SOS1 (англ. SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 333 амінокислот, а молекулярна маса — 152 464.
SOS1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SOS1, GF1, GGF1, GINGF, HGF, NS4, SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1, SOS-1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 182530 MGI: 98354 HomoloGene: 4117 GeneCards: SOS1 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
Noonan syndrome 4 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 2: 38.96 – 39.12 Mb | Хр. 17: 80.7 – 80.79 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MQAQQLPYEF | FSEENAPKWR | GLLVPALKKV | QGQVHPTLES | NDDALQYVEE | ||||
LILQLLNMLC | QAQPRSASDV | EERVQKSFPH | PIDKWAIADA | QSAIEKRKRR | ||||
NPLSLPVEKI | HPLLKEVLGY | KIDHQVSVYI | VAVLEYISAD | ILKLVGNYVR | ||||
NIRHYEITKQ | DIKVAMCADK | VLMDMFHQDV | EDINILSLTD | EEPSTSGEQT | ||||
YYDLVKAFMA | EIRQYIRELN | LIIKVFREPF | VSNSKLFSAN | DVENIFSRIV | ||||
DIHELSVKLL | GHIEDTVEMT | DEGSPHPLVG | SCFEDLAEEL | AFDPYESYAR | ||||
DILRPGFHDR | FLSQLSKPGA | ALYLQSIGEG | FKEAVQYVLP | RLLLAPVYHC | ||||
LHYFELLKQL | EEKSEDQEDK | ECLKQAITAL | LNVQSGMEKI | CSKSLAKRRL | ||||
SESACRFYSQ | QMKGKQLAIK | KMNEIQKNID | GWEGKDIGQC | CNEFIMEGTL | ||||
TRVGAKHERH | IFLFDGLMIC | CKSNHGQPRL | PGASNAEYRL | KEKFFMRKVQ | ||||
INDKDDTNEY | KHAFEIILKD | ENSVIFSAKS | AEEKNNWMAA | LISLQYRSTL | ||||
ERMLDVTMLQ | EEKEEQMRLP | SADVYRFAEP | DSEENIIFEE | NMQPKAGIPI | ||||
IKAGTVIKLI | ERLTYHMYAD | PNFVRTFLTT | YRSFCKPQEL | LSLIIERFEI | ||||
PEPEPTEADR | IAIENGDQPL | SAELKRFRKE | YIQPVQLRVL | NVCRHWVEHH | ||||
FYDFERDAYL | LQRMEEFIGT | VRGKAMKKWV | ESITKIIQRK | KIARDNGPGH | ||||
NITFQSSPPT | VEWHISRPGH | IETFDLLTLH | PIEIARQLTL | LESDLYRAVQ | ||||
PSELVGSVWT | KEDKEINSPN | LLKMIRHTTN | LTLWFEKCIV | ETENLEERVA | ||||
VVSRIIEILQ | VFQELNNFNG | VLEVVSAMNS | SPVYRLDHTF | EQIPSRQKKI | ||||
LEEAHELSED | HYKKYLAKLR | SINPPCVPFF | GIYLTNILKT | EEGNPEVLKR | ||||
HGKELINFSK | RRKVAEITGE | IQQYQNQPYC | LRVESDIKRF | FENLNPMGNS | ||||
MEKEFTDYLF | NKSLEIEPRN | PKPLPRFPKK | YSYPLKSPGV | RPSNPRPGTM | ||||
RHPTPLQQEP | RKISYSRIPE | SETESTASAP | NSPRTPLTPP | PASGASSTTD | ||||
VCSVFDSDHS | SPFHSSNDTV | FIQVTLPHGP | RSASVSSISL | TKGTDEVPVP | ||||
PPVPPRRRPE | SAPAESSPSK | IMSKHLDSPP | AIPPRQPTSK | AYSPRYSISD | ||||
RTSISDPPES | PPLLPPREPV | RTPDVFSSSP | LHLQPPPLGK | KSDHGNAFFP | ||||
NSPSPFTPPP | PQTPSPHGTR | RHLPSPPLTQ | EVDLHSIAGP | PVPPRQSTSQ | ||||
HIPKLPPKTY | KREHTHPSMH | RDGPPLLENA | HSS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг.
Література
- Braverman L.E., Quilliam L.A. (1999). Identification of Grb4/Nckbeta, a src homology 2 and 3 domain-containing adapter protein having similar binding and biological properties to Nck. J. Biol. Chem. 274: 5542—5549. PMID 10026169 DOI:10.1074/jbc.274.9.5542
- Soisson S.M., Nimnual A.S., Uy M., Bar-Sagi D., Kuriyan J. (1998). Crystal structure of the Dbl and pleckstrin homology domains from the human Son of sevenless protein. Cell. 95: 259—268. PMID 9790532 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81756-0
- Ko J.M., Kim J.M., Kim G.H., Yoo H.W. (2008). PTPN11, SOS1, KRAS, and RAF1 gene analysis, and genotype-phenotype correlation in Korean patients with Noonan syndrome. J. Hum. Genet. 53: 999—1006. PMID 19020799 DOI:10.1007/s10038-008-0343-6
- Hanna N., Parfait B., Talaat I.M., Vidaud M., Elsedfy H.H. (2009). SOS1: a new player in the Noonan-like/multiple giant cell lesion syndrome. Clin. Genet. 75: 568—571. PMID 19438935 DOI:10.1111/j.1399-0004.2009.01149.x
- Pandey P., Kharbanda S., Kufe D. (1995). Association of the DF3/MUC1 breast cancer antigen with Grb2 and the Sos/Ras exchange protein. Cancer Res. 55: 4000—4003. PMID 7664271
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з SOS1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11187 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 16 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
SOS1 angl SOS Ras Rac guanine nucleotide exchange factor 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 2 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 333 aminokislot a molekulyarna masa 152 464 SOS1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1AWE 1BKD 1DBH 1NVU 1NVV 1NVW 1NVX 1Q9C 1XD2 1XD4 1XDV 3KSY 4NYI 4NYJ 4NYM 4URU 4URV 4URW 4URX 4URY 4URZ 4US0 4US1 4US2 2II0IdentifikatoriSimvoliSOS1 GF1 GGF1 GINGF HGF NS4 SOS Ras Rac guanine nucleotide exchange factor 1 SOS 1Zovnishni ID OMIM 182530 MGI 98354 HomoloGene 4117 GeneCards SOS1Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaNoonan syndrome 4 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding GO 0005097 GO 0005099 GO 0005100 GTPase activator activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding protein heterodimerization activity guanyl nucleotide exchange factor activity SH3 domain bindingKlitinna komponenta gialoplazma GO 0097483 GO 0097481 postsinaptichne ushilnennya klitinna membrana neuronal cell body citoplazma NukleosomaBiologichnij proces regulation of pro B cell differentiation hair follicle development GO 1901047 insulin receptor signaling pathway roof of mouth development heart trabecula morphogenesis regulation of T cell proliferation positive regulation of small GTPase mediated signal transduction blood vessel morphogenesis epidermal growth factor receptor signaling pathway vitellogenesis multicellular organism growth lymphocyte homeostasis heart morphogenesis B cell homeostasis eyelid development in camera type eye MAPK cascade axon guidance Fc epsilon receptor signaling pathway regulation of T cell differentiation in thymus pericardium morphogenesis positive regulation of apoptotic process midbrain morphogenesis cardiac atrium morphogenesis Ras protein signal transduction regulation of Rho protein signal transduction regulation of small GTPase mediated signal transduction positive regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway leukocyte migration GO 0072468 signalna transdukciya GO 0032320 GO 0032321 GO 0032855 GO 0043089 GO 0032854 positive regulation of GTPase activity small GTPase mediated signal transduction ERBB2 signaling pathway G protein coupled receptor signaling pathway cytokine mediated signaling pathway neurotrophin TRK receptor signaling pathwayDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez6654 20662Ensembl ENSG00000115904 ENSMUSG00000024241UniProt Q07889 Q62245RefSeq mRNK NM 005633 NM 001382394 NM 001382395NM 009231RefSeq bilok NP 005624 NP 001369323 NP 001369324NP 033257Lokus UCSC Hr 2 38 96 39 12 MbHr 17 80 7 80 79 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MQAQQLPYEFFSEENAPKWRGLLVPALKKVQGQVHPTLESNDDALQYVEE LILQLLNMLCQAQPRSASDVEERVQKSFPHPIDKWAIADAQSAIEKRKRR NPLSLPVEKIHPLLKEVLGYKIDHQVSVYIVAVLEYISADILKLVGNYVR NIRHYEITKQDIKVAMCADKVLMDMFHQDVEDINILSLTDEEPSTSGEQT YYDLVKAFMAEIRQYIRELNLIIKVFREPFVSNSKLFSANDVENIFSRIV DIHELSVKLLGHIEDTVEMTDEGSPHPLVGSCFEDLAEELAFDPYESYAR DILRPGFHDRFLSQLSKPGAALYLQSIGEGFKEAVQYVLPRLLLAPVYHC LHYFELLKQLEEKSEDQEDKECLKQAITALLNVQSGMEKICSKSLAKRRL SESACRFYSQQMKGKQLAIKKMNEIQKNIDGWEGKDIGQCCNEFIMEGTL TRVGAKHERHIFLFDGLMICCKSNHGQPRLPGASNAEYRLKEKFFMRKVQ INDKDDTNEYKHAFEIILKDENSVIFSAKSAEEKNNWMAALISLQYRSTL ERMLDVTMLQEEKEEQMRLPSADVYRFAEPDSEENIIFEENMQPKAGIPI IKAGTVIKLIERLTYHMYADPNFVRTFLTTYRSFCKPQELLSLIIERFEI PEPEPTEADRIAIENGDQPLSAELKRFRKEYIQPVQLRVLNVCRHWVEHH FYDFERDAYLLQRMEEFIGTVRGKAMKKWVESITKIIQRKKIARDNGPGH NITFQSSPPTVEWHISRPGHIETFDLLTLHPIEIARQLTLLESDLYRAVQ PSELVGSVWTKEDKEINSPNLLKMIRHTTNLTLWFEKCIVETENLEERVA VVSRIIEILQVFQELNNFNGVLEVVSAMNSSPVYRLDHTFEQIPSRQKKI LEEAHELSEDHYKKYLAKLRSINPPCVPFFGIYLTNILKTEEGNPEVLKR HGKELINFSKRRKVAEITGEIQQYQNQPYCLRVESDIKRFFENLNPMGNS MEKEFTDYLFNKSLEIEPRNPKPLPRFPKKYSYPLKSPGVRPSNPRPGTM RHPTPLQQEPRKISYSRIPESETESTASAPNSPRTPLTPPPASGASSTTD VCSVFDSDHSSPFHSSNDTVFIQVTLPHGPRSASVSSISLTKGTDEVPVP PPVPPRRRPESAPAESSPSKIMSKHLDSPPAIPPRQPTSKAYSPRYSISD RTSISDPPESPPLLPPREPVRTPDVFSSSPLHLQPPPLGKKSDHGNAFFP NSPSPFTPPPPQTPSPHGTRRHLPSPPLTQEVDLHSIAGPPVPPRQSTSQ HIPKLPPKTYKREHTHPSMHRDGPPLLENAHSS A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak polimorfizm alternativnij splajsing LiteraturaBraverman L E Quilliam L A 1999 Identification of Grb4 Nckbeta a src homology 2 and 3 domain containing adapter protein having similar binding and biological properties to Nck J Biol Chem 274 5542 5549 PMID 10026169 DOI 10 1074 jbc 274 9 5542 Soisson S M Nimnual A S Uy M Bar Sagi D Kuriyan J 1998 Crystal structure of the Dbl and pleckstrin homology domains from the human Son of sevenless protein Cell 95 259 268 PMID 9790532 DOI 10 1016 S0092 8674 00 81756 0 Ko J M Kim J M Kim G H Yoo H W 2008 PTPN11 SOS1 KRAS and RAF1 gene analysis and genotype phenotype correlation in Korean patients with Noonan syndrome J Hum Genet 53 999 1006 PMID 19020799 DOI 10 1007 s10038 008 0343 6 Hanna N Parfait B Talaat I M Vidaud M Elsedfy H H 2009 SOS1 a new player in the Noonan like multiple giant cell lesion syndrome Clin Genet 75 568 571 PMID 19438935 DOI 10 1111 j 1399 0004 2009 01149 x Pandey P Kharbanda S Kufe D 1995 Association of the DF3 MUC1 breast cancer antigen with Grb2 and the Sos Ras exchange protein Cancer Res 55 4000 4003 PMID 7664271PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z SOS1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 11187 angl Procitovano 28 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 16 serpnya 2017 Procitovano 28 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 2 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi