RRP1B (англ. Ribosomal RNA processing 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 758 амінокислот, а молекулярна маса — 84 428.
RRP1B | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | RRP1B, KIAA0179, NNP1L, Nnp1, PPP1R136, RRP1, ribosomal RNA processing 1B | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 610654 MGI: 1919712 HomoloGene: 57086 GeneCards: RRP1B | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 21: 43.66 – 43.7 Mb | Хр. 17: 32.26 – 32.28 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAPAMQPAEI | QFAQRLASSE | KGIRDRAVKK | LRQYISVKTQ | RETGGFSQEE | ||||
LLKIWKGLFY | CMWVQDEPLL | QEELANTIAQ | LVHAVNNSAA | QHLFIQTFWQ | ||||
TMNREWKGID | RLRLDKYYML | IRLVLRQSFE | VLKRNGWEES | RIKVFLDVLM | ||||
KEVLCPESQS | PNGVRFHFID | IYLDELSKVG | GKELLADQNL | KFIDPFCKIA | ||||
AKTKDHTLVQ | TIARGVFEAI | VDQSPFVPEE | TMEEQKTKVG | DGDLSAEEIP | ||||
ENEVSLRRAV | SKKKTALGKN | HSRKDGLSDE | RGRDDCGTFE | DTGPLLQFDY | ||||
KAVADRLLEM | TSRKNTPHFN | RKRLSKLIKK | FQDLSEGSSI | SQLSFAEDIS | ||||
ADEDDQILSQ | GKHKKKGNKL | LEKTNLEKEK | GSRVFCVEEE | DSESSLQKRR | ||||
RKKKKKHHLQ | PENPGPGGAA | PSLEQNRGRE | PEASGLKALK | ARVAEPGAEA | ||||
TSSTGEESGS | EHPPAVPMHN | KRKRPRKKSP | RAHREMLESA | VLPPEDMSQS | ||||
GPSGSHPQGP | RGSPTGGAQL | LKRKRKLGVV | PVNGSGLSTP | AWPPLQQEGP | ||||
PTGPAEGANS | HTTLPQRRRL | QKKKAGPGSL | ELCGLPSQKT | ASLKKRKKMR | ||||
VMSNLVEHNG | VLESEAGQPQ | ALGSSGTCSS | LKKQKLRAES | DFVKFDTPFL | ||||
PKPLFFRRAK | SSTATHPPGP | AVQLNKTPSS | SKKVTFGLNR | NMTAEFKKTD | ||||
KSILVSPTGP | SRVAFDPEQK | PLHGVLKTPT | SSPASSPLVA | KKPLTTTPRR | ||||
RPRAMDFF |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tanaka A., Nomura N. (1996). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. V. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0161-KIAA0200) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 3: 17—24. PMID 8724849 DOI:10.1093/dnares/3.1.17
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23818 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
RRP1B angl Ribosomal RNA processing 1B bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 21 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 758 aminokislot a molekulyarna masa 84 428 RRP1BIdentifikatoriSimvoliRRP1B KIAA0179 NNP1L Nnp1 PPP1R136 RRP1 ribosomal RNA processing 1BZovnishni ID OMIM 610654 MGI 1919712 HomoloGene 57086 GeneCards RRP1BOntologiya genaMolekulyarna funkciya RNA binding GO 0001105 transcription coactivator activity GO 0001948 GO 0016582 protein bindingKlitinna komponenta GO 0035328 Geterohromatin preribosome small subunit precursor gialoplazma GO 0035327 Euhromatin yaderce klitinne yadro preribosome large subunit precursor granular component nukleoplazma hromosomaBiologichnij proces negative regulation of phosphatase activity rRNA processing GO 0034259 negative regulation of GTPase activity positive regulation of apoptotic process regulation of RNA splicing GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II cellular response to virus mRNA processing GO 0097285 apoptoz Splajsing RNKDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez23076 72462Ensembl ENSG00000160208 ENSMUSG00000058392UniProt Q14684 Q91YK2RefSeq mRNK NM 015056NM 001163734 NM 028244RefSeq bilok NP 055871NP 001157206 NP 082520Lokus UCSC Hr 21 43 66 43 7 MbHr 17 32 26 32 28 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishejPoslidovnist aminokislot1020304050MAPAMQPAEIQFAQRLASSEKGIRDRAVKKLRQYISVKTQRETGGFSQEELLKIWKGLFYCMWVQDEPLLQEELANTIAQLVHAVNNSAAQHLFIQTFWQTMNREWKGIDRLRLDKYYMLIRLVLRQSFEVLKRNGWEESRIKVFLDVLMKEVLCPESQSPNGVRFHFIDIYLDELSKVGGKELLADQNLKFIDPFCKIAAKTKDHTLVQTIARGVFEAIVDQSPFVPEETMEEQKTKVGDGDLSAEEIPENEVSLRRAVSKKKTALGKNHSRKDGLSDERGRDDCGTFEDTGPLLQFDYKAVADRLLEMTSRKNTPHFNRKRLSKLIKKFQDLSEGSSISQLSFAEDISADEDDQILSQGKHKKKGNKLLEKTNLEKEKGSRVFCVEEEDSESSLQKRRRKKKKKHHLQPENPGPGGAAPSLEQNRGREPEASGLKALKARVAEPGAEATSSTGEESGSEHPPAVPMHNKRKRPRKKSPRAHREMLESAVLPPEDMSQSGPSGSHPQGPRGSPTGGAQLLKRKRKLGVVPVNGSGLSTPAWPPLQQEGPPTGPAEGANSHTTLPQRRRLQKKKAGPGSLELCGLPSQKTASLKKRKKMRVMSNLVEHNGVLESEAGQPQALGSSGTCSSLKKQKLRAESDFVKFDTPFLPKPLFFRRAKSSTATHPPGPAVQLNKTPSSSKKVTFGLNRNMTAEFKKTDKSILVSPTGPSRVAFDPEQKPLHGVLKTPTSSPASSPLVAKKPLTTTPRRRPRAMDFFA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak acetilyuvannya alternativnij splajsing Lokalizovanij u yadri LiteraturaNagase T Seki N Ishikawa K Tanaka A Nomura N 1996 Prediction of the coding sequences of unidentified human genes V The coding sequences of 40 new genes KIAA0161 KIAA0200 deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG 1 DNA Res 3 17 24 PMID 8724849 DOI 10 1093 dnares 3 1 17 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Beausoleil S A Villen J Gerber S A Rush J Gygi S P 2006 A probability based approach for high throughput protein phosphorylation analysis and site localization Nat Biotechnol 24 1285 1292 PMID 16964243 DOI 10 1038 nbt1240PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 23818 angl Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 8 serpnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 21Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi