MBD2 (англ. Methyl-CpG binding domain protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 411 амінокислот, а молекулярна маса — 43 255.
MBD2 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | MBD2, DMTase, NY-CO-41, methyl-CpG binding domain protein 2 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 603547 MGI: 1333813 HomoloGene: 2918 GeneCards: MBD2 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 18: 54.15 – 54.22 Mb | Хр. 18: 70.7 – 70.76 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MRAHPGGGRC | CPEQEEGESA | AGGSGAGGDS | AIEQGGQGSA | LAPSPVSGVR | ||||
REGARGGGRG | RGRWKQAGRG | GGVCGRGRGR | GRGRGRGRGR | GRGRGRPPSG | ||||
GSGLGGDGGG | CGGGGSGGGG | APRREPVPFP | SGSAGPGPRG | PRATESGKRM | ||||
DCPALPPGWK | KEEVIRKSGL | SAGKSDVYYF | SPSGKKFRSK | PQLARYLGNT | ||||
VDLSSFDFRT | GKMMPSKLQK | NKQRLRNDPL | NQNKGKPDLN | TTLPIRQTAS | ||||
IFKQPVTKVT | NHPSNKVKSD | PQRMNEQPRQ | LFWEKRLQGL | SASDVTEQII | ||||
KTMELPKGLQ | GVGPGSNDET | LLSAVASALH | TSSAPITGQV | SAAVEKNPAV | ||||
WLNTSQPLCK | AFIVTDEDIR | KQEERVQQVR | KKLEEALMAD | ILSRAADTEE | ||||
MDIEMDSGDE | A |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Hendrich B., Bird A. (1998). Identification and characterization of a family of mammalian methyl-CpG binding proteins. Mol. Cell. Biol. 18: 6538—6547. PMID 9774669 DOI:10.1128/MCB.18.11.6538
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Bhattacharya S.K., Ramchandani S., Cervoni N., Szyf M. (1999). A mammalian protein with specific demethylase activity for mCpG DNA. Nature. 397: 579—583. PMID 10050851 DOI:10.1038/17533
- Tatematsu K., Yamazaki T., Ishikawa F. (2000). MBD2-MBD3 complex binds to hemi-methylated DNA and forms a complex containing DNMT1 at the replication foci in late S phase. Genes Cells. 5: 677—688. PMID 10947852 DOI:10.1046/j.1365-2443.2000.00359.x
- Boeke J., Ammerpohl O., Kegel S., Moehren U., Renkawitz R. (2000). The minimal repression domain of MBD2b overlaps with the methyl-CpG-binding domain and binds directly to Sin3A. J. Biol. Chem. 275: 34963—34967. PMID 10950960 DOI:10.1074/jbc.M005929200
- Sekimata M., Takahashi A., Murakami-Sekimata A., Homma Y. (2001). Involvement of a novel zinc finger protein, MIZF, in transcriptional repression by interacting with a methyl-CpG-binding protein, MBD2. J. Biol. Chem. 276: 42632—42638. PMID 11553631 DOI:10.1074/jbc.M107048200
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6917 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 31 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
MBD2 angl Methyl CpG binding domain protein 2 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 18 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 411 aminokislot a molekulyarna masa 43 255 MBD2Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2L2LIdentifikatoriSimvoliMBD2 DMTase NY CO 41 methyl CpG binding domain protein 2Zovnishni ID OMIM 603547 MGI 1333813 HomoloGene 2918 GeneCards MBD2Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0000980 RNA polymerase II cis regulatory region sequence specific DNA binding DNA binding protein domain specific binding methyl CpG binding C2H2 zinc finger domain binding chromatin binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding siRNA binding nucleosomal DNA binding satellite DNA binding mRNA bindingKlitinna komponenta citoplazma histone deacetylase complex GO 0035328 Geterohromatin Hromatin klitinne yadro nukleoplazma gialoplazma GO 0009327 protein containing complexBiologichnij proces GO 0009373 regulation of transcription DNA templated GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II transcription DNA templated positive regulation of Wnt signaling pathway regulation of cell population proliferation maternal behavior GO 0045996 negative regulation of transcription DNA templated GO 0010260 starinnya lyudini response to mechanical stimulus response to estradiol GO 1904579 cellular response to organic cyclic compound response to nutrient levels GO 1904578 response to organic cyclic compound positive regulation of chromatin binding heart development embryonic organ development rDNA heterochromatin assembly regulation of DNA methylation DNA methylation dependent heterochromatin assemblyDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez8932 17191Ensembl ENSG00000134046 ENSMUSG00000024513UniProt Q9UBB5 Q9Z2E1RefSeq mRNK NM 015832 NM 003927NM 010773 NM 001311071RefSeq bilok NP 003918 NP 056647 NP 056647 1NP 001298000 NP 034903Lokus UCSC Hr 18 54 15 54 22 MbHr 18 70 7 70 76 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MRAHPGGGRCCPEQEEGESAAGGSGAGGDSAIEQGGQGSALAPSPVSGVR REGARGGGRGRGRWKQAGRGGGVCGRGRGRGRGRGRGRGRGRGRGRPPSG GSGLGGDGGGCGGGGSGGGGAPRREPVPFPSGSAGPGPRGPRATESGKRM DCPALPPGWKKEEVIRKSGLSAGKSDVYYFSPSGKKFRSKPQLARYLGNT VDLSSFDFRTGKMMPSKLQKNKQRLRNDPLNQNKGKPDLNTTLPIRQTAS IFKQPVTKVTNHPSNKVKSDPQRMNEQPRQLFWEKRLQGLSASDVTEQII KTMELPKGLQGVGPGSNDETLLSAVASALHTSSAPITGQVSAAVEKNPAV WLNTSQPLCKAFIVTDEDIRKQEERVQQVRKKLEEALMADILSRAADTEE MDIEMDSGDEA A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z DNK Lokalizovanij u yadri LiteraturaHendrich B Bird A 1998 Identification and characterization of a family of mammalian methyl CpG binding proteins Mol Cell Biol 18 6538 6547 PMID 9774669 DOI 10 1128 MCB 18 11 6538 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Bhattacharya S K Ramchandani S Cervoni N Szyf M 1999 A mammalian protein with specific demethylase activity for mCpG DNA Nature 397 579 583 PMID 10050851 DOI 10 1038 17533 Tatematsu K Yamazaki T Ishikawa F 2000 MBD2 MBD3 complex binds to hemi methylated DNA and forms a complex containing DNMT1 at the replication foci in late S phase Genes Cells 5 677 688 PMID 10947852 DOI 10 1046 j 1365 2443 2000 00359 x Boeke J Ammerpohl O Kegel S Moehren U Renkawitz R 2000 The minimal repression domain of MBD2b overlaps with the methyl CpG binding domain and binds directly to Sin3A J Biol Chem 275 34963 34967 PMID 10950960 DOI 10 1074 jbc M005929200 Sekimata M Takahashi A Murakami Sekimata A Homma Y 2001 Involvement of a novel zinc finger protein MIZF in transcriptional repression by interacting with a methyl CpG binding protein MBD2 J Biol Chem 276 42632 42638 PMID 11553631 DOI 10 1074 jbc M107048200PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 6917 angl Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 31 lipnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 18 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi