LITAF (англ. Lipopolysaccharide induced TNF factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 161 амінокислот, а молекулярна маса — 17 107.
LITAF | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | LITAF, PIG7, SIMPLE, TP53I7, lipopolysaccharide induced TNF factor | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 603795 MGI: 1929512 HomoloGene: 37974 GeneCards: LITAF | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
Charcot-Marie-Tooth disease type 1C | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 16: 11.55 – 11.64 Mb | Хр. 16: 10.78 – 10.88 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSVPGPYQAA | TGPSSAPSAP | PSYEETVAVN | SYYPTPPAPM | PGPTTGLVTG | ||||
PDGKGMNPPS | YYTQPAPIPN | NNPITVQTVY | VQHPITFLDR | PIQMCCPSCN | ||||
KMIVSQLSYN | AGALTWLSCG | SLCLLGCIAG | CCFIPFCVDA | LQDVDHYCPN | ||||
CRALLGTYKR | L |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.
Література
- Polyak K., Xia Y., Zweier J.L., Kinzler K.W., Vogelstein B. (1997). A model for p53-induced apoptosis. Nature. 389: 300—306. PMID 9305847 DOI:10.1038/38525
- Myokai F., Takashiba S., Lebo R., Amar S. (1999). A novel lipopolysaccharide-induced transcription factor regulating tumor necrosis factor alpha gene expression: molecular cloning, sequencing, characterization, and chromosomal assignment. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 4518—4523. PMID 10200294 DOI:10.1073/pnas.96.8.4518
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Shirk A.J., Anderson S.K., Hashemi S.H., Chance P.F., Bennett C.L. (2005). SIMPLE interacts with NEDD4 and TSG101: evidence for a role in lysosomal sorting and implications for Charcot-Marie-Tooth disease. J. Neurosci. Res. 82: 43—50. PMID 16118794 DOI:10.1002/jnr.20628
- Tang X., Marciano D.L., Leeman S.E., Amar S. (2005). LPS induces the interaction of a transcription factor, LPS-induced TNF-alpha factor, and STAT6(B) with effects on multiple cytokines. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 5132—5137. PMID 15793005 DOI:10.1073/pnas.0501159102
- Tang X., Metzger D., Leeman S., Amar S. (2006). LPS-induced TNF-alpha factor (LITAF)-deficient mice express reduced LPS-induced cytokine: Evidence for LITAF-dependent LPS signaling pathways. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 13777—13782. PMID 16954198 DOI:10.1073/pnas.0605988103
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з LITAF переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16841 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 9 жовтня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
LITAF angl Lipopolysaccharide induced TNF factor bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 16 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 161 aminokislot a molekulyarna masa 17 107 LITAFIdentifikatoriSimvoliLITAF PIG7 SIMPLE TP53I7 lipopolysaccharide induced TNF factorZovnishni ID OMIM 603795 MGI 1929512 HomoloGene 37974 GeneCards LITAFPov yazani genetichni zahvoryuvannyaCharcot Marie Tooth disease type 1C Ontologiya genaMolekulyarna funkciya signal transducer activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding WW domain binding zinc ion binding GO 0000980 RNA polymerase II cis regulatory region sequence specific DNA binding GO 0001077 GO 0001212 GO 0001213 GO 0001211 GO 0001205 DNA binding transcription activator activity RNA polymerase II specific DNA binding zv yazuvannya z ionom metaluKlitinna komponenta membrana nukleoplazma lysosomal membrane lizosoma gialoplazma cytoplasmic side of plasma membrane cytoplasmic side of early endosome membrane cytoplasmic side of late endosome membrane cytoplasmic side of lysosomal membrane Golgi membrane klitinne yadro citoplazma endosoma kompleks Goldzhi klitinna membrana endosome membrane early endosome membrane late endosome membrane vnutrishnoklitinna membranna organela integral component of membraneBiologichnij proces GO 0009373 regulation of transcription DNA templated GO 0044324 GO 0003256 GO 1901213 GO 0046019 GO 0046020 GO 1900094 GO 0061216 GO 0060994 GO 1902064 GO 0003258 GO 0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II GO 0010260 starinnya lyudini transcription DNA templated GO 0032657 regulation of cytokine production response to lipopolysaccharide positive regulation of I kappaB kinase NF kappaB signaling cellular response to lipopolysaccharide GO 0072468 signalna transdukciya transcription by RNA polymerase II GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase IIDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez9516 56722Ensembl ENSG00000189067 ENSMUSG00000022500UniProt Q99732 Q9JLJ0RefSeq mRNK NM 001136472 NM 001136473 NM 004862NM 019980RefSeq bilok NP 001129944 NP 001129945 NP 004853NP 064364Lokus UCSC Hr 16 11 55 11 64 MbHr 16 10 78 10 88 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MSVPGPYQAATGPSSAPSAPPSYEETVAVNSYYPTPPAPMPGPTTGLVTG PDGKGMNPPSYYTQPAPIPNNNPITVQTVYVQHPITFLDRPIQMCCPSCN KMIVSQLSYNAGALTWLSCGSLCLLGCIAGCCFIPFCVDALQDVDHYCPN CRALLGTYKRL A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku DNK Lokalizovanij u klitinnij membrani citoplazmi yadri membrani lizosomi aparati goldzhi endosomah LiteraturaPolyak K Xia Y Zweier J L Kinzler K W Vogelstein B 1997 A model for p53 induced apoptosis Nature 389 300 306 PMID 9305847 DOI 10 1038 38525 Myokai F Takashiba S Lebo R Amar S 1999 A novel lipopolysaccharide induced transcription factor regulating tumor necrosis factor alpha gene expression molecular cloning sequencing characterization and chromosomal assignment Proc Natl Acad Sci U S A 96 4518 4523 PMID 10200294 DOI 10 1073 pnas 96 8 4518 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Shirk A J Anderson S K Hashemi S H Chance P F Bennett C L 2005 SIMPLE interacts with NEDD4 and TSG101 evidence for a role in lysosomal sorting and implications for Charcot Marie Tooth disease J Neurosci Res 82 43 50 PMID 16118794 DOI 10 1002 jnr 20628 Tang X Marciano D L Leeman S E Amar S 2005 LPS induces the interaction of a transcription factor LPS induced TNF alpha factor and STAT6 B with effects on multiple cytokines Proc Natl Acad Sci U S A 102 5132 5137 PMID 15793005 DOI 10 1073 pnas 0501159102 Tang X Metzger D Leeman S Amar S 2006 LPS induced TNF alpha factor LITAF deficient mice express reduced LPS induced cytokine Evidence for LITAF dependent LPS signaling pathways Proc Natl Acad Sci U S A 103 13777 13782 PMID 16954198 DOI 10 1073 pnas 0605988103PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z LITAF pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 16841 angl Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 9 zhovtnya 2016 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 16 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi