SYT7

SYT7 (англ. Synaptotagmin 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 403 амінокислот, а молекулярна маса — 45 501.

SYT7
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2D8K
Ідентифікатори
Символи	SYT7, IPCA-7, IPCA7, PCANAP7, SYT-VII, SYTVII, synaptotagmin 7
Зовнішні ІД	OMIM: 604146 MGI: 1859545 HomoloGene: 20889 GeneCards: SYT7
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • SNARE binding • syntaxin binding • clathrin binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding • calcium-dependent phospholipid binding • calmodulin binding • phosphatidylserine binding Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • синапс • synaptic vesicle membrane • міжклітинні контакти • terminal bouton • dense core granule • екзосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • transport vesicle membrane • гіалоплазма • Синаптичні бульбашки • presynaptic membrane • лізосома • пероксисома • peroxisomal membrane • phagocytic vesicle membrane • клітинна мембрана • lysosomal membrane • early phagosome • дендрит (нейробіологія) • soma • axon terminus • аксон • neuron projection • exocytic vesicle • hippocampal mossy fiber to CA3 synapse • glutamatergic synapse • GABA-ergic synapse • integral component of presynaptic membrane Біологічний процес • regulation of insulin secretion • positive regulation of calcium ion-dependent exocytosis • екзоцитоз • regulation of bone remodeling • plasma membrane repair • calcium-ion regulated exocytosis • regulation of calcium ion-dependent exocytosis • calcium ion-regulated exocytosis of neurotransmitter • regulation of glucagon secretion • phagosome-lysosome fusion • synaptic vesicle recycling • vesicle-mediated cholesterol transport • regulation of phagocytosis • vesicle fusion • calcium ion regulated lysosome exocytosis • Фагоцитоз • regulation of dopamine secretion • short-term synaptic potentiation • vesicle-mediated transport • cellular response to calcium ion • calcium-dependent activation of synaptic vesicle fusion • regulation of synaptic vesicle endocytosis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9066	54525
Ensembl	ENSG00000011347	ENSMUSG00000024743
UniProt	O43581	Q9R0N7
RefSeq (мРНК)	NM_001252065 NM_001300773 NM_004200 NM_001365809 NM_001370210 NM_001370211	NM_018801 NM_173067 NM_173068 NM_001373944
RefSeq (білок)	NP_001238994 NP_001287702 NP_004191 NP_001352738 NP_001357139 NP_001357140	NP_061271 NP_775090 NP_775091
Локус (UCSC)	Хр. 11: 61.51 – 61.58 Mb	Хр. 19: 10.37 – 10.43 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MYRDPEAASP		GAPSRDVLLV		SAIITVSLSV		TVVLCGLCHW		CQRKLGKRYK
NSLETVGTPD		SGRGRSEKKA		IKLPAGGKAV		NTAPVPGQTP		HDESDRRTEP
RSSVSDLVNS		LTSEMLMLSP		GSEEDEAHEG		CSRENLGRIQ		FSVGYNFQES
TLTVKIMKAQ		ELPAKDFSGT		SDPFVKIYLL		PDKKHKLETK		VKRKNLNPHW
NETFLFEGFP		YEKVVQRILY		LQVLDYDRFS		RNDPIGEVSI		PLNKVDLTQM
QTFWKDLKPC		SDGSGSRGEL		LLSLCYNPSA		NSIIVNIIKA		RNLKAMDIGG
TSDPYVKVWL		MYKDKRVEKK		KTVTMKRNLN		PIFNESFAFD		IPTEKLRETT
IIITVMDKDK		LSRNDVIGKI		YLSWKSGPGE		VKHWKDMIAR		PRQPVAQWHQ
LKA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як екзоцитоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну, іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, пероксисомах, синапсах.

Література

• Cooper P.R., Nowak N.J., Higgins M.J., Church D.M., Shows T.B. (1998). Transcript mapping of the human chromosome 11q12-q13.1 gene-rich region identifies several newly described conserved genes. Genomics. 49: 419—429. PMID 9615227 DOI:10.1006/geno.1998.5291
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Caler E.V., Chakrabarti S., Fowler K.T., Rao S., Andrews N.W. (2001). The Exocytosis-regulatory protein synaptotagmin VII mediates cell invasion by Trypanosoma cruzi. J. Exp. Med. 193: 1097—1104. PMID 11342594 DOI:10.1084/jem.193.9.1097
• Fukuda M., Ogata Y., Saegusa C., Kanno E., Mikoshiba K. (2002). Alternative splicing isoforms of synaptotagmin VII in the mouse, rat and human. Biochem. J. 365: 173—180. PMID 12071850 DOI:10.1042/BJ20011877
• Chakrabarti S., Andrade L.O., Andrews N.W. (2005). Trypanosoma cruzi invades synaptotagmin VII-deficient cells by a PI-3 kinase independent pathway. Mol. Biochem. Parasitol. 141: 125—128. PMID 15811535 DOI:10.1016/j.molbiopara.2005.01.016
• Brandt D.S., Coffman M.D., Falke J.J., Knight J.D. (2012). Hydrophobic contributions to the membrane docking of synaptotagmin 7 C2A domain: mechanistic contrast between isoforms 1 and 7. Biochemistry. 51: 7654—7664. PMID 22966849 DOI:10.1021/bi3007115

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11514 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url ()
4. UniProt, O43581 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 11