PABPC1 (англ. Poly(A) binding protein cytoplasmic 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 636 амінокислот, а молекулярна маса — 70 671.
PABPC1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | PABPC1, PAB1, PABP, PABP1, PABPC2, PABPL1, poly(A) binding protein cytoplasmic 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 604679 MGI: 1349722 HomoloGene: 37638 GeneCards: PABPC1 | ||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
Viroporin 3a | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 8: 100.69 – 100.72 Mb | Хр. 15: 36.6 – 36.61 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MNPSAPSYPM | ASLYVGDLHP | DVTEAMLYEK | FSPAGPILSI | RVCRDMITRR | ||||
SLGYAYVNFQ | QPADAERALD | TMNFDVIKGK | PVRIMWSQRD | PSLRKSGVGN | ||||
IFIKNLDKSI | DNKALYDTFS | AFGNILSCKV | VCDENGSKGY | GFVHFETQEA | ||||
AERAIEKMNG | MLLNDRKVFV | GRFKSRKERE | AELGARAKEF | TNVYIKNFGE | ||||
DMDDERLKDL | FGKFGPALSV | KVMTDESGKS | KGFGFVSFER | HEDAQKAVDE | ||||
MNGKELNGKQ | IYVGRAQKKV | ERQTELKRKF | EQMKQDRITR | YQGVNLYVKN | ||||
LDDGIDDERL | RKEFSPFGTI | TSAKVMMEGG | RSKGFGFVCF | SSPEEATKAV | ||||
TEMNGRIVAT | KPLYVALAQR | KEERQAHLTN | QYMQRMASVR | AVPNPVINPY | ||||
QPAPPSGYFM | AAIPQTQNRA | AYYPPSQIAQ | LRPSPRWTAQ | GARPHPFQNM | ||||
PGAIRPAAPR | PPFSTMRPAS | SQVPRVMSTQ | RVANTSTQTM | GPRPAAAAAA | ||||
ATPAVRTVPQ | YKYAAGVRNP | QQHLNAQPQV | TMQQPAVHVQ | GQEPLTASML | ||||
ASAPPQEQKQ | MLGERLFPLI | QAMHPTLAGK | ITGMLLEIDN | SELLHMLESP | ||||
ESLRSKVDEA | VAVLQAHQAK | EAAQKAVNSA | TGVPTV |
Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Grange T., de Sa C.M., Oddos J., Pictet R. (1987). Human mRNA polyadenylate binding protein: evolutionary conservation of a nucleic acid binding motif. Nucleic Acids Res. 15: 4771—4787. PMID 2885805 DOI:10.1093/nar/15.12.4771
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Goerlach M., Burd C.G., Dreyfuss G. (1994). The mRNA poly(A)-binding protein: localization, abundance, and RNA-binding specificity. Exp. Cell Res. 211: 400—407. PMID 7908267 DOI:10.1006/excr.1994.1104
- Afonina E., Stauber R., Pavlakis G.N. (1998). The human poly(A)-binding protein 1 shuttles between the nucleus and the cytoplasm. J. Biol. Chem. 273: 13015—13021. PMID 9582337 DOI:10.1074/jbc.273.21.13015
- Craig A.W.B., Haghighat A., Yu A.T.K., Sonenberg N. (1998). Interaction of polyadenylate-binding protein with the eIF4G homologue PAIP enhances translation. Nature. 392: 520—523. PMID 9548260 DOI:10.1038/33198
- Lee J., Bedford M.T. (2002). PABP1 identified as an arginine methyltransferase substrate using high-density protein arrays. EMBO Rep. 3: 268—273. PMID 11850402 DOI:10.1093/embo-reports/kvf052
Примітки
- Сполуки, які фізично взаємодіють з Poly(A) binding protein cytoplasmic 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8554 (англ.) . Архів оригіналу за 4 квітня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.
- UniProt, P11940 (англ.) . Архів оригіналу за 8 лютого 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
Див. також
![]() | Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
PABPC1 angl Poly A binding protein cytoplasmic 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 8 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 636 aminokislot a molekulyarna masa 70 671 PABPC1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1CVJ 1G9L 1JGN 1JH4 2K8G 2RQG 2RQH 2X04 3KTP 3KTR 3KUI 3KUJ 3KUR 3KUS 3KUT 3PKN 3PTH 4F02 4F25 4F26 5DX1 5DXA 5DX8 2D9PIdentifikatoriSimvoliPABPC1 PAB1 PABP PABP1 PABPC2 PABPL1 poly A binding protein cytoplasmic 1Zovnishni ID OMIM 604679 MGI 1349722 HomoloGene 37638 GeneCards PABPC1Reaguye na spolukuViroporin 3a Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0001948 GO 0016582 protein binding nucleic acid binding protein C terminus binding translation activator activity poly U RNA binding poly A binding mRNA 3 UTR binding RNA binding mRNA bindingKlitinna komponenta focal adhesion catalytic step 2 spliceosome cytoplasmic stress granule citoplazma cytoplasmic ribonucleoprotein granule spliceosomal complex membrana ekzosoma klitinne yadro gialoplazma dendrit nejrobiologiya ribonucleoprotein granule sinaps messenger ribonucleoprotein complex RibonukleoproteyiniBiologichnij proces nuclear transcribed mRNA catabolic process nonsense mediated decay mRNA stabilization mRNA splicing via spliceosome regulation of mRNA stability Splajsing RNK mRNA polyadenylation mRNA processing nuclear transcribed mRNA poly A tail shortening positive regulation of viral genome replication translational initiation negative regulation of nuclear transcribed mRNA catabolic process nonsense mediated decay positive regulation of translation Sajlensing geniv positive regulation of nuclear transcribed mRNA poly A tail shortening positive regulation of nuclear transcribed mRNA catabolic process deadenylation dependent decayDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez26986 18458Ensembl ENSG00000070756 ENSMUSG00000022283UniProt P11940 P29341RefSeq mRNK NM 002568NM 008774RefSeq bilok NP 002559NP 032800Lokus UCSC Hr 8 100 69 100 72 MbHr 15 36 6 36 61 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MNPSAPSYPMASLYVGDLHPDVTEAMLYEKFSPAGPILSIRVCRDMITRR SLGYAYVNFQQPADAERALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGN IFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEA AERAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGE DMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDESGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDE MNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKN LDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAV TEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPY QPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNM PGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAA ATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASML ASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESP ESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak procesing mRNK splajsing mRNK Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z RNK Lokalizovanij u citoplazmi yadri LiteraturaGrange T de Sa C M Oddos J Pictet R 1987 Human mRNA polyadenylate binding protein evolutionary conservation of a nucleic acid binding motif Nucleic Acids Res 15 4771 4787 PMID 2885805 DOI 10 1093 nar 15 12 4771 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Goerlach M Burd C G Dreyfuss G 1994 The mRNA poly A binding protein localization abundance and RNA binding specificity Exp Cell Res 211 400 407 PMID 7908267 DOI 10 1006 excr 1994 1104 Afonina E Stauber R Pavlakis G N 1998 The human poly A binding protein 1 shuttles between the nucleus and the cytoplasm J Biol Chem 273 13015 13021 PMID 9582337 DOI 10 1074 jbc 273 21 13015 Craig A W B Haghighat A Yu A T K Sonenberg N 1998 Interaction of polyadenylate binding protein with the eIF4G homologue PAIP enhances translation Nature 392 520 523 PMID 9548260 DOI 10 1038 33198 Lee J Bedford M T 2002 PABP1 identified as an arginine methyltransferase substrate using high density protein arrays EMBO Rep 3 268 273 PMID 11850402 DOI 10 1093 embo reports kvf052PrimitkiSpoluki yaki fizichno vzayemodiyut z Poly A binding protein cytoplasmic 1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 8554 angl Arhiv originalu za 4 kvitnya 2016 Procitovano 6 lyutogo 2017 UniProt P11940 angl Arhiv originalu za 8 lyutogo 2017 Procitovano 6 lyutogo 2017 Div takozhHromosoma 8 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi