Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

SMARCA5 англ SWI SNF related matrix associated actin dependent regulator of chromatin subfamily a member 5 білок який ко

SMARCA5

SMARCA5

SMARCA5 (англ. SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 052 амінокислот, а молекулярна маса — 121 905.

SMARCA5
Ідентифікатори
Символи SMARCA5, ISWI, SNF2H, WCRF135, hISWI, hSNF2H, SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5
Зовнішні ІД OMIM: 603375 MGI: 1935129 HomoloGene: 55764 GeneCards: SMARCA5
Шаблон експресії
image

image

image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
8467
93762
Ensembl
ENSG00000153147
ENSMUSG00000031715
UniProt
O60264
Q91ZW3
RefSeq (мРНК)
NM_003601
NM_053124
RefSeq (білок)
NP_003592
NP_444354
Локус (UCSC) Хр. 4: 143.51 – 143.56 Mb Хр. 8: 81.43 – 81.47 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MSSAAEPPPPPPPESAPSKPAASIASGGSNSSNKGGPEGVAAQAVASAAS
AGPADAEMEEIFDDASPGKQKEIQEPDPTYEEKMQTDRANRFEYLLKQTE
LFAHFIQPAAQKTPTSPLKMKPGRPRIKKDEKQNLLSVGDYRHRRTEQEE
DEELLTESSKATNVCTRFEDSPSYVKWGKLRDYQVRGLNWLISLYENGIN
GILADEMGLGKTLQTISLLGYMKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMSEFKR
WVPTLRSVCLIGDKEQRAAFVRDVLLPGEWDVCVTSYEMLIKEKSVFKKF
NWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKTTNRLLLTGTPLQNNLHELWSL
LNFLLPDVFNSADDFDSWFDTNNCLGDQKLVERLHMVLRPFLLRRIKADV
EKSLPPKKEVKIYVGLSKMQREWYTRILMKDIDILNSAGKMDKMRLLNIL
MQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDMHLVTNSGKMVVLDKLLPKLKEQGS
RVLIFSQMTRVLDILEDYCMWRNYEYCRLDGQTPHDERQDSINAYNEPNS
TKFVFMLSTRAGGLGINLATADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAHRIGQTK
TVRVFRFITDNTVEERIVERAEMKLRLDSIVIQQGRLVDQNLNKIGKDEM
LQMIRHGATHVFASKESEITDEDIDGILERGAKKTAEMNEKLSKMGESSL
RNFTMDTESSVYNFEGEDYREKQKIAFTEWIEPPKRERKANYAVDAYFRE
ALRVSEPKAPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILFYRKTIGYKV
PRNPELPNAAQAQKEEQLKIDEAESLNDEELEEKEKLLTQGFTNWNKRDF
NQFIKANEKWGRDDIENIAREVEGKTPEEVIEYSAVFWERCNELQDIEKI
MAQIERGEARIQRRISIKKALDTKIGRYKAPFHQLRISYGTNKGKNYTEE
EDRFLICMLHKLGFDKENVYDELRQCIRNSPQFRFDWFLKSRTAMELQRR
CNTLITLIERENMELEEKEKAEKKKRGPKPSTQKRKMDGAPDGRGRKKKL
KL

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, , фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Aalfs J.D., Narlikar G.J., Kingston R.E. (2001). Functional differences between the human ATP-dependent nucleosome remodeling proteins BRG1 and SNF2H. J. Biol. Chem. 276: 34270—34278. PMID 11435432 DOI:10.1074/jbc.M104163200
  • Bozhenok L., Wade P.A., Varga-Weisz P. (2002). WSTF-ISWI chromatin remodeling complex targets heterochromatic replication foci. EMBO J. 21: 2231—2241. PMID 11980720 DOI:10.1093/emboj/21.9.2231
  • Dirscherl S.S., Krebs J.E. (2004). Functional diversity of ISWI complexes. Biochem. Cell Biol. 82: 482—489. PMID 15284901 DOI:10.1139/o04-044
  • Cavellan E., Asp P., Percipalle P., Oestlund Farrants A.-K. (2006). The WSTF-SNF2h chromatin remodeling complex interacts with several nuclear proteins in transcription. J. Biol. Chem. 281: 16264—16271. PMID 16603771 DOI:10.1074/jbc.M600233200

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11101 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

SMARCA5 angl SWI SNF related matrix associated actin dependent regulator of chromatin subfamily a member 5 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 4 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 052 aminokislot a molekulyarna masa 121 905 SMARCA5IdentifikatoriSimvoliSMARCA5 ISWI SNF2H WCRF135 hISWI hSNF2H SWI SNF related matrix associated actin dependent regulator of chromatin subfamily a member 5Zovnishni ID OMIM 603375 MGI 1935129 HomoloGene 55764 GeneCards SMARCA5Ontologiya genaMolekulyarna funkciya nucleotide binding GO 0008026 helicase activity GO 0031493 histone binding GO 0102490 GO 0102491 GO 0102489 GO 0102488 GO 0102487 GO 0102486 GO 0102485 hydrolase activity acting on acid anhydrides in phosphorus containing anhydrides GO 0001948 GO 0016582 protein binding nucleic acid binding nucleosome binding hydrolase activity DNA binding ATP binding ATPase activity GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specific ATP dependent activity acting on DNAKlitinna komponenta RSF complex nuclear replication fork nukleoplazma condensed chromosome klitinne yadro fibrillar center NURF complex chromatin silencing complex ISWI type complexBiologichnij proces epigenetic maintenance of chromatin in transcription competent conformation GO 0044324 GO 0003256 GO 1901213 GO 0046019 GO 0046020 GO 1900094 GO 0061216 GO 0060994 GO 1902064 GO 0003258 GO 0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II GO 0061641 CENP A containing chromatin assembly DNA templated transcription initiation nucleosome assembly remodelyuvannya hromatinu rDNA heterochromatin assembly GO 0060469 GO 0009371 positive regulation of transcription DNA templated cellular response to leukemia inhibitory factor GO 0031497 GO 0006336 GO 0034724 GO 0001301 GO 0007580 GO 0034652 GO 0010847 chromatin organization GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase IIDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez8467 93762Ensembl ENSG00000153147 ENSMUSG00000031715UniProt O60264 Q91ZW3RefSeq mRNK NM 003601NM 053124RefSeq bilok NP 003592NP 444354Lokus UCSC Hr 4 143 51 143 56 MbHr 8 81 43 81 47 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MSSAAEPPPPPPPESAPSKPAASIASGGSNSSNKGGPEGVAAQAVASAAS AGPADAEMEEIFDDASPGKQKEIQEPDPTYEEKMQTDRANRFEYLLKQTE LFAHFIQPAAQKTPTSPLKMKPGRPRIKKDEKQNLLSVGDYRHRRTEQEE DEELLTESSKATNVCTRFEDSPSYVKWGKLRDYQVRGLNWLISLYENGIN GILADEMGLGKTLQTISLLGYMKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMSEFKR WVPTLRSVCLIGDKEQRAAFVRDVLLPGEWDVCVTSYEMLIKEKSVFKKF NWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKTTNRLLLTGTPLQNNLHELWSL LNFLLPDVFNSADDFDSWFDTNNCLGDQKLVERLHMVLRPFLLRRIKADV EKSLPPKKEVKIYVGLSKMQREWYTRILMKDIDILNSAGKMDKMRLLNIL MQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDMHLVTNSGKMVVLDKLLPKLKEQGS RVLIFSQMTRVLDILEDYCMWRNYEYCRLDGQTPHDERQDSINAYNEPNS TKFVFMLSTRAGGLGINLATADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAHRIGQTK TVRVFRFITDNTVEERIVERAEMKLRLDSIVIQQGRLVDQNLNKIGKDEM LQMIRHGATHVFASKESEITDEDIDGILERGAKKTAEMNEKLSKMGESSL RNFTMDTESSVYNFEGEDYREKQKIAFTEWIEPPKRERKANYAVDAYFRE ALRVSEPKAPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILFYRKTIGYKV PRNPELPNAAQAQKEEQLKIDEAESLNDEELEEKEKLLTQGFTNWNKRDF NQFIKANEKWGRDDIENIAREVEGKTPEEVIEYSAVFWERCNELQDIEKI MAQIERGEARIQRRISIKKALDTKIGRYKAPFHQLRISYGTNKGKNYTEE EDRFLICMLHKLGFDKENVYDELRQCIRNSPQFRFDWFLKSRTAMELQRR CNTLITLIERENMELEEKEKAEKKKRGPKPSTQKRKMDGAPDGRGRKKKL KL A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do gidrolaz gelikaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak acetilyaciya Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ATF nukleotidami Lokalizovanij u yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Aalfs J D Narlikar G J Kingston R E 2001 Functional differences between the human ATP dependent nucleosome remodeling proteins BRG1 and SNF2H J Biol Chem 276 34270 34278 PMID 11435432 DOI 10 1074 jbc M104163200 Bozhenok L Wade P A Varga Weisz P 2002 WSTF ISWI chromatin remodeling complex targets heterochromatic replication foci EMBO J 21 2231 2241 PMID 11980720 DOI 10 1093 emboj 21 9 2231 Dirscherl S S Krebs J E 2004 Functional diversity of ISWI complexes Biochem Cell Biol 82 482 489 PMID 15284901 DOI 10 1139 o04 044 Cavellan E Asp P Percipalle P Oestlund Farrants A K 2006 The WSTF SNF2h chromatin remodeling complex interacts with several nuclear proteins in transcription J Biol Chem 281 16264 16271 PMID 16603771 DOI 10 1074 jbc M600233200PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 11101 angl Procitovano 30 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 22 veresnya 2017 Procitovano 30 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 4 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ