SRI

У Вікіпедії є статті про інші значення цього терміна: SRI (значення).

SRI (англ. Sorcin) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 198 амінокислот, а молекулярна маса — 21 676.

SRI
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1JUO, 2JC2, 4U8D, 4UPG, 4USL
Ідентифікатори
Символи	SRI, CP-22, CP22, SCN, V19, sorcin
Зовнішні ІД	OMIM: 182520 MGI: 98419 HomoloGene: 37736 GeneCards: SRI
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • transmembrane transporter binding • calcium channel regulator activity • зв'язування з іоном металу • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity • protease binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • identical protein binding • signaling receptor binding Клітинна компонента • axon terminus • dendritic spine neck • везикула • гіалоплазма • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • T-tubule • клітинна мембрана • внутрішньоклітинний • sarcoplasmic reticulum • нуклеоплазма • smooth endoplasmic reticulum • аксон • chromaffin granule membrane • Z discdkac • мітохондрія • sarcoplasmic reticulum membrane • екзосома • цитоплазма Біологічний процес • regulation of calcium ion transport • regulation of heart contraction • cytoplasmic sequestering of transcription factor • muscle organ development • positive regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol • negative regulation of heart rate • протеоліз • negative regulation of ryanodine-sensitive calcium-release channel activity • regulation of cardiac muscle cell contraction • heart development • intracellular sequestering of iron ion • regulation of striated muscle contraction • negative regulation of transcription regulatory region DNA binding • regulation of high voltage-gated calcium channel activity • потенціал дії • positive regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus • regulation of cell communication by electrical coupling • regulation of cell communication by electrical coupling involved in cardiac conduction • regulation of relaxation of muscle • regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol by sarcoplasmic reticulum • calcium ion transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of cardiac muscle contraction • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6717	109552
Ensembl	ENSG00000075142	ENSMUSG00000003161
UniProt	P30626	Q6P069
RefSeq (мРНК)	NM_001256891 NM_001256892 NM_003130 NM_198901	NM_001080974 NM_025618
RefSeq (білок)	NP_001243820 NP_001243821 NP_003121 NP_944490	NP_001074443 NP_079894
Локус (UCSC)	Хр. 7: 88.21 – 88.23 Mb	Хр. 5: 8.1 – 8.12 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAYPGHPGAG		GGYYPGGYGG		APGGPAFPGQ		TQDPLYGYFA		AVAGQDGQID
ADELQRCLTQ		SGIAGGYKPF		NLETCRLMVS		MLDRDMSGTM		GFNEFKELWA
VLNGWRQHFI		SFDTDRSGTV		DPQELQKALT		TMGFRLSPQA		VNSIAKRYST
NGKITFDDYI		ACCVKLRALT		DSFRRRDTAQ		QGVVNFPYDD		FIQCVMSV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, саркоплазматичному ретикулумі.

Література

• Wang S.L., Tam M.F., Ho Y.S., Pai S.H., Kao M.C. (1995). Isolation and molecular cloning of human sorcin a calcium-binding protein in vincristine-resistant HOB1 lymphoma cells. Biochim. Biophys. Acta. 1260: 285—293. PMID 7873602 DOI:10.1016/0167-4781(94)00206-I
• Lee W.P. (1996). Purification, cDNA cloning, and expression of human sorcin in vincristine-resistant HOB1 lymphoma cell lines. Arch. Biochem. Biophys. 325: 217—226. PMID 8561500 DOI:10.1006/abbi.1996.0027
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hansen C., Tarabykina S., la Cour J.M., Lollike K., Berchtold M.W. (2003). The PEF family proteins sorcin and grancalcin interact in vivo and in vitro. FEBS Lett. 545: 151—154. PMID 12804766 DOI:10.1016/S0014-5793(03)00518-0
• Xie X., Dwyer M.D., Swenson L., Parker M.H., Botfield M.C. (2001). Crystal structure of calcium-free human sorcin: a member of the penta-EF-hand protein family. Protein Sci. 10: 2419—2425. PMID 11714909 DOI:10.1110/ps.36701

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11292 (англ.) . Архів оригіналу за 7 грудня 2017. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2017-12-07 у Wayback Machine.]
4. UniProt, P30626 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 7