SPARCL1 (англ. SPARC like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 664 амінокислот, а молекулярна маса — 75 208.
SPARCL1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SPARCL1, MAST 9, MAST9, PIG33, SC1, SPARC like 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 606041 MGI: 108110 HomoloGene: 3438 GeneCards: SPARCL1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 4: 87.47 – 87.53 Mb | Хр. 5: 104.23 – 104.26 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MKTGLFFLCL | LGTAAAIPTN | ARLLSDHSKP | TAETVAPDNT | AIPSLRAEAE | ||||
ENEKETAVST | EDDSHHKAEK | SSVLKSKEES | HEQSAEQGKS | SSQELGLKDQ | ||||
EDSDGHLSVN | LEYAPTEGTL | DIKEDMSEPQ | EKKLSENTDF | LAPGVSSFTD | ||||
SNQQESITKR | EENQEQPRNY | SHHQLNRSSK | HSQGLRDQGN | QEQDPNISNG | ||||
EEEEEKEPGE | VGTHNDNQER | KTELPREHAN | SKQEEDNTQS | DDILEESDQP | ||||
TQVSKMQEDE | FDQGNQEQED | NSNAEMEEEN | ASNVNKHIQE | TEWQSQEGKT | ||||
GLEAISNHKE | TEEKTVSEAL | LMEPTDDGNT | TPRNHGVDDD | GDDDGDDGGT | ||||
DGPRHSASDD | YFIPSQAFLE | AERAQSIAYH | LKIEEQREKV | HENENIGTTE | ||||
PGEHQEAKKA | ENSSNEEETS | SEGNMRVHAV | DSCMSFQCKR | GHICKADQQG | ||||
KPHCVCQDPV | TCPPTKPLDQ | VCGTDNQTYA | SSCHLFATKC | RLEGTKKGHQ | ||||
LQLDYFGACK | SIPTCTDFEV | IQFPLRMRDW | LKNILMQLYE | ANSEHAGYLN | ||||
EKQRNKVKKI | YLDEKRLLAG | DHPIDLLLRD | FKKNYHMYVY | PVHWQFSELD | ||||
QHPMDRVLTH | SELAPLRASL | VPMEHCITRF | FEECDPNKDK | HITLKEWGHC | ||||
FGIKEEDIDE | NLLF |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- Girard J.-P., Springer T.A. (1995). Cloning from purified high endothelial venule cells of hevin, a close relative of the antiadhesive extracellular matrix protein SPARC. Immunity. 2: 113—123. PMID 7600298 DOI:10.1016/1074-7613(95)90083-7
- Halim A., Ruetschi U., Larson G., Nilsson J. (2013). LC-MS/MS characterization of O-glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins. J. Proteome Res. 12: 573—584. PMID 23234360 DOI:10.1021/pr300963h
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 22 листопада 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
SPARCL1 angl SPARC like 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 4 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 664 aminokislot a molekulyarna masa 75 208 SPARCL1IdentifikatoriSimvoliSPARCL1 MAST 9 MAST9 PIG33 SC1 SPARC like 1Zovnishni ID OMIM 606041 MGI 108110 HomoloGene 3438 GeneCards SPARCL1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya zv yazuvannya z ionom metalu calcium ion binding collagen binding extracellular matrix binding GO 0001948 GO 0016582 protein bindingKlitinna komponenta ekzosoma mizhklitinnij prostir endoplasmic reticulum lumen extracellular region collagen containing extracellular matrix glutamatergic synapseBiologichnij proces GO 0072468 signalna transdukciya GO 1903374 anatomical structure development posttranslyacijna modifikaciya synaptic membrane adhesionDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez8404 13602Ensembl ENSG00000152583 ENSMUSG00000029309UniProt Q14515 P70663RefSeq mRNK NM 004684 NM 001128310 NM 001291976 NM 001291977NM 010097 NM 001359014 NM 001359016RefSeq bilok NP 001121782 NP 001278905 NP 001278906 NP 004675NP 034227 NP 001345943 NP 001345945Lokus UCSC Hr 4 87 47 87 53 MbHr 5 104 23 104 26 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MKTGLFFLCLLGTAAAIPTNARLLSDHSKPTAETVAPDNTAIPSLRAEAE ENEKETAVSTEDDSHHKAEKSSVLKSKEESHEQSAEQGKSSSQELGLKDQ EDSDGHLSVNLEYAPTEGTLDIKEDMSEPQEKKLSENTDFLAPGVSSFTD SNQQESITKREENQEQPRNYSHHQLNRSSKHSQGLRDQGNQEQDPNISNG EEEEEKEPGEVGTHNDNQERKTELPREHANSKQEEDNTQSDDILEESDQP TQVSKMQEDEFDQGNQEQEDNSNAEMEEENASNVNKHIQETEWQSQEGKT GLEAISNHKETEEKTVSEALLMEPTDDGNTTPRNHGVDDDGDDDGDDGGT DGPRHSASDDYFIPSQAFLEAERAQSIAYHLKIEEQREKVHENENIGTTE PGEHQEAKKAENSSNEEETSSEGNMRVHAVDSCMSFQCKRGHICKADQQG KPHCVCQDPVTCPPTKPLDQVCGTDNQTYASSCHLFATKCRLEGTKKGHQ LQLDYFGACKSIPTCTDFEVIQFPLRMRDWLKNILMQLYEANSEHAGYLN EKQRNKVKKIYLDEKRLLAGDHPIDLLLRDFKKNYHMYVYPVHWQFSELD QHPMDRVLTHSELAPLRASLVPMEHCITRFFEECDPNKDKHITLKEWGHC FGIKEEDIDENLLF A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak polimorfizm alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom kalciyu Lokalizovanij u pozaklitinnomu matriksi Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaGirard J P Springer T A 1995 Cloning from purified high endothelial venule cells of hevin a close relative of the antiadhesive extracellular matrix protein SPARC Immunity 2 113 123 PMID 7600298 DOI 10 1016 1074 7613 95 90083 7 Halim A Ruetschi U Larson G Nilsson J 2013 LC MS MS characterization of O glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins J Proteome Res 12 573 584 PMID 23234360 DOI 10 1021 pr300963hPrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 14 zhovtnya 2017 Procitovano 30 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 22 listopada 2016 Procitovano 30 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 4 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi