PER1 (англ. Period circadian clock 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 290 амінокислот, а молекулярна маса — 136 212.
PER1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | PER1, PER, RIGUI, hPER, period circadian clock 1, period circadian regulator 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 602260 MGI: 1098283 HomoloGene: 1966 GeneCards: PER1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 17: 8.14 – 8.16 Mb | Хр. 11: 68.99 – 69 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSGPLEGADG | GGDPRPGESF | CPGGVPSPGP | PQHRPCPGPS | LADDTDANSN | ||||
GSSGNESNGH | ESRGASQRSS | HSSSSGNGKD | SALLETTESS | KSTNSQSPSP | ||||
PSSSIAYSLL | SASSEQDNPS | TSGCSSEQSA | RARTQKELMT | ALRELKLRLP | ||||
PERRGKGRSG | TLATLQYALA | CVKQVQANQE | YYQQWSLEEG | EPCSMDMSTY | ||||
TLEELEHITS | EYTLQNQDTF | SVAVSFLTGR | IVYISEQAAV | LLRCKRDVFR | ||||
GTRFSELLAP | QDVGVFYGST | APSRLPTWGT | GASAGSGLRD | FTQEKSVFCR | ||||
IRGGPDRDPG | PRYQPFRLTP | YVTKIRVSDG | APAQPCCLLI | AERIHSGYEA | ||||
PRIPPDKRIF | TTRHTPSCLF | QDVDERAAPL | LGYLPQDLLG | APVLLFLHPE | ||||
DRPLMLAIHK | KILQLAGQPF | DHSPIRFCAR | NGEYVTMDTS | WAGFVHPWSR | ||||
KVAFVLGRHK | VRTAPLNEDV | FTPPAPSPAP | SLDTDIQELS | EQIHRLLLQP | ||||
VHSPSPTGLC | GVGAVTSPGP | LHSPGSSSDS | NGGDAEGPGP | PAPVTFQQIC | ||||
KDVHLVKHQG | QQLFIESRAR | PQSRPRLPAT | GTFKAKALPC | QSPDPELEAG | ||||
SAPVQAPLAL | VPEEAERKEA | SSCSYQQINC | LDSILRYLES | CNLPSTTKRK | ||||
CASSSSYTTS | SASDDDRQRT | GPVSVGTKKD | PPSAALSGEG | ATPRKEPVVG | ||||
GTLSPLALAN | KAESVVSVTS | QCSFSSTIVH | VGDKKPPESD | IIMMEDLPGL | ||||
APGPAPSPAP | SPTVAPDPAP | DAYRPVGLTK | AVLSLHTQKE | EQAFLSRFRD | ||||
LGRLRGLDSS | STAPSALGER | GCHHGPAPPS | RRHHCRSKAK | RSRHHQNPRA | ||||
EAPCYVSHPS | PVPPSTPWPT | PPATTPFPAV | VQPYPLPVFS | PRGGPQPLPP | ||||
APTSVPPAAF | PAPLVTPMVA | LVLPNYLFPT | PSSYPYGALQ | TPAEGPPTPA | ||||
SHSPSPSLPA | LAPSPPHRPD | SPLFNSRCSS | PLQLNLLQLE | ELPRAEGAAV | ||||
AGGPGSSAGP | PPPSAEAAEP | EARLAEVTES | SNQDALSGSS | DLLELLLQED | ||||
SRSGTGSAAS | GSLGSGLGSG | SGSGSHEGGS | TSASITRSSQ | SSHTSKYFGS | ||||
IDSSEAEAGA | ARGGAEPGDQ | VIKYVLQDPI | WLLMANADQR | VMMTYQVPSR | ||||
DMTSVLKQDR | ERLRAMQKQQ | PRFSEDQRRE | LGAVHSWVRK | GQLPRALDVM | ||||
ACVDCGSSTQ | DPGHPDDPLF | SELDGLGLEP | MEEGGGEQGS | SGGGSGEGEG | ||||
CEEAQGGAKA | SSSQDLAMEE | EEEGRSSSSP | ALPTAGNCTS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Shearman L.P., Zylka M.J., Weaver D.R., Kolakowski L.F. Jr., Reppert S.M. (1997). Two period homologs: circadian expression and photic regulation in the suprachiasmatic nuclei. Neuron. 19: 1261—1269. PMID 9427249 DOI:10.1016/S0896-6273(00)80417-1
- Shirogane T., Jin J., Ang X.L., Harper J.W. (2005). SCFbeta-TRCP controls clock-dependent transcription via casein kinase 1-dependent degradation of the mammalian period-1 (Per1) protein. J. Biol. Chem. 280: 26863—26872. PMID 15917222 DOI:10.1074/jbc.M502862200
- Eckel-Mahan K., Sassone-Corsi P. (2013). Metabolism and the circadian clock converge. Physiol. Rev. 93: 107—135. PMID 23303907 DOI:10.1152/physrev.00016.2012
- Partch C.L., Green C.B., Takahashi J.S. (2014). Molecular architecture of the mammalian circadian clock. Trends Cell Biol. 24: 90—99. PMID 23916625 DOI:10.1016/j.tcb.2013.07.002
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
PER1 angl Period circadian clock 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 17 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 290 aminokislot a molekulyarna masa 136 212 PER1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1UL6IdentifikatoriSimvoliPER1 PER RIGUI hPER period circadian clock 1 period circadian regulator 1Zovnishni ID OMIM 602260 MGI 1098283 HomoloGene 1966 GeneCards PER1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya transcription factor binding GO 0000975 transcription cis regulatory region binding GO 0000980 RNA polymerase II cis regulatory region sequence specific DNA binding E box binding kinase binding chromatin DNA binding ubiquitin protein ligase binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding transcription corepressor bindingKlitinna komponenta citoplazma klitinne yadro nukleoplazma gialoplazmaBiologichnij proces histone H3 deacetylation negative regulation of glucocorticoid receptor signaling pathway GO 0009373 regulation of transcription DNA templated response to light stimulus regulation of cytokine production involved in inflammatory response regulation of sodium ion transport ritmichnij proces GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II negative regulation of I kappaB kinase NF kappaB signaling circadian regulation of gene expression transcription DNA templated entrainment of circadian clock negative regulation of JNK cascade circadian regulation of translation regulation of circadian rhythm cirkadnij ritm histone H3 acetylation regulation of hair cycle histone H4 acetylation posttranscriptional regulation of gene expression response to cAMP regulation of p38MAPK cascade GO 0045996 negative regulation of transcription DNA templated entrainment of circadian clock by photoperiod GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase IIDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez5187 18626Ensembl ENSG00000179094 ENSMUSG00000020893UniProt O15534 O35973RefSeq mRNK NM 002616NM 001159367 NM 011065RefSeq bilok NP 002607NP 001152839 NP 035195Lokus UCSC Hr 17 8 14 8 16 MbHr 11 68 99 69 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MSGPLEGADGGGDPRPGESFCPGGVPSPGPPQHRPCPGPSLADDTDANSN GSSGNESNGHESRGASQRSSHSSSSGNGKDSALLETTESSKSTNSQSPSP PSSSIAYSLLSASSEQDNPSTSGCSSEQSARARTQKELMTALRELKLRLP PERRGKGRSGTLATLQYALACVKQVQANQEYYQQWSLEEGEPCSMDMSTY TLEELEHITSEYTLQNQDTFSVAVSFLTGRIVYISEQAAVLLRCKRDVFR GTRFSELLAPQDVGVFYGSTAPSRLPTWGTGASAGSGLRDFTQEKSVFCR IRGGPDRDPGPRYQPFRLTPYVTKIRVSDGAPAQPCCLLIAERIHSGYEA PRIPPDKRIFTTRHTPSCLFQDVDERAAPLLGYLPQDLLGAPVLLFLHPE DRPLMLAIHKKILQLAGQPFDHSPIRFCARNGEYVTMDTSWAGFVHPWSR KVAFVLGRHKVRTAPLNEDVFTPPAPSPAPSLDTDIQELSEQIHRLLLQP VHSPSPTGLCGVGAVTSPGPLHSPGSSSDSNGGDAEGPGPPAPVTFQQIC KDVHLVKHQGQQLFIESRARPQSRPRLPATGTFKAKALPCQSPDPELEAG SAPVQAPLALVPEEAERKEASSCSYQQINCLDSILRYLESCNLPSTTKRK CASSSSYTTSSASDDDRQRTGPVSVGTKKDPPSAALSGEGATPRKEPVVG GTLSPLALANKAESVVSVTSQCSFSSTIVHVGDKKPPESDIIMMEDLPGL APGPAPSPAPSPTVAPDPAPDAYRPVGLTKAVLSLHTQKEEQAFLSRFRD LGRLRGLDSSSTAPSALGERGCHHGPAPPSRRHHCRSKAKRSRHHQNPRA EAPCYVSHPSPVPPSTPWPTPPATTPFPAVVQPYPLPVFSPRGGPQPLPP APTSVPPAAFPAPLVTPMVALVLPNYLFPTPSSYPYGALQTPAEGPPTPA SHSPSPSLPALAPSPPHRPDSPLFNSRCSSPLQLNLLQLEELPRAEGAAV AGGPGSSAGPPPPSAEAAEPEARLAEVTESSNQDALSGSSDLLELLLQED SRSGTGSAASGSLGSGLGSGSGSGSHEGGSTSASITRSSQSSHTSKYFGS IDSSEAEAGAARGGAEPGDQVIKYVLQDPIWLLMANADQRVMMTYQVPSR DMTSVLKQDRERLRAMQKQQPRFSEDQRRELGAVHSWVRKGQLPRALDVM ACVDCGSSTQDPGHPDDPLFSELDGLGLEPMEEGGGEQGSSGGGSGEGEG CEEAQGGAKASSSQDLAMEEEEEGRSSSSPALPTAGNCTS A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi biologichni ritmi alternativnij splajsing Lokalizovanij u citoplazmi yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Shearman L P Zylka M J Weaver D R Kolakowski L F Jr Reppert S M 1997 Two period homologs circadian expression and photic regulation in the suprachiasmatic nuclei Neuron 19 1261 1269 PMID 9427249 DOI 10 1016 S0896 6273 00 80417 1 Shirogane T Jin J Ang X L Harper J W 2005 SCFbeta TRCP controls clock dependent transcription via casein kinase 1 dependent degradation of the mammalian period 1 Per1 protein J Biol Chem 280 26863 26872 PMID 15917222 DOI 10 1074 jbc M502862200 Eckel Mahan K Sassone Corsi P 2013 Metabolism and the circadian clock converge Physiol Rev 93 107 135 PMID 23303907 DOI 10 1152 physrev 00016 2012 Partch C L Green C B Takahashi J S 2014 Molecular architecture of the mammalian circadian clock Trends Cell Biol 24 90 99 PMID 23916625 DOI 10 1016 j tcb 2013 07 002PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 13 bereznya 2016 Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 7 serpnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 17 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi