OLR1 (англ. Oxidized low density lipoprotein receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 273 амінокислот, а молекулярна маса — 30 959.
OLR1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | OLR1, CLEC8A, LOX1, LOXIN, SCARE1, SLOX1, oxidized low density lipoprotein receptor 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 602601 MGI: 1261434 HomoloGene: 1910 GeneCards: OLR1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 12: 10.16 – 10.17 Mb | Хр. 6: 129.46 – 129.48 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MTFDDLKIQT | VKDQPDEKSN | GKKAKGLQFL | YSPWWCLAAA | TLGVLCLGLV | ||||
VTIMVLGMQL | SQVSDLLTQE | QANLTHQKKK | LEGQISARQQ | AEEASQESEN | ||||
ELKEMIETLA | RKLNEKSKEQ | MELHHQNLNL | QETLKRVANC | SAPCPQDWIW | ||||
HGENCYLFSS | GSFNWEKSQE | KCLSLDAKLL | KINSTADLDF | IQQAISYSSF | ||||
PFWMGLSRRN | PSYPWLWEDG | SPLMPHLFRV | RGAVSQTYPS | GTCAYIQRGA | ||||
VYAENCILAA | FSICQKKANL | RAQ |
Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, імунітет, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Yamanaka S., Zhang X.-Y., Miura K., Kim S., Iwao H. (1998). The human gene encoding the lectin-type oxidized LDL receptor (OLR1) is a novel member of the natural killer gene complex with a unique expression profile. Genomics. 54: 191—199. PMID 9828121 DOI:10.1006/geno.1998.5561
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hayashida K., Kume N., Minami M., Kita T. (2002). Lectin-like oxidized LDL receptor-1 (LOX-1) supports adhesion of mononuclear leukocytes and a monocyte-like cell line THP-1 cells under static and flow conditions. FEBS Lett. 511: 133—138. PMID 11821063 DOI:10.1016/S0014-5793(01)03297-5
- Luedecking-Zimmer E., DeKosky S.T., Chen Q., Barmada M.M., Kamboh M.I. (2002). Investigation of oxidized LDL-receptor 1 (OLR1) as the candidate gene for Alzheimer's disease on chromosome 12. Hum. Genet. 111: 443—451. PMID 12384789 DOI:10.1007/s00439-002-0802-7
- Hu B., Li D., Sawamura T., Mehta J.L. (2003). Oxidized LDL through LOX-1 modulates LDL-receptor expression in human coronary artery endothelial cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 307: 1008—1012. PMID 12878212 DOI:10.1016/S0006-291X(03)01295-6
- Pritchard A., St Clair D., Lemmon H., Mann D.M.A., Lendon C. (2004). No association between polymorphisms in the lectin-like oxidised low density lipoprotein receptor (ORL1) gene on chromosome 12 and Alzheimer's disease in a UK cohort. Neurosci. Lett. 366: 126—129. PMID 15276231 DOI:10.1016/j.neulet.2004.05.023
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 29 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 10 листопада 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
OLR1 angl Oxidized low density lipoprotein receptor 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 12 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 273 aminokislot a molekulyarna masa 30 959 OLR1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSBSpisok kodiv PDB1YPO 1YPQ 1YPU 1YXJ 1YXK 3VLGIdentifikatoriSimvoliOLR1 CLEC8A LOX1 LOXIN SCARE1 SLOX1 oxidized low density lipoprotein receptor 1Zovnishni ID OMIM 602601 MGI 1261434 HomoloGene 1910 GeneCards OLR1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0001948 GO 0016582 protein binding carbohydrate binding identical protein bindingKlitinna komponenta integral component of membrane membrana vnutrishnoklitinna membranna organela receptor complex klitinna membrana integral component of plasma membrane nukleoplazma extracellular region membrane raft specific granule membrane tertiary granule membraneBiologichnij proces proces imunnoyi sistemi krovoobig proteoliz adgeziya klitin inflammatory response leukocyte migration neutrophil degranulationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez4973 108078Ensembl ENSG00000173391 ENSMUSG00000030162UniProt P78380 Q9EQ09RefSeq mRNK NM 001172632 NM 001172633 NM 002543NM 001301094 NM 001301096 NM 138648RefSeq bilok NP 001166103 NP 001166104 NP 002534NP 001288023 NP 001288025 NP 619589Lokus UCSC Hr 12 10 16 10 17 MbHr 6 129 46 129 48 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishejPoslidovnist aminokislot1020304050MTFDDLKIQTVKDQPDEKSNGKKAKGLQFLYSPWWCLAAATLGVLCLGLVVTIMVLGMQLSQVSDLLTQEQANLTHQKKKLEGQISARQQAEEASQESENELKEMIETLARKLNEKSKEQMELHHQNLNLQETLKRVANCSAPCPQDWIWHGENCYLFSSGSFNWEKSQEKCLSLDAKLLKINSTADLDFIQQAISYSSFPFWMGLSRRNPSYPWLWEDGSPLMPHLFRVRGAVSQTYPSGTCAYIQRGAVYAENCILAAFSICQKKANLRAQA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do receptoriv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak klitinna adgeziya imunitet zapalna vidpovid alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z lektinami Lokalizovanij u klitinnij membrani membrani Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaYamanaka S Zhang X Y Miura K Kim S Iwao H 1998 The human gene encoding the lectin type oxidized LDL receptor OLR1 is a novel member of the natural killer gene complex with a unique expression profile Genomics 54 191 199 PMID 9828121 DOI 10 1006 geno 1998 5561 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Hayashida K Kume N Minami M Kita T 2002 Lectin like oxidized LDL receptor 1 LOX 1 supports adhesion of mononuclear leukocytes and a monocyte like cell line THP 1 cells under static and flow conditions FEBS Lett 511 133 138 PMID 11821063 DOI 10 1016 S0014 5793 01 03297 5 Luedecking Zimmer E DeKosky S T Chen Q Barmada M M Kamboh M I 2002 Investigation of oxidized LDL receptor 1 OLR1 as the candidate gene for Alzheimer s disease on chromosome 12 Hum Genet 111 443 451 PMID 12384789 DOI 10 1007 s00439 002 0802 7 Hu B Li D Sawamura T Mehta J L 2003 Oxidized LDL through LOX 1 modulates LDL receptor expression in human coronary artery endothelial cells Biochem Biophys Res Commun 307 1008 1012 PMID 12878212 DOI 10 1016 S0006 291X 03 01295 6 Pritchard A St Clair D Lemmon H Mann D M A Lendon C 2004 No association between polymorphisms in the lectin like oxidised low density lipoprotein receptor ORL1 gene on chromosome 12 and Alzheimer s disease in a UK cohort Neurosci Lett 366 126 129 PMID 15276231 DOI 10 1016 j neulet 2004 05 023PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 29 bereznya 2016 Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 10 listopada 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 12Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi