Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

KDM1A англ Lysine demethylase 1A білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі 1 ї хром

KDM1A

KDM1A

KDM1A (англ. Lysine demethylase 1A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 852 амінокислот, а молекулярна маса — 92 903.

KDM1A
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи KDM1A, AOF2, BHC110, KDM1, LSD1, CPRF, lysine demethylase 1A
Зовнішні ІД OMIM: 609132 MGI: 1196256 HomoloGene: 32240 GeneCards: KDM1A
Пов'язані генетичні захворювання
palatal anomalies-widely spaced teeth-facial dysmorphism-developmental delay syndrome
Реагує на сполуку
транілципропромін, bomedemstat
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
23028
99982
Ensembl
ENSG00000004487
ENSMUSG00000036940
UniProt
O60341
Q6ZQ88
RefSeq (мРНК)
NM_001009999
NM_015013
NM_001363654
NM_133872
NM_001347221
NM_001356567
RefSeq (білок)
NP_001009999
NP_055828
NP_001350583
NP_001334150
NP_598633
NP_001343496
Локус (UCSC) Хр. 1: 23.02 – 23.08 Mb Хр. 4: 136.28 – 136.33 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MLSGKKAAAAAAAAAAAATGTEAGPGTAGGSENGSEVAAQPAGLSGPAEV
GPGAVGERTPRKKEPPRASPPGGLAEPPGSAGPQAGPTVVPGSATPMETG
IAETPEGRRTSRRKRAKVEYREMDESLANLSEDEYYSEEERNAKAEKEKK
LPPPPPQAPPEEENESEPEEPSGVEGAAFQSRLPHDRMTSQEAACFPDII
SGPQQTQKVFLFIRNRTLQLWLDNPKIQLTFEATLQQLEAPYNSDTVLVH
RVHSYLERHGLINFGIYKRIKPLPTKKTGKVIIIGSGVSGLAAARQLQSF
GMDVTLLEARDRVGGRVATFRKGNYVADLGAMVVTGLGGNPMAVVSKQVN
MELAKIKQKCPLYEANGQAVPKEKDEMVEQEFNRLLEATSYLSHQLDFNV
LNNKPVSLGQALEVVIQLQEKHVKDEQIEHWKKIVKTQEELKELLNKMVN
LKEKIKELHQQYKEASEVKPPRDITAEFLVKSKHRDLTALCKEYDELAET
QGKLEEKLQELEANPPSDVYLSSRDRQILDWHFANLEFANATPLSTLSLK
HWDQDDDFEFTGSHLTVRNGYSCVPVALAEGLDIKLNTAVRQVRYTASGC
EVIAVNTRSTSQTFIYKCDAVLCTLPLGVLKQQPPAVQFVPPLPEWKTSA
VQRMGFGNLNKVVLCFDRVFWDPSVNLFGHVGSTTASRGELFLFWNLYKA
PILLALVAGEAAGIMENISDDVIVGRCLAILKGIFGSSAVPQPKETVVSR
WRADPWARGSYSYVAAGSSGNDYDLMAQPITPGPSIPGAPQPIPRLFFAG
EHTIRNYPATVHGALLSGLREAGRIADQFLGAMYTLPRQATPGVPAQQSP
SM

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, репресорів, , , фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ФАД, флавопротеїном. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Hakimi M.-A., Dong Y., Lane W.S., Speicher D.W., Shiekhattar R. (2003). A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes. J. Biol. Chem. 278: 7234—7239. PMID 12493763 DOI:10.1074/jbc.M208992200
  • Forneris F., Binda C., Vanoni M.A., Mattevi A., Battaglioli E. (2005). Histone demethylation catalysed by LSD1 is a flavin-dependent oxidative process. FEBS Lett. 579: 2203—2207. PMID 15811342 DOI:10.1016/j.febslet.2005.03.015
  • Lee M.G., Wynder C., Cooch N., Shiekhattar R. (2005). An essential role for CoREST in nucleosomal histone 3 lysine 4 demethylation. Nature. 437: 432—435. PMID 16079794 DOI:10.1038/nature04021
  • Forneris F., Binda C., Vanoni M.A., Battaglioli E., Mattevi A. (2005). Human histone demethylase LSD1 reads the histone code. J. Biol. Chem. 280: 41360—41365. PMID 16223729 DOI:10.1074/jbc.M509549200
  • Lin T., Ponn A., Hu X., Law B.K., Lu J. (2010). Requirement of the histone demethylase LSD1 in Snai1-mediated transcriptional repression during epithelial-mesenchymal transition. Oncogene. 29: 4896—4904. PMID 20562920 DOI:10.1038/onc.2010.234

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з KDM1A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з lysine demethylase 1A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. (англ.) . Архів оригіналу за 7 червня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
  6. (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

KDM1A angl Lysine demethylase 1A bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 1 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 852 aminokislot a molekulyarna masa 92 903 KDM1ANayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2COM 2DW4 2EJR 2H94 2HKO 2IW5 2L3D 2UXN 2UXX 2V1D 2X0L 2XAF 2XAG 2XAH 2XAJ 2XAQ 2XAS 2Y48 2Z3Y 2Z5U 3ABT 3ZMS 3ZMT 3ZMU 3ZMV 3ZMZ 3ZN0 3ZN1 4BAY 4CZZ 4KUM 4UV8 4UV9 4UVA 4UVB 4UVC 4UXN 5AFW 5L3D 5L3B 5IT3 5L3C 4XBFIdentifikatoriSimvoliKDM1A AOF2 BHC110 KDM1 LSD1 CPRF lysine demethylase 1AZovnishni ID OMIM 609132 MGI 1196256 HomoloGene 32240 GeneCards KDM1APov yazani genetichni zahvoryuvannyapalatal anomalies widely spaced teeth facial dysmorphism developmental delay syndrome Reaguye na spolukutranilcipropromin bomedemstat Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding telomeric repeat containing RNA binding demethylase activity telomeric DNA binding flavin adenine dinucleotide binding p53 binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding androgen receptor binding nuclear receptor coactivator activity histone H3 methyl lysine 4 demethylase activity oxidoreductase activity chromatin binding histone deacetylase activity histone demethylase activity enzyme binding MRF binding transcription factor binding histone H3 methyl lysine 9 demethylase activityKlitinna komponenta DNA repair complex nukleoplazma klitinne yadro transcription regulator complex GO 0009327 protein containing complexBiologichnij proces GO 0009373 regulation of transcription DNA templated negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator regulation of double strand break repair via homologous recombination cellular response to UV histone H3 K4 demethylation GO 0044324 GO 0003256 GO 1901213 GO 0046019 GO 0046020 GO 1900094 GO 0061216 GO 0060994 GO 1902064 GO 0003258 GO 0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II negative regulation of DNA binding protein demethylation positive regulation of DNA binding transcription factor activity zsidannya krovi negative regulation of protein binding negative regulation of DNA binding transcription factor activity transcription DNA templated multicellular organism development negative regulation of DNA damage response signal transduction by p53 class mediator positive regulation of histone ubiquitination cellular response to gamma radiation GO 0045996 negative regulation of transcription DNA templated GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Alternativnij splajsing cerebral cortex development positive regulation of cell size GO 1904578 response to organic cyclic compound guanine metabolic process cellular response to cAMP positive regulation of chromatin binding histone deacetylation positive regulation of neuron projection development neuron maturation response to fungicide GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II histone H3 K9 demethylation muscle cell development GO 0031497 GO 0006336 GO 0034724 GO 0001301 GO 0007580 GO 0034652 GO 0010847 chromatin organization positive regulation of neuroblast proliferation negative regulation of histone H3 K4 methylation negative regulation of histone H3 K9 methylation positive regulation of cold induced thermogenesis positive regulation of neural precursor cell proliferation positive regulation of stem cell proliferationDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez23028 99982Ensembl ENSG00000004487 ENSMUSG00000036940UniProt O60341 Q6ZQ88RefSeq mRNK NM 001009999 NM 015013 NM 001363654NM 133872 NM 001347221 NM 001356567RefSeq bilok NP 001009999 NP 055828 NP 001350583NP 001334150 NP 598633 NP 001343496Lokus UCSC Hr 1 23 02 23 08 MbHr 4 136 28 136 33 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MLSGKKAAAAAAAAAAAATGTEAGPGTAGGSENGSEVAAQPAGLSGPAEV GPGAVGERTPRKKEPPRASPPGGLAEPPGSAGPQAGPTVVPGSATPMETG IAETPEGRRTSRRKRAKVEYREMDESLANLSEDEYYSEEERNAKAEKEKK LPPPPPQAPPEEENESEPEEPSGVEGAAFQSRLPHDRMTSQEAACFPDII SGPQQTQKVFLFIRNRTLQLWLDNPKIQLTFEATLQQLEAPYNSDTVLVH RVHSYLERHGLINFGIYKRIKPLPTKKTGKVIIIGSGVSGLAAARQLQSF GMDVTLLEARDRVGGRVATFRKGNYVADLGAMVVTGLGGNPMAVVSKQVN MELAKIKQKCPLYEANGQAVPKEKDEMVEQEFNRLLEATSYLSHQLDFNV LNNKPVSLGQALEVVIQLQEKHVKDEQIEHWKKIVKTQEELKELLNKMVN LKEKIKELHQQYKEASEVKPPRDITAEFLVKSKHRDLTALCKEYDELAET QGKLEEKLQELEANPPSDVYLSSRDRQILDWHFANLEFANATPLSTLSLK HWDQDDDFEFTGSHLTVRNGYSCVPVALAEGLDIKLNTAVRQVRYTASGC EVIAVNTRSTSQTFIYKCDAVLCTLPLGVLKQQPPAVQFVPPLPEWKTSA VQRMGFGNLNKVVLCFDRVFWDPSVNLFGHVGSTTASRGELFLFWNLYKA PILLALVAGEAAGIMENISDDVIVGRCLAILKGIFGSSAVPQPKETVVSR WRADPWARGSYSYVAAGSSGNDYDLMAQPITPGPSIPGAPQPIPRLFFAG EHTIRNYPATVHGALLSGLREAGRIADQFLGAMYTLPRQATPGVPAQQSP SM A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do oksidoreduktaz represoriv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z FAD flavoproteyinom Lokalizovanij u yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Hakimi M A Dong Y Lane W S Speicher D W Shiekhattar R 2003 A candidate X linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase containing complexes J Biol Chem 278 7234 7239 PMID 12493763 DOI 10 1074 jbc M208992200 Forneris F Binda C Vanoni M A Mattevi A Battaglioli E 2005 Histone demethylation catalysed by LSD1 is a flavin dependent oxidative process FEBS Lett 579 2203 2207 PMID 15811342 DOI 10 1016 j febslet 2005 03 015 Lee M G Wynder C Cooch N Shiekhattar R 2005 An essential role for CoREST in nucleosomal histone 3 lysine 4 demethylation Nature 437 432 435 PMID 16079794 DOI 10 1038 nature04021 Forneris F Binda C Vanoni M A Battaglioli E Mattevi A 2005 Human histone demethylase LSD1 reads the histone code J Biol Chem 280 41360 41365 PMID 16223729 DOI 10 1074 jbc M509549200 Lin T Ponn A Hu X Law B K Lu J 2010 Requirement of the histone demethylase LSD1 in Snai1 mediated transcriptional repression during epithelial mesenchymal transition Oncogene 29 4896 4904 PMID 20562920 DOI 10 1038 onc 2010 234PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z KDM1A pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Spoluki yaki fizichno vzayemodiyut z lysine demethylase 1A pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 7 chervnya 2017 Procitovano 28 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 7 zhovtnya 2017 Procitovano 28 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 1 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ