PDXDC1 (англ. Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 16-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 788 амінокислот, а молекулярна маса — 86 707.
PDXDC1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | PDXDC1, LP8165, pyridoxal-dependent decarboxylase domain containing 1, pyridoxal dependent decarboxylase domain containing 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 614244 MGI: 1920909 HomoloGene: 22858 GeneCards: PDXDC1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 16: 14.97 – 15.14 Mb | Хр. 16: 13.65 – 13.72 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MDASLEKIAD | PTLAEMGKNL | KEAVKMLEDS | QRRTEEENGK | KLISGDIPGP | ||||
LQGSGQDMVS | ILQLVQNLMH | GDEDEEPQSP | RIQNIGEQGH | MALLGHSLGA | ||||
YISTLDKEKL | RKLTTRILSD | TTLWLCRIFR | YENGCAYFHE | EEREGLAKIC | ||||
RLAIHSRYED | FVVDGFNVLY | NKKPVIYLSA | AARPGLGQYL | CNQLGLPFPC | ||||
LCRVPCNTVF | GSQHQMDVAF | LEKLIKDDIE | RGRLPLLLVA | NAGTAAVGHT | ||||
DKIGRLKELC | EQYGIWLHVE | GVNLATLALG | YVSSSVLAAA | KCDSMTMTPG | ||||
PWLGLPAVPA | VTLYKHDDPA | LTLVAGLTSN | KPTDKLRALP | LWLSLQYLGL | ||||
DGFVERIKHA | CQLSQRLQES | LKKVNYIKIL | VEDELSSPVV | VFRFFQELPG | ||||
SDPVFKAVPV | PNMTPSGVGR | ERHSCDALNR | WLGEQLKQLV | PASGLTVMDL | ||||
EAEGTCLRFS | PLMTAAVLGT | RGEDVDQLVA | CIESKLPVLC | CTLQLREEFK | ||||
QEVEATAGLL | YVDDPNWSGI | GVVRYEHAND | DKSSLKSDPE | GENIHAGLLK | ||||
KLNELESDLT | FKIGPEYKSM | KSCLYVGMAS | DNVDAAELVE | TIAATAREIE | ||||
ENSRLLENMT | EVVRKGIQEA | QVELQKASEE | RLLEEGVLRQ | IPVVGSVLNW | ||||
FSPVQALQKG | RTFNLTAGSL | ESTEPIYVYK | AQGAGVTLPP | TPSGSRTKQR | ||||
LPGQKPFKRS | LRGSDALSET | SSVSHIEDLE | KVERLSSGPE | QITLEASSTE | ||||
GHPGAPSPQH | TDQTEAFQKG | VPHPEDDHSQ | VEGPESLR |
Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, декарбоксилаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з піридоксаль-фосфатом.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:28995 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 3 жовтня 2017. Процитовано 21 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
PDXDC1 angl Pyridoxal dependent decarboxylase domain containing protein 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na 16 j hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 788 aminokislot a molekulyarna masa 86 707 PDXDC1IdentifikatoriSimvoliPDXDC1 LP8165 pyridoxal dependent decarboxylase domain containing 1 pyridoxal dependent decarboxylase domain containing 1Zovnishni ID OMIM 614244 MGI 1920909 HomoloGene 22858 GeneCards PDXDC1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya pyridoxal phosphate binding katalitichna aktivnist carboxy lyase activity lyase activity cadherin binding sphinganine 1 phosphate aldolase activityKlitinna komponenta kompleks Goldzhi vnutrishnoklitinna membranna organela endoplazmatichnij retikulumBiologichnij proces carboxylic acid metabolic process ameboidal type cell migration sphingolipid metabolic process sphingolipid catabolic processDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez23042 94184Ensembl ENSG00000275498 ENSG00000179889 ENSMUSG00000022680UniProt Q6P996 Q99K01RefSeq mRNK NM 001285444 NM 001285445 NM 001285447 NM 001285448 NM 001285449NM 001285450 NM 015027 NM 001324019 NM 001324020 NM 001324021NM 001039533 NM 001291017 NM 053181 NM 178853 NM 001357225RefSeq bilok NP 001272373 NP 001272374 NP 001272376 NP 001272377 NP 001272378NP 001272379 NP 001310948 NP 001310949 NP 001310950 NP 055842NP 001034622 NP 001277946 NP 444411 NP 001344154Lokus UCSC Hr 16 14 97 15 14 MbHr 16 13 65 13 72 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MDASLEKIADPTLAEMGKNLKEAVKMLEDSQRRTEEENGKKLISGDIPGP LQGSGQDMVSILQLVQNLMHGDEDEEPQSPRIQNIGEQGHMALLGHSLGA YISTLDKEKLRKLTTRILSDTTLWLCRIFRYENGCAYFHEEEREGLAKIC RLAIHSRYEDFVVDGFNVLYNKKPVIYLSAAARPGLGQYLCNQLGLPFPC LCRVPCNTVFGSQHQMDVAFLEKLIKDDIERGRLPLLLVANAGTAAVGHT DKIGRLKELCEQYGIWLHVEGVNLATLALGYVSSSVLAAAKCDSMTMTPG PWLGLPAVPAVTLYKHDDPALTLVAGLTSNKPTDKLRALPLWLSLQYLGL DGFVERIKHACQLSQRLQESLKKVNYIKILVEDELSSPVVVFRFFQELPG SDPVFKAVPVPNMTPSGVGRERHSCDALNRWLGEQLKQLVPASGLTVMDL EAEGTCLRFSPLMTAAVLGTRGEDVDQLVACIESKLPVLCCTLQLREEFK QEVEATAGLLYVDDPNWSGIGVVRYEHANDDKSSLKSDPEGENIHAGLLK KLNELESDLTFKIGPEYKSMKSCLYVGMASDNVDAAELVETIAATAREIE ENSRLLENMTEVVRKGIQEAQVELQKASEERLLEEGVLRQIPVVGSVLNW FSPVQALQKGRTFNLTAGSLESTEPIYVYKAQGAGVTLPPTPSGSRTKQR LPGQKPFKRSLRGSDALSETSSVSHIEDLEKVERLSSGPEQITLEASSTE GHPGAPSPQHTDQTEAFQKGVPHPEDDHSQVEGPESLR A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do liaz dekarboksilaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z piridoksal fosfatom LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Beausoleil S A Villen J Gerber S A Rush J Gygi S P 2006 A probability based approach for high throughput protein phosphorylation analysis and site localization Nat Biotechnol 24 1285 1292 PMID 16964243 DOI 10 1038 nbt1240PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 28995 angl Procitovano 21 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 3 zhovtnya 2017 Procitovano 21 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 16 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi