TAPBP (англ. TAP binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 448 амінокислот, а молекулярна маса — 47 626.
TAPBP | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | TAPBP, NGS17, TAPA, TPN, TPSN, TAP binding protein (tapasin), TAP binding protein | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 601962 MGI: 1201689 HomoloGene: 2401 GeneCards: TAPBP | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 6: 33.3 – 33.31 Mb | Хр. 17: 34.13 – 34.15 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MKSLSLLLAV | ALGLATAVSA | GPAVIECWFV | EDASGKGLAK | RPGALLLRQG | ||||
PGEPPPRPDL | DPELYLSVHD | PAGALQAAFR | RYPRGAPAPH | CEMSRFVPLP | ||||
ASAKWASGLT | PAQNCPRALD | GAWLMVSISS | PVLSLSSLLR | PQPEPQQEPV | ||||
LITMATVVLT | VLTHTPAPRV | RLGQDALLDL | SFAYMPPTSE | AASSLAPGPP | ||||
PFGLEWRRQH | LGKGHLLLAA | TPGLNGQMPA | AQEGAVAFAA | WDDDEPWGPW | ||||
TGNGTFWLPR | VQPFQEGTYL | ATIHLPYLQG | QVTLELAVYK | PPKVSLMPAT | ||||
LARAAPGEAP | PELLCLVSHF | YPSGGLEVEW | ELRGGPGGRS | QKAEGQRWLS | ||||
ALRHHSDGSV | SLSGHLQPPP | VTTEQHGARY | ACRIHHPSLP | ASGRSAEVTL | ||||
EVAGLSGPSL | EDSVGLFLSA | FLLLGLFKAL | GWAAVYLSTC | KDSKKKAE |
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.
Література
- Li S., Sjoegren H.-O., Hellman U., Pettersson R.F., Wang P. (1997). Cloning and functional characterization of a subunit of the transporter associated with antigen processing. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 8708—8713. PMID 9238042 DOI:10.1073/pnas.94.16.8708
- Herberg J.A., Beck S., Trowsdale J. (1998). TAPASIN, DAXX, RGL2, HKE2 and four new genes (BING 1, 3 to 5) form a dense cluster at the centromeric end of the MHC. J. Mol. Biol. 277: 839—857. PMID 9545376 DOI:10.1006/jmbi.1998.1637
- Gao B., Williams A., Sewell A., Elliott T. (2004). Generation of a functional, soluble tapasin protein from an alternatively spliced mRNA. Genes Immun. 5: 101—108. PMID 14668790 DOI:10.1038/sj.gene.6364043
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Bangia N., Lehner P.J., Hughes E.A., Surman M., Cresswell P. (1999). The N-terminal region of tapasin is required to stabilize the MHC class I loading complex. Eur. J. Immunol. 29: 1858—1870. PMID 10382748 DOI:10.1002/(SICI)1521-4141(199906)29:06<1858::AID-IMMU1858>3.0.CO;2-C
- Li S., Paulsson K.M., Chen S., Sjoegren H.-O., Wang P. (2000). Tapasin is required for efficient peptide binding to transporter associated with antigen processing. J. Biol. Chem. 275: 1581—1586. PMID 10636848 DOI:10.1074/jbc.275.3.1581
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до . |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
TAPBP angl TAP binding protein bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 6 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 448 aminokislot a molekulyarna masa 47 626 TAPBPNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSBSpisok kodiv PDB3F8UIdentifikatoriSimvoliTAPBP NGS17 TAPA TPN TPSN TAP binding protein tapasin TAP binding proteinZovnishni ID OMIM 601962 MGI 1201689 HomoloGene 2401 GeneCards TAPBPOntologiya genaMolekulyarna funkciya peptide antigen binding TAP2 binding unfolded protein binding ABC type peptide antigen transporter activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding MHC class I protein binding TAP1 binding TAP complex bindingKlitinna komponenta integral component of membrane endoplasmic reticulum membrane membrana Golgi membrane TAP complex MHC class I peptide loading complex endoplazmatichnij retikulum integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane phagocytic vesicle membrane endoplasmic reticulum Golgi intermediate compartment membraneBiologichnij proces retrograde vesicle mediated transport Golgi to endoplasmic reticulum antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class I regulation of protein complex stability GO 0046730 GO 0046737 GO 0046738 GO 0046736 imunna vidpovid peptide antigen stabilization regulyaciya ekspresiyi geniv antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I TAP dependent vesicle fusion with endoplasmic reticulum Golgi intermediate compartment ERGIC membrane amide transport GO 0034622 protein containing complex assembly MHC class Ib protein complex assembly peptide transportDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez6892 21356Ensembl ENSG00000231925 ENSG00000236490 ENSG00000206281 ENSG00000206208 ENSG00000112493n d ENSMUSG00000024308UniProt O15533 Q9R233RefSeq mRNK NM 003190 NM 172208 NM 172209NM 001025313 NM 009318RefSeq bilok NP 003181 NP 757345 NP 757346NP 001020484 NP 033344Lokus UCSC Hr 6 33 3 33 31 MbHr 17 34 13 34 15 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishejPoslidovnist aminokislot1020304050MKSLSLLLAVALGLATAVSAGPAVIECWFVEDASGKGLAKRPGALLLRQGPGEPPPRPDLDPELYLSVHDPAGALQAAFRRYPRGAPAPHCEMSRFVPLPASAKWASGLTPAQNCPRALDGAWLMVSISSPVLSLSSLLRPQPEPQQEPVLITMATVVLTVLTHTPAPRVRLGQDALLDLSFAYMPPTSEAASSLAPGPPPFGLEWRRQHLGKGHLLLAATPGLNGQMPAAQEGAVAFAAWDDDEPWGPWTGNGTFWLPRVQPFQEGTYLATIHLPYLQGQVTLELAVYKPPKVSLMPATLARAAPGEAPPELLCLVSHFYPSGGLEVEWELRGGPGGRSQKAEGQRWLSALRHHSDGSVSLSGHLQPPPVTTEQHGARYACRIHHPSLPASGRSAEVTLEVAGLSGPSLEDSVGLFLSAFLLLGLFKALGWAAVYLSTCKDSKKKAEA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak alternativnij splajsing Lokalizovanij u membrani endoplazmatichnomu retikulumi LiteraturaLi S Sjoegren H O Hellman U Pettersson R F Wang P 1997 Cloning and functional characterization of a subunit of the transporter associated with antigen processing Proc Natl Acad Sci U S A 94 8708 8713 PMID 9238042 DOI 10 1073 pnas 94 16 8708 Herberg J A Beck S Trowsdale J 1998 TAPASIN DAXX RGL2 HKE2 and four new genes BING 1 3 to 5 form a dense cluster at the centromeric end of the MHC J Mol Biol 277 839 857 PMID 9545376 DOI 10 1006 jmbi 1998 1637 Gao B Williams A Sewell A Elliott T 2004 Generation of a functional soluble tapasin protein from an alternatively spliced mRNA Genes Immun 5 101 108 PMID 14668790 DOI 10 1038 sj gene 6364043 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Bangia N Lehner P J Hughes E A Surman M Cresswell P 1999 The N terminal region of tapasin is required to stabilize the MHC class I loading complex Eur J Immunol 29 1858 1870 PMID 10382748 DOI 10 1002 SICI 1521 4141 199906 29 06 lt 1858 AID IMMU1858 gt 3 0 CO 2 C Li S Paulsson K M Chen S Sjoegren H O Wang P 2000 Tapasin is required for efficient peptide binding to transporter associated with antigen processing J Biol Chem 275 1581 1586 PMID 10636848 DOI 10 1074 jbc 275 3 1581PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 19 serpnya 2017 Procitovano 6 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 24 veresnya 2017 Procitovano 6 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 6Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Na cyu stattyu ne posilayutsya inshi statti Vikipediyi Bud laska rozstavte posilannya vidpovidno do prijnyatih rekomendacij