OAT (англ. Ornithine aminotransferase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 10-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 439 амінокислот, а молекулярна маса — 48 535.
OAT | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | OAT, GACR, HOGA, OATASE, OKT, ornithine aminotransferase | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 613349 MGI: 97394 HomoloGene: 231 GeneCards: OAT | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
gyrate atrophy of the choroid | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 10: 124.4 – 124.42 Mb | Хр. 7: 132.16 – 132.18 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MFSKLAHLQR | FAVLSRGVHS | SVASATSVAT | KKTVQGPPTS | DDIFEREYKY | ||||
GAHNYHPLPV | ALERGKGIYL | WDVEGRKYFD | FLSSYSAVNQ | GHCHPKIVNA | ||||
LKSQVDKLTL | TSRAFYNNVL | GEYEEYITKL | FNYHKVLPMN | TGVEAGETAC | ||||
KLARKWGYTV | KGIQKYKAKI | VFAAGNFWGR | TLSAISSSTD | PTSYDGFGPF | ||||
MPGFDIIPYN | DLPALERALQ | DPNVAAFMVE | PIQGEAGVVV | PDPGYLMGVR | ||||
ELCTRHQVLF | IADEIQTGLA | RTGRWLAVDY | ENVRPDIVLL | GKALSGGLYP | ||||
VSAVLCDDDI | MLTIKPGEHG | STYGGNPLGC | RVAIAALEVL | EEENLAENAD | ||||
KLGIILRNEL | MKLPSDVVTA | VRGKGLLNAI | VIKETKDWDA | WKVCLRLRDN | ||||
GLLAKPTHGD | IIRFAPPLVI | KEDELRESIE | IINKTILSF |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, амінотрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з піридоксаль-фосфатом. Локалізований у мітохондрії.
Література
- Ramesh V., Shaffer M.M., Allaire J.M., Shih V.E., Gusella J.F. (1986). Investigation of gyrate atrophy using a cDNA clone for human ornithine aminotransferase. DNA. 5: 493—501. PMID 3816496 DOI:10.1089/dna.1.1986.5.493
- Kobayashi T., Nishii M., Takagi Y., Titani T., Matsuzawa T. (1989). Molecular cloning and nucleotide sequence analysis of mRNA for human kidney ornithine aminotransferase. An examination of ornithine aminotransferase isozymes between liver and kidney. FEBS Lett. 255: 300—304. PMID 2507357 DOI:10.1016/0014-5793(89)81110-X
- Zintz C.B., Inana G. (1990). Analysis of the human ornithine aminotransferase gene family. Exp. Eye Res. 50: 759—770. PMID 2373169 DOI:10.1016/0014-4835(90)90126-F
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Simmaco M., John R.A., Barra D., Bossa F. (1986). The primary structure of ornithine aminotransferase. Identification of active-site sequence and site of post-translational proteolysis. FEBS Lett. 199: 39—42. PMID 3754226 DOI:10.1016/0014-5793(86)81219-4
- Shah S.A., Shen B.W., Brunger A.T. (1997). Human ornithine aminotransferase complexed with L-canaline and gabaculine: structural basis for substrate recognition. Structure. 5: 1067—1075. PMID 9309222 DOI:10.1016/S0969-2126(97)00258-X
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з OAT переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8091 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 18 жовтня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
OAT angl Ornithine aminotransferase bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na 10 j hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 439 aminokislot a molekulyarna masa 48 535 OATNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1GBN 1OAT 2BYJ 2BYL 2CAN 2OATIdentifikatoriSimvoliOAT GACR HOGA OATASE OKT ornithine aminotransferaseZovnishni ID OMIM 613349 MGI 97394 HomoloGene 231 GeneCards OATPov yazani genetichni zahvoryuvannyagyrate atrophy of the choroid Ontologiya genaMolekulyarna funkciya katalitichna aktivnist identical protein binding pyridoxal phosphate binding transferase activity transaminase activity ornithine oxo acid transaminase activityKlitinna komponenta citoplazma mitohondrialnij matriks nukleoplazma mitohondriyaBiologichnij proces L proline biosynthetic process zir cellular amino acid biosynthetic process protein hexamerization arginine catabolic process to proline via ornithine arginine catabolic process to glutamateDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez4942 18242Ensembl ENSG00000065154 ENSMUSG00000030934UniProt P04181 P29758RefSeq mRNK NM 000274 NM 001171814 NM 001322965 NM 001322966 NM 001322967NM 001322968 NM 001322969 NM 001322970 NM 001322971 NM 001322974NM 016978RefSeq bilok NP 000265 NP 001165285 NP 001309894 NP 001309895 NP 001309896NP 001309897 NP 001309898 NP 001309899 NP 001309900 NP 001309903NP 058674Lokus UCSC Hr 10 124 4 124 42 MbHr 7 132 16 132 18 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MFSKLAHLQRFAVLSRGVHSSVASATSVATKKTVQGPPTSDDIFEREYKY GAHNYHPLPVALERGKGIYLWDVEGRKYFDFLSSYSAVNQGHCHPKIVNA LKSQVDKLTLTSRAFYNNVLGEYEEYITKLFNYHKVLPMNTGVEAGETAC KLARKWGYTVKGIQKYKAKIVFAAGNFWGRTLSAISSSTDPTSYDGFGPF MPGFDIIPYNDLPALERALQDPNVAAFMVEPIQGEAGVVVPDPGYLMGVR ELCTRHQVLFIADEIQTGLARTGRWLAVDYENVRPDIVLLGKALSGGLYP VSAVLCDDDIMLTIKPGEHGSTYGGNPLGCRVAIAALEVLEEENLAENAD KLGIILRNELMKLPSDVVTAVRGKGLLNAIVIKETKDWDAWKVCLRLRDN GLLAKPTHGDIIRFAPPLVIKEDELRESIEIINKTILSF A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do transferaz aminotransferaz Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak acetilyuvannya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z piridoksal fosfatom Lokalizovanij u mitohondriyi LiteraturaRamesh V Shaffer M M Allaire J M Shih V E Gusella J F 1986 Investigation of gyrate atrophy using a cDNA clone for human ornithine aminotransferase DNA 5 493 501 PMID 3816496 DOI 10 1089 dna 1 1986 5 493 Kobayashi T Nishii M Takagi Y Titani T Matsuzawa T 1989 Molecular cloning and nucleotide sequence analysis of mRNA for human kidney ornithine aminotransferase An examination of ornithine aminotransferase isozymes between liver and kidney FEBS Lett 255 300 304 PMID 2507357 DOI 10 1016 0014 5793 89 81110 X Zintz C B Inana G 1990 Analysis of the human ornithine aminotransferase gene family Exp Eye Res 50 759 770 PMID 2373169 DOI 10 1016 0014 4835 90 90126 F The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Simmaco M John R A Barra D Bossa F 1986 The primary structure of ornithine aminotransferase Identification of active site sequence and site of post translational proteolysis FEBS Lett 199 39 42 PMID 3754226 DOI 10 1016 0014 5793 86 81219 4 Shah S A Shen B W Brunger A T 1997 Human ornithine aminotransferase complexed with L canaline and gabaculine structural basis for substrate recognition Structure 5 1067 1075 PMID 9309222 DOI 10 1016 S0969 2126 97 00258 XPrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z OAT pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 8091 angl Procitovano 19 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 18 zhovtnya 2017 Procitovano 19 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 10 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi