Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

RXRA англ Retinoid X receptor alpha білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі 9 ї х

RXRA

RXRA

RXRA (англ. Retinoid X receptor alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 462 амінокислот, а молекулярна маса — 50 811.

RXRA
image
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи RXRA, NR2B1, Retinoid X receptor alpha, RXR-alpha, RXRalpha
Зовнішні ІД OMIM: 180245 MGI: 98214 HomoloGene: 2220 GeneCards: RXRA
Реагує на сполуку
alitretinoin, bexarotene
Шаблон експресії
image

image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6256
20181
Ensembl
ENSG00000186350
ENSMUSG00000015846
UniProt
P19793
P28700
RefSeq (мРНК)
NM_002957
NM_001291920
NM_001291921
NM_001290481
NM_001290482
NM_011305
RefSeq (білок)
NP_001278849
NP_001278850
NP_002948
NP_001277410
NP_001277411
NP_035435
Локус (UCSC) Хр. 9: 134.32 – 134.44 Mb Хр. 2: 27.57 – 27.65 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MDTKHFLPLDFSTQVNSSLTSPTGRGSMAAPSLHPSLGPGIGSPGQLHSP
ISTLSSPINGMGPPFSVISSPMGPHSMSVPTTPTLGFSTGSPQLSSPMNP
VSSSEDIKPPLGLNGVLKVPAHPSGNMASFTKHICAICGDRSSGKHYGVY
SCEGCKGFFKRTVRKDLTYTCRDNKDCLIDKRQRNRCQYCRYQKCLAMGM
KREAVQEERQRGKDRNENEVESTSSANEDMPVERILEAELAVEPKTETYV
EANMGLNPSSPNDPVTNICQAADKQLFTLVEWAKRIPHFSELPLDDQVIL
LRAGWNELLIASFSHRSIAVKDGILLATGLHVHRNSAHSAGVGAIFDRVL
TELVSKMRDMQMDKTELGCLRAIVLFNPDSKGLSNPAEVEALREKVYASL
EAYCKHKYPEQPGRFAKLLLRLPALRSIGLKCLEHLFFFKLIGDTPIDTF
LMEMLEAPHQMT

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Mangelsdorf D.J., Ong E.S., Dyck J.A., Evans R.M. (1990). Nuclear receptor that identifies a novel retinoic acid response pathway. Nature. 345: 224—229. PMID 2159111 DOI:10.1038/345224a0
  • Kobayashi T., Kodani Y., Nozawa A., Endo Y., Sawasaki T. (2008). DNA-binding profiling of human hormone nuclear receptors via fluorescence correlation spectroscopy in a cell-free system. FEBS Lett. 582: 2737—2744. PMID 18619963 DOI:10.1016/j.febslet.2008.07.003
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Gorla-Bajszczak A., Juge-Aubry C., Pernin A., Burger A.G., Meier C.A. (1999). Conserved amino acids in the ligand-binding and tau(i) domains of the peroxisome proliferator-activated receptor alpha are necessary for heterodimerization with RXR. Mol. Cell. Endocrinol. 147: 37—47. PMID 10195690 DOI:10.1016/S0303-7207(98)00217-2
  • Harish S., Ashok M.S., Khanam T., Rangarajan P.N. (2000). Serine 27, a human retinoid X receptor alpha residue, phosphorylated by protein kinase A is essential for cyclicAMP-mediated downregulation of RXRalpha function. Biochem. Biophys. Res. Commun. 279: 853—857. PMID 11162439 DOI:10.1006/bbrc.2000.4043
  • Mathur M., Tucker P.W., Samuels H.H. (2001). PSF is a novel corepressor that mediates its effect through Sin3A and the DNA binding domain of nuclear hormone receptors. Mol. Cell. Biol. 21: 2298—2311. PMID 11259580 DOI:10.1128/MCB.21.7.2298-2311.2001

Примітки

  1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Retinoid X receptor alpha переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10477 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
  5. (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

RXRA angl Retinoid X receptor alpha bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 9 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 462 aminokislot a molekulyarna masa 50 811 RXRANayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1BY4 1DSZ 1FBY 1FM6 1FM9 1G1U 1G5Y 1K74 1LBD 1MV9 1MVC 1MZN 1R0N 1RDT 1RXR 1XLS 1XV9 1XVP 1YNW 2ACL 2NLL 2P1T 2P1U 2P1V 2ZXZ 2ZY0 3DZU 3DZY 3E00 3E94 3FAL 3FC6 3FUG 3H0A 3KWY 3NSP 3NSQ 3OAP 3OZJ 3PCU 3R29 3R2A 3R5M 3UVV 4CN2 4CN3 4CN5 4CN7 4J5W 4J5X 4K4J 4K6I 4M8E 4M8H 4N5G 4N8R 4NQA 4OC7 4POH 4POJ 4PP3 4PP5 4RFW 4RMC 4RMD 4RME 4ZO1 5EC9 4ZSHIdentifikatoriSimvoliRXRA NR2B1 Retinoid X receptor alpha RXR alpha RXRalphaZovnishni ID OMIM 180245 MGI 98214 HomoloGene 2220 GeneCards RXRAReaguye na spolukualitretinoin bexarotene Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding sequence specific DNA binding RNA polymerase II transcription regulatory region sequence specific DNA binding GO 0001131 GO 0001151 GO 0001130 GO 0001204 DNA binding transcription factor activity vitamin D response element binding GO 0001105 transcription coactivator activity transcription factor binding retinoic acid responsive element binding zv yazuvannya z ionom metalu steroid hormone receptor activity GO 0038050 GO 0004886 GO 0038051 nuclear receptor activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding protein heterodimerization activity enzyme binding chromatin DNA binding vitamin D receptor binding retinoic acid binding double stranded DNA binding zinc ion binding nuclear receptor binding peptidnij zv yazok DNA binding domain binding LBD domain binding GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specific signaling receptor activityKlitinna komponenta receptor complex nukleoplazma RNA polymerase II transcription regulator complex klitinne yadro GO 0009327 protein containing complexBiologichnij proces steroid hormone mediated signaling pathway regulation of branching involved in prostate gland morphogenesis GO 0009373 regulation of transcription DNA templated placenta development peroxisome proliferator activated receptor signaling pathway GO 0044324 GO 0003256 GO 1901213 GO 0046019 GO 0046020 GO 1900094 GO 0061216 GO 0060994 GO 1902064 GO 0003258 GO 0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II cholesterol metabolic process in utero embryonic development GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II cardiac muscle cell proliferation secretory columnal luminar epithelial cell differentiation involved in prostate glandular acinus development transcription DNA templated GO 0060469 GO 0009371 positive regulation of transcription DNA templated ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis heart development retinoic acid receptor signaling pathway maternal placenta development modulation by virus of host process vitamin metabolic process bile acid and bile salt transport ventricular cardiac muscle cell differentiation camera type eye development GO 0022415 viral process protein homotetramerization transcription initiation from RNA polymerase II promoter embryo implantation positive regulation of translational initiation by iron GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II GO 0007329 positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in cellular response to chemical stimulus response to retinoic acid regulation of lipid metabolic processDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez6256 20181Ensembl ENSG00000186350 ENSMUSG00000015846UniProt P19793 P28700RefSeq mRNK NM 002957 NM 001291920 NM 001291921NM 001290481 NM 001290482 NM 011305RefSeq bilok NP 001278849 NP 001278850 NP 002948NP 001277410 NP 001277411 NP 035435Lokus UCSC Hr 9 134 32 134 44 MbHr 2 27 57 27 65 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MDTKHFLPLDFSTQVNSSLTSPTGRGSMAAPSLHPSLGPGIGSPGQLHSP ISTLSSPINGMGPPFSVISSPMGPHSMSVPTTPTLGFSTGSPQLSSPMNP VSSSEDIKPPLGLNGVLKVPAHPSGNMASFTKHICAICGDRSSGKHYGVY SCEGCKGFFKRTVRKDLTYTCRDNKDCLIDKRQRNRCQYCRYQKCLAMGM KREAVQEERQRGKDRNENEVESTSSANEDMPVERILEAELAVEPKTETYV EANMGLNPSSPNDPVTNICQAADKQLFTLVEWAKRIPHFSELPLDDQVIL LRAGWNELLIASFSHRSIAVKDGILLATGLHVHRNSAHSAGVGAIFDRVL TELVSKMRDMQMDKTELGCLRAIVLFNPDSKGLSNPAEVEALREKVYASL EAYCKHKYPEQPGRFAKLLLRLPALRSIGLKCLEHLFFFKLIGDTPIDTF LMEMLEAPHQMT A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do receptoriv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak vzayemodiya hazyayin virus transkripciya regulyaciya transkripciyi alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku DNK Lokalizovanij u yadri LiteraturaMangelsdorf D J Ong E S Dyck J A Evans R M 1990 Nuclear receptor that identifies a novel retinoic acid response pathway Nature 345 224 229 PMID 2159111 DOI 10 1038 345224a0 Kobayashi T Kodani Y Nozawa A Endo Y Sawasaki T 2008 DNA binding profiling of human hormone nuclear receptors via fluorescence correlation spectroscopy in a cell free system FEBS Lett 582 2737 2744 PMID 18619963 DOI 10 1016 j febslet 2008 07 003 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Gorla Bajszczak A Juge Aubry C Pernin A Burger A G Meier C A 1999 Conserved amino acids in the ligand binding and tau i domains of the peroxisome proliferator activated receptor alpha are necessary for heterodimerization with RXR Mol Cell Endocrinol 147 37 47 PMID 10195690 DOI 10 1016 S0303 7207 98 00217 2 Harish S Ashok M S Khanam T Rangarajan P N 2000 Serine 27 a human retinoid X receptor alpha residue phosphorylated by protein kinase A is essential for cyclicAMP mediated downregulation of RXRalpha function Biochem Biophys Res Commun 279 853 857 PMID 11162439 DOI 10 1006 bbrc 2000 4043 Mathur M Tucker P W Samuels H H 2001 PSF is a novel corepressor that mediates its effect through Sin3A and the DNA binding domain of nuclear hormone receptors Mol Cell Biol 21 2298 2311 PMID 11259580 DOI 10 1128 MCB 21 7 2298 2311 2001PrimitkiSpoluki yaki fizichno vzayemodiyut z Retinoid X receptor alpha pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 10477 angl Procitovano 8 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 11 veresnya 2017 Procitovano 8 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 9 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ