SPARC (англ. Secreted protein acidic and cysteine rich) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 303 амінокислот, а молекулярна маса — 34 632.
SPARC | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SPARC, BM-40, ON, OI17, secreted protein acidic and cysteine rich, ONT | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 182120 MGI: 98373 HomoloGene: 31132 GeneCards: SPARC | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
osteogenesis imperfecta type 17 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 5: 151.66 – 151.69 Mb | Хр. 11: 55.29 – 55.31 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MRAWIFFLLC | LAGRALAAPQ | QEALPDETEV | VEETVAEVTE | VSVGANPVQV | ||||
EVGEFDDGAE | ETEEEVVAEN | PCQNHHCKHG | KVCELDENNT | PMCVCQDPTS | ||||
CPAPIGEFEK | VCSNDNKTFD | SSCHFFATKC | TLEGTKKGHK | LHLDYIGPCK | ||||
YIPPCLDSEL | TEFPLRMRDW | LKNVLVTLYE | RDEDNNLLTE | KQKLRVKKIH | ||||
ENEKRLEAGD | HPVELLARDF | EKNYNMYIFP | VHWQFGQLDQ | HPIDGYLSHT | ||||
ELAPLRAPLI | PMEHCTTRFF | ETCDLDNDKY | IALDEWAGCF | GIKQKDIDKD | ||||
LVI |
Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном міді, іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Lankat-Buttgereit B., Mann K., Deutzmann R., Timpl R., Krieg T. (1988). Cloning and complete amino acid sequences of human and murine basement membrane protein BM-40 (SPARC, osteonectin). FEBS Lett. 236: 352—356. PMID 3410046 DOI:10.1016/0014-5793(88)80054-1
- Swaroop A., Hogan B.L.M., Francke U. (1988). Molecular analysis of the cDNA for human SPARC/osteonectin/BM-40: sequence, expression, and localization of the gene to chromosome 5q31-q33. Genomics. 2: 37—47. PMID 2838412 DOI:10.1016/0888-7543(88)90107-3
- Villarreal X.C., Mann K.G., Long G.L. (1989). Structure of human osteonectin based upon analysis of cDNA and genomic sequences. Biochemistry. 28: 6483—6491. PMID 2790009 DOI:10.1021/bi00441a049
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hunzelmann N., Hafner M., Anders S., Krieg T., Nischt R. (1998). BM-40 (osteonectin, SPARC) is expressed both in the epidermal and in the dermal compartment of adult human skin. J. Invest. Dermatol. 110: 122—126. PMID 9457905 DOI:10.1046/j.1523-1747.1998.00094.x
- Hohenester E., Maurer P., Timpl R. (1997). Crystal structure of a pair of follistatin-like and EF-hand calcium-binding domains in BM-40. EMBO J. 16: 3778—3786. PMID 9233787 DOI:10.1093/emboj/16.13.3778
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з SPARC переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 3 квітня 2016. Процитовано 31 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 2 вересня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
SPARC angl Secreted protein acidic and cysteine rich bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 5 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 303 aminokislot a molekulyarna masa 34 632 SPARCNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1BMO 1NUB 1SRA 2V53IdentifikatoriSimvoliSPARC BM 40 ON OI17 secreted protein acidic and cysteine rich ONTZovnishni ID OMIM 182120 MGI 98373 HomoloGene 31132 GeneCards SPARCPov yazani genetichni zahvoryuvannyaosteogenesis imperfecta type 17 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya calcium ion binding zv yazuvannya z ionom metalu GO 0001948 GO 0016582 protein binding extracellular matrix binding collagen binding extracellular matrix structural constituentKlitinna komponenta citoplazma platelet alpha granule endocytic vesicle lumen nuclear matrix klitinna membrana vnutrishnoklitinnij bazalna membrana cell surface platelet alpha granule membrane mitohondriya platelet alpha granule lumen klitinne yadro mizhklitinnij prostir vezikula extracellular region GO 0005578 Pozaklitinna matricya sinaps collagen containing extracellular matrix glutamatergic synapseBiologichnij proces response to cytokine response to cadmium ion osifikaciya lung development cellular response to growth factor stimulus response to peptide hormone platelet degranulation extracellular matrix organization response to L ascorbic acid response to glucocorticoid Zagoyennya ran receptor oposeredkovanij endocitoz negative regulation of endothelial cell proliferation positive regulation of endothelial cell migration response to calcium ion response to gravity heart development response to lipopolysaccharide response to lead ion regulation of cell population proliferation negative regulation of angiogenesis inner ear development regulation of cell morphogenesis response to cAMP response to ethanol bone development GO 0072468 signalna transdukciya pigmentation GO 1904739 regulation of synapse organizationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez6678 20692Ensembl ENSG00000113140 ENSMUSG00000018593UniProt P09486 P07214RefSeq mRNK NM 003118 NM 001309443 NM 001309444NM 009242 NM 001290817RefSeq bilok NP 001296372 NP 001296373 NP 003109NP 001277746 NP 033268Lokus UCSC Hr 5 151 66 151 69 MbHr 11 55 29 55 31 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MRAWIFFLLCLAGRALAAPQQEALPDETEVVEETVAEVTEVSVGANPVQV EVGEFDDGAEETEEEVVAENPCQNHHCKHGKVCELDENNTPMCVCQDPTS CPAPIGEFEKVCSNDNKTFDSSCHFFATKCTLEGTKKGHKLHLDYIGPCK YIPPCLDSELTEFPLRMRDWLKNVLVTLYERDEDNNLLTEKQKLRVKKIH ENEKRLEAGDHPVELLARDFEKNYNMYIFPVHWQFGQLDQHPIDGYLSHT ELAPLRAPLIPMEHCTTRFFETCDLDNDKYIALDEWAGCFGIKQKDIDKD LVI A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak polimorfizm Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionom midi ionami metaliv ionom kalciyu Lokalizovanij u pozaklitinnomu matriksi bazalnij membrani Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaLankat Buttgereit B Mann K Deutzmann R Timpl R Krieg T 1988 Cloning and complete amino acid sequences of human and murine basement membrane protein BM 40 SPARC osteonectin FEBS Lett 236 352 356 PMID 3410046 DOI 10 1016 0014 5793 88 80054 1 Swaroop A Hogan B L M Francke U 1988 Molecular analysis of the cDNA for human SPARC osteonectin BM 40 sequence expression and localization of the gene to chromosome 5q31 q33 Genomics 2 37 47 PMID 2838412 DOI 10 1016 0888 7543 88 90107 3 Villarreal X C Mann K G Long G L 1989 Structure of human osteonectin based upon analysis of cDNA and genomic sequences Biochemistry 28 6483 6491 PMID 2790009 DOI 10 1021 bi00441a049 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Hunzelmann N Hafner M Anders S Krieg T Nischt R 1998 BM 40 osteonectin SPARC is expressed both in the epidermal and in the dermal compartment of adult human skin J Invest Dermatol 110 122 126 PMID 9457905 DOI 10 1046 j 1523 1747 1998 00094 x Hohenester E Maurer P Timpl R 1997 Crystal structure of a pair of follistatin like and EF hand calcium binding domains in BM 40 EMBO J 16 3778 3786 PMID 9233787 DOI 10 1093 emboj 16 13 3778PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z SPARC pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 3 kvitnya 2016 Procitovano 31 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 2 veresnya 2017 Procitovano 31 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 5 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi