Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

LIG1 англ DNA ligase 1 білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі 19 ї хромосоми Дов

LIG1

LIG1

LIG1 (англ. DNA ligase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 919 амінокислот, а молекулярна маса — 101 736.

LIG1
image
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи LIG1, DNA ligase 1, LIGI, hLig1, IMD96
Зовнішні ІД OMIM: 126391 MGI: 101789 HomoloGene: 197 GeneCards: LIG1
Шаблон експресії
image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3978
16881
Ensembl
ENSG00000105486
ENSMUSG00000056394
UniProt
P18858
P37913
RefSeq (мРНК)
NM_000234
NM_001289063
NM_001289064
NM_001320970
NM_001320971
NM_001083188
NM_001199310
NM_010715
RefSeq (білок)
NP_000225
NP_001275992
NP_001275993
NP_001307899
NP_001307900
NP_001076657
NP_001186239
NP_034845
Локус (UCSC) Хр. 19: 48.12 – 48.17 Mb Хр. 7: 13.01 – 13.05 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MQRSIMSFFHPKKEGKAKKPEKEASNSSRETEPPPKAALKEWNGVVSESD
SPVKRPGRKAARVLGSEGEEEDEALSPAKGQKPALDCSQVSPPRPATSPE
NNASLSDTSPMDSSPSGIPKRRTARKQLPKRTIQEVLEEQSEDEDREAKR
KKEEEEEETPKESLTEAEVATEKEGEDGDQPTTPPKPLKTSKAETPTESV
SEPEVATKQELQEEEEQTKPPRRAPKTLSSFFTPRKPAVKKEVKEEEPGA
PGKEGAAEGPLDPSGYNPAKNNYHPVEDACWKPGQKVPYLAVARTFEKIE
EVSARLRMVETLSNLLRSVVALSPPDLLPVLYLSLNHLGPPQQGLELGVG
DGVLLKAVAQATGRQLESVRAEAAEKGDVGLVAENSRSTQRLMLPPPPLT
ASGVFSKFRDIARLTGSASTAKKIDIIKGLFVACRHSEARFIARSLSGRL
RLGLAEQSVLAALSQAVSLTPPGQEFPPAMVDAGKGKTAEARKTWLEEQG
MILKQTFCEVPDLDRIIPVLLEHGLERLPEHCKLSPGIPLKPMLAHPTRG
ISEVLKRFEEAAFTCEYKYDGQRAQIHALEGGEVKIFSRNQEDNTGKYPD
IISRIPKIKLPSVTSFILDTEAVAWDREKKQIQPFQVLTTRKRKEVDASE
IQVQVCLYAFDLIYLNGESLVREPLSRRRQLLRENFVETEGEFVFATSLD
TKDIEQIAEFLEQSVKDSCEGLMVKTLDVDATYEIAKRSHNWLKLKKDYL
DGVGDTLDLVVIGAYLGRGKRAGRYGGFLLASYDEDSEELQAICKLGTGF
SDEELEEHHQSLKALVLPSPRPYVRIDGAVIPDHWLDPSAVWEVKCADLS
LSPIYPAARGLVDSDKGISLRFPRFIRVREDKQPEQATTSAQVACLYRKQ
SQIQNQQGEDSGSDPEDTY

Кодований геном білок за функціями належить до лігаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, реплікація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном магнію. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Petrini J.H.J., Huwiler K.G., Weaver D.T. (1991). A wild-type DNA ligase I gene is expressed in Bloom's syndrome cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 7615—7619. PMID 1881902 DOI:10.1073/pnas.88.17.7615
  • Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
  • Pascal J.M., O'Brien P.J., Tomkinson A.E., Ellenberger T. (2004). Human DNA ligase I completely encircles and partially unwinds nicked DNA. Nature. 432: 473—478. PMID 15565146 DOI:10.1038/nature03082
  • Barnes D.E., Tomkinson A.E., Lehmann A.R., Webster A.D.B., Lindahl T. (1992). Mutations in the DNA ligase I gene of an individual with immunodeficiencies and cellular hypersensitivity to DNA-damaging agents. Cell. 69: 495—503. PMID 1581963 DOI:10.1016/0092-8674(92)90450-Q

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6598 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 19 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

LIG1 angl DNA ligase 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 19 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 919 aminokislot a molekulyarna masa 101 736 LIG1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1X9NIdentifikatoriSimvoliLIG1 DNA ligase 1 LIGI hLig1 IMD96Zovnishni ID OMIM 126391 MGI 101789 HomoloGene 197 GeneCards LIG1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding nucleotide binding DNA ligase ATP activity zv yazuvannya z ionom metalu ligase activity ATP binding DNA ligase activityKlitinna komponenta vnutrishnoklitinna membranna organela nukleoplazma mitohondriya klitinne yadro citoplazmaBiologichnij proces nucleotide excision repair DNA gap filling DNA recombination DNA biosynthetic process anatomical structure morphogenesis Okazaki fragment processing involved in mitotic DNA replication cellular response to DNA damage stimulus podil klitini replikaciya DNK V D J rekombinaciya DNA mismatch repair DNA ligation involved in DNA repair klitinnij cikl transcription coupled nucleotide excision repair GO 0100026 Reparaciya DNK base excision repair DNA ligation lagging strand elongationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez3978 16881Ensembl ENSG00000105486 ENSMUSG00000056394UniProt P18858 P37913RefSeq mRNK NM 000234 NM 001289063 NM 001289064 NM 001320970 NM 001320971NM 001083188 NM 001199310 NM 010715RefSeq bilok NP 000225 NP 001275992 NP 001275993 NP 001307899 NP 001307900NP 001076657 NP 001186239 NP 034845Lokus UCSC Hr 19 48 12 48 17 MbHr 7 13 01 13 05 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MQRSIMSFFHPKKEGKAKKPEKEASNSSRETEPPPKAALKEWNGVVSESD SPVKRPGRKAARVLGSEGEEEDEALSPAKGQKPALDCSQVSPPRPATSPE NNASLSDTSPMDSSPSGIPKRRTARKQLPKRTIQEVLEEQSEDEDREAKR KKEEEEEETPKESLTEAEVATEKEGEDGDQPTTPPKPLKTSKAETPTESV SEPEVATKQELQEEEEQTKPPRRAPKTLSSFFTPRKPAVKKEVKEEEPGA PGKEGAAEGPLDPSGYNPAKNNYHPVEDACWKPGQKVPYLAVARTFEKIE EVSARLRMVETLSNLLRSVVALSPPDLLPVLYLSLNHLGPPQQGLELGVG DGVLLKAVAQATGRQLESVRAEAAEKGDVGLVAENSRSTQRLMLPPPPLT ASGVFSKFRDIARLTGSASTAKKIDIIKGLFVACRHSEARFIARSLSGRL RLGLAEQSVLAALSQAVSLTPPGQEFPPAMVDAGKGKTAEARKTWLEEQG MILKQTFCEVPDLDRIIPVLLEHGLERLPEHCKLSPGIPLKPMLAHPTRG ISEVLKRFEEAAFTCEYKYDGQRAQIHALEGGEVKIFSRNQEDNTGKYPD IISRIPKIKLPSVTSFILDTEAVAWDREKKQIQPFQVLTTRKRKEVDASE IQVQVCLYAFDLIYLNGESLVREPLSRRRQLLRENFVETEGEFVFATSLD TKDIEQIAEFLEQSVKDSCEGLMVKTLDVDATYEIAKRSHNWLKLKKDYL DGVGDTLDLVVIGAYLGRGKRAGRYGGFLLASYDEDSEELQAICKLGTGF SDEELEEHHQSLKALVLPSPRPYVRIDGAVIPDHWLDPSAVWEVKCADLS LSPIYPAARGLVDSDKGISLRFPRFIRVREDKQPEQATTSAQVACLYRKQ SQIQNQQGEDSGSDPEDTY A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do ligaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak klitinnij cikl podil klitini poshkodzhennya DNK reparaciya DNK rekombinaciya DNK replikaciya DNK acetilyuvannya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ATF nukleotidami ionami metaliv ionom magniyu Lokalizovanij u yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Petrini J H J Huwiler K G Weaver D T 1991 A wild type DNA ligase I gene is expressed in Bloom s syndrome cells Proc Natl Acad Sci U S A 88 7615 7619 PMID 1881902 DOI 10 1073 pnas 88 17 7615 Beausoleil S A Villen J Gerber S A Rush J Gygi S P 2006 A probability based approach for high throughput protein phosphorylation analysis and site localization Nat Biotechnol 24 1285 1292 PMID 16964243 DOI 10 1038 nbt1240 Pascal J M O Brien P J Tomkinson A E Ellenberger T 2004 Human DNA ligase I completely encircles and partially unwinds nicked DNA Nature 432 473 478 PMID 15565146 DOI 10 1038 nature03082 Barnes D E Tomkinson A E Lehmann A R Webster A D B Lindahl T 1992 Mutations in the DNA ligase I gene of an individual with immunodeficiencies and cellular hypersensitivity to DNA damaging agents Cell 69 495 503 PMID 1581963 DOI 10 1016 0092 8674 92 90450 QPrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 6598 angl Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 19 lipnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 19 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ