Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

LIG3 англ DNA ligase 3 білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі 17 ї хромосоми Дов

LIG3

LIG3

LIG3 (англ. DNA ligase 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 009 амінокислот, а молекулярна маса — 112 907.

LIG3
image
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи LIG3, LIG2, DNA ligase 3, LIG3alpha, MTDPS20
Зовнішні ІД OMIM: 600940 MGI: 109152 HomoloGene: 32109 GeneCards: LIG3
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3980
16882
Ensembl
ENSG00000005156
ENSMUSG00000020697
UniProt
P49916
P97386
RefSeq (мРНК)
NM_002311
NM_013975
NM_001291245
NM_001291246
NM_001291247
NM_010716
RefSeq (білок)
NP_002302
NP_039269
н/д
Локус (UCSC) Хр. 17: 34.98 – 35.01 Mb Хр. 11: 82.67 – 82.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MSLAFKIFFPQTLRALSRKELCLFRKHHWRDVRQFSQWSETDLLHGHPLF
LRRKPVLSFQGSHLRSRATYLVFLPGLHVGLCSGPCEMAEQRFCVDYAKR
GTAGCKKCKEKIVKGVCRIGKVVPNPFSESGGDMKEWYHIKCMFEKLERA
RATTKKIEDLTELEGWEELEDNEKEQITQHIADLSSKAAGTPKKKAVVQA
KLTTTGQVTSPVKGASFVTSTNPRKFSGFSAKPNNSGEAPSSPTPKRSLS
SSKCDPRHKDCLLREFRKLCAMVADNPSYNTKTQIIQDFLRKGSAGDGFH
GDVYLTVKLLLPGVIKTVYNLNDKQIVKLFSRIFNCNPDDMARDLEQGDV
SETIRVFFEQSKSFPPAAKSLLTIQEVDEFLLRLSKLTKEDEQQQALQDI
ASRCTANDLKCIIRLIKHDLKMNSGAKHVLDALDPNAYEAFKASRNLQDV
VERVLHNAQEVEKEPGQRRALSVQASLMTPVQPMLAEACKSVEYAMKKCP
NGMFSEIKYDGERVQVHKNGDHFSYFSRSLKPVLPHKVAHFKDYIPQAFP
GGHSMILDSEVLLIDNKTGKPLPFGTLGVHKKAAFQDANVCLFVFDCIYF
NDVSLMDRPLCERRKFLHDNMVEIPNRIMFSEMKRVTKALDLADMITRVI
QEGLEGLVLKDVKGTYEPGKRHWLKVKKDYLNEGAMADTADLVVLGAFYG
QGSKGGMMSIFLMGCYDPGSQKWCTVTKCAGGHDDATLARLQNELDMVKI
SKDPSKIPSWLKVNKIYYPDFIVPDPKKAAVWEITGAEFSKSEAHTADGI
SIRFPRCTRIRDDKDWKSATNLPQLKELYQLSKEKADFTVVAGDEGSSTT
GGSSEENKGPSGSAVSRKAPSKPSASTKKAEGKLSNSNSKDGNMQTAKPS
AMKVGEKLATKSSPVKVGEKRKAADETLCQTKVLLDIFTGVRLYLPPSTP
DFSRLRRYFVAFDGDLVQEFDMTSATHVLGSRDKNPAAQQVSPEWIWACI
RKRRLVAPC

Кодований геном білок за функціями належить до лігаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, реплікація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, іоном магнію. Локалізований у ядрі, мітохондрії.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Lakshmipathy U., Campbell C. (1999). The human DNA ligase III gene encodes nuclear and mitochondrial proteins. Mol. Cell. Biol. 19: 3869—3876. PMID 10207110 DOI:10.1128/MCB.19.5.3869
  • Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
  • Kulczyk A.W., Yang J.C., Neuhaus D. (2004). Solution structure and DNA binding of the zinc-finger domain from DNA ligase IIIalpha. J. Mol. Biol. 341: 723—738. PMID 15288782 DOI:10.1016/j.jmb.2004.06.035
  • Cuneo M.J., Gabel S.A., Krahn J.M., Ricker M.A., London R.E. (2011). The structural basis for partitioning of the XRCC1/DNA ligase III-? BRCT-mediated dimer complexes. Nucleic Acids Res. 39: 7816—7827. PMID 21652643 DOI:10.1093/nar/gkr419

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. (англ.) . Архів оригіналу за 23 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

LIG3 angl DNA ligase 3 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 17 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 009 aminokislot a molekulyarna masa 112 907 LIG3Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1IMO 1IN1 1UW0 3L2P 3PC7 3PC8 3QVGIdentifikatoriSimvoliLIG3 LIG2 DNA ligase 3 LIG3alpha MTDPS20Zovnishni ID OMIM 600940 MGI 109152 HomoloGene 32109 GeneCards LIG3Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding nucleotide binding zinc ion binding zv yazuvannya z ionom metalu ligase activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding DNA ligase activity ATP binding DNA ligase ATP activityKlitinna komponenta DNA ligase III XRCC1 complex nukleoplazma klitinne yadro mitohondriya citoplazmaBiologichnij proces nucleotide excision repair DNA gap filling DNA recombination lagging strand elongation DNA biosynthetic process mitochondrial DNA repair mitochondrion organization double strand break repair via alternative nonhomologous end joining negative regulation of mitochondrial DNA replication cellular response to DNA damage stimulus podil klitini DNA ligation replikaciya DNK double strand break repair via homologous recombination V D J rekombinaciya DNA ligation involved in DNA repair klitinnij cikl transcription coupled nucleotide excision repair double strand break repair GO 0100026 Reparaciya DNK base excision repair DNA ligationDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez3980 16882Ensembl ENSG00000005156 ENSMUSG00000020697UniProt P49916 P97386RefSeq mRNK NM 002311 NM 013975NM 001291245 NM 001291246 NM 001291247 NM 010716RefSeq bilok NP 002302 NP 039269n dLokus UCSC Hr 17 34 98 35 01 MbHr 11 82 67 82 7 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MSLAFKIFFPQTLRALSRKELCLFRKHHWRDVRQFSQWSETDLLHGHPLF LRRKPVLSFQGSHLRSRATYLVFLPGLHVGLCSGPCEMAEQRFCVDYAKR GTAGCKKCKEKIVKGVCRIGKVVPNPFSESGGDMKEWYHIKCMFEKLERA RATTKKIEDLTELEGWEELEDNEKEQITQHIADLSSKAAGTPKKKAVVQA KLTTTGQVTSPVKGASFVTSTNPRKFSGFSAKPNNSGEAPSSPTPKRSLS SSKCDPRHKDCLLREFRKLCAMVADNPSYNTKTQIIQDFLRKGSAGDGFH GDVYLTVKLLLPGVIKTVYNLNDKQIVKLFSRIFNCNPDDMARDLEQGDV SETIRVFFEQSKSFPPAAKSLLTIQEVDEFLLRLSKLTKEDEQQQALQDI ASRCTANDLKCIIRLIKHDLKMNSGAKHVLDALDPNAYEAFKASRNLQDV VERVLHNAQEVEKEPGQRRALSVQASLMTPVQPMLAEACKSVEYAMKKCP NGMFSEIKYDGERVQVHKNGDHFSYFSRSLKPVLPHKVAHFKDYIPQAFP GGHSMILDSEVLLIDNKTGKPLPFGTLGVHKKAAFQDANVCLFVFDCIYF NDVSLMDRPLCERRKFLHDNMVEIPNRIMFSEMKRVTKALDLADMITRVI QEGLEGLVLKDVKGTYEPGKRHWLKVKKDYLNEGAMADTADLVVLGAFYG QGSKGGMMSIFLMGCYDPGSQKWCTVTKCAGGHDDATLARLQNELDMVKI SKDPSKIPSWLKVNKIYYPDFIVPDPKKAAVWEITGAEFSKSEAHTADGI SIRFPRCTRIRDDKDWKSATNLPQLKELYQLSKEKADFTVVAGDEGSSTT GGSSEENKGPSGSAVSRKAPSKPSASTKKAEGKLSNSNSKDGNMQTAKPS AMKVGEKLATKSSPVKVGEKRKAADETLCQTKVLLDIFTGVRLYLPPSTP DFSRLRRYFVAFDGDLVQEFDMTSATHVLGSRDKNPAAQQVSPEWIWACI RKRRLVAPC A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do ligaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak klitinnij cikl podil klitini poshkodzhennya DNK reparaciya DNK rekombinaciya DNK replikaciya DNK alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ATF nukleotidami ionami metaliv ionom cinku ionom magniyu Lokalizovanij u yadri mitohondriyi LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Lakshmipathy U Campbell C 1999 The human DNA ligase III gene encodes nuclear and mitochondrial proteins Mol Cell Biol 19 3869 3876 PMID 10207110 DOI 10 1128 MCB 19 5 3869 Beausoleil S A Villen J Gerber S A Rush J Gygi S P 2006 A probability based approach for high throughput protein phosphorylation analysis and site localization Nat Biotechnol 24 1285 1292 PMID 16964243 DOI 10 1038 nbt1240 Kulczyk A W Yang J C Neuhaus D 2004 Solution structure and DNA binding of the zinc finger domain from DNA ligase IIIalpha J Mol Biol 341 723 738 PMID 15288782 DOI 10 1016 j jmb 2004 06 035 Cuneo M J Gabel S A Krahn J M Ricker M A London R E 2011 The structural basis for partitioning of the XRCC1 DNA ligase III BRCT mediated dimer complexes Nucleic Acids Res 39 7816 7827 PMID 21652643 DOI 10 1093 nar gkr419PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 23 travnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 22 serpnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 17 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ