NLRC4 (англ. NLR family CARD domain containing 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 024 амінокислот, а молекулярна маса — 116 159.
NLRC4 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | NLRC4, CARD12, CLAN, CLAN1, CLANA, CLANB, CLANC, CLAND, CLR2.1, IPAF, AIFEC, FCAS4, NLR family, CARD domain containing 4, NLR family CARD domain containing 4 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 606831 MGI: 3036243 HomoloGene: 10924 GeneCards: NLRC4 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
familial cold autoinflammatory syndrome 4, periodic fever-infantile enterocolitis-autoinflammatory syndrome | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 2: 32.22 – 32.27 Mb | Хр. 17: 74.73 – 74.77 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MNFIKDNSRA | LIQRMGMTVI | KQITDDLFVW | NVLNREEVNI | ICCEKVEQDA | ||||
ARGIIHMILK | KGSESCNLFL | KSLKEWNYPL | FQDLNGQSLF | HQTSEGDLDD | ||||
LAQDLKDLYH | TPSFLNFYPL | GEDIDIIFNL | KSTFTEPVLW | RKDQHHHRVE | ||||
QLTLNGLLQA | LQSPCIIEGE | SGKGKSTLLQ | RIAMLWGSGK | CKALTKFKFV | ||||
FFLRLSRAQG | GLFETLCDQL | LDIPGTIRKQ | TFMAMLLKLR | QRVLFLLDGY | ||||
NEFKPQNCPE | IEALIKENHR | FKNMVIVTTT | TECLRHIRQF | GALTAEVGDM | ||||
TEDSAQALIR | EVLIKELAEG | LLLQIQKSRC | LRNLMKTPLF | VVITCAIQMG | ||||
ESEFHSHTQT | TLFHTFYDLL | IQKNKHKHKG | VAASDFIRSL | DHCGDLALEG | ||||
VFSHKFDFEL | QDVSSVNEDV | LLTTGLLCKY | TAQRFKPKYK | FFHKSFQEYT | ||||
AGRRLSSLLT | SHEPEEVTKG | NGYLQKMVSI | SDITSTYSSL | LRYTCGSSVE | ||||
ATRAVMKHLA | AVYQHGCLLG | LSIAKRPLWR | QESLQSVKNT | TEQEILKAIN | ||||
INSFVECGIH | LYQESTSKSA | LSQEFEAFFQ | GKSLYINSGN | IPDYLFDFFE | ||||
HLPNCASALD | FIKLDFYGGA | MASWEKAAED | TGGIHMEEAP | ETYIPSRAVS | ||||
LFFNWKQEFR | TLEVTLRDFS | KLNKQDIRYL | GKIFSSATSL | RLQIKRCAGV | ||||
AGSLSLVLST | CKNIYSLMVE | ASPLTIEDER | HITSVTNLKT | LSIHDLQNQR | ||||
LPGGLTDSLG | NLKNLTKLIM | DNIKMNEEDA | IKLAEGLKNL | KKMCLFHLTH | ||||
LSDIGEGMDY | IVKSLSSEPC | DLEEIQLVSC | CLSANAVKIL | AQNLHNLVKL | ||||
SILDLSENYL | EKDGNEALHE | LIDRMNVLEQ | LTALMLPWGC | DVQGSLSSLL | ||||
KHLEEVPQLV | KLGLKNWRLT | DTEIRILGAF | FGKNPLKNFQ | QLNLAGNRVS | ||||
SDGWLAFMGV | FENLKQLVFF | DFSTKEFLPD | PALVRKLSQV | LSKLTFLQEA | ||||
RLVGWQFDDD | DLSVITGAFK | LVTA |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- Damiano J.S., Stehlik C., Pio F., Godzik A., Reed J.C. (2001). CLAN, a novel human CED-4-like gene. Genomics. 75: 77—83. PMID 11472070 DOI:10.1006/geno.2001.6579
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Damiano J.S., Oliveira V., Welsh K., Reed J.C. (2004). Heterotypic interactions among NACHT domains: implications for regulation of innate immune responses. Biochem. J. 381: 213—219. PMID 15107016 DOI:10.1042/BJ20031506
- Kitamura A., Sasaki Y., Abe T., Kano H., Yasutomo K. (2014). An inherited mutation in NLRC4 causes autoinflammation in human and mice. J. Exp. Med. 211: 2385—2396. PMID 25385754 DOI:10.1084/jem.20141091
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з NLRC4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16412 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 6 листопада 2012. Процитовано 29 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
NLRC4 angl NLR family CARD domain containing 4 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 2 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 024 aminokislot a molekulyarna masa 116 159 NLRC4Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB4KXFIdentifikatoriSimvoliNLRC4 CARD12 CLAN CLAN1 CLANA CLANB CLANC CLAND CLR2 1 IPAF AIFEC FCAS4 NLR family CARD domain containing 4 NLR family CARD domain containing 4Zovnishni ID OMIM 606831 MGI 3036243 HomoloGene 10924 GeneCards NLRC4Pov yazani genetichni zahvoryuvannyafamilial cold autoinflammatory syndrome 4 periodic fever infantile enterocolitis autoinflammatory syndrome Ontologiya genaMolekulyarna funkciya nucleotide binding protein homodimerization activity GO 0050372 ubiquitin protein transferase activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding ATP binding magnesium ion binding cysteine type endopeptidase inhibitor activity involved in apoptotic process identical protein bindingKlitinna komponenta citoplazma gialoplazma vnutrishnoklitinnij IPAF inflammasome complex klitinne yadroBiologichnij proces Piroptoz inhibition of cysteine type endopeptidase activity involved in apoptotic process proces imunnoyi sistemi regulation of cysteine type endopeptidase activity involved in apoptotic process mitotic spindle assembly regulation of signal transduction defense response to bacterium positive regulation of NF kappaB transcription factor activity detection of bacterium activation of innate immune response positive regulation of apoptotic process inflammatory response protein homooligomerization activation of cysteine type endopeptidase activity involved in apoptotic process GO 0097285 apoptoz Ubikvitin zalezhnij proteoliz regulation of apoptotic process vrodzhenij imunitetDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez58484 268973Ensembl ENSG00000091106 ENSMUSG00000039193UniProt Q9NPP4 Q3UP24RefSeq mRNK NM 001199138 NM 001199139 NM 001302504 NM 021209NM 001033367RefSeq bilok NP 001186067 NP 001186068 NP 001289433 NP 067032NP 001028539Lokus UCSC Hr 2 32 22 32 27 MbHr 17 74 73 74 77 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MNFIKDNSRALIQRMGMTVIKQITDDLFVWNVLNREEVNIICCEKVEQDA ARGIIHMILKKGSESCNLFLKSLKEWNYPLFQDLNGQSLFHQTSEGDLDD LAQDLKDLYHTPSFLNFYPLGEDIDIIFNLKSTFTEPVLWRKDQHHHRVE QLTLNGLLQALQSPCIIEGESGKGKSTLLQRIAMLWGSGKCKALTKFKFV FFLRLSRAQGGLFETLCDQLLDIPGTIRKQTFMAMLLKLRQRVLFLLDGY NEFKPQNCPEIEALIKENHRFKNMVIVTTTTECLRHIRQFGALTAEVGDM TEDSAQALIREVLIKELAEGLLLQIQKSRCLRNLMKTPLFVVITCAIQMG ESEFHSHTQTTLFHTFYDLLIQKNKHKHKGVAASDFIRSLDHCGDLALEG VFSHKFDFELQDVSSVNEDVLLTTGLLCKYTAQRFKPKYKFFHKSFQEYT AGRRLSSLLTSHEPEEVTKGNGYLQKMVSISDITSTYSSLLRYTCGSSVE ATRAVMKHLAAVYQHGCLLGLSIAKRPLWRQESLQSVKNTTEQEILKAIN INSFVECGIHLYQESTSKSALSQEFEAFFQGKSLYINSGNIPDYLFDFFE HLPNCASALDFIKLDFYGGAMASWEKAAEDTGGIHMEEAPETYIPSRAVS LFFNWKQEFRTLEVTLRDFSKLNKQDIRYLGKIFSSATSLRLQIKRCAGV AGSLSLVLSTCKNIYSLMVEASPLTIEDERHITSVTNLKTLSIHDLQNQR LPGGLTDSLGNLKNLTKLIMDNIKMNEEDAIKLAEGLKNLKKMCLFHLTH LSDIGEGMDYIVKSLSSEPCDLEEIQLVSCCLSANAVKILAQNLHNLVKL SILDLSENYLEKDGNEALHELIDRMNVLEQLTALMLPWGCDVQGSLSSLL KHLEEVPQLVKLGLKNWRLTDTEIRILGAFFGKNPLKNFQQLNLAGNRVS SDGWLAFMGVFENLKQLVFFDFSTKEFLPDPALVRKLSQVLSKLTFLQEA RLVGWQFDDDDLSVITGAFKLVTA A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak apoptoz imunitet vrodzhenij imunitet zapalna vidpovid alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ATF nukleotidami Lokalizovanij u citoplazmi LiteraturaDamiano J S Stehlik C Pio F Godzik A Reed J C 2001 CLAN a novel human CED 4 like gene Genomics 75 77 83 PMID 11472070 DOI 10 1006 geno 2001 6579 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Damiano J S Oliveira V Welsh K Reed J C 2004 Heterotypic interactions among NACHT domains implications for regulation of innate immune responses Biochem J 381 213 219 PMID 15107016 DOI 10 1042 BJ20031506 Kitamura A Sasaki Y Abe T Kano H Yasutomo K 2014 An inherited mutation in NLRC4 causes autoinflammation in human and mice J Exp Med 211 2385 2396 PMID 25385754 DOI 10 1084 jem 20141091PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z NLRC4 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 16412 angl Procitovano 29 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 6 listopada 2012 Procitovano 29 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 2 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi