PEX5 (англ. Peroxisomal biogenesis factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 639 амінокислот, а молекулярна маса — 70 865.
PEX5 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | PEX5, peroxisomal biogenesis factor 5, RCDP5, PTS1R, PBD2B, PTS1-BP, PXR1, PBD2A | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 600414 MGI: 1098808 HomoloGene: 270 GeneCards: PEX5 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
rhizomelic chondrodysplasia punctata type 5, Zellweger spectrum disorder, peroxisomal biogenesis disorder | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 12: 7.19 – 7.22 Mb | Хр. 6: 124.37 – 124.39 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAMRELVEAE | CGGANPLMKL | AGHFTQDKAL | RQEGLRPGPW | PPGAPASEAA | ||||
SKPLGVASED | ELVAEFLQDQ | NAPLVSRAPQ | TFKMDDLLAE | MQQIEQSNFR | ||||
QAPQRAPGVA | DLALSENWAQ | EFLAAGDAVD | VTQDYNETDW | SQEFISEVTD | ||||
PLSVSPARWA | EEYLEQSEEK | LWLGEPEGTA | TDRWYDEYHP | EEDLQHTASD | ||||
FVAKVDDPKL | ANSEFLKFVR | QIGEGQVSLE | SGAGSGRAQA | EQWAAEFIQQ | ||||
QGTSDAWVDQ | FTRPVNTSAL | DMEFERAKSA | IESDVDFWDK | LQAELEEMAK | ||||
RDAEAHPWLS | DYDDLTSATY | DKGYQFEEEN | PLRDHPQPFE | EGLRRLQEGD | ||||
LPNAVLLFEA | AVQQDPKHME | AWQYLGTTQA | ENEQELLAIS | ALRRCLELKP | ||||
DNQTALMALA | VSFTNESLQR | QACETLRDWL | RYTPAYAHLV | TPAEEGAGGA | ||||
GLGPSKRILG | SLLSDSLFLE | VKELFLAAVR | LDPTSIDPDV | QCGLGVLFNL | ||||
SGEYDKAVDC | FTAALSVRPN | DYLLWNKLGA | TLANGNQSEE | AVAAYRRALE | ||||
LQPGYIRSRY | NLGISCINLG | AHREAVEHFL | EALNMQRKSR | GPRGEGGAMS | ||||
ENIWSTLRLA | LSMLGQSDAY | GAADARDLST | LLTMFGLPQ |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, пероксисомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Chang C.C., Warren D.S., Sacksteder K.A., Gould S.J. (1999). PEX12 interacts with PEX5 and PEX10 and acts downstream of receptor docking in peroxisomal matrix protein import. J. Cell Biol. 147: 761—774. PMID 10562279 DOI:10.1083/jcb.147.4.761
- Miyata N., Okumoto K., Mukai S., Noguchi M., Fujiki Y. (2012). AWP1/ZFAND6 functions in Pex5 export by interacting with cys-monoubiquitinated Pex5 and Pex6 AAA ATPase. Traffic. 13: 168—183. PMID 21980954 DOI:10.1111/j.1600-0854.2011.01298.x
- Gatto G.J. Jr., Geisbrecht B.V., Gould S.J., Berg J.M. (2000). Peroxisomal targeting signal-1 recognition by the TPR domains of human PEX5. Nat. Struct. Biol. 7: 1091—1095. PMID 11101887 DOI:10.1038/81930
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з PEX5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 25 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
PEX5 angl Peroxisomal biogenesis factor 5 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 12 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 639 aminokislot a molekulyarna masa 70 865 PEX5Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1FCH 2C0L 2C0M 2J9Q 2W84 3R9A 4BXU 4KXK 4KYOIdentifikatoriSimvoliPEX5 peroxisomal biogenesis factor 5 RCDP5 PTS1R PBD2B PTS1 BP PXR1 PBD2AZovnishni ID OMIM 600414 MGI 1098808 HomoloGene 270 GeneCards PEX5Pov yazani genetichni zahvoryuvannyarhizomelic chondrodysplasia punctata type 5 Zellweger spectrum disorder peroxisomal biogenesis disorder Ontologiya genaMolekulyarna funkciya protein C terminus binding small GTPase binding protein N terminus binding peroxisome targeting sequence binding enzyme binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding peroxisome matrix targeting signal 1 bindingKlitinna komponenta citoplazma peroksisoma membrana peroxisomal matrix vnutrishnoklitinnij kompleks Goldzhi gialoplazma peroxisomal membrane GO 0009327 protein containing complexBiologichnij proces negative regulation of protein homotetramerization protein import into peroxisome membrane protein import into peroxisome matrix docking protein tetramerization protein transport protein targeting to peroxisome protein import into peroxisome matrix translocation protein import into peroxisome matrix Ubikvitin zalezhnij proteoliz GO 0015915 transportDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez5830 19305Ensembl ENSG00000139197 ENSG00000288217 ENSMUSG00000005069UniProt P50542 O09012RefSeq mRNK NM 000319 NM 001131023 NM 001131024 NM 001131025 NM 001131026NM 001300789 NM 001351124 NM 001351126 NM 001351127 NM 001351128 NM 001351130 NM 001351131 NM 001351132 NM 001351133 NM 001351134 NM 001351135 NM 001351136 NM 001351137 NM 001351138 NM 001351139 NM 001351140 NM 001374645 NM 001374646 NM 001374647 NM 001374648 NM 001374649NM 001277330 NM 001277805 NM 008995 NM 175933 NM 001360570RefSeq bilok NP 000310 NP 001124495 NP 001124496 NP 001124497 NP 001124498NP 001287718 NP 001338053 NP 001338055 NP 001338056 NP 001338057 NP 001338059 NP 001338060 NP 001338061 NP 001338062 NP 001338063 NP 001338064 NP 001338065 NP 001338066 NP 001338067 NP 001338068 NP 001338069NP 001264259 NP 001264734 NP 033021 NP 787947 NP 001347499Lokus UCSC Hr 12 7 19 7 22 MbHr 6 124 37 124 39 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MAMRELVEAECGGANPLMKLAGHFTQDKALRQEGLRPGPWPPGAPASEAA SKPLGVASEDELVAEFLQDQNAPLVSRAPQTFKMDDLLAEMQQIEQSNFR QAPQRAPGVADLALSENWAQEFLAAGDAVDVTQDYNETDWSQEFISEVTD PLSVSPARWAEEYLEQSEEKLWLGEPEGTATDRWYDEYHPEEDLQHTASD FVAKVDDPKLANSEFLKFVRQIGEGQVSLESGAGSGRAQAEQWAAEFIQQ QGTSDAWVDQFTRPVNTSALDMEFERAKSAIESDVDFWDKLQAELEEMAK RDAEAHPWLSDYDDLTSATYDKGYQFEEENPLRDHPQPFEEGLRRLQEGD LPNAVLLFEAAVQQDPKHMEAWQYLGTTQAENEQELLAISALRRCLELKP DNQTALMALAVSFTNESLQRQACETLRDWLRYTPAYAHLVTPAEEGAGGA GLGPSKRILGSLLSDSLFLEVKELFLAAVRLDPTSIDPDVQCGLGVLFNL SGEYDKAVDCFTAALSVRPNDYLLWNKLGATLANGNQSEEAVAAYRRALE LQPGYIRSRYNLGISCINLGAHREAVEHFLEALNMQRKSRGPRGEGGAMS ENIWSTLRLALSMLGQSDAYGAADARDLSTLLTMFGLPQ A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transport transport bilkiv alternativnij splajsing Lokalizovanij u citoplazmi membrani peroksisomah LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Chang C C Warren D S Sacksteder K A Gould S J 1999 PEX12 interacts with PEX5 and PEX10 and acts downstream of receptor docking in peroxisomal matrix protein import J Cell Biol 147 761 774 PMID 10562279 DOI 10 1083 jcb 147 4 761 Miyata N Okumoto K Mukai S Noguchi M Fujiki Y 2012 AWP1 ZFAND6 functions in Pex5 export by interacting with cys monoubiquitinated Pex5 and Pex6 AAA ATPase Traffic 13 168 183 PMID 21980954 DOI 10 1111 j 1600 0854 2011 01298 x Gatto G J Jr Geisbrecht B V Gould S J Berg J M 2000 Peroxisomal targeting signal 1 recognition by the TPR domains of human PEX5 Nat Struct Biol 7 1091 1095 PMID 11101887 DOI 10 1038 81930PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z PEX5 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 25 bereznya 2016 Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 23 lipnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 12 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi