PDE6D (англ. Phosphodiesterase 6D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 150 амінокислот, а молекулярна маса — 17 420.
PDE6D | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | PDE6D, JBTS22, PDED, phosphodiesterase 6D | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 602676 MGI: 1270843 HomoloGene: 1954 GeneCards: PDE6D | ||||||||||||||||
3.1.4.35 | |||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
Joubert syndrome 22 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 2: 231.73 – 231.79 Mb | Хр. 1: 86.47 – 86.51 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSAKDERARE | ILRGFKLNWM | NLRDAETGKI | LWQGTEDLSV | PGVEHEARVP | ||||
KKILKCKAVS | RELNFSSTEQ | MEKFRLEQKV | YFKGQCLEEW | FFEFGFVIPN | ||||
STNTWQSLIE | AAPESQMMPA | SVLTGNVIIE | TKFFDDDLLV | STSRVRLFYV | ||||
Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах.
Література
- Marzesco A.M., Galli T., Louvard D., Zahraoui A. (1998). The rod cGMP phosphodiesterase delta subunit dissociates the small GTPase Rab13 from membranes. J. Biol. Chem. 273: 22340—22345. PMID 9712853 DOI:10.1074/jbc.273.35.22340
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Linari M., Hanzal-Bayer M., Becker J. (1999). The delta subunit of rod specific cyclic GMP phosphodiesterase, PDE delta, interacts with the Arf-like protein Arl3 in a GTP specific manner. FEBS Lett. 458: 55—59. PMID 10518933 DOI:10.1016/S0014-5793(99)01117-5
- Hanzal-Bayer M., Renault L., Roversi P., Wittinghofer A., Hillig R.C. (2002). The complex of Arl2-GTP and PDE delta: from structure to function. EMBO J. 21: 2095—2106. PMID 11980706 DOI:10.1093/emboj/21.9.2095
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з PDE6D переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8788 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
PDE6D angl Phosphodiesterase 6D bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 2 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 150 aminokislot a molekulyarna masa 17 420 PDE6DNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1KSG 1KSH 1KSJ 3T5G 3T5I 4JHP 4JV6 4JV8 4JVB 4JVF 5E8F 5E80 5F2UIdentifikatoriSimvoliPDE6D JBTS22 PDED phosphodiesterase 6DZovnishni ID OMIM 602676 MGI 1270843 HomoloGene 1954 GeneCards PDE6D3 1 4 35Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaJoubert syndrome 22 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GTPase inhibitor activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding 3 5 cyclic nucleotide phosphodiesterase activityKlitinna komponenta citoplazma gialoplazma cell projection citoskelet cytoplasmic vesicle membrane membrana GO 0016023 cytoplasmic vesicle vijkaBiologichnij proces GO 0034259 negative regulation of GTPase activity vidpovid na stimul zir sensory perception of light stimulusDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez5147 18582Ensembl ENSG00000156973 ENSMUSG00000026239UniProt O43924 Q6IB24 O55057RefSeq mRNK NM 001291018 NM 002601NM 008801 NM 001360816 NM 001360817RefSeq bilok NP 001277947 NP 002592 NP 002592 1NP 032827 NP 001347745 NP 001347746Lokus UCSC Hr 2 231 73 231 79 MbHr 1 86 47 86 51 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MSAKDERAREILRGFKLNWMNLRDAETGKILWQGTEDLSVPGVEHEARVP KKILKCKAVSRELNFSSTEQMEKFRLEQKVYFKGQCLEEWFFEFGFVIPN STNTWQSLIEAAPESQMMPASVLTGNVIIETKFFDDDLLVSTSRVRLFYV A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Lokalizovanij u citoplazmi citoskeleti membrani klitinnih vidrostkah citoplazmatichnih vezikulah LiteraturaMarzesco A M Galli T Louvard D Zahraoui A 1998 The rod cGMP phosphodiesterase delta subunit dissociates the small GTPase Rab13 from membranes J Biol Chem 273 22340 22345 PMID 9712853 DOI 10 1074 jbc 273 35 22340 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Linari M Hanzal Bayer M Becker J 1999 The delta subunit of rod specific cyclic GMP phosphodiesterase PDE delta interacts with the Arf like protein Arl3 in a GTP specific manner FEBS Lett 458 55 59 PMID 10518933 DOI 10 1016 S0014 5793 99 01117 5 Hanzal Bayer M Renault L Roversi P Wittinghofer A Hillig R C 2002 The complex of Arl2 GTP and PDE delta from structure to function EMBO J 21 2095 2106 PMID 11980706 DOI 10 1093 emboj 21 9 2095PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z PDE6D pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 8788 angl Procitovano 28 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 8 serpnya 2017 Procitovano 28 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 2 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi