Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

PRPF8 англ Pre mRNA processing factor 8 білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі 1

PRPF8

PRPF8

PRPF8 (англ. Pre-mRNA processing factor 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 335 амінокислот, а молекулярна маса — 273 600.

PRPF8
image
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи PRPF8, pre-mRNA processing factor 8, HPRP8, PRP8, PRPC8, RP13, SNRNP220
Зовнішні ІД OMIM: 607300 MGI: 2179381 HomoloGene: 4706 GeneCards: PRPF8
Пов'язані генетичні захворювання
retinitis pigmentosa 13
Шаблон експресії
image

image

image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
10594
192159
Ensembl
ENSG00000274442
ENSG00000174231
ENSMUSG00000020850
UniProt
Q6P2Q9
Q99PV0
RefSeq (мРНК)
NM_006445
NM_138659
RefSeq (білок)
NP_006436
NP_619600
Локус (UCSC) Хр. 17: 1.65 – 1.68 Mb Хр. 11: 75.38 – 75.4 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MAGVFPYRGPGNPVPGPLAPLPDYMSEEKLQEKARKWQQLQAKRYAEKRK
FGFVDAQKEDMPPEHVRKIIRDHGDMTNRKFRHDKRVYLGALKYMPHAVL
KLLENMPMPWEQIRDVPVLYHITGAISFVNEIPWVIEPVYISQWGSMWIM
MRREKRDRRHFKRMRFPPFDDEEPPLDYADNILDVEPLEAIQLELDPEED
APVLDWFYDHQPLRDSRKYVNGSTYQRWQFTLPMMSTLYRLANQLLTDLV
DDNYFYLFDLKAFFTSKALNMAIPGGPKFEPLVRDINLQDEDWNEFNDIN
KIIIRQPIRTEYKIAFPYLYNNLPHHVHLTWYHTPNVVFIKTEDPDLPAF
YFDPLINPISHRHSVKSQEPLPDDDEEFELPEFVEPFLKDTPLYTDNTAN
GIALLWAPRPFNLRSGRTRRALDIPLVKNWYREHCPAGQPVKVRVSYQKL
LKYYVLNALKHRPPKAQKKRYLFRSFKATKFFQSTKLDWVEVGLQVCRQG
YNMLNLLIHRKNLNYLHLDYNFNLKPVKTLTTKERKKSRFGNAFHLCREV
LRLTKLVVDSHVQYRLGNVDAFQLADGLQYIFAHVGQLTGMYRYKYKLMR
QIRMCKDLKHLIYYRFNTGPVGKGPGCGFWAAGWRVWLFFMRGITPLLER
WLGNLLARQFEGRHSKGVAKTVTKQRVESHFDLELRAAVMHDILDMMPEG
IKQNKARTILQHLSEAWRCWKANIPWKVPGLPTPIENMILRYVKAKADWW
TNTAHYNRERIRRGATVDKTVCKKNLGRLTRLYLKAEQERQHNYLKDGPY
ITAEEAVAVYTTTVHWLESRRFSPIPFPPLSYKHDTKLLILALERLKEAY
SVKSRLNQSQREELGLIEQAYDNPHEALSRIKRHLLTQRAFKEVGIEFMD
LYSHLVPVYDVEPLEKITDAYLDQYLWYEADKRRLFPPWIKPADTEPPPL
LVYKWCQGINNLQDVWETSEGECNVMLESRFEKMYEKIDLTLLNRLLRLI
VDHNIADYMTAKNNVVINYKDMNHTNSYGIIRGLQFASFIVQYYGLVMDL
LVLGLHRASEMAGPPQMPNDFLSFQDIATEAAHPIRLFCRYIDRIHIFFR
FTADEARDLIQRYLTEHPDPNNENIVGYNNKKCWPRDARMRLMKHDVNLG
RAVFWDIKNRLPRSVTTVQWENSFVSVYSKDNPNLLFNMCGFECRILPKC
RTSYEEFTHKDGVWNLQNEVTKERTAQCFLRVDDESMQRFHNRVRQILMA
SGSTTFTKIVNKWNTALIGLMTYFREAVVNTQELLDLLVKCENKIQTRIK
IGLNSKMPSRFPPVVFYTPKELGGLGMLSMGHVLIPQSDLRWSKQTDVGI
THFRSGMSHEEDQLIPNLYRYIQPWESEFIDSQRVWAEYALKRQEAIAQN
RRLTLEDLEDSWDRGIPRINTLFQKDRHTLAYDKGWRVRTDFKQYQVLKQ
NPFWWTHQRHDGKLWNLNNYRTDMIQALGGVEGILEHTLFKGTYFPTWEG
LFWEKASGFEESMKWKKLTNAQRSGLNQIPNRRFTLWWSPTINRANVYVG
FQVQLDLTGIFMHGKIPTLKISLIQIFRAHLWQKIHESIVMDLCQVFDQE
LDALEIETVQKETIHPRKSYKMNSSCADILLFASYKWNVSRPSLLADSKD
VMDSTTTQKYWIDIQLRWGDYDSHDIERYARAKFLDYTTDNMSIYPSPTG
VLIAIDLAYNLHSAYGNWFPGSKPLIQQAMAKIMKANPALYVLRERIRKG
LQLYSSEPTEPYLSSQNYGELFSNQIIWFVDDTNVYRVTIHKTFEGNLTT
KPINGAIFIFNPRTGQLFLKIIHTSVWAGQKRLGQLAKWKTAEEVAALIR
SLPVEEQPKQIIVTRKGMLDPLEVHLLDFPNIVIKGSELQLPFQACLKVE
KFGDLILKATEPQMVLFNLYDDWLKTISSYTAFSRLILILRALHVNNDRA
KVILKPDKTTITEPHHIWPTLTDEEWIKVEVQLKDLILADYGKKNNVNVA
SLTQSEIRDIILGMEISAPSQQRQQIAEIEKQTKEQSQLTATQTRTVNKH
GDEIITSTTSNYETQTFSSKTEWRVRAISAANLHLRTNHIYVSSDDIKET
GYTYILPKNVLKKFICISDLRAQIAGYLYGVSPPDNPQVKEIRCIVMVPQ
WGTHQTVHLPGQLPQHEYLKEMEPLGWIHTQPNESPQLSPQDVTTHAKIM
ADNPSWDGEKTIIITCSFTPGSCTLTAYKLTPSGYEWGRQNTDKGNNPKG
YLPSHYERVQMLLSDRFLGFFMVPAQSSWNYNFMGVRHDPNMKYELQLAN
PKEFYHEVHRPSHFLNFALLQEGEVYSADREDLYA

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Luo H.R., Moreau G.A., Levin N., Moore M.J. (1999). The human Prp8 protein is a component of both U2- and U12-dependent spliceosomes. RNA. 5: 893—908. PMID 10411133 DOI:10.1017/S1355838299990520
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Anderson G.J., Bach M., Luehrmann R., Beggs J.D. (1989). Conservation between yeast and man of a protein associated with U5 small nuclear ribonucleoprotein. Nature. 342: 819—821. PMID 2532307 DOI:10.1038/342819a0
  • Bach M., Winkelmann G., Luehrmann R. (1989). 20S small nuclear ribonucleoprotein U5 shows a surprisingly complex protein composition. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 6038—6042. PMID 2527369 DOI:10.1073/pnas.86.16.6038
  • Pinto A.L., Steitz J.A. (1989). The mammalian analogue of the yeast PRP8 splicing protein is present in the U4/5/6 small nuclear ribonucleoprotein particle and the spliceosome. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 8742—8746. PMID 2479028 DOI:10.1073/pnas.86.22.8742
  • Garcia-Blanco M.A., Anderson G.J., Beggs J., Sharp P.A. (1990). A mammalian protein of 220 kDa binds pre-mRNAs in the spliceosome: a potential homologue of the yeast PRP8 protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 3082—3086. PMID 2139226 DOI:10.1073/pnas.87.8.3082

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з PRPF8 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 26 жовтня 2016. Процитовано 28 лютого 2017.
  5. (англ.) . Архів оригіналу за 20 квітня 2017. Процитовано 28 лютого 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

PRPF8 angl Pre mRNA processing factor 8 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 17 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 2 335 aminokislot a molekulyarna masa 273 600 PRPF8Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB3E9L 3ENB 3LRU 4JK7 4JK8 4JK9 4JKA 4JKB 4JKC 4JKD 4JKE 4JKF 4JKG 4JKH 4KIT 3JCRIdentifikatoriSimvoliPRPF8 pre mRNA processing factor 8 HPRP8 PRP8 PRPC8 RP13 SNRNP220Zovnishni ID OMIM 607300 MGI 2179381 HomoloGene 4706 GeneCards PRPF8Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaretinitis pigmentosa 13 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya K63 linked polyubiquitin modification dependent protein binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding RNA binding second spliceosomal transesterification activity U6 snRNA binding U1 snRNA binding U2 snRNA binding U5 snRNA binding pre mRNA intronic bindingKlitinna komponenta nuclear speck catalytic step 2 spliceosome membrana U5 snRNP nukleoplazma small nuclear ribonucleoprotein complex spliceosomal complex klitinne yadro U4 U6 x U5 tri snRNP complex U2 type precatalytic spliceosome U2 type catalytic step 2 spliceosomeBiologichnij proces mRNA splicing via spliceosome spliceosomal tri snRNP complex assembly RNA splicing via transesterification reactions cellular response to tumor necrosis factor mRNA processing Splajsing RNK cellular response to lipopolysaccharideDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez10594 192159Ensembl ENSG00000274442 ENSG00000174231 ENSMUSG00000020850UniProt Q6P2Q9 Q99PV0RefSeq mRNK NM 006445NM 138659RefSeq bilok NP 006436NP 619600Lokus UCSC Hr 17 1 65 1 68 MbHr 11 75 38 75 4 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MAGVFPYRGPGNPVPGPLAPLPDYMSEEKLQEKARKWQQLQAKRYAEKRK FGFVDAQKEDMPPEHVRKIIRDHGDMTNRKFRHDKRVYLGALKYMPHAVL KLLENMPMPWEQIRDVPVLYHITGAISFVNEIPWVIEPVYISQWGSMWIM MRREKRDRRHFKRMRFPPFDDEEPPLDYADNILDVEPLEAIQLELDPEED APVLDWFYDHQPLRDSRKYVNGSTYQRWQFTLPMMSTLYRLANQLLTDLV DDNYFYLFDLKAFFTSKALNMAIPGGPKFEPLVRDINLQDEDWNEFNDIN KIIIRQPIRTEYKIAFPYLYNNLPHHVHLTWYHTPNVVFIKTEDPDLPAF YFDPLINPISHRHSVKSQEPLPDDDEEFELPEFVEPFLKDTPLYTDNTAN GIALLWAPRPFNLRSGRTRRALDIPLVKNWYREHCPAGQPVKVRVSYQKL LKYYVLNALKHRPPKAQKKRYLFRSFKATKFFQSTKLDWVEVGLQVCRQG YNMLNLLIHRKNLNYLHLDYNFNLKPVKTLTTKERKKSRFGNAFHLCREV LRLTKLVVDSHVQYRLGNVDAFQLADGLQYIFAHVGQLTGMYRYKYKLMR QIRMCKDLKHLIYYRFNTGPVGKGPGCGFWAAGWRVWLFFMRGITPLLER WLGNLLARQFEGRHSKGVAKTVTKQRVESHFDLELRAAVMHDILDMMPEG IKQNKARTILQHLSEAWRCWKANIPWKVPGLPTPIENMILRYVKAKADWW TNTAHYNRERIRRGATVDKTVCKKNLGRLTRLYLKAEQERQHNYLKDGPY ITAEEAVAVYTTTVHWLESRRFSPIPFPPLSYKHDTKLLILALERLKEAY SVKSRLNQSQREELGLIEQAYDNPHEALSRIKRHLLTQRAFKEVGIEFMD LYSHLVPVYDVEPLEKITDAYLDQYLWYEADKRRLFPPWIKPADTEPPPL LVYKWCQGINNLQDVWETSEGECNVMLESRFEKMYEKIDLTLLNRLLRLI VDHNIADYMTAKNNVVINYKDMNHTNSYGIIRGLQFASFIVQYYGLVMDL LVLGLHRASEMAGPPQMPNDFLSFQDIATEAAHPIRLFCRYIDRIHIFFR FTADEARDLIQRYLTEHPDPNNENIVGYNNKKCWPRDARMRLMKHDVNLG RAVFWDIKNRLPRSVTTVQWENSFVSVYSKDNPNLLFNMCGFECRILPKC RTSYEEFTHKDGVWNLQNEVTKERTAQCFLRVDDESMQRFHNRVRQILMA SGSTTFTKIVNKWNTALIGLMTYFREAVVNTQELLDLLVKCENKIQTRIK IGLNSKMPSRFPPVVFYTPKELGGLGMLSMGHVLIPQSDLRWSKQTDVGI THFRSGMSHEEDQLIPNLYRYIQPWESEFIDSQRVWAEYALKRQEAIAQN RRLTLEDLEDSWDRGIPRINTLFQKDRHTLAYDKGWRVRTDFKQYQVLKQ NPFWWTHQRHDGKLWNLNNYRTDMIQALGGVEGILEHTLFKGTYFPTWEG LFWEKASGFEESMKWKKLTNAQRSGLNQIPNRRFTLWWSPTINRANVYVG FQVQLDLTGIFMHGKIPTLKISLIQIFRAHLWQKIHESIVMDLCQVFDQE LDALEIETVQKETIHPRKSYKMNSSCADILLFASYKWNVSRPSLLADSKD VMDSTTTQKYWIDIQLRWGDYDSHDIERYARAKFLDYTTDNMSIYPSPTG VLIAIDLAYNLHSAYGNWFPGSKPLIQQAMAKIMKANPALYVLRERIRKG LQLYSSEPTEPYLSSQNYGELFSNQIIWFVDDTNVYRVTIHKTFEGNLTT KPINGAIFIFNPRTGQLFLKIIHTSVWAGQKRLGQLAKWKTAEEVAALIR SLPVEEQPKQIIVTRKGMLDPLEVHLLDFPNIVIKGSELQLPFQACLKVE KFGDLILKATEPQMVLFNLYDDWLKTISSYTAFSRLILILRALHVNNDRA KVILKPDKTTITEPHHIWPTLTDEEWIKVEVQLKDLILADYGKKNNVNVA SLTQSEIRDIILGMEISAPSQQRQQIAEIEKQTKEQSQLTATQTRTVNKH GDEIITSTTSNYETQTFSSKTEWRVRAISAANLHLRTNHIYVSSDDIKET GYTYILPKNVLKKFICISDLRAQIAGYLYGVSPPDNPQVKEIRCIVMVPQ WGTHQTVHLPGQLPQHEYLKEMEPLGWIHTQPNESPQLSPQDVTTHAKIM ADNPSWDGEKTIIITCSFTPGSCTLTAYKLTPSGYEWGRQNTDKGNNPKG YLPSHYERVQMLLSDRFLGFFMVPAQSSWNYNFMGVRHDPNMKYELQLAN PKEFYHEVHRPSHFLNFALLQEGEVYSADREDLYA A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do ribonukleoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak procesing mRNK splajsing mRNK Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z RNK Lokalizovanij u yadri LiteraturaLuo H R Moreau G A Levin N Moore M J 1999 The human Prp8 protein is a component of both U2 and U12 dependent spliceosomes RNA 5 893 908 PMID 10411133 DOI 10 1017 S1355838299990520 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Anderson G J Bach M Luehrmann R Beggs J D 1989 Conservation between yeast and man of a protein associated with U5 small nuclear ribonucleoprotein Nature 342 819 821 PMID 2532307 DOI 10 1038 342819a0 Bach M Winkelmann G Luehrmann R 1989 20S small nuclear ribonucleoprotein U5 shows a surprisingly complex protein composition Proc Natl Acad Sci U S A 86 6038 6042 PMID 2527369 DOI 10 1073 pnas 86 16 6038 Pinto A L Steitz J A 1989 The mammalian analogue of the yeast PRP8 splicing protein is present in the U4 5 6 small nuclear ribonucleoprotein particle and the spliceosome Proc Natl Acad Sci U S A 86 8742 8746 PMID 2479028 DOI 10 1073 pnas 86 22 8742 Garcia Blanco M A Anderson G J Beggs J Sharp P A 1990 A mammalian protein of 220 kDa binds pre mRNAs in the spliceosome a potential homologue of the yeast PRP8 protein Proc Natl Acad Sci U S A 87 3082 3086 PMID 2139226 DOI 10 1073 pnas 87 8 3082PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z PRPF8 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 26 zhovtnya 2016 Procitovano 28 lyutogo 2017 angl Arhiv originalu za 20 kvitnya 2017 Procitovano 28 lyutogo 2017 Div takozhHromosoma 17 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ