SMURF1 (англ. SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 757 амінокислот, а молекулярна маса — 86 114.
SMURF1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SMURF1, SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 605568 MGI: 1923038 HomoloGene: 10712 GeneCards: SMURF1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 7: 99.03 – 99.14 Mb | Хр. 5: 144.81 – 144.9 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSNPGTRRNG | SSIKIRLTVL | CAKNLAKKDF | FRLPDPFAKI | VVDGSGQCHS | ||||
TDTVKNTLDP | KWNQHYDLYV | GKTDSITISV | WNHKKIHKKQ | GAGFLGCVRL | ||||
LSNAISRLKD | TGYQRLDLCK | LNPSDTDAVR | GQIVVSLQTR | DRIGTGGSVV | ||||
DCRGLLENEG | TVYEDSGPGR | PLSCFMEEPA | PYTDSTGAAA | GGGNCRFVES | ||||
PSQDQRLQAQ | RLRNPDVRGS | LQTPQNRPHG | HQSPELPEGY | EQRTTVQGQV | ||||
YFLHTQTGVS | TWHDPRIPSP | SGTIPGGDAA | FLYEFLLQGH | TSEPRDLNSV | ||||
NCDELGPLPP | GWEVRSTVSG | RIYFVDHNNR | TTQFTDPRLH | HIMNHQCQLK | ||||
EPSQPLPLPS | EGSLEDEELP | AQRYERDLVQ | KLKVLRHELS | LQQPQAGHCR | ||||
IEVSREEIFE | ESYRQIMKMR | PKDLKKRLMV | KFRGEEGLDY | GGVAREWLYL | ||||
LCHEMLNPYY | GLFQYSTDNI | YMLQINPDSS | INPDHLSYFH | FVGRIMGLAV | ||||
FHGHYINGGF | TVPFYKQLLG | KPIQLSDLES | VDPELHKSLV | WILENDITPV | ||||
LDHTFCVEHN | AFGRILQHEL | KPNGRNVPVT | EENKKEYVRL | YVNWRFMRGI | ||||
EAQFLALQKG | FNELIPQHLL | KPFDQKELEL | IIGGLDKIDL | NDWKSNTRLK | ||||
HCVADSNIVR | WFWQAVETFD | EERRARLLQF | VTGSTRVPLQ | GFKALQGSTG | ||||
AAGPRLFTIH | LIDANTDNLP | KAHTCFNRID | IPPYESYEKL | YEKLLTAVEE | ||||
TCGFAVE |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.
Література
- Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Zhu H., Kavsak P., Abdollah S., Wrana J.L., Thomsen G.H. (1999). A SMAD ubiquitin ligase targets the BMP pathway and affects embryonic pattern formation. Nature. 400: 687—693. PMID 10458166 DOI:10.1038/23293
- Wang Y., Tong X., Ye X. (2012). Ndfip1 negatively regulates RIG-I-dependent immune signaling by enhancing E3 ligase Smurf1-mediated MAVS degradation. J. Immunol. 189: 5304—5313. PMID 23087404 DOI:10.4049/jimmunol.1201445
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 10 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 5 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
SMURF1 angl SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 7 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 757 aminokislot a molekulyarna masa 86 114 SMURF1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2LAZ 2LB0 2LB1 2LTX 3PYCIdentifikatoriSimvoliSMURF1 SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1Zovnishni ID OMIM 605568 MGI 1923038 HomoloGene 10712 GeneCards SMURF1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya R SMAD binding I SMAD binding activin binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding phospholipid binding transferase activity GO 0050372 ubiquitin protein transferase activity GO 1904264 GO 1904822 GO 0090622 GO 0090302 ubiquitin protein ligase activityKlitinna komponenta citoplazma gialoplazma membrana klitinna membrana nukleoplazma akson neuronal cell body mitohondriya ekzosomaBiologichnij proces diferenciaciya klitin engulfment of target by autophagosome ectoderm development protein polyubiquitination BMP signaling pathway receptor catabolic process ubiquitin dependent SMAD protein catabolic process negative regulation of ossification protein localization to cell surface protein targeting to vacuole involved in autophagy positive regulation of ubiquitin dependent protein catabolic process Ubikvitin zalezhnij proteoliz protein export from nucleus positive regulation of dendrite extension proteasome mediated ubiquitin dependent protein catabolic process negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway transforming growth factor beta receptor signaling pathway Wnt signaling pathway planar cell polarity pathway parkin mediated stimulation of mitophagy in response to mitochondrial depolarization substrate localization to autophagosome ubiquitin dependent protein catabolic process negative regulation of BMP signaling pathway protein localization to plasma membrane GO 1903364 positive regulation of protein catabolic processDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez57154 75788Ensembl ENSG00000284126 ENSG00000198742 ENSMUSG00000038780UniProt Q9HCE7 Q9CUN6RefSeq mRNK NM 001199847 NM 020429 NM 181349NM 001038627 NM 029438RefSeq bilok NP 001186776 NP 065162 NP 851994NP 001033716 NP 083714Lokus UCSC Hr 7 99 03 99 14 MbHr 5 144 81 144 9 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MSNPGTRRNGSSIKIRLTVLCAKNLAKKDFFRLPDPFAKIVVDGSGQCHS TDTVKNTLDPKWNQHYDLYVGKTDSITISVWNHKKIHKKQGAGFLGCVRL LSNAISRLKDTGYQRLDLCKLNPSDTDAVRGQIVVSLQTRDRIGTGGSVV DCRGLLENEGTVYEDSGPGRPLSCFMEEPAPYTDSTGAAAGGGNCRFVES PSQDQRLQAQRLRNPDVRGSLQTPQNRPHGHQSPELPEGYEQRTTVQGQV YFLHTQTGVSTWHDPRIPSPSGTIPGGDAAFLYEFLLQGHTSEPRDLNSV NCDELGPLPPGWEVRSTVSGRIYFVDHNNRTTQFTDPRLHHIMNHQCQLK EPSQPLPLPSEGSLEDEELPAQRYERDLVQKLKVLRHELSLQQPQAGHCR IEVSREEIFEESYRQIMKMRPKDLKKRLMVKFRGEEGLDYGGVAREWLYL LCHEMLNPYYGLFQYSTDNIYMLQINPDSSINPDHLSYFHFVGRIMGLAV FHGHYINGGFTVPFYKQLLGKPIQLSDLESVDPELHKSLVWILENDITPV LDHTFCVEHNAFGRILQHELKPNGRNVPVTEENKKEYVRLYVNWRFMRGI EAQFLALQKGFNELIPQHLLKPFDQKELELIIGGLDKIDLNDWKSNTRLK HCVADSNIVRWFWQAVETFDEERRARLLQFVTGSTRVPLQGFKALQGSTG AAGPRLFTIHLIDANTDNLPKAHTCFNRIDIPPYESYEKLYEKLLTAVEE TCGFAVE A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do transferaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak ubikvitinuvannya bilkiv diferenciaciya klitin alternativnij splajsing Lokalizovanij u klitinnij membrani citoplazmi membrani LiteraturaNagase T Kikuno R Nakayama M Hirosawa M Ohara O 2000 Prediction of the coding sequences of unidentified human genes XVIII The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro DNA Res 7 273 281 PMID 10997877 DOI 10 1093 dnares 7 4 271 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Zhu H Kavsak P Abdollah S Wrana J L Thomsen G H 1999 A SMAD ubiquitin ligase targets the BMP pathway and affects embryonic pattern formation Nature 400 687 693 PMID 10458166 DOI 10 1038 23293 Wang Y Tong X Ye X 2012 Ndfip1 negatively regulates RIG I dependent immune signaling by enhancing E3 ligase Smurf1 mediated MAVS degradation J Immunol 189 5304 5313 PMID 23087404 DOI 10 4049 jimmunol 1201445PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 10 travnya 2017 Procitovano 7 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 5 zhovtnya 2017 Procitovano 7 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 7 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi