STIM1 (англ. Stromal interaction molecule 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 685 амінокислот, а молекулярна маса — 77 423.
STIM1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | STIM1, D11S4896E, GOK, IMD10, STRMK, TAM, TAM1, stromal interaction molecule 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 605921 MGI: 107476 HomoloGene: 20681 GeneCards: STIM1 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
Stormorken syndrome, tubular aggregate myopathy, combined immunodeficiency due to STIM1 deficiency | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 11: 3.85 – 4.09 Mb | Хр. 7: 101.92 – 102.09 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MDVCVRLALW | LLWGLLLHQG | QSLSHSHSEK | ATGTSSGANS | EESTAAEFCR | ||||
IDKPLCHSED | EKLSFEAVRN | IHKLMDDDAN | GDVDVEESDE | FLREDLNYHD | ||||
PTVKHSTFHG | EDKLISVEDL | WKAWKSSEVY | NWTVDEVVQW | LITYVELPQY | ||||
EETFRKLQLS | GHAMPRLAVT | NTTMTGTVLK | MTDRSHRQKL | QLKALDTVLF | ||||
GPPLLTRHNH | LKDFMLVVSI | VIGVGGCWFA | YIQNRYSKEH | MKKMMKDLEG | ||||
LHRAEQSLHD | LQERLHKAQE | EHRTVEVEKV | HLEKKLRDEI | NLAKQEAQRL | ||||
KELREGTENE | RSRQKYAEEE | LEQVREALRK | AEKELESHSS | WYAPEALQKW | ||||
LQLTHEVEVQ | YYNIKKQNAE | KQLLVAKEGA | EKIKKKRNTL | FGTFHVAHSS | ||||
SLDDVDHKIL | TAKQALSEVT | AALRERLHRW | QQIEILCGFQ | IVNNPGIHSL | ||||
VAALNIDPSW | MGSTRPNPAH | FIMTDDVDDM | DEEIVSPLSM | QSPSLQSSVR | ||||
QRLTEPQHGL | GSQRDLTHSD | SESSLHMSDR | QRVAPKPPQM | SRAADEALNA | ||||
MTSNGSHRLI | EGVHPGSLVE | KLPDSPALAK | KALLALNHGL | DKAHSLMELS | ||||
PSAPPGGSPH | LDSSRSHSPS | SPDPDTPSPV | GDSRALQASR | NTRIPHLAGK | ||||
KAVAEEDNGS | IGEETDSSPG | RKKFPLKIFK | KPLKK |
Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, саркоплазматичному ретикулумі.
Література
- Parker N.J., Begley C.G., Smith P.J., Fox R.M. (1996). Molecular cloning of a novel human gene (D11S4896E) at chromosomal region 11p15.5. Genomics. 37: 253—256. PMID 8921403 DOI:10.1006/geno.1996.0553
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
- Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 DOI:10.1038/nbt827
- Lewandrowski U., Moebius J., Walter U., Sickmann A. (2006). Elucidation of N-glycosylation sites on human platelet proteins: a glycoproteomic approach. Mol. Cell. Proteomics. 5: 226—233. PMID 16263699 DOI:10.1074/mcp.M500324-MCP200
- Krapivinsky G., Krapivinsky L., Stotz S.C., Manasian Y., Clapham D.E. (2011). POST, partner of stromal interaction molecule 1 (STIM1), targets STIM1 to multiple transporters. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 19234—19239. PMID 22084111 DOI:10.1073/pnas.1117231108
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з STIM1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 23 травня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
STIM1 angl Stromal interaction molecule 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 11 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 685 aminokislot a molekulyarna masa 77 423 STIM1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2K60 3TEQ 2MAJ 2MAK 4O9BIdentifikatoriSimvoliSTIM1 D11S4896E GOK IMD10 STRMK TAM TAM1 stromal interaction molecule 1Zovnishni ID OMIM 605921 MGI 107476 HomoloGene 20681 GeneCards STIM1Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaStormorken syndrome tubular aggregate myopathy combined immunodeficiency due to STIM1 deficiency Ontologiya genaMolekulyarna funkciya calcium ion binding calcium channel regulator activity microtubule plus end binding zv yazuvannya z ionom metalu protease binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding identical protein bindingKlitinna komponenta citoplazma integral component of membrane endoplasmic reticulum membrane membrana integral component of plasma membrane cortical endoplasmic reticulum sarcoplasmic reticulum integral component of endoplasmic reticulum membrane endoplazmatichnij retikulum sarcoplasmic reticulum membrane mikrotrubochka citoskelet klitinna membranaBiologichnij proces regulation of cardiac conduction regulation of calcium ion transport ion transport detection of calcium ion enamel mineralization activation of store operated calcium channel activity calcium ion transport cellular calcium ion homeostasis regulation of store operated calcium entry store operated calcium entry positive regulation of angiogenesisDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez6786 20866Ensembl ENSG00000167323 ENSMUSG00000030987UniProt Q13586 P70302RefSeq mRNK NM 003156 NM 001277961 NM 001277962NM 009287 NM 001374058 NM 001374060 NM 001400557RefSeq bilok NP 001264890 NP 001264891 NP 003147 NP 001369495 NP 001369496NP 001369497 NP 001369498 NP 001369499 NP 001369500 NP 001369501 NP 001369502 NP 001369503 NP 001369504 NP 001369505 NP 001369506 NP 001369507 NP 001369508 NP 001369509 NP 001369510NP 033313 NP 001360987 NP 001360989 NP 001387486Lokus UCSC Hr 11 3 85 4 09 MbHr 7 101 92 102 09 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MDVCVRLALWLLWGLLLHQGQSLSHSHSEKATGTSSGANSEESTAAEFCR IDKPLCHSEDEKLSFEAVRNIHKLMDDDANGDVDVEESDEFLREDLNYHD PTVKHSTFHGEDKLISVEDLWKAWKSSEVYNWTVDEVVQWLITYVELPQY EETFRKLQLSGHAMPRLAVTNTTMTGTVLKMTDRSHRQKLQLKALDTVLF GPPLLTRHNHLKDFMLVVSIVIGVGGCWFAYIQNRYSKEHMKKMMKDLEG LHRAEQSLHDLQERLHKAQEEHRTVEVEKVHLEKKLRDEINLAKQEAQRL KELREGTENERSRQKYAEEELEQVREALRKAEKELESHSSWYAPEALQKW LQLTHEVEVQYYNIKKQNAEKQLLVAKEGAEKIKKKRNTLFGTFHVAHSS SLDDVDHKILTAKQALSEVTAALRERLHRWQQIEILCGFQIVNNPGIHSL VAALNIDPSWMGSTRPNPAHFIMTDDVDDMDEEIVSPLSMQSPSLQSSVR QRLTEPQHGLGSQRDLTHSDSESSLHMSDRQRVAPKPPQMSRAADEALNA MTSNGSHRLIEGVHPGSLVEKLPDSPALAKKALLALNHGLDKAHSLMELS PSAPPGGSPHLDSSRSHSPSSPDPDTPSPVGDSRALQASRNTRIPHLAGK KAVAEEDNGSIGEETDSSPGRKKFPLKIFKKPLKK A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transport ioniv transport transport kalciyu Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom kalciyu Lokalizovanij u klitinnij membrani citoplazmi citoskeleti membrani endoplazmatichnomu retikulumi sarkoplazmatichnomu retikulumi LiteraturaParker N J Begley C G Smith P J Fox R M 1996 Molecular cloning of a novel human gene D11S4896E at chromosomal region 11p15 5 Genomics 37 253 256 PMID 8921403 DOI 10 1006 geno 1996 0553 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Carrascal M Ovelleiro D Casas V Gay M Abian J 2008 Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment J Proteome Res 7 5167 5176 PMID 19367720 DOI 10 1021 pr800500r Zhang H Li X J Martin D B Aebersold R 2003 Identification and quantification of N linked glycoproteins using hydrazide chemistry stable isotope labeling and mass spectrometry Nat Biotechnol 21 660 666 PMID 12754519 DOI 10 1038 nbt827 Lewandrowski U Moebius J Walter U Sickmann A 2006 Elucidation of N glycosylation sites on human platelet proteins a glycoproteomic approach Mol Cell Proteomics 5 226 233 PMID 16263699 DOI 10 1074 mcp M500324 MCP200 Krapivinsky G Krapivinsky L Stotz S C Manasian Y Clapham D E 2011 POST partner of stromal interaction molecule 1 STIM1 targets STIM1 to multiple transporters Proc Natl Acad Sci U S A 108 19234 19239 PMID 22084111 DOI 10 1073 pnas 1117231108PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z STIM1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 23 travnya 2017 Procitovano 22 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 26 veresnya 2017 Procitovano 22 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 11 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi