SREBF1 (англ. Sterol regulatory element binding transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 147 амінокислот, а молекулярна маса — 121 675.
SREBF1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SREBF1, SREBP-1c, SREBP1, bHLHd1, SREBP1a, sterol regulatory element binding transcription factor 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 184756 MGI: 107606 HomoloGene: 3079 GeneCards: SREBF1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 17: 17.81 – 17.84 Mb | Хр. 11: 60.09 – 60.11 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MDEPPFSEAA | LEQALGEPCD | LDAALLTDIE | DMLQLINNQD | SDFPGLFDPP | ||||
YAGSGAGGTD | PASPDTSSPG | SLSPPPATLS | SSLEAFLSGP | QAAPSPLSPP | ||||
QPAPTPLKMY | PSMPAFSPGP | GIKEESVPLS | ILQTPTPQPL | PGALLPQSFP | ||||
APAPPQFSST | PVLGYPSPPG | GFSTGSPPGN | TQQPLPGLPL | ASPPGVPPVS | ||||
LHTQVQSVVP | QQLLTVTAAP | TAAPVTTTVT | SQIQQVPVLL | QPHFIKADSL | ||||
LLTAMKTDGA | TVKAAGLSPL | VSGTTVQTGP | LPTLVSGGTI | LATVPLVVDA | ||||
EKLPINRLAA | GSKAPASAQS | RGEKRTAHNA | IEKRYRSSIN | DKIIELKDLV | ||||
VGTEAKLNKS | AVLRKAIDYI | RFLQHSNQKL | KQENLSLRTA | VHKSKSLKDL | ||||
VSACGSGGNT | DVLMEGVKTE | VEDTLTPPPS | DAGSPFQSSP | LSLGSRGSGS | ||||
GGSGSDSEPD | SPVFEDSKAK | PEQRPSLHSR | GMLDRSRLAL | CTLVFLCLSC | ||||
NPLASLLGAR | GLPSPSDTTS | VYHSPGRNVL | GTESRDGPGW | AQWLLPPVVW | ||||
LLNGLLVLVS | LVLLFVYGEP | VTRPHSGPAV | YFWRHRKQAD | LDLARGDFAQ | ||||
AAQQLWLALR | ALGRPLPTSH | LDLACSLLWN | LIRHLLQRLW | VGRWLAGRAG | ||||
GLQQDCALRV | DASASARDAA | LVYHKLHQLH | TMGKHTGGHL | TATNLALSAL | ||||
NLAECAGDAV | SVATLAEIYV | AAALRVKTSL | PRALHFLTRF | FLSSARQACL | ||||
AQSGSVPPAM | QWLCHPVGHR | FFVDGDWSVL | STPWESLYSL | AGNPVDPLAQ | ||||
VTQLFREHLL | ERALNCVTQP | NPSPGSADGD | KEFSDALGYL | QLLNSCSDAA | ||||
GAPAYSFSIS | SSMATTTGVD | PVAKWWASLT | AVVIHWLRRD | EEAAERLCPL | ||||
VEHLPRVLQE | SERPLPRAAL | HSFKAARALL | GCAKAESGPA | SLTICEKASG | ||||
YLQDSLATTP | ASSSIDKAVQ | LFLCDLLLVV | RTSLWRQQQP | PAPAPAAQGT | ||||
SSRPQASALE | LRGFQRDLSS | LRRLAQSFRP | AMRRVFLHEA | TARLMAGASP | ||||
TRTHQLLDRS | LRRRAGPGGK | GGAVAELEPR | PTRREHAEAL | LLASCYLPPG | ||||
FLSAPGQRVG | MLAEAARTLE | KLGDRRLLHD | CQQMLMRLGG | GTTVTSS |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, метаболізм ліпідів, метаболізм холестеролу, метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.
Література
- Hua X., Wu J., Goldstein J.L., Brown M.S., Hobbs H.H. (1995). Structure of the human gene encoding sterol regulatory element binding protein-1 (SREBF1) and localization of SREBF1 and SREBF2 to chromosomes 17p11.2 and 22q13. Genomics. 25: 667—673. PMID 7759101 DOI:10.1016/0888-7543(95)80009-B
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hua X., Sakai J., Brown M.S., Goldstein J.L. (1996). Regulated cleavage of sterol regulatory element binding proteins requires sequences on both sides of the endoplasmic reticulum membrane. J. Biol. Chem. 271: 10379—10384. PMID 8626610 DOI:10.1074/jbc.271.17.10379
- Parraga A., Bellsolell L., Ferre-D'Amare A.R., Burley S.K. (1998). Co-crystal structure of sterol regulatory element binding protein 1a at 2.3-A resolution. Structure. 6: 661—672. PMID 9634703 DOI:10.1016/S0969-2126(98)00067-7
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 20 жовтня 2018. Процитовано 12 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 22 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
SREBF1 angl Sterol regulatory element binding transcription factor 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 17 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 147 aminokislot a molekulyarna masa 121 675 SREBF1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1AM9IdentifikatoriSimvoliSREBF1 SREBP 1c SREBP1 bHLHd1 SREBP1a sterol regulatory element binding transcription factor 1Zovnishni ID OMIM 184756 MGI 107606 HomoloGene 3079 GeneCards SREBF1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding sequence specific DNA binding protein dimerization activity GO 0001131 GO 0001151 GO 0001130 GO 0001204 DNA binding transcription factor activity sterol response element binding chromatin binding GO 0000980 RNA polymerase II cis regulatory region sequence specific DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II core promoter proximal region sequence specific binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding protein kinase binding RNA polymerase II transcription regulatory region sequence specific DNA binding GO 0038050 GO 0004886 GO 0038051 nuclear receptor activity GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specific GO 0001077 GO 0001212 GO 0001213 GO 0001211 GO 0001205 DNA binding transcription activator activity RNA polymerase II specific GO 0032403 protein containing complex binding GO 0010577 enzyme activator activityKlitinna komponenta citoplazma integral component of membrane gialoplazma kompleks Goldzhi nuclear envelope endoplasmic reticulum membrane membrana vnutrishnoklitinna membranna organela Golgi membrane nukleoplazma endoplazmatichnij retikulum ER to Golgi transport vesicle membrane GO 0016023 cytoplasmic vesicle klitinne yadro GO 0009327 protein containing complexBiologichnij proces positive regulation of histone deacetylation GO 1901047 insulin receptor signaling pathway positive regulation of triglyceride biosynthetic process steroid metabolic process negative regulation of insulin secretion response to fatty acid lipid biosynthetic process response to glucagon regulation of protein stability GO 0009373 regulation of transcription DNA templated response to retinoic acid GO 1904578 response to organic cyclic compound lung development lipid metabolism regulation of insulin secretion GO 0044324 GO 0003256 GO 1901213 GO 0046019 GO 0046020 GO 1900094 GO 0061216 GO 0060994 GO 1902064 GO 0003258 GO 0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II cellular response to starvation response to progesterone GO 0010260 starinnya lyudini response to peptide hormone mRNA transcription by RNA polymerase II cholesterol metabolic process GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II response to glucose transcription DNA templated GO 0060469 GO 0009371 positive regulation of transcription DNA templated response to lipid cellular response to fatty acid regulation of autophagy of mitochondrion regulation of protein targeting to mitochondrion regulation of fatty acid metabolic process cirkadnij ritm cellular response to insulin stimulus response to food positive regulation of cholesterol biosynthetic process response to cAMP regulation of heart rate by chemical signal fat cell differentiation intracellular receptor signaling pathway GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II regulation of cholesterol biosynthetic process transcription by RNA polymerase II positive regulation of pri miRNA transcription by RNA polymerase II GO 0048554 positive regulation of catalytic activityDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez6720 20787Ensembl ENSG00000072310 ENSMUSG00000020538UniProt P36956 Q9WTN3RefSeq mRNK NM 001005291 NM 004176 NM 001321096NM 011480 NM 001313979 NM 001358314 NM 001358315RefSeq bilok NP 001005291 NP 001308025 NP 004167NP 001300908 NP 035610 NP 001345243 NP 001345244Lokus UCSC Hr 17 17 81 17 84 MbHr 11 60 09 60 11 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MDEPPFSEAALEQALGEPCDLDAALLTDIEDMLQLINNQDSDFPGLFDPP YAGSGAGGTDPASPDTSSPGSLSPPPATLSSSLEAFLSGPQAAPSPLSPP QPAPTPLKMYPSMPAFSPGPGIKEESVPLSILQTPTPQPLPGALLPQSFP APAPPQFSSTPVLGYPSPPGGFSTGSPPGNTQQPLPGLPLASPPGVPPVS LHTQVQSVVPQQLLTVTAAPTAAPVTTTVTSQIQQVPVLLQPHFIKADSL LLTAMKTDGATVKAAGLSPLVSGTTVQTGPLPTLVSGGTILATVPLVVDA EKLPINRLAAGSKAPASAQSRGEKRTAHNAIEKRYRSSINDKIIELKDLV VGTEAKLNKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLSLRTAVHKSKSLKDL VSACGSGGNTDVLMEGVKTEVEDTLTPPPSDAGSPFQSSPLSLGSRGSGS GGSGSDSEPDSPVFEDSKAKPEQRPSLHSRGMLDRSRLALCTLVFLCLSC NPLASLLGARGLPSPSDTTSVYHSPGRNVLGTESRDGPGWAQWLLPPVVW LLNGLLVLVSLVLLFVYGEPVTRPHSGPAVYFWRHRKQADLDLARGDFAQ AAQQLWLALRALGRPLPTSHLDLACSLLWNLIRHLLQRLWVGRWLAGRAG GLQQDCALRVDASASARDAALVYHKLHQLHTMGKHTGGHLTATNLALSAL NLAECAGDAVSVATLAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRFFLSSARQACL AQSGSVPPAMQWLCHPVGHRFFVDGDWSVLSTPWESLYSLAGNPVDPLAQ VTQLFREHLLERALNCVTQPNPSPGSADGDKEFSDALGYLQLLNSCSDAA GAPAYSFSISSSMATTTGVDPVAKWWASLTAVVIHWLRRDEEAAERLCPL VEHLPRVLQESERPLPRAALHSFKAARALLGCAKAESGPASLTICEKASG YLQDSLATTPASSSIDKAVQLFLCDLLLVVRTSLWRQQQPPAPAPAAQGT SSRPQASALELRGFQRDLSSLRRLAQSFRPAMRRVFLHEATARLMAGASP TRTHQLLDRSLRRRAGPGGKGGAVAELEPRPTRREHAEALLLASCYLPPG FLSAPGQRVGMLAEAARTLEKLGDRRLLHDCQQMLMRLGGGTTVTSS A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do aktivatoriv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi metabolizm lipidiv metabolizm holesterolu metabolizm steroyidiv metabolizm steroliv alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z DNK Lokalizovanij u yadri membrani endoplazmatichnomu retikulumi citoplazmatichnih vezikulah aparati goldzhi LiteraturaHua X Wu J Goldstein J L Brown M S Hobbs H H 1995 Structure of the human gene encoding sterol regulatory element binding protein 1 SREBF1 and localization of SREBF1 and SREBF2 to chromosomes 17p11 2 and 22q13 Genomics 25 667 673 PMID 7759101 DOI 10 1016 0888 7543 95 80009 B The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Hua X Sakai J Brown M S Goldstein J L 1996 Regulated cleavage of sterol regulatory element binding proteins requires sequences on both sides of the endoplasmic reticulum membrane J Biol Chem 271 10379 10384 PMID 8626610 DOI 10 1074 jbc 271 17 10379 Parraga A Bellsolell L Ferre D Amare A R Burley S K 1998 Co crystal structure of sterol regulatory element binding protein 1a at 2 3 A resolution Structure 6 661 672 PMID 9634703 DOI 10 1016 S0969 2126 98 00067 7PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 20 zhovtnya 2018 Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 22 lipnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 17 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi