Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

SNRNP200 англ Small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 200 білок який кодується однойменним геном розташованим у людей

SNRNP200

SNRNP200

SNRNP200 (англ. Small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 200) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 136 амінокислот, а молекулярна маса — 244 508.

SNRNP200
image
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи SNRNP200, ASCC3L1, BRR2, HELIC2, RP33, U5-200KD, small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 200
Зовнішні ІД OMIM: 601664 MGI: 2444401 HomoloGene: 5859 GeneCards: SNRNP200
Пов'язані генетичні захворювання
retinitis pigmentosa 33
Шаблон експресії
image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
23020
320632
Ensembl
ENSG00000144028
ENSMUSG00000003660
UniProt
O75643
Q6P4T2
RefSeq (мРНК)
NM_014014
NM_177214
RefSeq (білок)
NP_054733
NP_796188
Локус (UCSC) Хр. 2: 96.27 – 96.32 Mb Хр. 2: 127.05 – 127.08 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MADVTARSLQYEYKANSNLVLQADRSLIDRTRRDEPTGEVLSLVGKLEGT
RMGDKAQRTKPQMQEERRAKRRKRDEDRHDINKMKGYTLLSEGIDEMVGI
IYKPKTKETRETYEVLLSFIQAALGDQPRDILCGAADEVLAVLKNEKLRD
KERRKEIDLLLGQTDDTRYHVLVNLGKKITDYGGDKEIQNMDDNIDETYG
VNVQFESDEEEGDEDVYGEVREEASDDDMEGDEAVVRCTLSANLVASGEL
MSSKKKDLHPRDIDAFWLQRQLSRFYDDAIVSQKKADEVLEILKTASDDR
ECENQLVLLLGFNTFDFIKVLRQHRMMILYCTLLASAQSEAEKERIMGKM
EADPELSKFLYQLHETEKEDLIREERSRRERVRQSRMDTDLETMDLDQGG
EALAPRQVLDLEDLVFTQGSHFMANKRCQLPDGSFRRQRKGYEEVHVPAL
KPKPFGSEEQLLPVEKLPKYAQAGFEGFKTLNRIQSKLYRAALETDENLL
LCAPTGAGKTNVALMCMLREIGKHINMDGTINVDDFKIIYIAPMRSLVQE
MVGSFGKRLATYGITVAELTGDHQLCKEEISATQIIVCTPEKWDIITRKG
GERTYTQLVRLIILDEIHLLHDDRGPVLEALVARAIRNIEMTQEDVRLIG
LSATLPNYEDVATFLRVDPAKGLFYFDNSFRPVPLEQTYVGITEKKAIKR
FQIMNEIVYEKIMEHAGKNQVLVFVHSRKETGKTARAIRDMCLEKDTLGL
FLREGSASTEVLRTEAEQCKNLELKDLLPYGFAIHHAGMTRVDRTLVEDL
FADKHIQVLVSTATLAWGVNLPAHTVIIKGTQVYSPEKGRWTELGALDIL
QMLGRAGRPQYDTKGEGILITSHGELQYYLSLLNQQLPIESQMVSKLPDM
LNAEIVLGNVQNAKDAVNWLGYAYLYIRMLRSPTLYGISHDDLKGDPLLD
QRRLDLVHTAALMLDKNNLVKYDKKTGNFQVTELGRIASHYYITNDTVQT
YNQLLKPTLSEIELFRVFSLSSEFKNITVREEEKLELQKLLERVPIPVKE
SIEEPSAKINVLLQAFISQLKLEGFALMADMVYVTQSAGRLMRAIFEIVL
NRGWAQLTDKTLNLCKMIDKRMWQSMCPLRQFRKLPEEVVKKIEKKNFPF
ERLYDLNHNEIGELIRMPKMGKTIHKYVHLFPKLELSVHLQPITRSTLKV
ELTITPDFQWDEKVHGSSEAFWILVEDVDSEVILHHEYFLLKAKYAQDEH
LITFFVPVFEPLPPQYFIRVVSDRWLSCETQLPVSFRHLILPEKYPPPTE
LLDLQPLPVSALRNSAFESLYQDKFPFFNPIQTQVFNTVYNSDDNVFVGA
PTGSGKTICAEFAILRMLLQSSEGRCVYITPMEALAEQVYMDWYEKFQDR
LNKKVVLLTGETSTDLKLLGKGNIIISTPEKWDILSRRWKQRKNVQNINL
FVVDEVHLIGGENGPVLEVICSRMRYISSQIERPIRIVALSSSLSNAKDV
AHWLGCSATSTFNFHPNVRPVPLELHIQGFNISHTQTRLLSMAKPVYHAI
TKHSPKKPVIVFVPSRKQTRLTAIDILTTCAADIQRQRFLHCTEKDLIPY
LEKLSDSTLKETLLNGVGYLHEGLSPMERRLVEQLFSSGAIQVVVASRSL
CWGMNVAAHLVIIMDTQYYNGKIHAYVDYPIYDVLQMVGHANRPLQDDEG
RCVIMCQGSKKDFFKKFLYEPLPVESHLDHCMHDHFNAEIVTKTIENKQD
AVDYLTWTFLYRRMTQNPNYYNLQGISHRHLSDHLSELVEQTLSDLEQSK
CISIEDEMDVAPLNLGMIAAYYYINYTTIELFSMSLNAKTKVRGLIEIIS
NAAEYENIPIRHHEDNLLRQLAQKVPHKLNNPKFNDPHVKTNLLLQAHLS
RMQLSAELQSDTEEILSKAIRLIQACVDVLSSNGWLSPALAAMELAQMVT
QAMWSKDSYLKQLPHFTSEHIKRCTDKGVESVFDIMEMEDEERNALLQLT
DSQIADVARFCNRYPNIELSYEVVDKDSIRSGGPVVVLVQLEREEEVTGP
VIAPLFPQKREEGWWVVIGDAKSNSLISIKRLTLQQKAKVKLDFVAPATG
AHNYTLYFMSDAYMGCDQEYKFSVDVKEAETDSDSD

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

  • Liu S., Rauhut R., Vornlocher H.-P., Luehrmann R. (2006). The network of protein-protein interactions within the human U4/U6.U5 tri-snRNP. RNA. 12: 1418—1430. PMID 16723661 DOI:10.1261/rna.55406
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Laggerbauer B., Achsel T., Luehrmann R. (1998). The human U5-200kD DEXH-box protein unwinds U4/U6 RNA duplices in vitro. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 4188—4192. PMID 9539711 DOI:10.1073/pnas.95.8.4188
  • Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
  • Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
  • Li N., Mei H., MacDonald I.M., Jiao X., Hejtmancik J.F. (2010). Mutations in ASCC3L1 on 2q11.2 are associated with autosomal dominant retinitis pigmentosa in a Chinese family. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 51: 1036—1043. PMID 19710410 DOI:10.1167/iovs.09-3725

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з SNRNP200 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 7 квітня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.
  5. (англ.) . Архів оригіналу за 23 листопада 2016. Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

SNRNP200 angl Small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 200 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 2 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 2 136 aminokislot a molekulyarna masa 244 508 SNRNP200Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2Q0Z 4F91 4F92 4F93 4KIT 3JCRIdentifikatoriSimvoliSNRNP200 ASCC3L1 BRR2 HELIC2 RP33 U5 200KD small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 200Zovnishni ID OMIM 601664 MGI 2444401 HomoloGene 5859 GeneCards SNRNP200Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaretinitis pigmentosa 33 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya nucleotide binding GO 0008026 helicase activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding identical protein binding nucleic acid binding hydrolase activity ATP binding RNA bindingKlitinna komponenta catalytic step 2 spliceosome membrana U5 snRNP nukleoplazma spliceosomal complex klitinne yadro U4 U6 x U5 tri snRNP complex post mRNA release spliceosomal complexBiologichnij proces mRNA splicing via spliceosome mRNA processing osteoblast differentiation cis assembly of pre catalytic spliceosome Splajsing RNK spliceosome conformational change to release U4 or U4atac and U1 or U11 Dzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez23020 320632Ensembl ENSG00000144028 ENSMUSG00000003660UniProt O75643 Q6P4T2RefSeq mRNK NM 014014NM 177214RefSeq bilok NP 054733NP 796188Lokus UCSC Hr 2 96 27 96 32 MbHr 2 127 05 127 08 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MADVTARSLQYEYKANSNLVLQADRSLIDRTRRDEPTGEVLSLVGKLEGT RMGDKAQRTKPQMQEERRAKRRKRDEDRHDINKMKGYTLLSEGIDEMVGI IYKPKTKETRETYEVLLSFIQAALGDQPRDILCGAADEVLAVLKNEKLRD KERRKEIDLLLGQTDDTRYHVLVNLGKKITDYGGDKEIQNMDDNIDETYG VNVQFESDEEEGDEDVYGEVREEASDDDMEGDEAVVRCTLSANLVASGEL MSSKKKDLHPRDIDAFWLQRQLSRFYDDAIVSQKKADEVLEILKTASDDR ECENQLVLLLGFNTFDFIKVLRQHRMMILYCTLLASAQSEAEKERIMGKM EADPELSKFLYQLHETEKEDLIREERSRRERVRQSRMDTDLETMDLDQGG EALAPRQVLDLEDLVFTQGSHFMANKRCQLPDGSFRRQRKGYEEVHVPAL KPKPFGSEEQLLPVEKLPKYAQAGFEGFKTLNRIQSKLYRAALETDENLL LCAPTGAGKTNVALMCMLREIGKHINMDGTINVDDFKIIYIAPMRSLVQE MVGSFGKRLATYGITVAELTGDHQLCKEEISATQIIVCTPEKWDIITRKG GERTYTQLVRLIILDEIHLLHDDRGPVLEALVARAIRNIEMTQEDVRLIG LSATLPNYEDVATFLRVDPAKGLFYFDNSFRPVPLEQTYVGITEKKAIKR FQIMNEIVYEKIMEHAGKNQVLVFVHSRKETGKTARAIRDMCLEKDTLGL FLREGSASTEVLRTEAEQCKNLELKDLLPYGFAIHHAGMTRVDRTLVEDL FADKHIQVLVSTATLAWGVNLPAHTVIIKGTQVYSPEKGRWTELGALDIL QMLGRAGRPQYDTKGEGILITSHGELQYYLSLLNQQLPIESQMVSKLPDM LNAEIVLGNVQNAKDAVNWLGYAYLYIRMLRSPTLYGISHDDLKGDPLLD QRRLDLVHTAALMLDKNNLVKYDKKTGNFQVTELGRIASHYYITNDTVQT YNQLLKPTLSEIELFRVFSLSSEFKNITVREEEKLELQKLLERVPIPVKE SIEEPSAKINVLLQAFISQLKLEGFALMADMVYVTQSAGRLMRAIFEIVL NRGWAQLTDKTLNLCKMIDKRMWQSMCPLRQFRKLPEEVVKKIEKKNFPF ERLYDLNHNEIGELIRMPKMGKTIHKYVHLFPKLELSVHLQPITRSTLKV ELTITPDFQWDEKVHGSSEAFWILVEDVDSEVILHHEYFLLKAKYAQDEH LITFFVPVFEPLPPQYFIRVVSDRWLSCETQLPVSFRHLILPEKYPPPTE LLDLQPLPVSALRNSAFESLYQDKFPFFNPIQTQVFNTVYNSDDNVFVGA PTGSGKTICAEFAILRMLLQSSEGRCVYITPMEALAEQVYMDWYEKFQDR LNKKVVLLTGETSTDLKLLGKGNIIISTPEKWDILSRRWKQRKNVQNINL FVVDEVHLIGGENGPVLEVICSRMRYISSQIERPIRIVALSSSLSNAKDV AHWLGCSATSTFNFHPNVRPVPLELHIQGFNISHTQTRLLSMAKPVYHAI TKHSPKKPVIVFVPSRKQTRLTAIDILTTCAADIQRQRFLHCTEKDLIPY LEKLSDSTLKETLLNGVGYLHEGLSPMERRLVEQLFSSGAIQVVVASRSL CWGMNVAAHLVIIMDTQYYNGKIHAYVDYPIYDVLQMVGHANRPLQDDEG RCVIMCQGSKKDFFKKFLYEPLPVESHLDHCMHDHFNAEIVTKTIENKQD AVDYLTWTFLYRRMTQNPNYYNLQGISHRHLSDHLSELVEQTLSDLEQSK CISIEDEMDVAPLNLGMIAAYYYINYTTIELFSMSLNAKTKVRGLIEIIS NAAEYENIPIRHHEDNLLRQLAQKVPHKLNNPKFNDPHVKTNLLLQAHLS RMQLSAELQSDTEEILSKAIRLIQACVDVLSSNGWLSPALAAMELAQMVT QAMWSKDSYLKQLPHFTSEHIKRCTDKGVESVFDIMEMEDEERNALLQLT DSQIADVARFCNRYPNIELSYEVVDKDSIRSGGPVVVLVQLEREEEVTGP VIAPLFPQKREEGWWVVIGDAKSNSLISIKRLTLQQKAKVKLDFVAPATG AHNYTLYFMSDAYMGCDQEYKFSVDVKEAETDSDSD A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do gidrolaz gelikaz Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak procesing mRNK splajsing mRNK Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ATF nukleotidami Lokalizovanij u yadri LiteraturaLiu S Rauhut R Vornlocher H P Luehrmann R 2006 The network of protein protein interactions within the human U4 U6 U5 tri snRNP RNA 12 1418 1430 PMID 16723661 DOI 10 1261 rna 55406 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Laggerbauer B Achsel T Luehrmann R 1998 The human U5 200kD DEXH box protein unwinds U4 U6 RNA duplices in vitro Proc Natl Acad Sci U S A 95 4188 4192 PMID 9539711 DOI 10 1073 pnas 95 8 4188 Jurica M S Licklider L J Gygi S P Grigorieff N Moore M J 2002 Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three dimensional structural analysis RNA 8 426 439 PMID 11991638 DOI 10 1017 S1355838202021088 Carrascal M Ovelleiro D Casas V Gay M Abian J 2008 Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment J Proteome Res 7 5167 5176 PMID 19367720 DOI 10 1021 pr800500r Li N Mei H MacDonald I M Jiao X Hejtmancik J F 2010 Mutations in ASCC3L1 on 2q11 2 are associated with autosomal dominant retinitis pigmentosa in a Chinese family Invest Ophthalmol Vis Sci 51 1036 1043 PMID 19710410 DOI 10 1167 iovs 09 3725PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z SNRNP200 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 7 kvitnya 2016 Procitovano 6 lyutogo 2017 angl Arhiv originalu za 23 listopada 2016 Procitovano 6 lyutogo 2017 Div takozhHromosoma 2 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ