SP1 (англ. Sp1 transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 785 амінокислот, а молекулярна маса — 80 693.
SP1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SP1, entrez:6667, Sp1 transcription factor | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 189906 MGI: 98372 HomoloGene: 8276 GeneCards: SP1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 12: 53.38 – 53.42 Mb | Хр. 15: 102.31 – 102.34 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSDQDHSMDE | MTAVVKIEKG | VGGNNGGNGN | GGGAFSQARS | SSTGSSSSTG | ||||
GGGQESQPSP | LALLAATCSR | IESPNENSNN | SQGPSQSGGT | GELDLTATQL | ||||
SQGANGWQII | SSSSGATPTS | KEQSGSSTNG | SNGSESSKNR | TVSGGQYVVA | ||||
AAPNLQNQQV | LTGLPGVMPN | IQYQVIPQFQ | TVDGQQLQFA | ATGAQVQQDG | ||||
SGQIQIIPGA | NQQIITNRGS | GGNIIAAMPN | LLQQAVPLQG | LANNVLSGQT | ||||
QYVTNVPVAL | NGNITLLPVN | SVSAATLTPS | SQAVTISSSG | SQESGSQPVT | ||||
SGTTISSASL | VSSQASSSSF | FTNANSYSTT | TTTSNMGIMN | FTTSGSSGTN | ||||
SQGQTPQRVS | GLQGSDALNI | QQNQTSGGSL | QAGQQKEGEQ | NQQTQQQQIL | ||||
IQPQLVQGGQ | ALQALQAAPL | SGQTFTTQAI | SQETLQNLQL | QAVPNSGPII | ||||
IRTPTVGPNG | QVSWQTLQLQ | NLQVQNPQAQ | TITLAPMQGV | SLGQTSSSNT | ||||
TLTPIASAAS | IPAGTVTVNA | AQLSSMPGLQ | TINLSALGTS | GIQVHPIQGL | ||||
PLAIANAPGD | HGAQLGLHGA | GGDGIHDDTA | GGEEGENSPD | AQPQAGRRTR | ||||
REACTCPYCK | DSEGRGSGDP | GKKKQHICHI | QGCGKVYGKT | SHLRAHLRWH | ||||
TGERPFMCTW | SYCGKRFTRS | DELQRHKRTH | TGEKKFACPE | CPKRFMRSDH | ||||
LSKHIKTHQN | KKGGPGVALS | VGTLPLDSGA | GSEGSGTATP | SALITTNMVA | ||||
MEAICPEGIA | RLANSGINVM | QVADLQSINI | SGNGF |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Takahara T., Kanazu S., Yanagisawa S., Akanuma H. (2000). Heterogeneous Sp1 mRNAs in human HepG2 cells include a product of homotypic trans-splicing. J. Biol. Chem. 275: 38067—38072. PMID 10973950 DOI:10.1074/jbc.M002010200
- Kadonaga J.T., Carner K.R., Masiarz F.R., Tjian R. (1987). Isolation of cDNA encoding transcription factor Sp1 and functional analysis of the DNA binding domain. Cell. 51: 1079—1090. PMID 3319186 DOI:10.1016/0092-8674(87)90594-0
- Jackson S.P., Tjian R. (1988). O-glycosylation of eukaryotic transcription factors: implications for mechanisms of transcriptional regulation. Cell. 55: 125—133. PMID 3139301 DOI:10.1016/0092-8674(88)90015-3
- Courey A.J., Tjian R. (1988). Analysis of Sp1 in vivo reveals multiple transcriptional domains, including a novel glutamine-rich activation motif. Cell. 55: 887—898. PMID 3142690 DOI:10.1016/0092-8674(88)90144-4
- Wang L., Mukherjee S., Jia F., Narayan O., Zhao L.J. (1995). Interaction of virion protein Vpr of human immunodeficiency virus type 1 with cellular transcription factor Sp1 and trans-activation of viral long terminal repeat. J. Biol. Chem. 270: 25564—25569. PMID 7592727 DOI:10.1074/jbc.270.43.25564
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11205 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
SP1 angl Sp1 transcription factor bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 12 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 785 aminokislot a molekulyarna masa 80 693 SP1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSBSpisok kodiv PDB1SP1 1SP2 1VA1 1VA2 1VA3IdentifikatoriSimvoliSP1 entrez 6667 Sp1 transcription factorZovnishni ID OMIM 189906 MGI 98372 HomoloGene 8276 GeneCards SP1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya protein homodimerization activity HMG box domain binding transcription factor binding histone deacetylase binding zv yazuvannya z ionom metalu transcription factor activity RNA polymerase II core promoter proximal region sequence specific binding bHLH transcription factor binding protein C terminus binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding histone acetyltransferase binding nucleic acid binding sequence specific DNA binding RNA polymerase II transcription regulatory region sequence specific DNA binding DNA binding double stranded DNA binding GO 0001077 GO 0001212 GO 0001213 GO 0001211 GO 0001205 DNA binding transcription activator activity RNA polymerase II specific GO 0001131 GO 0001151 GO 0001130 GO 0001204 DNA binding transcription factor activity GO 0000980 RNA polymerase II cis regulatory region sequence specific DNA binding core promoter sequence specific DNA binding GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specific GO 0001158 cis regulatory region sequence specific DNA bindingKlitinna komponenta citoplazma nukleoplazma protein DNA complex klitinne yadro transcription repressor complexBiologichnij proces positive regulation of hydrogen sulfide biosynthetic process ritmichnij proces GO 0044324 GO 0003256 GO 1901213 GO 0046019 GO 0046020 GO 1900094 GO 0061216 GO 0060994 GO 1902064 GO 0003258 GO 0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II GO 0060469 GO 0009371 positive regulation of transcription DNA templated GO 0022415 viral process GO 0009373 regulation of transcription DNA templated transcription DNA templated snRNA transcription by RNA polymerase II cellular response to insulin stimulus GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II regulation of cholesterol biosynthetic process GO 1901313 positive regulation of gene expression positive regulation of blood vessel endothelial cell migration positive regulation of angiogenesis positive regulation of vascular endothelial cell proliferation response to hydroperoxideDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez6667 20683Ensembl ENSG00000185591 ENSMUSG00000001280UniProt P08047 O89090RefSeq mRNK NM 001251825 NM 003109 NM 138473NM 013672RefSeq bilok NP 001238754 NP 003100 NP 612482NP 038700Lokus UCSC Hr 12 53 38 53 42 MbHr 15 102 31 102 34 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishejPoslidovnist aminokislot1020304050MSDQDHSMDEMTAVVKIEKGVGGNNGGNGNGGGAFSQARSSSTGSSSSTGGGGQESQPSPLALLAATCSRIESPNENSNNSQGPSQSGGTGELDLTATQLSQGANGWQIISSSSGATPTSKEQSGSSTNGSNGSESSKNRTVSGGQYVVAAAPNLQNQQVLTGLPGVMPNIQYQVIPQFQTVDGQQLQFAATGAQVQQDGSGQIQIIPGANQQIITNRGSGGNIIAAMPNLLQQAVPLQGLANNVLSGQTQYVTNVPVALNGNITLLPVNSVSAATLTPSSQAVTISSSGSQESGSQPVTSGTTISSASLVSSQASSSSFFTNANSYSTTTTTSNMGIMNFTTSGSSGTNSQGQTPQRVSGLQGSDALNIQQNQTSGGSLQAGQQKEGEQNQQTQQQQILIQPQLVQGGQALQALQAAPLSGQTFTTQAISQETLQNLQLQAVPNSGPIIIRTPTVGPNGQVSWQTLQLQNLQVQNPQAQTITLAPMQGVSLGQTSSSNTTLTPIASAASIPAGTVTVNAAQLSSMPGLQTINLSALGTSGIQVHPIQGLPLAIANAPGDHGAQLGLHGAGGDGIHDDTAGGEEGENSPDAQPQAGRRTRREACTCPYCKDSEGRGSGDPGKKKQHICHIQGCGKVYGKTSHLRAHLRWHTGERPFMCTWSYCGKRFTRSDELQRHKRTHTGEKKFACPECPKRFMRSDHLSKHIKTHQNKKGGPGVALSVGTLPLDSGAGSEGSGTATPSALITTNMVAMEAICPEGIARLANSGINVMQVADLQSINISGNGFA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do represoriv aktivatoriv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak vzayemodiya hazyayin virus transkripciya regulyaciya transkripciyi biologichni ritmi acetilyuvannya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku DNK Lokalizovanij u citoplazmi yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Takahara T Kanazu S Yanagisawa S Akanuma H 2000 Heterogeneous Sp1 mRNAs in human HepG2 cells include a product of homotypic trans splicing J Biol Chem 275 38067 38072 PMID 10973950 DOI 10 1074 jbc M002010200 Kadonaga J T Carner K R Masiarz F R Tjian R 1987 Isolation of cDNA encoding transcription factor Sp1 and functional analysis of the DNA binding domain Cell 51 1079 1090 PMID 3319186 DOI 10 1016 0092 8674 87 90594 0 Jackson S P Tjian R 1988 O glycosylation of eukaryotic transcription factors implications for mechanisms of transcriptional regulation Cell 55 125 133 PMID 3139301 DOI 10 1016 0092 8674 88 90015 3 Courey A J Tjian R 1988 Analysis of Sp1 in vivo reveals multiple transcriptional domains including a novel glutamine rich activation motif Cell 55 887 898 PMID 3142690 DOI 10 1016 0092 8674 88 90144 4 Wang L Mukherjee S Jia F Narayan O Zhao L J 1995 Interaction of virion protein Vpr of human immunodeficiency virus type 1 with cellular transcription factor Sp1 and trans activation of viral long terminal repeat J Biol Chem 270 25564 25569 PMID 7592727 DOI 10 1074 jbc 270 43 25564PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 11205 angl Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 17 serpnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 12Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi