HNRNPA1 (англ. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 372 амінокислот, а молекулярна маса — 38 747.
HNRNPA1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | HNRNPA1, ALS19, ALS20, HNRPA1, HNRPA1L3, IBMPFD3, hnRNP A1, hnRNP-A1, UP 1, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 164017 HomoloGene: 134664 GeneCards: HNRNPA1 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
amyotrophic lateral sclerosis type 20 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | н/д | н/д | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSKSESPKEP | EQLRKLFIGG | LSFETTDESL | RSHFEQWGTL | TDCVVMRDPN | ||||
TKRSRGFGFV | TYATVEEVDA | AMNARPHKVD | GRVVEPKRAV | SREDSQRPGA | ||||
HLTVKKIFVG | GIKEDTEEHH | LRDYFEQYGK | IEVIEIMTDR | GSGKKRGFAF | ||||
VTFDDHDSVD | KIVIQKYHTV | NGHNCEVRKA | LSKQEMASAS | SSQRGRSGSG | ||||
NFGGGRGGGF | GGNDNFGRGG | NFSGRGGFGG | SRGGGGYGGS | GDGYNGFGND | ||||
GGYGGGGPGY | SGGSRGYGSG | GQGYGNQGSG | YGGSGSYDSY | NNGGGGGFGG | ||||
GSGSNFGGGG | SYNDFGNYNN | QSSNFGPMKG | GNFGGRSSGP | YGGGGQYFAK | ||||
PRNQGGYGGS | SSSSSYGSGR | RF |
Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транспорт, транспорт мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Siomi H., Dreyfuss G. (1995). A nuclear localization domain in the hnRNP A1 protein. J. Cell Biol. 129: 551—560. PMID 7730395 DOI:10.1083/jcb.129.3.551
- Michael W.M., Choi M., Dreyfuss G. (1995). A nuclear export signal in hnRNP A1: a signal-mediated, temperature-dependent nuclear protein export pathway. Cell. 83: 415—422. PMID 8521471 DOI:10.1016/0092-8674(95)90119-1
- Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
- Ong S.E., Mittler G., Mann M. (2004). Identifying and quantifying in vivo methylation sites by heavy methyl SILAC. Nat. Methods. 1: 119—126. PMID 15782174 DOI:10.1038/nmeth715
- Paronetto M.P., Achsel T., Massiello A., Chalfant C.E., Sette C. (2007). The RNA-binding protein Sam68 modulates the alternative splicing of Bcl-x. J. Cell Biol. 176: 929—939. PMID 17371836 DOI:10.1083/jcb.200701005
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з HNRNPA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5031 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 21 грудня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
HNRNPA1 angl Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 12 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 372 aminokislot a molekulyarna masa 38 747 HNRNPA1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1HA1 1L3K 1PGZ 1PO6 1U1K 1U1L 1U1M 1U1N 1U1O 1U1P 1U1Q 1U1R 1UP1 2H4M 2LYV 2UP1 4YOEIdentifikatoriSimvoliHNRNPA1 ALS19 ALS20 HNRPA1 HNRPA1L3 IBMPFD3 hnRNP A1 hnRNP A1 UP 1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1Zovnishni ID OMIM 164017 HomoloGene 134664 GeneCards HNRNPA1Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaamyotrophic lateral sclerosis type 20 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya telomeric repeat containing RNA binding single stranded DNA binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding single stranded RNA binding G rich strand telomeric DNA binding nucleic acid binding RNA binding protein domain specific binding pre mRNA binding miRNA binding identical protein binding mRNA bindingKlitinna komponenta citoplazma catalytic step 2 spliceosome membrana nukleoplazma spliceosomal complex ekzosoma klitinne yadro RibonukleoproteyiniBiologichnij proces mRNA splicing via spliceosome mRNA transport negative regulation of telomere maintenance via telomerase RNA export from nucleus mRNA processing positive regulation of telomere maintenance via telomerase nuclear export GO 0022415 viral process import into nucleus Splajsing RNK fibroblast growth factor receptor signaling pathway cellular response to sodium arsenite regulation of alternative mRNA splicing via spliceosome RNA metabolic process cellular response to glucose starvation GO 0015915 transportDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez3178 29578Ensembl ENSG00000135486 ENSRNOG00000036839UniProt P09651 P04256RefSeq mRNK NM 002136 NM 031157NM 017248 NM 001399274RefSeq bilok NP 002127 NP 112420NP 058944 NP 001386203Lokus UCSC n dn dPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MSKSESPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLRSHFEQWGTLTDCVVMRDPN TKRSRGFGFVTYATVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGA HLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAF VTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRSGSG NFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSRGGGGYGGSGDGYNGFGND GGYGGGGPGYSGGSRGYGSGGQGYGNQGSGYGGSGSYDSYNNGGGGGFGG GSGSNFGGGGSYNDFGNYNNQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAK PRNQGGYGGSSSSSSYGSGRRF A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do ribonukleoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak vzayemodiya hazyayin virus procesing mRNK splajsing mRNK transport transport mRNK Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z RNK Lokalizovanij u citoplazmi yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Siomi H Dreyfuss G 1995 A nuclear localization domain in the hnRNP A1 protein J Cell Biol 129 551 560 PMID 7730395 DOI 10 1083 jcb 129 3 551 Michael W M Choi M Dreyfuss G 1995 A nuclear export signal in hnRNP A1 a signal mediated temperature dependent nuclear protein export pathway Cell 83 415 422 PMID 8521471 DOI 10 1016 0092 8674 95 90119 1 Jurica M S Licklider L J Gygi S P Grigorieff N Moore M J 2002 Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three dimensional structural analysis RNA 8 426 439 PMID 11991638 DOI 10 1017 S1355838202021088 Ong S E Mittler G Mann M 2004 Identifying and quantifying in vivo methylation sites by heavy methyl SILAC Nat Methods 1 119 126 PMID 15782174 DOI 10 1038 nmeth715 Paronetto M P Achsel T Massiello A Chalfant C E Sette C 2007 The RNA binding protein Sam68 modulates the alternative splicing of Bcl x J Cell Biol 176 929 939 PMID 17371836 DOI 10 1083 jcb 200701005PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z HNRNPA1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 5031 angl Procitovano 6 lyutogo 2017 angl Arhiv originalu za 21 grudnya 2016 Procitovano 6 lyutogo 2017 Div takozhHromosoma 12 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi