SHOC2 (англ. SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 582 амінокислот, а молекулярна маса — 64 888.
SHOC2 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SHOC2, SIAA0862, SOC2, SUR8, SHOC2 leucine-rich repeat scaffold protein, leucine rich repeat scaffold protein, SHOC2 leucine rich repeat scaffold protein, NSLH1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 602775 MGI: 1927197 HomoloGene: 7219 GeneCards: SHOC2 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
Noonan syndrome-like disorder with loose anagen hair | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 10: 110.92 – 111.02 Mb | Хр. 19: 53.93 – 54.02 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSSSLGKEKD | SKEKDPKVPS | AKEREKEAKA | SGGFGKESKE | KEPKTKGKDA | ||||
KDGKKDSSAA | QPGVAFSVDN | TIKRPNPAPG | TRKKSSNAEV | IKELNKCREE | ||||
NSMRLDLSKR | SIHILPSSIK | ELTQLTELYL | YSNKLQSLPA | EVGCLVNLMT | ||||
LALSENSLTS | LPDSLDNLKK | LRMLDLRHNK | LREIPSVVYR | LDSLTTLYLR | ||||
FNRITTVEKD | IKNLSKLSML | SIRENKIKQL | PAEIGELCNL | ITLDVAHNQL | ||||
EHLPKEIGNC | TQITNLDLQH | NELLDLPDTI | GNLSSLSRLG | LRYNRLSAIP | ||||
RSLAKCSALE | ELNLENNNIS | TLPESLLSSL | VKLNSLTLAR | NCFQLYPVGG | ||||
PSQFSTIYSL | NMEHNRINKI | PFGIFSRAKV | LSKLNMKDNQ | LTSLPLDFGT | ||||
WTSMVELNLA | TNQLTKIPED | VSGLVSLEVL | ILSNNLLKKL | PHGLGNLRKL | ||||
RELDLEENKL | ESLPNEIAYL | KDLQKLVLTN | NQLTTLPRGI | GHLTNLTHLG | ||||
LGENLLTHLP | EEIGTLENLE | ELYLNDNPNL | HSLPFELALC | SKLSIMSIEN | ||||
CPLSHLPPQI | VAGGPSFIIQ | FLKMQGPYRA | MV |
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Sieburth D.S., Sun Q., Han M. (1998). SUR-8, a conserved Ras-binding protein with leucine-rich repeats, positively regulates Ras-mediated signaling in C. elegans. Cell. 94: 119—130. PMID 9674433 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81227-1
- Selfors L.M., Schutzman J.L., Borland C.Z., Stern M.J. (1998). Soc-2 encodes a leucine-rich repeat protein implicated in fibroblast growth factor receptor signaling. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 6903—6908. PMID 9618511 DOI:10.1073/pnas.95.12.6903
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Dai P., Xiong W.C., Mei L. (2006). Erbin inhibits RAF activation by disrupting the sur-8-Ras-Raf complex. J. Biol. Chem. 281: 927—933. PMID 16301319 DOI:10.1074/jbc.M507360200
- Rodriguez-Viciana P., Oses-Prieto J., Burlingame A., Fried M., McCormick F. (2006). A phosphatase holoenzyme comprised of Shoc2/Sur8 and the catalytic subunit of PP1 functions as an M-Ras effector to modulate Raf activity. Mol. Cell. 22: 217—230. PMID 16630891 DOI:10.1016/j.molcel.2006.03.027
- Hannig V., Jeoung M., Jang E.R., Phillips J.A. III, Galperin E. (2014). A Novel SHOC2 Variant in Rasopathy. Hum. Mutat. 35: 1290—1294. PMID 25137548 DOI:10.1002/humu.22634
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з SHOC2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15454 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 2 квітня 2018. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
SHOC2 angl SHOC2 leucine rich repeat scaffold protein bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 10 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 582 aminokislot a molekulyarna masa 64 888 SHOC2IdentifikatoriSimvoliSHOC2 SIAA0862 SOC2 SUR8 SHOC2 leucine rich repeat scaffold protein leucine rich repeat scaffold protein SHOC2 leucine rich repeat scaffold protein NSLH1Zovnishni ID OMIM 602775 MGI 1927197 HomoloGene 7219 GeneCards SHOC2Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaNoonan syndrome like disorder with loose anagen hair Ontologiya genaMolekulyarna funkciya protein phosphatase 1 binding protein phosphatase regulator activity protein phosphatase binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding protein serine threonine phosphatase activityKlitinna komponenta protein phosphatase type 1 complex nukleoplazma klitinne yadro citoplazma gialoplazma klitinna membrana photoreceptor inner segment photoreceptor outer segment membraneBiologichnij proces fibroblast growth factor receptor signaling pathway positive regulation of Ras protein signal transduction Ras protein signal transduction regulation of phosphoprotein phosphatase activity GO 0016576 protein dephosphorylationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez8036 56392Ensembl ENSG00000108061 ENSMUSG00000024976UniProt Q9UQ13 O88520RefSeq mRNK NM 001269039 NM 007373 NM 001324336 NM 001324337NM 001168505 NM 019658 NM 001355242RefSeq bilok NP 001255968 NP 001311265 NP 001311266 NP 031399NP 001161977 NP 062632 NP 001342171Lokus UCSC Hr 10 110 92 111 02 MbHr 19 53 93 54 02 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MSSSLGKEKDSKEKDPKVPSAKEREKEAKASGGFGKESKEKEPKTKGKDA KDGKKDSSAAQPGVAFSVDNTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREE NSMRLDLSKRSIHILPSSIKELTQLTELYLYSNKLQSLPAEVGCLVNLMT LALSENSLTSLPDSLDNLKKLRMLDLRHNKLREIPSVVYRLDSLTTLYLR FNRITTVEKDIKNLSKLSMLSIRENKIKQLPAEIGELCNLITLDVAHNQL EHLPKEIGNCTQITNLDLQHNELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIP RSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNCFQLYPVGG PSQFSTIYSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLPLDFGT WTSMVELNLATNQLTKIPEDVSGLVSLEVLILSNNLLKKLPHGLGNLRKL RELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTTLPRGIGHLTNLTHLG LGENLLTHLPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPFELALCSKLSIMSIEN CPLSHLPPQIVAGGPSFIIQFLKMQGPYRAMV A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak alternativnij splajsing Lokalizovanij u citoplazmi yadri LiteraturaSieburth D S Sun Q Han M 1998 SUR 8 a conserved Ras binding protein with leucine rich repeats positively regulates Ras mediated signaling in C elegans Cell 94 119 130 PMID 9674433 DOI 10 1016 S0092 8674 00 81227 1 Selfors L M Schutzman J L Borland C Z Stern M J 1998 Soc 2 encodes a leucine rich repeat protein implicated in fibroblast growth factor receptor signaling Proc Natl Acad Sci U S A 95 6903 6908 PMID 9618511 DOI 10 1073 pnas 95 12 6903 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Dai P Xiong W C Mei L 2006 Erbin inhibits RAF activation by disrupting the sur 8 Ras Raf complex J Biol Chem 281 927 933 PMID 16301319 DOI 10 1074 jbc M507360200 Rodriguez Viciana P Oses Prieto J Burlingame A Fried M McCormick F 2006 A phosphatase holoenzyme comprised of Shoc2 Sur8 and the catalytic subunit of PP1 functions as an M Ras effector to modulate Raf activity Mol Cell 22 217 230 PMID 16630891 DOI 10 1016 j molcel 2006 03 027 Hannig V Jeoung M Jang E R Phillips J A III Galperin E 2014 A Novel SHOC2 Variant in Rasopathy Hum Mutat 35 1290 1294 PMID 25137548 DOI 10 1002 humu 22634PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z SHOC2 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 15454 angl Procitovano 8 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 2 kvitnya 2018 Procitovano 8 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 10 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi