SYT6

SYT6 (англ. Synaptotagmin 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 510 амінокислот, а молекулярна маса — 57 325.

SYT6
Ідентифікатори
Символи	SYT6, sytVI, synaptotagmin 6
Зовнішні ІД	OMIM: 607718 MGI: 1859544 HomoloGene: 10301 GeneCards: SYT6
Пов'язані генетичні захворювання
рак молочної залози
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • protein homodimerization activity • clathrin binding • calcium-dependent protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • calcium-dependent phospholipid binding • syntaxin binding • phosphatidylserine binding • SNARE binding Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • гіалоплазма • мембрана • perinuclear endoplasmic reticulum • синапс • synaptic vesicle membrane • міжклітинні контакти • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • клітинна мембрана • extrinsic component of membrane • glutamatergic synapse • integral component of synaptic membrane • exocytic vesicle Біологічний процес • acrosomal vesicle exocytosis • акросомна реакція • regulation of calcium ion-dependent exocytosis • calcium ion-regulated exocytosis of neurotransmitter • vesicle fusion • presynaptic dense core vesicle exocytosis • regulation of dopamine secretion • synaptic vesicle exocytosis • vesicle-mediated transport • calcium-ion regulated exocytosis • cellular response to calcium ion Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	148281	54524
Ensembl	ENSG00000134207	ENSMUSG00000027849
UniProt	Q5T7P8	Q9R0N8
RefSeq (мРНК)	NM_001253772 NM_001270805 NM_205848 NM_001366223 NM_001366224 NM_001366225 NM_001366226	NM_001276676 NM_001276677 NM_001276679 NM_001276680 NM_001276681 NM_018800
RefSeq (білок)	NP_001257734 NP_995320 NP_001240701 NP_001353152 NP_001353153 NP_001353154 NP_001353155	NP_001263605 NP_001263606 NP_001263608 NP_001263609 NP_001263610 NP_061270
Локус (UCSC)	Хр. 1: 114.09 – 114.15 Mb	Хр. 3: 103.48 – 103.55 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGVWGAGGP		RCQEALAVLA		SLCRARPPPL		GLDVETCRSF		ELQPPERSPS
AAGAGTSVSL		LAVVVIVCGV		ALVAVFLFLF		WKLCWMPWRN		KEASSPSSAN
PPLEALQSPS		FRGNMADKLK		DPSTLGFLEA		AVKISHTSPD		IPAEVQMSVK
EHIMRHTRLQ		RQTTEPASST		RHTSFKRHLP		RQMHVSSVDY		GNELPPAAEQ
PTSIGRIKPE		LYKQKSVDGE		DAKSEATKSC		GKINFSLRYD		YETETLIVRI
LKAFDLPAKD		FCGSSDPYVK		IYLLPDRKCK		LQTRVHRKTL		NPTFDENFHF
PVPYEELADR		KLHLSVFDFD		RFSRHDMIGE		VILDNLFEAS		DLSRETSIWK
DIQYATSESV		DLGEIMFSLC		YLPTAGRLTL		TVIKCRNLKA		MDITGYSDPY
VKVSLLCDGR		RLKKKKTTIK		KNTLNPVYNE		AIIFDIPPEN		MDQVSLLISV
MDYDRVGHNE		IIGVCRVGIT		AEGLGRDHWN		EMLAYPRKPI		AHWHSLVEVK
KSFKEGNPRL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах.

Література

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з SYT6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18638 (англ.) . Архів оригіналу за 7 квітня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
5. UniProt, Q5T7P8 (англ.) . Архів оригіналу за 12 грудня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 1