S100A9

S100A9 (англ. S100 calcium binding protein A9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 114 амінокислот, а молекулярна маса — 13 242.

S100A9
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1IRJ, 1XK4, 4GGF, 4XJK
Ідентифікатори
Символи	S100A9, 60B8AG, CAGB, CFAG, CGLB, L1AG, LIAG, MAC387, MIF, MRP14, NIF, P14, S100 calcium binding protein A9, S100-A9
Зовнішні ІД	OMIM: 123886 MGI: 1338947 HomoloGene: 2227 GeneCards: S100A9
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • microtubule binding • zinc ion binding • signal transducer activity • зв'язування з іоном металу • Toll-like receptor 4 binding • antioxidant activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RAGE receptor binding • arachidonic acid binding Клітинна компонента • мембрана • клітинна мембрана • екзосома • цитоскелет • клітинне ядро • GO:0005578 Позаклітинна матриця • міжклітинний простір • нуклеоплазма • гіалоплазма • міжклітинні контакти • secretory granule lumen • цитоплазма • extracellular region • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • peptidyl-cysteine S-trans-nitrosylation • positive regulation of inflammatory response • chemokine production • процес імунної системи • cellular oxidant detoxification • cell-cell signaling • GO:0032617 творба цитокінів • leukocyte migration involved in inflammatory response • neutrophil chemotaxis • defense response to fungus • хемотаксис • sequestering of zinc ion • neutrophil aggregation • positive regulation of cell growth • defense response to bacterium • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • regulation of inflammatory response • вроджений імунітет • inflammatory response • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway • regulation of cytoskeleton organization • GO:0097285 апоптоз • автофагія • toll-like receptor signaling pathway • antimicrobial humoral response • neutrophil degranulation • positive regulation of neuron projection development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6280	20202
Ensembl	ENSG00000163220	ENSMUSG00000056071
UniProt	P06702	P31725
RefSeq (мРНК)	NM_002965	NM_001281852 NM_009114
RefSeq (білок)	NP_002956	NP_001268781 NP_033140
Локус (UCSC)	Хр. 1: 153.36 – 153.36 Mb	Хр. 3: 90.6 – 90.6 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTCKMSQLER		NIETIINTFH		QYSVKLGHPD		TLNQGEFKEL		VRKDLQNFLK
KENKNEKVIE		HIMEDLDTNA		DKQLSFEEFI		MLMARLTWAS		HEKMHEGDEG
PGHHHKPGLG		EGTP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антиоксидантів, . Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, хемотаксис, автофагія. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Lagasse E., Clerc R.G. (1988). Cloning and expression of two human genes encoding calcium-binding proteins that are regulated during myeloid differentiation. Mol. Cell. Biol. 8: 2402—2410. PMID 3405210 DOI:10.1128/MCB.8.6.2402
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Edgeworth J., Freemont P., Hogg N. (1989). Ionomycin-regulated phosphorylation of the myeloid calcium-binding protein p14. Nature. 342: 189—192. PMID 2478889 DOI:10.1038/342189a0
• Tobe T., Murakami K., Tomita M., Nozawa R. (1989). Amino acid sequences of 60B8 antigens induced in HL-60 cells by 1,25-dihydroxyvitamin D3. The antigens are identical with macrophage-related protein-14 and -8. Chem. Pharm. Bull. 37: 1576—1580. PMID 2776242 DOI:10.1248/cpb.37.1576
• Miyasaki K.T., Bodeau A.L., Murthy A.R., Lehrer R.I. (1993). In vitro antimicrobial activity of the human neutrophil cytosolic S-100 protein complex, calprotectin, against Capnocytophaga sputigena. J. Dent. Res. 72: 517—523. PMID 8423249 DOI:10.1177/00220345930720020801
• Ryckman C., Vandal K., Rouleau P., Talbot M., Tessier P.A. (2003). Proinflammatory activities of S100: proteins S100A8, S100A9, and S100A8/A9 induce neutrophil chemotaxis and adhesion. J. Immunol. 170: 3233—3242. PMID 12626582 DOI:10.4049/jimmunol.170.6.3233

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10499 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.{{}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url ()
4. UniProt, P06702 (англ.) . Архів оригіналу за 23 грудня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

• Хромосома 1