 1074 jbc M104236200 Cassel J A Reitz A B 2013 Ubiquilin 2 UBQLN2 binds with high affinity to the C terminal region of TDP 43 and modulates TDP 43 levels in H4 cells characterization of inhibition by nucleic acids and 4 aminoquinolines Biochim Biophys Acta 1834 964 971 PMID 23541532 DOI 10 1016 j bbapap 2013 03 020 Hendriks I A Treffers L W Verlaan de Vries M Olsen J V Vertegaal A C 2015 SUMO 2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage Cell Rep 10 1778 1791 PMID 25772364 DOI 10 1016 j celrep 2015 02 033 Luquin N Yu B Saunderson R B Trent R J Pamphlett R 2009 Genetic variants in the promoter of TARDBP in sporadic amyotrophic lateral sclerosis Neuromuscul Disord 19 696 700 PMID 19695877 DOI 10 1016 j nmd 2009 07 005 Ou S H I Wu F Harrich D Garcia Martinez L F Gaynor R B 1995 Cloning and characterization of a novel cellular protein TDP 43 that binds to human immunodeficiency virus type 1 TAR DNA sequence motifs J Virol 69 3584 3596 PMID 7745706PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z TARDBP pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 29 veresnya 2016 Procitovano 21 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 9 serpnya 2017 Procitovano 21 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 1 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ