SCARB1 (англ. Scavenger receptor class B member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 552 амінокислот, а молекулярна маса — 60 878.
SCARB1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SCARB1, CD36L1, CLA-1, CLA1, HDLQTL6, SR-BI, SRB1, scavenger receptor class B member 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 601040 MGI: 893578 HomoloGene: 21132 GeneCards: SCARB1 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
Рак нирки | |||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
Viroporin 3a | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 12: 124.78 – 124.88 Mb | Хр. 5: 125.35 – 125.42 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MGCSAKARWA | AGALGVAGLL | CAVLGAVMIV | MVPSLIKQQV | LKNVRIDPSS | ||||
LSFNMWKEIP | IPFYLSVYFF | DVMNPSEILK | GEKPQVRERG | PYVYREFRHK | ||||
SNITFNNNDT | VSFLEYRTFQ | FQPSKSHGSE | SDYIVMPNIL | VLGAAVMMEN | ||||
KPMTLKLIMT | LAFTTLGERA | FMNRTVGEIM | WGYKDPLVNL | INKYFPGMFP | ||||
FKDKFGLFAE | LNNSDSGLFT | VFTGVQNISR | IHLVDKWNGL | SKVDFWHSDQ | ||||
CNMINGTSGQ | MWPPFMTPES | SLEFYSPEAC | RSMKLMYKES | GVFEGIPTYR | ||||
FVAPKTLFAN | GSIYPPNEGF | CPCLESGIQN | VSTCRFSAPL | FLSHPHFLNA | ||||
DPVLAEAVTG | LHPNQEAHSL | FLDIHPVTGI | PMNCSVKLQL | SLYMKSVAGI | ||||
GQTGKIEPVV | LPLLWFAESG | AMEGETLHTF | YTQLVLMPKV | MHYAQYVLLA | ||||
LGCVLLLVPV | ICQIRSQVGA | GQRAARADSH | SLACWGKGAS | DRTLWPTAAW | ||||
SPPPAAVLRL | CRSGSGHCWG | LRSTLASFAC | RVATTLPVLE | GLGPSLGGGT | ||||
GS |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kawasaki Y., Nakagawa A., Nagaosa K., Shiratsuchi A., Nakanishi Y. (2002). Phosphatidylserine binding of class B scavenger receptor type I, a phagocytosis receptor of testicular Sertoli cells. J. Biol. Chem. 277: 27559—27566. PMID 12016218 DOI:10.1074/jbc.M202879200
- Philips J.A., Rubin E.J., Perrimon N. (2005). Drosophila RNAi screen reveals CD36 family member required for mycobacterial infection. Science. 309: 1251—1253. PMID 16020694 DOI:10.1126/science.1116006
- Calvo D., Vega M. (1993). Identification, primary structure and distribution of CLA-1, a novel member of the CD36/LIMPII gene family. J. Biol. Chem. 268: 18929—18935. PMID 7689561
- Webb N.R., de Villiers W.J., Connell P.M., de Beer F.C., van der Westhuyzen D.R. (1997). Alternative forms of the scavenger receptor BI (SR-BI). J. Lipid Res. 38: 1490—1495. PMID 9254074
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з SCARB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Сполуки, які фізично взаємодіють з SCARB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1664 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
SCARB1 angl Scavenger receptor class B member 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 12 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 552 aminokislot a molekulyarna masa 60 878 SCARB1IdentifikatoriSimvoliSCARB1 CD36L1 CLA 1 CLA1 HDLQTL6 SR BI SRB1 scavenger receptor class B member 1Zovnishni ID OMIM 601040 MGI 893578 HomoloGene 21132 GeneCards SCARB1Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaRak nirki Reaguye na spolukuViroporin 3a Ontologiya genaMolekulyarna funkciya apolipoprotein binding protein homodimerization activity virus receptor activity transporter activity high density lipoprotein particle receptor activity phosphatidylserine binding apolipoprotein A I binding lipopolysaccharide binding low density lipoprotein particle binding 1 phosphatidylinositol binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding high density lipoprotein particle binding lipopolysaccharide immune receptor activity amyloid beta binding scavenger receptor activityKlitinna komponenta citoplazma integral component of membrane endocytic vesicle membrane vnutrishnoklitinna membranna organela membrana klitinna membrana integral component of plasma membrane cell surface lysosomal membrane caveola ekzosoma microvillus membraneBiologichnij proces cholesterol import positive regulation of triglyceride biosynthetic process regulation of phosphatidylcholine catabolic process recognition of apoptotic cell lipid transport low density lipoprotein particle clearance blood vessel endothelial cell migration positive regulation of cholesterol storage phospholipid transport cholesterol transport Zagoyennya ran cholesterol catabolic process receptor oposeredkovanij endocitoz high density lipoprotein particle remodeling positive regulation of endothelial cell migration androgen biosynthetic process vitamin transmembrane transport positive regulation of nitric oxide synthase activity endothelial cell proliferation GO 0015921 lipopolysaccharide transport cholesterol efflux phagocytosis recognition viral entry into host cell intestinal absorption cholesterol homeostasis regulation of phagocytosis GO 0051856 adhesion of symbiont to host GO 0022415 viral process detection of lipopolysaccharide triglyceride homeostasis reverse cholesterol transport lipopolysaccharide mediated signaling pathway high density lipoprotein particle clearanceDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez949 20778Ensembl ENSG00000073060 ENSMUSG00000037936UniProt Q8WTV0 Q61009RefSeq mRNK NM 005505 NM 001082959NM 001205082 NM 001205083 NM 016741RefSeq bilok NP 001076428 NP 005496 NP 001354910 NP 001354911 NP 001354912NP 001354913 NP 001354914 NP 001354915 NP 001354916 NP 001354917 NP 001354918NP 001192011 NP 001192012 NP 058021Lokus UCSC Hr 12 124 78 124 88 MbHr 5 125 35 125 42 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MGCSAKARWAAGALGVAGLLCAVLGAVMIVMVPSLIKQQVLKNVRIDPSS LSFNMWKEIPIPFYLSVYFFDVMNPSEILKGEKPQVRERGPYVYREFRHK SNITFNNNDTVSFLEYRTFQFQPSKSHGSESDYIVMPNILVLGAAVMMEN KPMTLKLIMTLAFTTLGERAFMNRTVGEIMWGYKDPLVNLINKYFPGMFP FKDKFGLFAELNNSDSGLFTVFTGVQNISRIHLVDKWNGLSKVDFWHSDQ CNMINGTSGQMWPPFMTPESSLEFYSPEACRSMKLMYKESGVFEGIPTYR FVAPKTLFANGSIYPPNEGFCPCLESGIQNVSTCRFSAPLFLSHPHFLNA DPVLAEAVTGLHPNQEAHSLFLDIHPVTGIPMNCSVKLQLSLYMKSVAGI GQTGKIEPVVLPLLWFAESGAMEGETLHTFYTQLVLMPKVMHYAQYVLLA LGCVLLLVPVICQIRSQVGAGQRAARADSHSLACWGKGASDRTLWPTAAW SPPPAAVLRLCRSGSGHCWGLRSTLASFACRVATTLPVLEGLGPSLGGGT GS A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do receptoriv klitini hazyayina dlya vhodu virusu receptoriv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak vzayemodiya hazyayin virus alternativnij splajsing Lokalizovanij u klitinnij membrani membrani LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Kawasaki Y Nakagawa A Nagaosa K Shiratsuchi A Nakanishi Y 2002 Phosphatidylserine binding of class B scavenger receptor type I a phagocytosis receptor of testicular Sertoli cells J Biol Chem 277 27559 27566 PMID 12016218 DOI 10 1074 jbc M202879200 Philips J A Rubin E J Perrimon N 2005 Drosophila RNAi screen reveals CD36 family member required for mycobacterial infection Science 309 1251 1253 PMID 16020694 DOI 10 1126 science 1116006 Calvo D Vega M 1993 Identification primary structure and distribution of CLA 1 a novel member of the CD36 LIMPII gene family J Biol Chem 268 18929 18935 PMID 7689561 Webb N R de Villiers W J Connell P M de Beer F C van der Westhuyzen D R 1997 Alternative forms of the scavenger receptor BI SR BI J Lipid Res 38 1490 1495 PMID 9254074PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z SCARB1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Spoluki yaki fizichno vzayemodiyut z SCARB1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 1664 angl Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 14 zhovtnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 12 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi