Azərbaycanca
Беларускі
Dansk
Deutsch
Española
Français
Indonesia
Italiana
日本語
Қазақ
Lietuvos
Nederlands
Português
Русский
සිංහල
แบบไทย
Türkçe
Українська
中國人
United State
Afrikaans
PRPF6 (англ. Pre-mRNA processing factor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 941 амінокислот, а молекулярна маса — 106 925.
| PRPF6 | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
| Ідентифікатори | |||||||||||||||||
| Символи | PRPF6, ANT-1, ANT1, C20orf14, Prp6, RP60, SNRNP102, TOM, U5-102K, hPrp6, pre-mRNA processing factor 6 | ||||||||||||||||
| Зовнішні ІД | OMIM: 613979 MGI: 1922946 HomoloGene: 5368 GeneCards: PRPF6 | ||||||||||||||||
| Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
| retinitis pigmentosa 60 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
| Ортологи | |||||||||||||||||
| Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
| Entrez |
|
| |||||||||||||||
| Ensembl |
|
| |||||||||||||||
| UniProt |
|
| |||||||||||||||
| RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
| RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
| Локус (UCSC) | Хр. 20: 63.98 – 64.03 Mb | Хр. 2: 181.23 – 181.3 Mb | |||||||||||||||
| PubMed search | |||||||||||||||||
| Вікідані | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MNKKKKPFLG | MPAPLGYVPG | LGRGATGFTT | RSDIGPARDA | NDPVDDRHAP | ||||
| PGKRTVGDQM | KKNQAADDDD | EDLNDTNYDE | FNGYAGSLFS | SGPYEKDDEE | ||||
| ADAIYAALDK | RMDERRKERR | EQREKEEIEK | YRMERPKIQQ | QFSDLKRKLA | ||||
| EVTEEEWLSI | PEVGDARNKR | QRNPRYEKLT | PVPDSFFAKH | LQTGENHTSV | ||||
| DPRQTQFGGL | NTPYPGGLNT | PYPGGMTPGL | MTPGTGELDM | RKIGQARNTL | ||||
| MDMRLSQVSD | SVSGQTVVDP | KGYLTDLNSM | IPTHGGDIND | IKKARLLLKS | ||||
| VRETNPHHPP | AWIASARLEE | VTGKLQVARN | LIMKGTEMCP | KSEDVWLEAA | ||||
| RLQPGDTAKA | VVAQAVRHLP | QSVRIYIRAA | ELETDIRAKK | RVLRKALEHV | ||||
| PNSVRLWKAA | VELEEPEDAR | IMLSRAVECC | PTSVELWLAL | ARLETYENAR | ||||
| KVLNKARENI | PTDRHIWITA | AKLEEANGNT | QMVEKIIDRA | ITSLRANGVE | ||||
| INREQWIQDA | EECDRAGSVA | TCQAVMRAVI | GIGIEEEDRK | HTWMEDADSC | ||||
| VAHNALECAR | AIYAYALQVF | PSKKSVWLRA | AYFEKNHGTR | ESLEALLQRA | ||||
| VAHCPKAEVL | WLMGAKSKWL | AGDVPAARSI | LALAFQANPN | SEEIWLAAVK | ||||
| LESENDEYER | ARRLLAKARS | SAPTARVFMK | SVKLEWVQDN | IRAAQDLCEE | ||||
| ALRHYEDFPK | LWMMKGQIEE | QKEMMEKARE | AYNQGLKKCP | HSTPLWLLLS | ||||
| RLEEKIGQLT | RARAILEKSR | LKNPKNPGLW | LESVRLEYRA | GLKNIANTLM | ||||
| AKALQECPNS | GILWSEAIFL | EARPQRRTKS | VDALKKCEHD | PHVLLAVAKL | ||||
| FWSQRKITKA | REWFHRTVKI | DSDLGDAWAF | FYKFELQHGT | EEQQEEVRKR | ||||
| CESAEPRHGE | LWCAVSKDIA | NWQKKIGDIL | RLVAGRIKNT | F |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- Nishikimi A., Mukai J., Kioka N., Yamada M. (1999). A novel mammalian nuclear protein similar to Schizosaccharomyces pombe Prp1p/Zer1p and Saccharomyces cerevisiae Prp6p pre-mRNA splicing factors. Biochim. Biophys. Acta. 1435: 147—152. PMID 10561546 DOI:10.1016/S0167-4838(99)00203-4
- Makarov E.M., Makarova O.V., Achsel T., Luehrmann R. (2000). The human homologue of the yeast splicing factor Prp6p contains multiple TPR elements and is stably associated with the U5 snRNP via protein-protein interactions. J. Mol. Biol. 298: 567—575. PMID 10788320 DOI:10.1006/jmbi.2000.3685
- Yuryev A., Ono M., Goff S.A., Macaluso F., Wennogle L.P. (2000). Isoform-specific localization of A-RAF in mitochondria. Mol. Cell. Biol. 20: 4870—4878. PMID 10848612 DOI:10.1128/MCB.20.13.4870-4878.2000
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
- Liu S., Rauhut R., Vornlocher H.-P., Luehrmann R. (2006). The network of protein-protein interactions within the human U4/U6.U5 tri-snRNP. RNA. 12: 1418—1430. PMID 16723661 DOI:10.1261/rna.55406
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з PRPF6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15860 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
PRPF6 angl Pre mRNA processing factor 6 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 20 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 941 aminokislot a molekulyarna masa 106 925 PRPF6Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB3JCRIdentifikatoriSimvoliPRPF6 ANT 1 ANT1 C20orf14 Prp6 RP60 SNRNP102 TOM U5 102K hPrp6 pre mRNA processing factor 6Zovnishni ID OMIM 613979 MGI 1922946 HomoloGene 5368 GeneCards PRPF6Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaretinitis pigmentosa 60 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0001105 transcription coactivator activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding androgen receptor binding RNA binding ribonucleoprotein complex bindingKlitinna komponenta U4 U6 x U5 tri snRNP complex catalytic step 2 spliceosome membrana U5 snRNP spliceosomal complex klitinne yadro nukleoplazma nuclear speck U2 type precatalytic spliceosomeBiologichnij proces mRNA splicing via spliceosome GO 0033168 GO 0036404 GO 1902360 RNA processing spliceosomal tri snRNP complex assembly RNA splicing via transesterification reactions mRNA processing spliceosomal complex assembly RNA localization GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Splajsing RNKDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez24148 68879Ensembl ENSG00000101161 ENSMUSG00000002455UniProt O94906 Q91YR7RefSeq mRNK NM 012469NM 133701RefSeq bilok NP 036601NP 598462Lokus UCSC Hr 20 63 98 64 03 MbHr 2 181 23 181 3 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MNKKKKPFLGMPAPLGYVPGLGRGATGFTTRSDIGPARDANDPVDDRHAP PGKRTVGDQMKKNQAADDDDEDLNDTNYDEFNGYAGSLFSSGPYEKDDEE ADAIYAALDKRMDERRKERREQREKEEIEKYRMERPKIQQQFSDLKRKLA EVTEEEWLSIPEVGDARNKRQRNPRYEKLTPVPDSFFAKHLQTGENHTSV DPRQTQFGGLNTPYPGGLNTPYPGGMTPGLMTPGTGELDMRKIGQARNTL MDMRLSQVSDSVSGQTVVDPKGYLTDLNSMIPTHGGDINDIKKARLLLKS VRETNPHHPPAWIASARLEEVTGKLQVARNLIMKGTEMCPKSEDVWLEAA RLQPGDTAKAVVAQAVRHLPQSVRIYIRAAELETDIRAKKRVLRKALEHV PNSVRLWKAAVELEEPEDARIMLSRAVECCPTSVELWLALARLETYENAR KVLNKARENIPTDRHIWITAAKLEEANGNTQMVEKIIDRAITSLRANGVE INREQWIQDAEECDRAGSVATCQAVMRAVIGIGIEEEDRKHTWMEDADSC VAHNALECARAIYAYALQVFPSKKSVWLRAAYFEKNHGTRESLEALLQRA VAHCPKAEVLWLMGAKSKWLAGDVPAARSILALAFQANPNSEEIWLAAVK LESENDEYERARRLLAKARSSAPTARVFMKSVKLEWVQDNIRAAQDLCEE ALRHYEDFPKLWMMKGQIEEQKEMMEKAREAYNQGLKKCPHSTPLWLLLS RLEEKIGQLTRARAILEKSRLKNPKNPGLWLESVRLEYRAGLKNIANTLM AKALQECPNSGILWSEAIFLEARPQRRTKSVDALKKCEHDPHVLLAVAKL FWSQRKITKAREWFHRTVKIDSDLGDAWAFFYKFELQHGTEEQQEEVRKR CESAEPRHGELWCAVSKDIANWQKKIGDILRLVAGRIKNTF A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak procesing mRNK splajsing mRNK alternativnij splajsing Lokalizovanij u yadri LiteraturaNishikimi A Mukai J Kioka N Yamada M 1999 A novel mammalian nuclear protein similar to Schizosaccharomyces pombe Prp1p Zer1p and Saccharomyces cerevisiae Prp6p pre mRNA splicing factors Biochim Biophys Acta 1435 147 152 PMID 10561546 DOI 10 1016 S0167 4838 99 00203 4 Makarov E M Makarova O V Achsel T Luehrmann R 2000 The human homologue of the yeast splicing factor Prp6p contains multiple TPR elements and is stably associated with the U5 snRNP via protein protein interactions J Mol Biol 298 567 575 PMID 10788320 DOI 10 1006 jmbi 2000 3685 Yuryev A Ono M Goff S A Macaluso F Wennogle L P 2000 Isoform specific localization of A RAF in mitochondria Mol Cell Biol 20 4870 4878 PMID 10848612 DOI 10 1128 MCB 20 13 4870 4878 2000 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Jurica M S Licklider L J Gygi S P Grigorieff N Moore M J 2002 Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three dimensional structural analysis RNA 8 426 439 PMID 11991638 DOI 10 1017 S1355838202021088 Liu S Rauhut R Vornlocher H P Luehrmann R 2006 The network of protein protein interactions within the human U4 U6 U5 tri snRNP RNA 12 1418 1430 PMID 16723661 DOI 10 1261 rna 55406PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z PRPF6 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 15860 angl Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 8 serpnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 20 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi