SYT4

SYT4 (англ. Synaptotagmin 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 425 амінокислот, а молекулярна маса — 47 958.

SYT4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1UGK
Ідентифікатори
Символи	SYT4, HsT1192, synaptotagmin 4
Зовнішні ІД	OMIM: 600103 MGI: 101759 HomoloGene: 7559 GeneCards: SYT4
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • clathrin binding • phosphatidylserine binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • SNARE binding • syntaxin-1 binding • syntaxin binding • syntaxin-3 binding • protein homodimerization activity • protein heterodimerization activity • calcium-dependent phospholipid binding Клітинна компонента • integral component of membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • синапс • synaptic vesicle membrane • міжклітинні контакти • perinuclear region of cytoplasm • neuron projection • dense core granule • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • дендрит (нейробіологія) • комплекс Ґольджі • везикула • аксон • клітинна мембрана • Синаптичні бульбашки • integral component of Golgi membrane • integral component of synaptic vesicle membrane • secretory granule membrane • dense core granule membrane • somatodendritic compartment • soma • neuron projection terminus • exocytic vesicle • astrocyte projection • microvesicle • glutamatergic synapse • integral component of neuronal dense core vesicle membrane Біологічний процес • диференціація клітин • brain development • positive regulation of dendrite extension • negative regulation of vesicle fusion • GO:0010554 neurotransmitter secretion • екзоцитоз • vesicle fusion • calcium ion-regulated exocytosis of neurotransmitter • пам'ять • positive regulation of glutamate secretion • regulation of dopamine secretion • regulation of endocytosis • regulation of vesicle fusion • negative regulation of catecholamine secretion • positive regulation of calcium ion-dependent exocytosis • negative regulation of neurotransmitter secretion • negative regulation of short-term neuronal synaptic plasticity • vesicle fusion with vesicle • secretory granule maturation • negative regulation of protein secretion • negative regulation of retrograde trans-synaptic signaling by neuropeptide • regulation of calcium ion-dependent exocytosis • negative regulation of calcium ion-dependent exocytosis • trans-synaptic signaling by BDNF, modulating synaptic transmission • vesicle-mediated transport • calcium-ion regulated exocytosis • cellular response to calcium ion • regulation of presynaptic dense core granule exocytosis • negative regulation of dense core granule exocytosis • positive regulation of dense core granule exocytosis • negative regulation of synaptic vesicle exocytosis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6860	20983
Ensembl	ENSG00000132872	ENSMUSG00000024261
UniProt	Q9H2B2	P40749
RefSeq (мРНК)	NM_020783	NM_009308
RefSeq (білок)	NP_065834	NP_033334
Локус (UCSC)	Хр. 18: 43.27 – 43.28 Mb	Хр. 18: 31.57 – 31.58 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPITTSREE		FDEIPTVVGI		FSAFGLVFTV		SLFAWICCQR		KSSKSNKTPP
YKFVHVLKGV		DIYPENLNSK		KKFGADDKNE		VKNKPAVPKN		SLHLDLEKRD
LNGNFPKTNL		KPGSPSDLEN		ATPKLFLEGE		KESVSPESLK		SSTSLTSEEK
QEKLGTLFFS		LEYNFERKAF		VVNIKEARGL		PAMDEQSMTS		DPYIKMTILP
EKKHKVKTRV		LRKTLDPAFD		ETFTFYGIPY		TQIQELALHF		TILSFDRFSR
DDIIGEVLIP		LSGIELSEGK		MLMNREIIKR		NVRKSSGRGE		LLISLCYQST
TNTLTVVVLK		ARHLPKSDVS		GLSDPYVKVN		LYHAKKRISK		KKTHVKKCTP
NAVFNELFVF		DIPCEGLEDI		SVEFLVLDSE		RGSRNEVIGQ		LVLGAAAEGT
GGEHWKEICD		YPRRQIAKWH		VLCDG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах.

Література

• Ferguson G.D., Chen X.-N., Korenberg J.R., Herschman H.R. (2000). The human synaptotagmin IV gene defines an evolutionary break point between syntenic mouse and human chromosome regions but retains ligand inducibility and tissue specificity. J. Biol. Chem. 275: 36920—36926. PMID 10938284 DOI:10.1074/jbc.M005801200
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11512 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
4. UniProt, Q9H2B2 (англ.) . Архів оригіналу за 10 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 18