RORA (англ. RAR related orphan receptor A) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 523 амінокислот, а молекулярна маса — 58 975.
RORA | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | RORA, NR1F1, ROR1, ROR2, ROR3, RZR-ALPHA, RZRA, RAR related orphan receptor A, IDDECA | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 600825 MGI: 104661 HomoloGene: 56594 GeneCards: RORA | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
шизофренія, бронхіальна астма, депресія клінічна | |||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
холестерол | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 15: 60.49 – 61.23 Mb | Хр. 9: 68.56 – 69.3 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MESAPAAPDP | AASEPGSSGA | DAAAGSRETP | LNQESARKSE | PPAPVRRQSY | ||||
SSTSRGISVT | KKTHTSQIEI | IPCKICGDKS | SGIHYGVITC | EGCKGFFRRS | ||||
QQSNATYSCP | RQKNCLIDRT | SRNRCQHCRL | QKCLAVGMSR | DAVKFGRMSK | ||||
KQRDSLYAEV | QKHRMQQQQR | DHQQQPGEAE | PLTPTYNISA | NGLTELHDDL | ||||
SNYIDGHTPE | GSKADSAVSS | FYLDIQPSPD | QSGLDINGIK | PEPICDYTPA | ||||
SGFFPYCSFT | NGETSPTVSM | AELEHLAQNI | SKSHLETCQY | LREELQQITW | ||||
QTFLQEEIEN | YQNKQREVMW | QLCAIKITEA | IQYVVEFAKR | IDGFMELCQN | ||||
DQIVLLKAGS | LEVVFIRMCR | AFDSQNNTVY | FDGKYASPDV | FKSLGCEDFI | ||||
SFVFEFGKSL | CSMHLTEDEI | ALFSAFVLMS | ADRSWLQEKV | KIEKLQQKIQ | ||||
LALQHVLQKN | HREDGILTKL | ICKVSTLRAL | CGRHTEKLMA | FKAIYPDIVR | ||||
LHFPPLYKEL | FTSEFEPAMQ | IDG |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, альтернативний сплайсинг. Білок має вузол для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
Валері Ху відкрила, що ген RORA, який може перебувати під позитивною регуляцією андрогенів, призводить до накопичення додаткового тестостерону, який може спричиняти більшу частоту проявів аутизму у чоловіків.
Література
- Becker-Andre M., Andre E., Delamarter J.F. (1993). Identification of nuclear receptor mRNAs by RT-PCR amplification of conserved zinc-finger motif sequences. Biochem. Biophys. Res. Commun. 194: 1371—1379. PMID 7916608 DOI:10.1006/bbrc.1993.1976
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Harding H.P., Atkins G.B., Jaffe A.B., Seo W.J., Lazar M.A. (1997). Transcriptional activation and repression by RORalpha, an orphan nuclear receptor required for cerebellar development. Mol. Endocrinol. 11: 1737—1746. PMID 9328355 DOI:10.1210/mend.11.11.0002
- Lau P., Bailey P., Dowhan D.H., Muscat G.E. (1999). Exogenous expression of a dominant negative RORalpha1 vector in muscle cells impairs differentiation: RORalpha1 directly interacts with p300 and myoD. Nucleic Acids Res. 27: 411—420. PMID 9862959 DOI:10.1093/nar/27.2.411
- Sundvold H., Lien S. (2001). Identification of a novel peroxisome proliferator-activated receptor (PPAR) gamma promoter in man and transactivation by the nuclear receptor RORalpha1. Biochem. Biophys. Res. Commun. 287: 383—390. PMID 11554739 DOI:10.1006/bbrc.2001.5602
- Moraitis A.N., Giguere V. (2003). The co-repressor hairless protects RORalpha orphan nuclear receptor from proteasome-mediated degradation. J. Biol. Chem. 278: 52511—52518. PMID 14570920 DOI:10.1074/jbc.M308152200
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з RORA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Сполуки, які фізично взаємодіють з RAR related orphan receptor A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10258 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
- Anderson, Lisa (2013). . Neuroscience Research. BTNRC. Архів оригіналу за 4 березня 2016. Процитовано 30 жовтня 2013.
- Jabr, Ferris (17 лютого 2011). . New Scientist. Архів оригіналу за 23 квітня 2015. Процитовано 2 листопада 2013.
- Weaver, Janelle (19 липня 2011). . Scientific American. Архів оригіналу за 10 листопада 2013. Процитовано 6 листопада 2013.
- Rowan, Karen (18 лютого 2011). . NBC News. Архів оригіналу за 2 грудня 2016. Процитовано 5 лютого 2014.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
RORA angl RAR related orphan receptor A bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 15 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 523 aminokislot a molekulyarna masa 58 975 RORANayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1N83 1S0X 4S15IdentifikatoriSimvoliRORA NR1F1 ROR1 ROR2 ROR3 RZR ALPHA RZRA RAR related orphan receptor A IDDECAZovnishni ID OMIM 600825 MGI 104661 HomoloGene 56594 GeneCards RORAPov yazani genetichni zahvoryuvannyashizofreniya bronhialna astma depresiya klinichna Reaguye na spolukuholesterol Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding sequence specific DNA binding beta catenin binding RNA polymerase II transcription regulatory region sequence specific DNA binding ligand activated transcription factor activity GO 0001131 GO 0001151 GO 0001130 GO 0001204 DNA binding transcription factor activity zinc ion binding transcription factor binding zv yazuvannya z ionom metalu steroid hormone receptor activity GO 0038050 GO 0004886 GO 0038051 nuclear receptor activity core promoter sequence specific DNA binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding transcription coactivator binding transcription corepressor binding oxysterol binding GO 0001077 GO 0001212 GO 0001213 GO 0001211 GO 0001205 DNA binding transcription activator activity RNA polymerase II specific GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specific GO 0000980 RNA polymerase II cis regulatory region sequence specific DNA bindingKlitinna komponenta nukleoplazma klitinne yadroBiologichnij proces negative regulation of fat cell differentiation nitric oxide biosynthetic process GO 0009373 regulation of transcription DNA templated cGMP metabolic process ritmichnij proces cellular response to sterol cellular response to tumor necrosis factor cerebellar Purkinje cell differentiation negative regulation of I kappaB kinase NF kappaB signaling circadian regulation of gene expression transcription DNA templated cerebellar granule cell precursor proliferation regulation of steroid metabolic process GO 0060469 GO 0009371 positive regulation of transcription DNA templated regulation of smoothened signaling pathway muscle cell differentiation intracellular receptor signaling pathway regulation of glucose metabolic process regulation of circadian rhythm Angiogenez cellular response to interleukin 1 xenobiotic metabolic process positive regulation of circadian rhythm positive regulation of vascular endothelial growth factor production T helper 17 cell differentiation transcription initiation from RNA polymerase II promoter negative regulation of inflammatory response cellular response to hypoxia triglyceride homeostasis regulation of macrophage activation GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II steroid hormone mediated signaling pathway cirkadnij ritm cytokine mediated signaling pathway cholesterol homeostasis multicellular organism developmentDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez6095 19883Ensembl ENSG00000069667 ENSMUSG00000032238UniProt P35398 P51448RefSeq mRNK NM 002943 NM 134260 NM 134261 NM 134262NM 013646 NM 001289916 NM 001289917RefSeq bilok NP 002934 NP 599022 NP 599023 NP 599024NP 001276845 NP 001276846 NP 038674Lokus UCSC Hr 15 60 49 61 23 MbHr 9 68 56 69 3 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MESAPAAPDPAASEPGSSGADAAAGSRETPLNQESARKSEPPAPVRRQSY SSTSRGISVTKKTHTSQIEIIPCKICGDKSSGIHYGVITCEGCKGFFRRS QQSNATYSCPRQKNCLIDRTSRNRCQHCRLQKCLAVGMSRDAVKFGRMSK KQRDSLYAEVQKHRMQQQQRDHQQQPGEAEPLTPTYNISANGLTELHDDL SNYIDGHTPEGSKADSAVSSFYLDIQPSPDQSGLDINGIKPEPICDYTPA SGFFPYCSFTNGETSPTVSMAELEHLAQNISKSHLETCQYLREELQQITW QTFLQEEIENYQNKQREVMWQLCAIKITEAIQYVVEFAKRIDGFMELCQN DQIVLLKAGSLEVVFIRMCRAFDSQNNTVYFDGKYASPDVFKSLGCEDFI SFVFEFGKSLCSMHLTEDEIALFSAFVLMSADRSWLQEKVKIEKLQQKIQ LALQHVLQKNHREDGILTKLICKVSTLRALCGRHTEKLMAFKAIYPDIVR LHFPPLYKELFTSEFEPAMQIDG A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do receptoriv aktivatoriv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi biologichni ritmi alternativnij splajsing Bilok maye vuzol dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku DNK Lokalizovanij u yadri Valeri Hu vidkrila sho gen RORA yakij mozhe perebuvati pid pozitivnoyu regulyaciyeyu androgeniv prizvodit do nakopichennya dodatkovogo testosteronu yakij mozhe sprichinyati bilshu chastotu proyaviv autizmu u cholovikiv LiteraturaBecker Andre M Andre E Delamarter J F 1993 Identification of nuclear receptor mRNAs by RT PCR amplification of conserved zinc finger motif sequences Biochem Biophys Res Commun 194 1371 1379 PMID 7916608 DOI 10 1006 bbrc 1993 1976 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Harding H P Atkins G B Jaffe A B Seo W J Lazar M A 1997 Transcriptional activation and repression by RORalpha an orphan nuclear receptor required for cerebellar development Mol Endocrinol 11 1737 1746 PMID 9328355 DOI 10 1210 mend 11 11 0002 Lau P Bailey P Dowhan D H Muscat G E 1999 Exogenous expression of a dominant negative RORalpha1 vector in muscle cells impairs differentiation RORalpha1 directly interacts with p300 and myoD Nucleic Acids Res 27 411 420 PMID 9862959 DOI 10 1093 nar 27 2 411 Sundvold H Lien S 2001 Identification of a novel peroxisome proliferator activated receptor PPAR gamma promoter in man and transactivation by the nuclear receptor RORalpha1 Biochem Biophys Res Commun 287 383 390 PMID 11554739 DOI 10 1006 bbrc 2001 5602 Moraitis A N Giguere V 2003 The co repressor hairless protects RORalpha orphan nuclear receptor from proteasome mediated degradation J Biol Chem 278 52511 52518 PMID 14570920 DOI 10 1074 jbc M308152200PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z RORA pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Spoluki yaki fizichno vzayemodiyut z RAR related orphan receptor A pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 10258 angl Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 17 serpnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 Anderson Lisa 2013 Neuroscience Research BTNRC Arhiv originalu za 4 bereznya 2016 Procitovano 30 zhovtnya 2013 Jabr Ferris 17 lyutogo 2011 New Scientist Arhiv originalu za 23 kvitnya 2015 Procitovano 2 listopada 2013 Weaver Janelle 19 lipnya 2011 Scientific American Arhiv originalu za 10 listopada 2013 Procitovano 6 listopada 2013 Rowan Karen 18 lyutogo 2011 NBC News Arhiv originalu za 2 grudnya 2016 Procitovano 5 lyutogo 2014 Div takozhHromosoma 15 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi