LIMK1 (англ. LIM domain kinase 1) – білок, який кодується однойменним геномом, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 647 амінокислот, а молекулярна маса — 72 585.
LIMK1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | LIMK1, LIMK, LIMK-1, LIM domain kinase 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 601329 MGI: 104572 HomoloGene: 1738 GeneCards: LIMK1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 7: 74.08 – 74.12 Mb | Хр. 5: 134.68 – 134.72 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MRLTLLCCTW | REERMGEEGS | ELPVCASCGQ | RIYDGQYLQA | LNADWHADCF | ||||
RCCDCSASLS | HQYYEKDGQL | FCKKDYWARY | GESCHGCSEQ | ITKGLVMVAG | ||||
ELKYHPECFI | CLTCGTFIGD | GDTYTLVEHS | KLYCGHCYYQ | TVVTPVIEQI | ||||
LPDSPGSHLP | HTVTLVSIPA | SSHGKRGLSV | SIDPPHGPPG | CGTEHSHTVR | ||||
VQGVDPGCMS | PDVKNSIHVG | DRILEINGTP | IRNVPLDEID | LLIQETSRLL | ||||
QLTLEHDPHD | TLGHGLGPET | SPLSSPAYTP | SGEAGSSARQ | KPVLRSCSID | ||||
RSPGAGSLGS | PASQRKDLGR | SESLRVVCRP | HRIFRPSDLI | HGEVLGKGCF | ||||
GQAIKVTHRE | TGEVMVMKEL | IRFDEETQRT | FLKEVKVMRC | LEHPNVLKFI | ||||
GVLYKDKRLN | FITEYIKGGT | LRGIIKSMDS | QYPWSQRVSF | AKDIASGMAY | ||||
LHSMNIIHRD | LNSHNCLVRE | NKNVVVADFG | LARLMVDEKT | QPEGLRSLKK | ||||
PDRKKRYTVV | GNPYWMAPEM | INGRSYDEKV | DVFSFGIVLC | EIIGRVNADP | ||||
DYLPRTMDFG | LNVRGFLDRY | CPPNCPPSFF | PITVRCCDLD | PEKRPSFVKL | ||||
EHWLETLRMH | LAGHLPLGPQ | LEQLDRGFWE | TYRRGESGLP | AHPEVPD |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Edwards D.C., Gill G.N. (1999). Structural features of LIM kinase that control effects on the actin cytoskeleton. J. Biol. Chem. 274: 11352—11361. PMID 10196227 DOI:10.1074/jbc.274.16.11352
- Edwards D.C., Sanders L.C., Bokoch G.M., Gill G.N. (1999). Activation of LIM-kinase by Pak1 couples Rac/Cdc42 GTPase signalling to actin cytoskeletal dynamics. Nat. Cell Biol. 1: 253—259. PMID 10559936 DOI:10.1038/12963
- Sumi T., Matsumoto K., Shibuya A., Nakamura T. (2001). Activation of LIM kinases by myotonic dystrophy kinase-related Cdc42-binding kinase alpha. J. Biol. Chem. 276: 23092—23096. PMID 11340065 DOI:10.1074/jbc.C100196200
- Dan C., Kelly A., Bernard O., Minden A. (2001). Cytoskeletal changes regulated by the PAK4 serine/threonine kinase are mediated by LIM kinase 1 and cofilin. J. Biol. Chem. 276: 32115—32121. PMID 11413130 DOI:10.1074/jbc.M100871200
- Niwa R., Nagata-Ohashi K., Takeichi M., Mizuno K., Uemura T. (2002). Control of actin reorganization by Slingshot, a family of phosphatases that dephosphorylate ADF/cofilin. Cell. 108: 233—246. PMID 11832213 DOI:10.1016/S0092-8674(01)00638-9
- Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 5 липня 2018. Процитовано 7 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 2 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
LIMK1 angl LIM domain kinase 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genomom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 7 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 647 aminokislot a molekulyarna masa 72 585 LIMK1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB3S95 5L6W 5HVK 5HVJIdentifikatoriSimvoliLIMK1 LIMK LIMK 1 LIM domain kinase 1Zovnishni ID OMIM 601329 MGI 104572 HomoloGene 1738 GeneCards LIMK1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya transferase activity nucleotide binding heat shock protein binding zv yazuvannya z ionom metalu kinase activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding protein heterodimerization activity ATP binding protein kinase activity protein serine threonine kinase activity signal transducer activityKlitinna komponenta membrana focal adhesion citoplazma klitinne yadro kompleks Goldzhi gialoplazma nuclear speck neuron projection lamellipodium cell projectionBiologichnij proces Fc gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis fosforilyuvannya nejrobiologiya rozvitku negative regulation of ubiquitin protein transferase activity Rho protein signal transduction positive regulation of actin filament bundle assembly actin cytoskeleton organization GO 0072468 signalna transdukciya positive regulation of axon extension protein phosphorylation positive regulation of stress fiber assemblyDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez3984 16885Ensembl ENSG00000106683 ENSMUSG00000029674UniProt P53667 P53668RefSeq mRNK NM 016735 NM 001204426 NM 002314NM 010717 NM 001305875RefSeq bilok NP 001191355 NP 002305NP 001292804 NP 034847Lokus UCSC Hr 7 74 08 74 12 MbHr 5 134 68 134 72 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MRLTLLCCTWREERMGEEGSELPVCASCGQRIYDGQYLQALNADWHADCF RCCDCSASLSHQYYEKDGQLFCKKDYWARYGESCHGCSEQITKGLVMVAG ELKYHPECFICLTCGTFIGDGDTYTLVEHSKLYCGHCYYQTVVTPVIEQI LPDSPGSHLPHTVTLVSIPASSHGKRGLSVSIDPPHGPPGCGTEHSHTVR VQGVDPGCMSPDVKNSIHVGDRILEINGTPIRNVPLDEIDLLIQETSRLL QLTLEHDPHDTLGHGLGPETSPLSSPAYTPSGEAGSSARQKPVLRSCSID RSPGAGSLGSPASQRKDLGRSESLRVVCRPHRIFRPSDLIHGEVLGKGCF GQAIKVTHRETGEVMVMKELIRFDEETQRTFLKEVKVMRCLEHPNVLKFI GVLYKDKRLNFITEYIKGGTLRGIIKSMDSQYPWSQRVSFAKDIASGMAY LHSMNIIHRDLNSHNCLVRENKNVVVADFGLARLMVDEKTQPEGLRSLKK PDRKKRYTVVGNPYWMAPEMINGRSYDEKVDVFSFGIVLCEIIGRVNADP DYLPRTMDFGLNVRGFLDRYCPPNCPPSFFPITVRCCDLDPEKRPSFVKL EHWLETLRMHLAGHLPLGPQLEQLDRGFWETYRRGESGLPAHPEVPD A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do transferaz kinaz serin treoninovih proteyinkinaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ATF nukleotidami ionami metaliv ionom cinku Lokalizovanij u citoplazmi yadri LiteraturaEdwards D C Gill G N 1999 Structural features of LIM kinase that control effects on the actin cytoskeleton J Biol Chem 274 11352 11361 PMID 10196227 DOI 10 1074 jbc 274 16 11352 Edwards D C Sanders L C Bokoch G M Gill G N 1999 Activation of LIM kinase by Pak1 couples Rac Cdc42 GTPase signalling to actin cytoskeletal dynamics Nat Cell Biol 1 253 259 PMID 10559936 DOI 10 1038 12963 Sumi T Matsumoto K Shibuya A Nakamura T 2001 Activation of LIM kinases by myotonic dystrophy kinase related Cdc42 binding kinase alpha J Biol Chem 276 23092 23096 PMID 11340065 DOI 10 1074 jbc C100196200 Dan C Kelly A Bernard O Minden A 2001 Cytoskeletal changes regulated by the PAK4 serine threonine kinase are mediated by LIM kinase 1 and cofilin J Biol Chem 276 32115 32121 PMID 11413130 DOI 10 1074 jbc M100871200 Niwa R Nagata Ohashi K Takeichi M Mizuno K Uemura T 2002 Control of actin reorganization by Slingshot a family of phosphatases that dephosphorylate ADF cofilin Cell 108 233 246 PMID 11832213 DOI 10 1016 S0092 8674 01 00638 9 Hillman R T Green R E Brenner S E 2004 An unappreciated role for RNA surveillance Genome Biol 5 R8 1 R8 16 PMID 14759258 DOI 10 1186 gb 2004 5 2 r8PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 5 lipnya 2018 Procitovano 7 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 2 serpnya 2017 Procitovano 7 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 7 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi