IRF5 (англ. Interferon regulatory factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 498 амінокислот, а молекулярна маса — 56 044.
IRF5 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | IRF5, SLEB10, interferon regulatory factor 5 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 607218 MGI: 1350924 HomoloGene: 8088 GeneCards: IRF5 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
ревматоїдний артрит, inflammatory bowel disease 14 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 7: 128.94 – 128.95 Mb | Хр. 6: 29.53 – 29.54 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MNQSIPVAPT | PPRRVRLKPW | LVAQVNSCQY | PGLQWVNGEK | KLFCIPWRHA | ||||
TRHGPSQDGD | NTIFKAWAKE | TGKYTEGVDE | ADPAKWKANL | RCALNKSRDF | ||||
RLIYDGPRDM | PPQPYKIYEV | CSNGPAPTDS | QPPEDYSFGA | GEEEEEEEEL | ||||
QRMLPSLSLT | EDVKWPPTLQ | PPTLRPPTLQ | PPTLQPPVVL | GPPAPDPSPL | ||||
APPPGNPAGF | RELLSEVLEP | GPLPASLPPA | GEQLLPDLLI | SPHMLPLTDL | ||||
EIKFQYRGRP | PRALTISNPH | GCRLFYSQLE | ATQEQVELFG | PISLEQVRFP | ||||
SPEDIPSDKQ | RFYTNQLLDV | LDRGLILQLQ | GQDLYAIRLC | QCKVFWSGPC | ||||
ASAHDSCPNP | IQREVKTKLF | SLEHFLNELI | LFQKGQTNTP | PPFEIFFCFG | ||||
EEWPDRKPRE | KKLITVQVVP | VAARLLLEMF | SGELSWSADS | IRLQISNPDL | ||||
KDRMVEQFKE | LHHIWQSQQR | LQPVAQAPPG | AGLGVGQGPW | PMHPAGMQ |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Barnes B.J., Moore P.A., Pitha P.M. (2001). Virus-specific activation of a novel interferon regulatory factor, IRF-5, results in the induction of distinct interferon alpha genes. J. Biol. Chem. 276: 23382—23390. PMID 11303025 DOI:10.1074/jbc.M101216200
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Barnes B.J., Kellum M.J., Field A.E., Pitha P.M. (2002). Multiple regulatory domains of IRF-5 control activation, cellular localization, and induction of chemokines that mediate recruitment of T lymphocytes. Mol. Cell. Biol. 22: 5721—5740. PMID 12138184 DOI:10.1128/MCB.22.16.5721-5740.2002
- Lin R., Yang L., Arguello M., Penafuerte C., Hiscott J. (2005). A CRM1-dependent nuclear export pathway is involved in the regulation of IRF-5 subcellular localization. J. Biol. Chem. 280: 3088—3095. PMID 15556946 DOI:10.1074/jbc.M408452200
- Balkhi M.Y., Fitzgerald K.A., Pitha P.M. (2008). Functional regulation of MyD88-activated interferon regulatory factor 5 by K63-linked polyubiquitination. Mol. Cell. Biol. 28: 7296—7308. PMID 18824541 DOI:10.1128/MCB.00662-08
- Chang Foreman H.C., Van Scoy S., Cheng T.F., Reich N.C. (2012). Activation of interferon regulatory factor 5 by site specific phosphorylation. PLoS ONE. 7: E33098—E33098. PMID 22412986 DOI:10.1371/journal.pone.0033098
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з IRF5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6120 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 15 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
IRF5 angl Interferon regulatory factor 5 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 7 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 498 aminokislot a molekulyarna masa 56 044 IRF5Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB3DSHIdentifikatoriSimvoliIRF5 SLEB10 interferon regulatory factor 5Zovnishni ID OMIM 607218 MGI 1350924 HomoloGene 8088 GeneCards IRF5Pov yazani genetichni zahvoryuvannyarevmatoyidnij artrit inflammatory bowel disease 14 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding GO 0001131 GO 0001151 GO 0001130 GO 0001204 DNA binding transcription factor activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding GO 0001077 GO 0001212 GO 0001213 GO 0001211 GO 0001205 DNA binding transcription activator activity RNA polymerase II specific sequence specific DNA binding identical protein binding GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specificKlitinna komponenta citoplazma gialoplazma klitinne yadroBiologichnij proces GO 0009373 regulation of transcription DNA templated positive regulation of interleukin 12 production interferon gamma mediated signaling pathway proces imunnoyi sistemi GO 0044324 GO 0003256 GO 1901213 GO 0046019 GO 0046020 GO 1900094 GO 0061216 GO 0060994 GO 1902064 GO 0003258 GO 0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II positive regulation of interferon alpha production response to muramyl dipeptide transcription DNA templated defense response to virus type I interferon signaling pathway response to peptidoglycan positive regulation of apoptotic process vrodzhenij imunitet GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II positive regulation of interferon beta production cytokine mediated signaling pathway transcription by RNA polymerase IIDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez3663 27056Ensembl ENSG00000128604 ENSMUSG00000029771UniProt Q13568 P56477RefSeq mRNK NM 001098627 NM 001098629 NM 001098630 NM 001242452 NM 032643NM 001347928 NM 001364314NM 001252382 NM 012057 NM 001311083RefSeq bilok NP 001092097 NP 001092099 NP 001092100 NP 001229381 NP 116032NP 001334857 NP 001351243 NP 001092099 1NP 001239311 NP 001298012 NP 036187Lokus UCSC Hr 7 128 94 128 95 MbHr 6 29 53 29 54 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MNQSIPVAPTPPRRVRLKPWLVAQVNSCQYPGLQWVNGEKKLFCIPWRHA TRHGPSQDGDNTIFKAWAKETGKYTEGVDEADPAKWKANLRCALNKSRDF RLIYDGPRDMPPQPYKIYEVCSNGPAPTDSQPPEDYSFGAGEEEEEEEEL QRMLPSLSLTEDVKWPPTLQPPTLRPPTLQPPTLQPPVVLGPPAPDPSPL APPPGNPAGFRELLSEVLEPGPLPASLPPAGEQLLPDLLISPHMLPLTDL EIKFQYRGRPPRALTISNPHGCRLFYSQLEATQEQVELFGPISLEQVRFP SPEDIPSDKQRFYTNQLLDVLDRGLILQLQGQDLYAIRLCQCKVFWSGPC ASAHDSCPNPIQREVKTKLFSLEHFLNELILFQKGQTNTPPPFEIFFCFG EEWPDRKPREKKLITVQVVPVAARLLLEMFSGELSWSADSIRLQISNPDL KDRMVEQFKELHHIWQSQQRLQPVAQAPPGAGLGVGQGPWPMHPAGMQ A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak imunitet vrodzhenij imunitet transkripciya regulyaciya transkripciyi protivirusnij zahist alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z DNK Lokalizovanij u citoplazmi yadri LiteraturaBarnes B J Moore P A Pitha P M 2001 Virus specific activation of a novel interferon regulatory factor IRF 5 results in the induction of distinct interferon alpha genes J Biol Chem 276 23382 23390 PMID 11303025 DOI 10 1074 jbc M101216200 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Barnes B J Kellum M J Field A E Pitha P M 2002 Multiple regulatory domains of IRF 5 control activation cellular localization and induction of chemokines that mediate recruitment of T lymphocytes Mol Cell Biol 22 5721 5740 PMID 12138184 DOI 10 1128 MCB 22 16 5721 5740 2002 Lin R Yang L Arguello M Penafuerte C Hiscott J 2005 A CRM1 dependent nuclear export pathway is involved in the regulation of IRF 5 subcellular localization J Biol Chem 280 3088 3095 PMID 15556946 DOI 10 1074 jbc M408452200 Balkhi M Y Fitzgerald K A Pitha P M 2008 Functional regulation of MyD88 activated interferon regulatory factor 5 by K63 linked polyubiquitination Mol Cell Biol 28 7296 7308 PMID 18824541 DOI 10 1128 MCB 00662 08 Chang Foreman H C Van Scoy S Cheng T F Reich N C 2012 Activation of interferon regulatory factor 5 by site specific phosphorylation PLoS ONE 7 E33098 E33098 PMID 22412986 DOI 10 1371 journal pone 0033098PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z IRF5 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 6120 angl Procitovano 7 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 15 travnya 2017 Procitovano 7 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 7 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi