RARG (англ. Retinoic acid receptor gamma) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 454 амінокислот, а молекулярна маса — 50 342.
RARG | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | RARG, NR1B3, RARC, retinoic acid receptor gamma, RARgamma | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 180190 MGI: 97858 HomoloGene: 20263 GeneCards: RARG | ||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
adapalene, alitretinoin, palovarotene, tamibarotene, tazarotene, третиноїн | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 12: 53.21 – 53.23 Mb | Хр. 15: 102.14 – 102.17 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MATNKERLFA | AGALGPGSGY | PGAGFPFAFP | GALRGSPPFE | MLSPSFRGLG | ||||
QPDLPKEMAS | LSVETQSTSS | EEMVPSSPSP | PPPPRVYKPC | FVCNDKSSGY | ||||
HYGVSSCEGC | KGFFRRSIQK | NMVYTCHRDK | NCIINKVTRN | RCQYCRLQKC | ||||
FEVGMSKEAV | RNDRNKKKKE | VKEEGSPDSY | ELSPQLEELI | TKVSKAHQET | ||||
FPSLCQLGKY | TTNSSADHRV | QLDLGLWDKF | SELATKCIIK | IVEFAKRLPG | ||||
FTGLSIADQI | TLLKAACLDI | LMLRICTRYT | PEQDTMTFSD | GLTLNRTQMH | ||||
NAGFGPLTDL | VFAFAGQLLP | LEMDDTETGL | LSAICLICGD | RMDLEEPEKV | ||||
DKLQEPLLEA | LRLYARRRRP | SQPYMFPRML | MKITDLRGIS | TKGAERAITL | ||||
KMEIPGPMPP | LIREMLENPE | MFEDDSSQPG | PHPNASSEDE | VPGGQGKGGL | ||||
KSPA |
Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Krust A., Kastner P., Petkovich M., Zelent A., Chambon P. (1989). A third human retinoic acid receptor, hRAR-gamma. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 5310—5314. PMID 2546152 DOI:10.1073/pnas.86.14.5310
- Lehmann J.M., Hoffmann B., Pfahl M. (1991). Genomic organization of the retinoic acid receptor gamma gene. Nucleic Acids Res. 19: 573—578. PMID 1849262 DOI:10.1093/nar/19.3.573
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Lehmann J.M., Zhang X.K., Pfahl M. (1992). RAR-gamma-2 expression is regulated through a retinoic acid response element embedded in Sp1 sites. Mol. Cell. Biol. 12: 2976—2985. PMID 1320193 DOI:10.1128/MCB.12.7.2976
Примітки
- Сполуки, які фізично взаємодіють з Retinoic acid receptor gamma переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 18 червня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
RARG angl Retinoic acid receptor gamma bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 12 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 454 aminokislot a molekulyarna masa 50 342 RARGNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv H3BMH6 PDBe H3BMH6 RCSB Spisok kodiv PDB1EXA 1EXX 1FCX 1FCY 1FCZ 1FD0 2LBD 3LBD 4LBDIdentifikatoriSimvoliRARG NR1B3 RARC retinoic acid receptor gamma RARgammaZovnishni ID OMIM 180190 MGI 97858 HomoloGene 20263 GeneCards RARGReaguye na spolukuadapalene alitretinoin palovarotene tamibarotene tazarotene tretinoyin Ontologiya genaMolekulyarna funkciya sequence specific DNA binding RNA polymerase II transcription regulatory region sequence specific DNA binding zinc ion binding zv yazuvannya z ionom metalu steroid hormone receptor activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding GO 0001131 GO 0001151 GO 0001130 GO 0001204 DNA binding transcription factor activity DNA binding retinoid X receptor binding GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specific GO 0000975 transcription cis regulatory region binding transcription factor binding nuclear receptor coactivator activity signaling receptor activity GO 0038050 GO 0004886 GO 0038051 nuclear receptor activityKlitinna komponenta integral component of membrane nukleoplazma klitinne yadro transcription regulator complex RNA polymerase II transcription regulator complexBiologichnij proces regulation of cell size growth plate cartilage development cellular response to retinoic acid gland development GO 0009373 regulation of transcription DNA templated negative regulation of cartilage development response to retinoic acid multicellular organism growth negative regulation of cell differentiation bone morphogenesis chondrocyte development negative regulation of apoptotic process retinal pigment epithelium development transcription DNA templated epithelium development embryonic camera type eye development reproductive structure development limb development face development neural tube closure negative regulation of chondrocyte differentiation Harderian gland development prostate gland epithelium morphogenesis regulation of myelination GO 1901313 positive regulation of gene expression retina development in camera type eye positive regulation of cell population proliferation growth plate cartilage chondrocyte growth canonical Wnt signaling pathway regulyaciya ekspresiyi geniv camera type eye development transcription initiation from RNA polymerase II promoter regulation of myeloid cell differentiation bone development trachea cartilage development anterior posterior pattern specification glandular epithelial cell development steroid hormone mediated signaling pathway GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II embryonic hindlimb morphogenesis retinoic acid receptor signaling pathway negative regulation of cell population proliferation embryonic eye morphogenesis positive regulation of apoptotic process positive regulation of programmed cell death cellular response to leukemia inhibitory factor multicellular organism development hormone mediated signaling pathway diferenciaciya klitin response to lipidDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez5916 19411Ensembl ENSG00000172819 ENSMUSG00000001288UniProt P13631 P18911RefSeq mRNK NM 000966 NM 001042728 NM 001243730 NM 001243731 NM 001243732NM 001042727 NM 011244RefSeq bilok NP 000957 NP 001036193 NP 001230659 NP 001230660 NP 001230661NP 001036192 NP 035374Lokus UCSC Hr 12 53 21 53 23 MbHr 15 102 14 102 17 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MATNKERLFAAGALGPGSGYPGAGFPFAFPGALRGSPPFEMLSPSFRGLG QPDLPKEMASLSVETQSTSSEEMVPSSPSPPPPPRVYKPCFVCNDKSSGY HYGVSSCEGCKGFFRRSIQKNMVYTCHRDKNCIINKVTRNRCQYCRLQKC FEVGMSKEAVRNDRNKKKKEVKEEGSPDSYELSPQLEELITKVSKAHQET FPSLCQLGKYTTNSSADHRVQLDLGLWDKFSELATKCIIKIVEFAKRLPG FTGLSIADQITLLKAACLDILMLRICTRYTPEQDTMTFSDGLTLNRTQMH NAGFGPLTDLVFAFAGQLLPLEMDDTETGLLSAICLICGDRMDLEEPEKV DKLQEPLLEALRLYARRRRPSQPYMFPRMLMKITDLRGISTKGAERAITL KMEIPGPMPPLIREMLENPEMFEDDSSQPGPHPNASSEDEVPGGQGKGGL KSPA A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do receptoriv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku DNK Lokalizovanij u yadri LiteraturaKrust A Kastner P Petkovich M Zelent A Chambon P 1989 A third human retinoic acid receptor hRAR gamma Proc Natl Acad Sci U S A 86 5310 5314 PMID 2546152 DOI 10 1073 pnas 86 14 5310 Lehmann J M Hoffmann B Pfahl M 1991 Genomic organization of the retinoic acid receptor gamma gene Nucleic Acids Res 19 573 578 PMID 1849262 DOI 10 1093 nar 19 3 573 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Lehmann J M Zhang X K Pfahl M 1992 RAR gamma 2 expression is regulated through a retinoic acid response element embedded in Sp1 sites Mol Cell Biol 12 2976 2985 PMID 1320193 DOI 10 1128 MCB 12 7 2976PrimitkiSpoluki yaki fizichno vzayemodiyut z Retinoic acid receptor gamma pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 18 chervnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 31 serpnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 12 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi