PCDH15 (англ. Protocadherin related 15) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 955 амінокислот, а молекулярна маса — 216 069.
PCDH15 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | PCDH15, CDHR15, DFNB23, USH1F, protocadherin-related 15, protocadherin related 15 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 605514 MGI: 1891428 HomoloGene: 23401 GeneCards: PCDH15 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
Usher syndrome type 1F, Usher syndrome type 1D, autosomal recessive nonsyndromic deafness 23 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 10: 53.8 – 55.63 Mb | Хр. 10: 73.1 – 74.65 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MFRQFYLWTC | LASGIILGSL | FEICLGQYDD | DCKLARGGPP | ATIVAIDEES | ||||
RNGTILVDNM | LIKGTAGGPD | PTIELSLKDN | VDYWVLMDPV | KQMLFLNSTG | ||||
RVLDRDPPMN | IHSIVVQVQC | INKKVGTIIY | HEVRIVVRDR | NDNSPTFKHE | ||||
SYYATVNELT | PVGTTIFTGF | SGDNGATDID | DGPNGQIEYV | IQYNPDDPTS | ||||
NDTFEIPLML | TGNIVLRKRL | NYEDKTRYFV | IIQANDRAQN | LNERRTTTTT | ||||
LTVDVLDGDD | LGPMFLPCVL | VPNTRDCRPL | TYQAAIPELR | TPEELNPIIV | ||||
TPPIQAIDQD | RNIQPPSDRP | GILYSILVGT | PEDYPRFFHM | HPRTAELSLL | ||||
EPVNRDFHQK | FDLVIKAEQD | NGHPLPAFAG | LHIEILDENN | QSPYFTMPSY | ||||
QGYILESAPV | GATISDSLNL | TSPLRIVALD | KDIEDTKDPE | LHLFLNDYTS | ||||
VFTVTQTGIT | RYLTLLQPVD | REEQQTYTFS | ITAFDGVQES | EPVIVNIQVM | ||||
DANDNTPTFP | EISYDVYVYT | DMRPGDSVIQ | LTAVDADEGS | NGEITYEILV | ||||
GAQGDFIINK | TTGLITIAPG | VEMIVGRTYA | LTVQAADNAP | PAERRNSICT | ||||
VYIEVLPPNN | QSPPRFPQLM | YSLEISEAMR | VGAVLLNLQA | TDREGDSITY | ||||
AIENGDPQRV | FNLSETTGIL | TLGKALDRES | TDRYILIITA | SDGRPDGTST | ||||
ATVNIVVTDV | NDNAPVFDPY | LPRNLSVVEE | EANAFVGQVK | ATDPDAGING | ||||
QVHYSLGNFN | NLFRITSNGS | IYTAVKLNRE | VRDYYELVVV | ATDGAVHPRH | ||||
STLTLAIKVL | DIDDNSPVFT | NSTYTVLVEE | NLPAGTTILQ | IEAKDVDLGA | ||||
NVSYRIRSPE | VKHFFALHPF | TGELSLLRSL | DYEAFPDQEA | SITFLVEAFD | ||||
IYGTMPPGIA | TVTVIVKDMN | DYPPVFSKRI | YKGMVAPDAV | KGTPITTVYA | ||||
EDADPPGLPA | SRVRYRVDDV | QFPYPASIFE | VEEDSGRVIT | RVNLNEEPTT | ||||
IFKLVVVAFD | DGEPVMSSSA | TVKILVLHPG | EIPRFTQEEY | RPPPVSELAT | ||||
KGTMVGVISA | AAINQSIVYS | IVSGNEEDTF | GINNITGVIY | VNGPLDYETR | ||||
TSYVLRVQAD | SLEVVLANLR | VPSKSNTAKV | YIEIQDENNH | PPVFQKKFYI | ||||
GGVSEDARMF | TSVLRVKATD | KDTGNYSVMA | YRLIIPPIKE | GKEGFVVETY | ||||
TGLIKTAMLF | HNMRRSYFKF | QVIATDDYGK | GLSGKADVLV | SVVNQLDMQV | ||||
IVSNVPPTLV | EKKIEDLTEI | LDRYVQEQIP | GAKVVVESIG | ARRHGDAFSL | ||||
EDYTKCDLTV | YAIDPQTNRA | IDRNELFKFL | DGKLLDINKD | FQPYYGEGGR | ||||
ILEIRTPEAV | TSIKKRGESL | GYTEGALLAL | AFIIILCCIP | AILVVLVSYR | ||||
QFKVRQAECT | KTARIQAALP | AAKPAVPAPA | PVAAPPPPPP | PPPGAHLYEE | ||||
LGDSSILFLL | YHFQQSRGNN | SVSEDRKHQQ | VVMPFSSNTI | EAHKSAHVDG | ||||
SLKSNKLKSA | RKFTFLSDED | DLSAHNPLYK | ENISQVSTNS | DISQRTDFVD | ||||
PFSPKIQAKS | KSLRGPREKI | QRLWSQSVSL | PRRLMRKVPN | RPEIIDLQQW | ||||
QGTRQKAENE | NTGICTNKRG | SSNPLLTTEE | ANLTEKEEIR | QGETLMIEGT | ||||
EQLKSLSSDS | SFCFPRPHFS | FSTLPTVSRT | VELKSEPNVI | SSPAECSLEL | ||||
SPSRPCVLHS | SLSRRETPIC | MLPIETERNI | FENFAHPPNI | SPSACPLPPP | ||||
PPISPPSPPP | APAPLAPPPD | ISPFSLFCPP | PSPPSIPLPL | PPPTFFPLSV | ||||
STSGPPTPPL | LPPFPTPLPP | PPPSIPCPPP | PSASFLSTEC | VCITGVKCTT | ||||
NLMPAEKIKS | SMTQLSTTTV | CKTDPQREPK | GILRHVKNLA | ELEKSVANMY | ||||
SQIEKNYLRT | NVSELQTMCP | SEVTNMEITS | EQNKGSLNNI | VEGTEKQSHS | ||||
QSTSL |
Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.
Література
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з PCDH15 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14674 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 29 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
PCDH15 angl Protocadherin related 15 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 10 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 955 aminokislot a molekulyarna masa 216 069 PCDH15Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB4APX 4AQ8 4AQA 4AQE 4AXWIdentifikatoriSimvoliPCDH15 CDHR15 DFNB23 USH1F protocadherin related 15 protocadherin related 15Zovnishni ID OMIM 605514 MGI 1891428 HomoloGene 23401 GeneCards PCDH15Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaUsher syndrome type 1F Usher syndrome type 1D autosomal recessive nonsyndromic deafness 23 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya calcium ion bindingKlitinna komponenta integral component of membrane extracellular region klitinna membrana photoreceptor outer segment sinaps membrana stereocilium mizhklitinnij prostir integral component of plasma membraneBiologichnij proces inner ear development photoreceptor cell maintenance sensory perception of light stimulus sluh Vidchuttya rivnovagi ekvilibriocepciya homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules adgeziya klitin cell cell signaling nejrobiologiya rozvitkuDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez65217 11994Ensembl ENSG00000150275 ENSMUSG00000052613UniProt Q96QU1 Q99PJ1RefSeq mRNK NM 033056 NM 001142763 NM 001142764 NM 001142765 NM 001142766NM 001142767 NM 001142768 NM 001142769 NM 001142770 NM 001142771 NM 001142772 NM 001142773 NM 001354404 NM 001354411 NM 001354420 NM 001354429 NM 001354430 NM 001384140NM 001142735 NM 001142736 NM 001142737 NM 001142738 NM 001142739NM 001142740 NM 001142741 NM 001142742 NM 001142743 NM 001142746 NM 001142747 NM 001142748 NM 001142760 NM 023115RefSeq bilok NP 001136235 NP 001136236 NP 001136237 NP 001136238 NP 001136239NP 001136240 NP 001136241 NP 001136242 NP 001136243 NP 001136244 NP 001136245 NP 149045 NP 001341333 NP 001341340 NP 001341349 NP 001341358 NP 001341359 NP 001371069NP 001136207 NP 001136208 NP 001136209 NP 001136210 NP 001136211NP 001136212 NP 001136213 NP 001136214 NP 001136215 NP 001136218 NP 001136219 NP 001136220 NP 001136232 NP 075604Lokus UCSC Hr 10 53 8 55 63 MbHr 10 73 1 74 65 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MFRQFYLWTCLASGIILGSLFEICLGQYDDDCKLARGGPPATIVAIDEES RNGTILVDNMLIKGTAGGPDPTIELSLKDNVDYWVLMDPVKQMLFLNSTG RVLDRDPPMNIHSIVVQVQCINKKVGTIIYHEVRIVVRDRNDNSPTFKHE SYYATVNELTPVGTTIFTGFSGDNGATDIDDGPNGQIEYVIQYNPDDPTS NDTFEIPLMLTGNIVLRKRLNYEDKTRYFVIIQANDRAQNLNERRTTTTT LTVDVLDGDDLGPMFLPCVLVPNTRDCRPLTYQAAIPELRTPEELNPIIV TPPIQAIDQDRNIQPPSDRPGILYSILVGTPEDYPRFFHMHPRTAELSLL EPVNRDFHQKFDLVIKAEQDNGHPLPAFAGLHIEILDENNQSPYFTMPSY QGYILESAPVGATISDSLNLTSPLRIVALDKDIEDTKDPELHLFLNDYTS VFTVTQTGITRYLTLLQPVDREEQQTYTFSITAFDGVQESEPVIVNIQVM DANDNTPTFPEISYDVYVYTDMRPGDSVIQLTAVDADEGSNGEITYEILV GAQGDFIINKTTGLITIAPGVEMIVGRTYALTVQAADNAPPAERRNSICT VYIEVLPPNNQSPPRFPQLMYSLEISEAMRVGAVLLNLQATDREGDSITY AIENGDPQRVFNLSETTGILTLGKALDRESTDRYILIITASDGRPDGTST ATVNIVVTDVNDNAPVFDPYLPRNLSVVEEEANAFVGQVKATDPDAGING QVHYSLGNFNNLFRITSNGSIYTAVKLNREVRDYYELVVVATDGAVHPRH STLTLAIKVLDIDDNSPVFTNSTYTVLVEENLPAGTTILQIEAKDVDLGA NVSYRIRSPEVKHFFALHPFTGELSLLRSLDYEAFPDQEASITFLVEAFD IYGTMPPGIATVTVIVKDMNDYPPVFSKRIYKGMVAPDAVKGTPITTVYA EDADPPGLPASRVRYRVDDVQFPYPASIFEVEEDSGRVITRVNLNEEPTT IFKLVVVAFDDGEPVMSSSATVKILVLHPGEIPRFTQEEYRPPPVSELAT KGTMVGVISAAAINQSIVYSIVSGNEEDTFGINNITGVIYVNGPLDYETR TSYVLRVQADSLEVVLANLRVPSKSNTAKVYIEIQDENNHPPVFQKKFYI GGVSEDARMFTSVLRVKATDKDTGNYSVMAYRLIIPPIKEGKEGFVVETY TGLIKTAMLFHNMRRSYFKFQVIATDDYGKGLSGKADVLVSVVNQLDMQV IVSNVPPTLVEKKIEDLTEILDRYVQEQIPGAKVVVESIGARRHGDAFSL EDYTKCDLTVYAIDPQTNRAIDRNELFKFLDGKLLDINKDFQPYYGEGGR ILEIRTPEAVTSIKKRGESLGYTEGALLALAFIIILCCIPAILVVLVSYR QFKVRQAECTKTARIQAALPAAKPAVPAPAPVAAPPPPPPPPPGAHLYEE LGDSSILFLLYHFQQSRGNNSVSEDRKHQQVVMPFSSNTIEAHKSAHVDG SLKSNKLKSARKFTFLSDEDDLSAHNPLYKENISQVSTNSDISQRTDFVD PFSPKIQAKSKSLRGPREKIQRLWSQSVSLPRRLMRKVPNRPEIIDLQQW QGTRQKAENENTGICTNKRGSSNPLLTTEEANLTEKEEIRQGETLMIEGT EQLKSLSSDSSFCFPRPHFSFSTLPTVSRTVELKSEPNVISSPAECSLEL SPSRPCVLHSSLSRRETPICMLPIETERNIFENFAHPPNISPSACPLPPP PPISPPSPPPAPAPLAPPPDISPFSLFCPPPSPPSIPLPLPPPTFFPLSV STSGPPTPPLLPPFPTPLPPPPPSIPCPPPPSASFLSTECVCITGVKCTT NLMPAEKIKSSMTQLSTTTVCKTDPQREPKGILRHVKNLAELEKSVANMY SQIEKNYLRTNVSELQTMCPSEVTNMEITSEQNKGSLNNIVEGTEKQSHS QSTSL A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak klitinna adgeziya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionom kalciyu Lokalizovanij u klitinnij membrani membrani Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaPrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z PCDH15 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 14674 angl Procitovano 8 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 29 zhovtnya 2017 Procitovano 8 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 10 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi